Rippkaea orientalis PCC 8802: Cyan8802_4022
Help
Entry
Cyan8802_4022 CDS
T00968
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cyh
Rippkaea orientalis PCC 8802
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MIT
Surface_antigen
RIF5_SNase_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACV02820
LinkDB
All DBs
Position
4139623..4141326
Genome browser
AA seq
567 aa
AA seq
DB search
MSDLIRESVDLESLEQVLQSHLDDLGLSSVVLGIQCSESQDILRVTVEGIDADLSDLQKI
FESLTEILDNQNLSEQYGIVIYWSLDSYPQKLETMIAQKKIKQTLLKLFRQDYYAKFNYG
QLTEKFSYQTFYKTWQELQEKKLQRFFLITGVTGLTVLGGIYTLTRPCVVGSCQMIEEVK
QQTSETITLLENSPSELTMLETKQQLEKSINVLKSIPWWSNYYHNALNLEQTYQQELDYL
AKLISTNNLDNQIASIAHSNSISTGQWKQLHQQLEDAIISLKTIPQRSHLQDIATVKIED
YQTILSRFYEKLSKEQQANFKFKLAKEASDLAQKRQNNANNLSDLQLVVATWKTAIKRLQ
EIPPGTSVYQPSKSLLKTYVTKLSQGENRKSQEVLAVKLHEQGIDSAKLAQKAESEKQWS
QAVNHWKTALNYLNQMPKNTFQRTKSQALIPNYTLALNRAQTQLTLAMEVEKLRSDLATI
CTNPSQICNYIMDERGIKINLTSDYIAQVWNTALQAKVQGNLQIQSELLNHLSSFEYRLQ
GISDRTGKPIEVYNAQGILMAVYHRRQ
NT seq
1704 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgatttaattcgggaatcagttgatttagaatctttagagcaggtattacaaagt
catttagatgacttgggtttatcttctgttgttttgggaatccaatgttctgaaagtcag
gatatcctaagggtaacagttgagggtattgatgctgatttatccgatttacaaaagatt
ttcgagagtttaactgaaatattagacaatcaaaatttatctgagcagtatgggattgtg
atctattggtcactcgatagctatcctcagaaacttgagacaatgattgctcaaaagaaa
attaaacaaacattattaaagttatttcgtcaagattattatgccaaatttaactatggt
cagttaaccgaaaaatttagttatcaaacgttttataaaacttggcaagagttacaagaa
aaaaaactacaacggttttttcttataacaggagttactggactcacggtattaggagga
atttataccttaactcgtccttgtgtagtaggttcgtgtcaaatgattgaggaagttaaa
caacaaacgagtgagacaattacgcttcttgaaaattccccatctgagttaactatgtta
gagacaaaacaacaattagagaagtcaattaacgtattaaagtctattccttggtggtca
aattattatcataatgctcttaatcttgagcaaacttaccaacaagaacttgattatttg
gccaaattaatatcaaccaataatttagataatcagattgcttcaattgctcattctaac
tctatttctactgggcaatggaaacaattacaccaacaattagaagacgctattatatcg
ttaaaaacgattcctcaaagaagtcatttgcaggatatagcaaccgtaaaaatcgaagat
tatcaaacgatactatctcgtttttatgaaaaattatcgaaggaacaacaagcaaacttt
aagtttaaactggctaaagaagctagtgatcttgctcaaaaacgccagaataatgctaac
aacctatcggatttgcaattagtggttgctacttggaaaactgctattaaaagactgcaa
gaaattccccctggaacgtcagtttatcaaccctcgaaaagtttacttaagacttatgta
accaaactttcccaaggagaaaaccgaaaaagtcaagaagtattagctgtaaaattgcat
gagcaagggattgactcagctaaattagcgcaaaaagcagaatctgagaagcaatggtca
caagcagttaatcattggaagactgccctcaattatcttaatcagatgcctaaaaatacc
tttcaacgcactaaatctcaagctttaatccctaactatactttagctttaaaccgcgct
caaacccaattaaccctagccatggaagtagaaaagcttcgcagtgatttagccacaatt
tgcactaaccctagtcaaatttgcaactatatcatggatgagcgaggcattaagatcaac
ttaacatctgattatatcgcccaagtgtggaataccgctctacaagctaaagttcaaggc
aatttacaaatccaaagcgaattactcaatcatttgtccagttttgagtaccgtttacag
ggaattagcgatcgcacaggaaaacccattgaagtctataatgcccaaggaattttaatg
gcagtgtatcacagacgacagtag
DBGET
integrated database retrieval system