Clostridium scatologenes: CSCA_4435
Help
Entry
CSCA_4435 CDS
T03803
Name
(GenBank) transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain
Organism
csq
Clostridium scatologenes
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_1_2
GntR
Asp_aminotransf
HTH_36
HTH_Crp_2
HTH_11
HTH_CodY
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKA71560
UniProt:
A0A0E3JR99
LinkDB
All DBs
Position
complement(4787953..4789419)
Genome browser
AA seq
488 aa
AA seq
DB search
MININWKPQKNSSNPLYKQIVDYIINEISTGNWVVGTKLPSQRQLAGDFKVNRSTIVEAF
DELKSKGFIEGNSGGGTRIVNSTWSLLSSRSKLNWQNYIEGSIHKPNLHTIQMVNKLEYK
KDIIRLGTGEPGPQLFPKNIMDKVLNRCSNKITSLGYLEGKGLLELRTILSEYLKIYGIN
VKPSSILIVSGALQALQLIALSILPLGSKILIEKPSYLKSLHIFQSMGMNMIGTNMDDKG
IIPNEISKEINSKVNTLLYTIPTFHNPTGTVMTKDRRMEILNLCEKHRIPIIEDDVYREL
WLDEVPPLPLKSCDKNGNILYLGSVSKSLAPGFRIGWLIGPEPVVERLADIKMQTDYGSS
SLSQLILAEWISSGLYSEHLNNVRSKLKIQRDNALKTLNENFSDIATWNIPKGGFYIWLK
LNSPISMNRLFSEAAKENILINPGSIYDSLNSENLRISYSYASLEEMKIGLEKLSRIVRS
FIKTSSYS
NT seq
1467 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgataaacattaactggaaaccacaaaaaaatagttctaaccctttatacaaacaaatt
gtagattatataataaatgaaatatccactggaaattgggttgtaggtactaagcttccc
tcacaaagacaattagctggagactttaaagtaaatagaagtactatagtagaagccttt
gatgaattaaaaagtaagggttttattgaaggaaatagtggtggtggcactagaatagta
aatagtacttggtctttgctttcatcaagatctaaattaaactggcaaaattacatagaa
ggaagtatacacaaacccaatcttcatactattcaaatggttaataagctggaatataaa
aaagacattatacgattaggaactggtgaacctggacctcaattgtttcctaaaaatatt
atggataaagtattaaacaggtgctccaacaaaattacatccttaggctatcttgagggt
aaaggtcttttagaactgagaactattttaagtgaatatcttaaaatttatgggataaat
gttaagccatcttccatactaattgtttctggagcacttcaagccttacaattaatagct
ttatcaattttacctttaggttctaaaatacttatagaaaaaccatcttatttaaaatcc
cttcacatatttcaatccatgggtatgaatatgattggaacaaatatggatgacaaaggt
attattcctaatgaaatatctaaggaaattaatagtaaagttaatactttattatataca
attcctacttttcacaatcctacaggaaccgtaatgactaaagatagacgtatggaaata
ttaaatttatgtgaaaaacatagaattcctattattgaagatgatgtatatagagaatta
tggttagatgaagtacctccccttccattaaaatcttgtgacaaaaatgggaatatactt
tatcttggaagtgtgtcaaaatctcttgcaccaggttttagaattggatggcttattggt
cctgaaccagtagttgaaagattagctgatataaaaatgcaaacggactatggttctagt
tcattatctcaactaatattagcagaatggataagtagtggactttatagcgagcatctt
aacaatgtaagatccaaattaaaaattcaaagagataatgccttaaaaaccttaaacgaa
aatttttctgatattgctacttggaatattcctaaaggtggcttttatatatggttaaag
ctaaattctcctatatcaatgaataggttattctccgaagcagcaaaagaaaatatactt
attaatccaggaagtatatacgactctcttaatagtgaaaatttaagaatatcttattct
tatgcttcattagaagaaatgaaaattggtttagaaaaattatctcgtatagttagaagt
tttatcaaaacatcaagttattcctag
DBGET
integrated database retrieval system
