Desulfurococcus amylolyticus DSM 16532: Desfe_0552
Help
Entry
Desfe_0552 CDS
T02136
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
dfd
Desulfurococcus amylolyticus DSM 16532
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NPCBM_assoc
Gemini_mov
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFL66453
UniProt:
I3XR79
LinkDB
All DBs
Position
complement(516200..519784)
Genome browser
AA seq
1194 aa
AA seq
DB search
MMARVLIPRILILLLFTSYLIQTPLVYQQTSNWVLEGYSYRSRSGGDVYPGSSATILTVD
LRYTGSNNAISPYACLVLPEGFTTRGSQCTSGAYTNGTYIHKASPGDVLRFTYTIDVSRN
TTPGEYYFTLNISYYIEGSSALEYYTLAIPVTVSPYPQLVLTVEKAYFTPYGYPGSNPVS
LYVKLVNNGNTTITSMDLTLELPGEYFTPSEANTSYTGSVDPGGSASVLFNNIQVKPYTQ
PGSYTVSMHVSAELSTSDGVTYRDDGELVFQITVGSTPPLDIRVLDYSLTAQYPLPGLNS
TGIRFIIQSLEPSTVRILYLTTELNGAFTGNGSRTIIQEVSQALSYMDTLELRITGLNIA
EDTGVVEAYIELSCMVNRDQSWYPASYSMRLVIPLETSPELNVRIVNATWSTSTAYPGAT
GLGLTVTLLNNEGFSIRDGDAVLRLPMVFRPGELVVRNIVVNQYSLTEIVFTGIDIALDA
SPGTYEAYMTLRGFLVNNDGSTKYVELAFTIGVRVSNPGELLGWRPVLELTDYFWGDGAP
TYIYPGNPRAGLTIEVTNTGIYQVSSLELEITTPSDVTPLTRNTTCATTLPPGSTCQAVF
YLDLSSATAGVKYFNVTARYRVNAFNTGIYFNESLSFSLLLPEYRAGEGVRVASSSWAGN
NPVYPGERGAVFTVQLANLEPYPIYSLWVSIEPPLCMLLHEGVNNTTYIPGPVNSLQSVT
ISYTIDVKCSKPGQYIGYLNINYYVQYAGGGFRRSIREPLLFTISSLENTVEVVKAGWVG
GAPTKGGRGVSYMVAVRNNGFPSISNPVLTLYLPQGLSDALTGSQEATVTPSSIIPSQQL
QQILQEGVPDLSGILQMLQATQAQQPASVQRGDLMVFIARLNILNASAGLYEVPFTLSFT
DHWGYVYSVNSTLVMQIQYQPPLLTVHPASPIVYFANGSSILDIDVVNEYDSPVYNVYIA
LIPTSNNAIPQGAVKYVDMIPGNSSVRIRYELIYNPVSISIGGGVTASPSSAVFTVSLIY
RDVYGYIGSINTTLSAIIRPFINLELTGDTSARYYDNAGKLSVNGVILNTGLAQARSVYV
KVFYGDASGYMFIGDIDPSSQTPFRVDLYSFRYLDNCSLIIEFKDEYNTLYTLRYDIPVQ
LVHQQTTTMPQSSGIEGYYYLAVILVVALFLVAVFYLLYRYISRHRITVGENAG
NT seq
3585 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggccagggtgcttataccccgtatactaatacttctactctttacgagctatcta
atccagaccccacttgtctaccagcagacaagcaattgggtgttggaagggtattcctat
agatcgaggagcggtggagacgtttaccccggtagctctgcaactattttaacagtagac
ctcaggtataccggttcaaacaatgcgatctcaccctacgcatgtctagttctaccggag
ggcttcacgaccagggggtctcagtgcactagtggagcatacaccaatggcacatacatc
cataaggcctcaccgggcgatgtactccgctttacgtacaccattgatgtatcgaggaat
actacacctggggaatactatttcacactgaatatctcatactatatcgagggttcatca
gcactggagtactatactctggcaattccggttacagtctcaccttacccgcagctggtt
ttaacagttgagaaggcatacttcacaccctacgggtacccgggttcaaacccagtgagc
ctctacgttaaactggtcaataacggtaatacaactattacatcaatggatctaacacta
gagctacctggagaatacttcacaccctccgaggctaacacctcttacaccgggagcgtt
gatccaggtggatcagcctccgtattattcaataacatacaggttaaaccatatacacaa
ccgggttcttacactgtcagcatgcatgtctcagccgagttatccactagcgatggagta
acgtatagggatgatggagaattagtctttcaaatcaccgtggggtcaactccaccctta
gatatcagggtactagattactcgcttacagcacagtacccattgcccggcttaaacagt
acaggtataagattcattatccaatccctcgagccgagcacggtgaggatattatacctt
accacggaactgaatggcgcattcacagggaatgggagtagaaccattatacaagaggtt
tcacaagcgctctcatacatggacacccttgaattaagaatcacggggttgaatatcgcg
gaagacactggtgttgttgaagcatacatcgagctcagctgcatggttaatagggatcaa
tcatggtatccggcatcgtattccatgaggctggtgataccgttggagacctctccggaa
ctaaatgtaaggatcgttaatgcaacatggtctacttcaaccgcgtacccaggtgccacc
ggcttaggcctcacagtgacattgttgaacaatgagggcttcagcattagggatggcgac
gctgtgctcaggcttccaatggtgtttagacccggtgaactagtagtgagaaatattgtt
gtgaaccagtactcgctcacagaaatagttttcacaggcatagatatcgctctcgatgcc
tctccgggaacctacgaggcatatatgactctaagaggcttcttagtgaataacgatggc
tcaacaaagtatgtcgagttggcgttcactatcggggtaagggtttctaatcctggggag
ctcttagggtggaggcctgtattagagttaacagattacttctggggcgatggagcgccg
acgtatatatacccaggcaacccgagggctggtttaaccatcgaggtaaccaataccggg
atataccaggtttcaagcctggagctggagataactaccccgagcgatgtcacacccctt
acaaggaacactacttgtgcaaccactctgccaccgggctccacgtgccaggcagtgttt
tacctggatctatcgagtgctacagcgggtgtgaagtactttaatgtgacagctagatac
cgtgttaacgcgtttaatacagggatatactttaatgagtcactcagcttcagcctacta
ctaccggagtatagagctggggaaggcgtgagggttgcctcttcatcgtgggccggtaac
aaccctgtctatccaggtgagaggggagccgtgttcacggtgcaactagccaatctggag
ccataccctatatactctctatgggtttctatcgagccacccttatgcatgttgcttcat
gagggcgtgaataatactacgtatatacctggaccagttaacagtcttcaatctgtgacc
ataagttacactattgatgtaaagtgtagtaagccgggtcagtatataggatacctcaac
atcaactactacgtgcagtatgctggcgggggattcaggaggagtatcagggaaccatta
ttattcaccatcagtagcttggaaaacactgtggaggttgtaaaagctggatgggttggc
ggagcacccacgaagggcgggagaggggtcagctacatggttgcggtgaggaacaatgga
ttcccctctatctcaaacccagttctaacactatacctgccccagggactcagtgatgca
ttaacgggttcacaggaagccactgtaacacctagcagtattataccgagtcagcagctc
caacagatcctacaggaaggggttccagacttatccggtatccttcaaatgctgcaggct
acgcaggctcagcaaccggctagtgtccagagaggggatctgatggttttcattgccagg
ctcaatatattaaatgcctcagcaggcttatacgaggtgcctttcacgctttcattcact
gatcactggggatacgtttacagcgtgaactcaacgctagtcatgcagatacagtaccaa
cctccattactcaccgtacacccggcttctccaatcgtatacttcgcaaatggatccagc
atactggatatagacgtggtcaacgagtatgattcaccagtttacaatgtatacatcgcg
ttaatacctacatcaaacaatgcgataccacagggagccgttaaatacgttgacatgata
cccggtaactcgagtgtcagaatcagatacgagcttatatacaaccctgtctcaataagc
atcgggggaggagttacagcctctccttcatcagccgtgttcactgtctcattaatatac
cgcgacgtatatggctacattggatccatcaataccacgctctcagccattataaggcca
ttcataaaccttgagctaaccggggatactagtgcaaggtactatgataacgctgggaaa
ctcagtgttaacggagtaatactcaatactggtctcgcacaagctagaagcgtgtacgtg
aaggtattctatggggatgcatccggctatatgtttataggagacatagatccatcatca
cagacgcccttcagagtagacctgtactcattcaggtacctggataactgtagcttgatc
atagagttcaaggacgagtacaatacattgtatacactccgctatgatataccggtgcaa
ttagtgcatcagcaaaccacgacgatgccacagtccagcggtattgaaggatactactac
ctagctgtgatattagttgtggcgttattccttgtcgccgtgttttacctgctatatagg
tatataagtagacacaggatcacggttggtgaaaatgctggttag
DBGET
integrated database retrieval system