Dendrobium catenatum: 110115196
Help
Entry
110115196 CDS
T05027
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat receptor protein kinase MSP1
Organism
dct
Dendrobium catenatum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
LRR_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110115196
NCBI-ProteinID:
XP_020704024
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1299 aa
AA seq
DB search
MPCQAPKQMASSANVSMVLFFICCVSFSSAETSKDVQTLFTLRSSLSRERELIPSWFNGK
TPPCQWLGVKCTTNHEIVEAIDLSFTPLNLPIPSCIGQFSSLKILNFSNCELFGQIPETL
GHLWNLQYLDLSNNQLSGTVPLSLANSTKLKQLLLGSNMLHGNLGPIIRQFNDLRILSLS
GNVFSGNLPMELGNLQKLQVLEFSMNSFAGSLPESLGNLTQLIHLDGSHNGFTGTFFFGL
GSLVNLKTLDLSSNSFTGPLTEDIGKLSSLISLWLGPNGFNGSIPVEIGNLKQLEIFSIP
SCKFTGKIPSEISKLKKITDLDISDNNFEGELPPCIGELTNLNYLVASHAGLTGKIPEEL
GNLKNLMILDLSFNHFYGPLPDSLFALESINSFLVDDNHLFGPIPGWLSNWSMARFISLE
KNDFSGTLPSLRLQYLTSFTADANHLSGEIPADICEAESLSHLSLADNELTGSIHETFRG
CSNLTDLILNGNKFFGQVPGYLAELPLVTLELSHNNFSGFLPSQLLQSETIVEIYLCDNQ
LSGKLPDSNGGLSLLRRLQLDNNYFEGFIPNSIGKLSNLTNLSLHGNKLSGGIPLDLFNC
TNLVELDIGSNRLSGPIPKAISQLKLLGDLVFSNNLLSGEIPDEICAGFQLAQHPDSEFN
QHYGVLDLSYNNLKGQIPKTIKNCVEVKELMLQGNKLNGIIPPELNDLLNLAVLDLSFNS
LSGTLLSAQFSLKNLQGLLLSNNQLEGPIPDNLGLMMPSLVKLNLSSNRLTGPLPESLFV
LKSLTHLDTSLNFLSGSISFLTDIDGGVSSLIIFNASNNLFSGAISESISNLTSLSILDL
HNNNFTGSLPSLLSSLNSLTYLDVSNNNLQDAIPCKICSIVGLTYVNFSGNKFDNFAPES
CTMSQACVGSHIISKPLAAYPSARLFGRALVWGIIISVAFISVLIFFIIIKWRRHYQKNL
ALAPANKTKSSAIEPASSEELLSKRLKEPVSINIATFEHALFRITLADIMKATNEFSKSH
IIGDGGFGTVYKASLPENQVVAIKRLNSGRHFQGDREFLAEMETIGKVKHRNLVPLLGYC
VFGEERFLIYEYMENGSLEQWLRKQADADGTLSWSIRLKICLGAARGLSFLHHGFVPHII
HRDMKSSNILLDQYFEPRVADFGLARIISACETHVTTDLAGTFGYIPPEYGLTMKATAKG
DVYSFGVVLLELLTGRTPTGQEEEKGGGNLVEWVRWMEGFGLVDEVFDPSLSPINLWREQ
MMCVLRVAKMCTTDEPAKRPTMIEVVNHFKEIQMMDDSI
NT seq
3900 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccttgccaagcaccaaaacaaatggcatctagtgcaaatgtatccatggttctcttc
ttcatctgctgtgtttccttttcaagtgcagaaacaagcaaggatgtacagacactcttt
actctcaggtcctcactaagcagagagagagaactcattccaagctggtttaatggaaaa
acaccaccatgccagtggttaggtgtaaaatgcaccactaatcatgaaattgtggaggca
atagatttatccttcacacctctaaaccttcccatcccaagctgcattggacaattcagt
tccctaaagatcctcaactttagcaattgtgaactctttggccaaatcccagaaacactg
gggcatctgtggaatctccagtatttggacctgagcaacaatcaactttctggaactgtt
cctctttcacttgccaattcgacgaagcttaaacaattattgctgggttcaaacatgttg
catgggaacttgggcccaataattaggcagttcaatgatctcagaatactcagtttatct
ggaaatgtcttctctggaaacctccccatggagttgggaaatctacagaagctgcaggtt
ctagagttcagcatgaactcttttgctgggagtcttccggaaagccttgggaatctgacc
caactcatacacttagatggaagccataatgggtttacaggaacattcttttttggcctt
ggttctcttgtcaatctaaagacactggacctctcttctaacagctttacaggacctcta
acggaagatattgggaagttgtcaagtctaatatctttatggttgggtcctaatggcttc
aatgggagtattccagtggaaattggaaatcttaaacagctcgaaatcttttcaatccct
agctgcaagttcactgggaaaattcccagtgagatctccaaactcaagaaaataacagac
ctggacatatctgacaacaactttgaaggggagcttcctccatgtattggggaactgaca
aatcttaattacctcgttgcatcccatgctggactcactgggaagatacccgaggagttg
ggaaatctgaagaatctgatgatattggatctctccttcaatcacttctatggtccattg
ccagatagtctctttgcgcttgaatccatcaactcattccttgttgatgataaccatttg
tttggaccaattcctggctggttgtcaaattggagcatggcacgattcatcagtttggag
aagaacgacttcagtgggactctgccttctttaaggctacagtacttgacctcattcact
gctgacgcaaaccatctgtcaggagagatccccgctgatatttgtgaggctgagtcactc
tctcatctttctcttgctgacaatgaactcacaggaagcattcatgaaaccttcagagga
tgctcaaacctcactgatttaatcttaaacgggaacaagttcttcggacaggttccaggt
tatttagccgagttgcctttagttaccctagagctttcgcacaacaacttctctggcttt
cttccctcacaattgttgcagtctgaaaccatagttgaaatctatctctgtgacaatcaa
cttagtggtaagctcccagatagcaatggaggtttatctcttcttcggaggttgcaactt
gacaataattattttgaaggattcattccaaactctattggaaaattaagcaacttaact
aatttgtcacttcatgggaataaactctctggggggatcccattagatctcttcaactgt
actaacctggtagaacttgacattggatcaaacagattgtctgggcctattcctaaggcc
atatctcagttgaagcttctaggtgatctagtgttttccaacaacctgttatctggtgaa
atacctgatgaaatctgtgcggggtttcagttggcgcagcacccggattctgaattcaat
cagcattatggtgtgcttgatctatcgtataacaatcttaaaggtcagattccaaaaaca
atcaagaactgtgtggaagtaaaagagctaatgttgcaaggaaacaagcttaatggcatc
atccctcctgagcttaatgacctcctgaacctggctgtccttgatctttctttcaattct
ctttcaggtacattattgtctgcacagttctctttaaagaaccttcagggcttacttttg
tcaaacaaccagctagagggtccaattcctgataatcttggcttgatgatgccaagttta
gtgaagcttaacttatcaagtaatcgacttactggccctcttcctgaatctctttttgtt
cttaagagccttacgcatttggacactagcctaaattttctctctgggtctatatcgttt
ctcacagacattgatggtggagttagctcacttattatattcaacgccagcaataattta
ttctctggtgctatatcagagtctatttcaaacctaacttctctctctattctcgacctc
cataacaataatttcactggaagtcttccatctttattgtccagtctaaattctctcact
tatcttgatgtctctaacaacaatctccaggatgccatcccttgtaagatttgcagcata
gttgggctcacatatgtgaatttttctggcaataaatttgacaattttgcaccagagagc
tgcacgatgtcccaggcatgtgtagggagtcacattatctcaaagccattggctgcatac
ccttctgcacgattgtttggtcgagctttagtttggggtattattatttctgtcgcattt
atttctgtgttaatttttttcattattatcaaatggaggagacattaccagaaaaattta
gccctcgctccagcaaataagaccaagtcatcagctattgagccagcatcctctgaggag
cttttgagcaaaagactaaaggagccagtcagcatcaacattgccacttttgagcatgct
ttgtttcgcatcactcttgctgatatcatgaaagcaacaaatgagtttagcaagtctcat
attattggggatggtggattcggcacggtctataaggcgtctttacctgaaaaccaggtt
gttgcaattaaaaggctcaatagtgggagacattttcagggtgaccgggagttcctggct
gaaatggagactattggaaaggtgaagcacaggaatcttgttcccttgcttggctactgt
gtctttggtgaagagaggtttctaatctacgagtacatggaaaatgggagtcttgagcaa
tggcttaggaaacaagctgatgctgatggaacacttagctggtcaattcggctaaagatc
tgcttaggcgctgcccgggggctatctttcctgcatcatggctttgtccctcacattatt
cacagggatatgaaatcaagtaacatccttcttgaccaatacttcgagcccagggttgcg
gactttggtcttgctcgtattatcagtgcttgtgagactcatgtaactactgaccttgct
gggacctttggctatatcccaccagagtacggcttaacaatgaaggcaacagcaaagggt
gatgtttacagctttggggttgtattgttggagttgttgactggaagaactcctactggc
caggaagaagagaaggggggaggtaatctggtggaatgggtgaggtggatggagggcttt
gggttggttgatgaggtatttgatccatccctttcacctatcaacttgtggagagagcaa
atgatgtgtgttctgagggttgccaagatgtgtaccactgatgagccagccaaaaggcca
acaatgattgaagttgtgaaccattttaaggagattcagatgatggatgacagtatataa
DBGET
integrated database retrieval system
