Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0276239
Help
Entry
DDB_G0276239 CDS
T00245
Name
(RefSeq) Sec1-like family protein
KO
K20182
vacuolar protein sorting-associated protein 33A
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04148 Efferocytosis
DDB_G0276239
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0276239
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Endosome - Lysosome transport
Tethering complex
CORVET complex
DDB_G0276239
Hops complex
DDB_G0276239
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sec1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8620335
NCBI-ProteinID:
XP_643291
dictyBase:
DDB_G0276239
UniProt:
Q552I9
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(6373737..6376313)
Genome browser
AA seq
858 aa
AA seq
DB search
MFNKLKKPIINSNNNQNSQNNKESINTSEEKRESSGINGVVNNLFNRKTVPLNNNPNVNA
NNVQPKPTILSQTTDVSSILNFEPLREQYKLNFIDALDFIRNEQSLINNLNLINNSTPPN
LSPNLSSQNNQNNNNQNSTNYNNILNNNNISSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNLTSL
IIDSKIIGLMNLFLDPIFLKQNGIDKIYELKSGKLETESKNIIYLIRPNVKYMNFISEHI
RGHLYDYVKKNYSMIYIPKVDPICDSILEEQGVYGNFSTITSMSMDLIPLDNDVLSFESP
NSYREYLMENNKSIAYDISKSVMKLQSIFGLIPTIKGKGKVSKLIVETLSRLRNEKQRDL
NQNNQNSIRSLEISKEIDSIMFIDRDIDLITPLCTPLTYEGLIDEYFSINNNILLIDSQI
LNDSISSQQNNNQNNNQNNKRNNNNNSGSMYYNKKSSFPLHSGDKIFSQVRDMNFSSLMG
PGGVLNSKAKQQYYDEKKQLTGSESLTALRDLMKRVNSSKQEEFCLHVHVGIAEKIHEIT
ASTYFQNRLDCEQKLLLGSDDIYLADRYIQECITIKDPILKVLRLLSLYSLTNNGLPLND
YEFIKSKIISNYGIEWLIQLSQLEKVGLIQIRKSDSKPIGNFQQIKEDLNLIIDDVNEID
PSDFSYVYSGYAPLLIRLVQYSLPSSKTGWKSIENTLKLLPGPIFDENQLFFLNNNNNNN
GSGIVHSGSAPSIASLSLNNDENENYDYDDDNNNNHNINNNNNNNINNINNNTNSNNTPI
SSSGSPGTLNTDVTNNSNNINSIEKSGVSMVFFVGGVTFSEISALRFLGKQTNKKFIILT
TKLINGDSLIQSFLDPLG
NT seq
2577 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaataaattaaaaaaaccaattattaatagtaataataatcaaaatagtcaaaat
aataaagaaagtattaatacaagtgaagagaaaagagagagtagtggtattaatggtgtc
gttaataatctttttaatagaaaaacagtaccattaaataataacccaaatgtaaatgca
aataatgtacaaccaaaaccaactattttaagtcaaactacagatgtatcatcaatatta
aattttgaaccattaagagaacaatataaattaaattttattgatgcattagattttata
aggaatgaacaatcattaattaataatttaaatttaattaataattcaacacctccaaat
ttatcaccaaatttatcatctcaaaataatcaaaataataataatcaaaatagtacaaat
tataataatattttaaataataataatattagtagtaataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataatttaacatcatta
attattgattcaaaaattattggattaatgaatttatttttagatccaatatttttaaaa
caaaatggtattgataaaatttatgaattaaaatcaggtaaattagaaactgaatcaaag
aacataatttatttaattagaccaaatgtaaagtatatgaatttcatatcagaacatatt
agaggtcatttatatgattatgttaaaaagaattattcaatgatttatataccaaaagta
gatccaatttgtgattcaatattagaggaacaaggtgtttatggtaatttttcaacgatt
acatcaatgtcaatggatttaataccattggataatgatgtactatcatttgaatcacca
aattcctatagagaatatttaatggagaataataaatcgattgcatatgatatatcaaaa
tcagtaatgaaacttcaatcgatatttggtttaattccaacaattaaaggtaaaggtaaa
gtttcaaagctaatcgttgaaactctatcaagacttagaaatgaaaaacaaagagattta
aatcaaaataatcaaaattcaattagatctttagaaatttcaaaagaaattgattcaatt
atgtttattgatcgtgatattgatttaattacaccattatgtacacctctaacatatgaa
ggtttaattgatgaatatttttcaattaataataatattttattaattgatagtcaaatt
ttaaatgatagtatttcatcacaacaaaataataatcaaaataataatcaaaataataaa
agaaataataataataatagtggatcaatgtattataataaaaaatcatcatttccatta
catagtggtgataaaatattttcacaagttagagatatgaatttttcaagtttaatggga
ccaggtggtgtattaaattcaaaagctaaacaacaatattatgatgaaaagaaacaatta
actggatcagaaagtttaacagcattacgtgatttaatgaaacgtgtaaactctagtaag
caagaggaattttgtttacatgttcatgttggaattgcagagaaaattcatgaaattact
gcatcaacttattttcaaaatagattagattgtgaacaaaagttattattaggttcagat
gatatttatttagccgatagatatattcaagaatgtatcactattaaagatccaatttta
aaagtacttagattattatcattgtatagtttaactaataatggtttaccattgaatgat
tatgaattcattaaatctaaaatcatctcaaactatggcatagaatggttaattcaatta
tcacaacttgaaaaagttggtcttattcaaattagaaaatcagattcaaaaccaattggt
aattttcaacaaattaaagaggatttaaatttaataattgatgatgtcaatgaaattgat
ccttctgatttctcttacgtttactctggttatgctccactattaattagattggttcaa
tattctttaccatcttctaaaactggttggaaatcaattgaaaatactttaaaattatta
cctggtccaatttttgatgaaaatcaattattctttttaaataataataataataataat
ggtagtggtatagttcattctggttctgcgccttcaattgcatcactttctttaaataat
gatgaaaatgaaaattatgattatgatgatgataataataataatcataatataaataat
aataataataataatataaataatataaataataatacaaatagtaataatacaccaatt
tcgtcaagtggttctcctggtacattaaatactgatgttacaaataatagtaataatata
aattcaatagaaaaatcaggtgtttcaatggtattttttgttggtggtgttactttttca
gaaatttcagctttaagatttttgggtaaacaaactaataagaagtttattattttaaca
acaaaattaattaatggtgattcattgattcaaagttttttagatcctcttggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
