Drosophila ananassae: 6502142
Help
Entry
6502142 CDS
T01059
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(I) chain
Organism
dan
Drosophila ananassae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
CBM_14
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
6502142
NCBI-ProteinID:
XP_032309349
FlyBase:
FBgn0096392
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1549 aa
AA seq
DB search
MTTNRSTRLLVLLVLTSLVARHQVNAAAAGLKCSGKSAVCVGPHSYQDCVDDVTVGPVVA
CPLNTRCVTDGLEICVAVKSAVVEAPTAAVAKMVTITDSPVSEPASLVESNPVPNESSTE
GPSIASSAAPAETTAPPAENTLAPVETTVLVEEPTTTGAVETETTAPSQDVTTTQAPGET
TLAPGSEDTNPPIDPNTPLDPNAPETTTAAPGEVDPNAPLDPNAPIDPNAPVDPNAPETT
TTAPGEVDPNAPVDPNSPQDPNAPEGSTNEPGLVDPNAPEVTTTAPGTPADPNAPVETTA
APGEPADPNAPAKPTAAPGEPADPNVPTKPTAAPGEPADPNAPAGSTAAPGEPADPNAPA
GSTAAPGEPADPNAPAGSTAAPGEPADPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGEPADP
NAPAGSTAAPGEPADPNAPAGSTAAPGEPANPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGE
PADPNAPAGSTAAPGEPSDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTA
APGAPFDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGEPADPNAPAGSTAAPGEPADPNAPA
GSTAAPGEPADPNAPAGSTAAPGEPADPNAPAGSTAAPGEPSDPNAPAGSTAAPGAPVDP
NAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPEGSTAAPGVPVDPNAPAGSTAAPGA
PGDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGEPADPNAPAGSTA
APGEPADPNAPAGSTAVPGAPVDPNAPAGSTAAPEAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPE
GSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDP
NAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGVPVDPNAPAGSTAAPGA
PVDPNAPAGSTAAPGVPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPSGSTA
APGAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNAPAGSTAAPGAPVDPNIPAGGAPGSSAGGAPGSAA
GGAPGSSSGAAGGYPAGGAPGSSSGAAGGSPAGGAPGTSGSPAGGAPGSAAGGAPGSSSG
AAGGSPAGGAPGSSSGAAGGSPAGGAPGTSGSPAGGAPGSAAGGAPGSSSGAAGGSPAGG
APGSSSGAAGGSPAGAAPGTSGSPAGGSPGSAAGGAPGSSSGAGAGSPAGGAPGSSSGAA
GGSPAGVIPSIPTLPGGSGSWPWQRPNPPVVPPFWRPHLPGQNGEAAGSNAAGNGVINPV
PPHHPLPFWPNWQNWVNSWRKPTTEAPVAAPAQPEEPQIPSQPEAPQQPGQAEKPSNNSP
ETAESVEQPAQSPPASNENASVEEKSKPKSGEEQDKKKPASEEKDSKEKKDKDSKEKEKE
KEKKDSKEEKENESQSPKENEKDDSEDNELSSKEKKQYVKDVLKKLKKGEECDEDDAIPD
VRDCRKYYRCELKKSGKHKFVHLRCDKKERFDWLSQSCIPKDQARCLEK
NT seq
4650 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaacgaaccgatccaccagacttctggtgttgctagtgctcacctctttggtggcg
agacatcaggtgaacgccgctgccgcaggactgaagtgcagtggcaagagcgccgtttgt
gtgggaccacactcctaccaggactgcgtcgacgatgtgaccgtcggcccggtggtggcc
tgccccctcaacacccgctgcgtcaccgacggcctggagatctgtgtggccgtcaagtcc
gcggtcgtggaggcacccacggcggccgtggccaagatggtgaccatcaccgacagtccg
gtcagcgagccagcttcgctcgtggagagcaaccctgttcccaacgagagctccaccgaa
ggacccagcatcgcttccagtgctgcccctgctgagacgaccgcacctcccgccgagaat
actttggcgcccgttgagactactgtgcttgtggaggagcccaccaccactggagctgtc
gaaacagagactactgctcccagtcaggacgtcaccaccacccaggctcccggagaaacc
actctagcacccggatcggaggacaccaacccacccatcgaccccaatactcccctagat
cccaacgcacccgaaaccactaccgccgcaccaggagaagttgatcccaacgctcctctt
gatcccaatgctcctattgatcccaacgcgcctgttgaccctaatgcccctgagaccact
accacagcaccaggagaagtcgatcccaatgctccagtcgatcctaactcccctcaggac
cccaacgcaccggaaggatctacaaatgaacctggtctggtcgacccgaacgcacctgaa
gtaaccactaccgcccctggaactcctgccgaccctaacgctcccgttgaaactaccgct
gctccaggcgaacctgccgatcccaatgcacctgccaagcccaccgctgctcctggagaa
cctgccgaccccaatgtacctaccaagcccaccgctgctcctggagaacctgctgacccg
aatgcaccagcaggatctactgctgctcctggagaacctgccgaccctaacgctcctgct
ggatccactgctgctcctggagaacccgccgacccgaatgcacctgctggatctactgct
gcccctggagaacctgccgaccctaacgctcctgctggatccaccgctgcccctggagct
cctgttgatcccaacgctcctgctggctccaccgcggctcctggagaacctgccgaccct
aacgctcctgctggatccactgctgctcctggagaacctgccgacccgaatgcacctgct
ggatctactgctgcccctggagaacctgccaaccctaacgctcctgctggatccaccgct
gcccctggagctcctgttgatcccaacgctcctgctggctccaccgcggctcctggagaa
cctgccgaccctaacgctcctgctggatccactgcagctcctggagaaccttccgaccct
aacgctcctgctggatccactgctgcccctggagctcctgttgaccccaacgctcctgct
ggatccaccgctgcccctggagctcctgttgaccccaacgcccctgctggatccaccgct
gcccctggagctccatttgaccccaacgctcctgctggttccaccgctgcccctggagct
ccagttgaccccaacgctcctgctggctccaccgcggctcctggagaacctgccgaccct
aacgctcctgctggatccactgcagctcctggagaacctgccgaccctaacgctcctgct
ggatccactgctgctcctggagaacccgccgacccgaatgcacctgctggatctactgct
gcccctggagaaccagccgaccctaacgctcctgctggatccactgctgctcctggagaa
ccttccgaccccaacgctcctgctggttccaccgctgcccctggagctcctgttgacccc
aacgctcctgctggatccaccgctgcccctggagctcctgttgaccccaacgcccctgct
ggatccaccgctgcccctggagctcctgttgatcccaacgctcctgaaggttccaccgct
gcccctggagttcctgttgatcccaacgctcctgctggatccaccgctgcccctggagct
cctggtgaccccaacgcccctgctggatccaccgctgcccctggagctcctgttgatccc
aacgctcctgctggatccaccgctgcccctggagctcctgttgaccccaacgctcctgct
ggctccaccgctgctcctggagaacctgccgaccctaacgctcctgctggatccactgct
gctcctggagaacccgccgaccctaacgctcctgctggttccaccgctgtccctggagct
cctgttgaccccaacgctcctgctggatccaccgctgcccctgaagctcctgttgatccc
aacgctcctgcaggttccaccgctgctcctggagctcctgttgatcccaacgctcctgag
ggttccaccgctgcccctggagctcctgttgatcccaacgctcctgctggctccaccgct
gcccctggagctcctgttgatcccaacgctcctgctggatccaccgctgcccctggagct
cctgttgaccccaacgctcctgctggatccaccgctgcccctggagctcctgttgatccc
aacgctcctgcaggttccaccgctgcccctggagctcctgttgatcccaacgctcctgca
ggttccaccgctgcccctggagctcctgttgatcccaacgctcctgctggctccaccgct
gcccctggagttcctgttgaccccaacgctccggctggatccaccgctgcccctggagct
cctgttgatcccaacgctcctgctggttccaccgctgcccctggcgttcctgttgacccc
aacgctcctgctggatccaccgccgcccctggagctcctgttgaccccaacgctcctgct
ggttccaccgctgcccctggagctccagttgaccccaacgctccttctggatccaccgct
gcccctggagctcctgttgaccccaacgctcctgctggttccaccgctgcccctggagct
ccagttgaccccaacgctcctgctggctccaccgcagcccctggagctcctgttgatccg
aacatccctgctggaggtgccccaggctcgtctgccggaggtgccccaggatctgccgca
ggcggtgctccaggctcttcatctggtgccgctggcggatatcctgctggtggagctcca
ggctcttcatctggagccgctggtggatcccctgctggtggtgctcctggcacttctgga
tctcctgctggtggtgccccaggatcggccgcaggcggtgctccaggctcttcatctggt
gccgctggcggatctcctgctggtggagctccaggctcctcatctggagccgctggtgga
tcccctgctggtggtgctcctggcacttctggatctcctgctggtggtgccccaggatct
gccgcaggcggtgctccaggctcttcatctggtgccgctggcggatctcctgctggtgga
gctccaggctcctcatctggagccgctggtggatcccctgctggtgctgctcctggcact
tctggatctcctgctggtggttccccaggatctgctgcaggtggcgctccaggctcttca
tctggtgccggtgcaggatctcctgctggtggtgctccgggctcttcatctggagccgct
ggtggatctcctgctggggtcattccatcgattcctacactgcctggcggatctggttct
tggccttggcaacgacccaaccctcccgtcgtgccaccgttctggagaccacatctccca
ggacagaatggtgaagccgccggctcgaatgctgctggcaatggcgtcatcaatccggtg
ccaccccaccatcctctgcccttctggcccaattggcaaaactgggtgaacagctggcga
aagccgaccaccgaggctcctgttgccgctccagcccagcctgaagagccgcagatcccg
tcgcagcccgaggccccccagcagcccggacaggccgagaagccaagcaacaacagtccc
gagactgccgagagtgtggaacagcctgcccagagcccacctgcctccaacgagaacgcc
tctgtagaggagaagtcgaagccgaagtccggcgaggagcaggataagaagaaacccgcc
tccgaggagaaggacagcaaggagaagaaggacaaggacagcaaggagaaggagaaggaa
aaggagaagaaagattcgaaagaggaaaaggagaacgagtcgcaaagccccaaggagaac
gagaaggacgacagcgaggacaacgagctgagctccaaggagaagaagcagtacgtcaag
gatgtgctcaagaagctaaagaagggcgaggagtgcgacgaagatgacgccattcccgat
gtccgtgactgccggaagtactaccgctgcgagctgaagaagtccggcaagcacaagttc
gtccacctccgttgcgacaagaaggagcgcttcgactggctctcccagtcctgtatcccc
aaggatcaagcccgctgcctggagaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
