Diuraphis noxia (Russian wheat aphid): 107166932
Help
Entry
107166932 CDS
T04900
Name
(RefSeq) cadherin-23
Organism
dnx
Diuraphis noxia (Russian wheat aphid)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
Cadherin_3
Cadherin_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107166932
NCBI-ProteinID:
XP_015371265
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1749 aa
AA seq
DB search
MCPPMAYSWLVILLVFLDVFGQSECVSNNRPPQFLPGGDMARFSISEDTPVGKSVYKLSA
IDPEGSRVSYTVSGQHLNIDRSTGVVTLAKRLDRETLDSLEVVISVTDESIKDSDANTVS
LRRDIAIIDVNDNPPEFLGRPYSFSVSEDTQVGTIIYSNVTVVDKDIGSNSEISMTCIQN
NEPCVTFNLLTEKVSTGTYVGSIRLARPLDFDTVSSYKLTVKASDGGLKTTLSSTANITV
VVKDIQDERPVFTNSPYSIVIDENTPAGVQVLKVNAEDGDAGLKRPVVLSLEDDSLGYFT
IENESNGTAYIFTSDNPIDRENKVVSDAGGIYTFRLKATELINNELPGDVSYEIVTVVVQ
DVDDEKPEFNEKSFTTSVSEDISIGTPLPGLNIIVNDKDLGDNGRYVLVMRTQDSRVSNW
FKIIPETALGRSTVLIRLVDNDGFDYDAGVTDVEFDIVAMYQDNISGGFKEASAAHVQVN
VLDANDNLPKFAQSTYAYSIPENFVPGTSIANLTATDIDSGINGEITYSLQGFGMDKFGS
DPEFGGIYLTGKVDYEQQSSYSLTFEAKDGGNRSTHVVILVEIIDVNDNTPVFNSLEYKR
TIREGGTEFQPKFFVQASDADSGLNSMIRYSVASSNYNGVVMVNPISGELTLNSPVNSSH
TSRGQYEVVIRATDLGIPPLHAEANIYIRVGVPGNQRPMFKNLTYSITIPENTPRTMDIL
KVRATDPDGPDHLIEYSMVNSNDNFQINKKTGAISVSERAILDLDSTGLSYYHLVVMAMD
SGLPIREVAHADVYVNVTDVNNKPPKFDDNISYIVYVPEITKIGEVVYKVNAVDPDKNAS
IKYAIVEPVRANDKTGLPLKNSSSYNFKDVFSINKLTGEIKVNSSLNYQLASVIVLTIRA
VDMNAVENVHEQYDEVEITFFVKPYLNKNPVFTNSGWSADGDMSILIIRVDEETPIGTEL
VQLKARDVLTNESLYDFKAITAVPRQIAMDYAGKVILTERLDYETLENKTLTFQVKVTTE
DGERSTXKTIVIEVQDINDNSPEFEYPMYRTSLVESSPKGTVVLSVRANDKDLATSQNGI
IRYHLGGENSNLFTVDPISGEITVSGNGVIDREKTPILKLMLFASDTPQGGPHQKLSSVP
VHIDVKDINDNAPEFDTSIYIAVVLENVVPETSVLNVSAHDPDEGSAGLVHYKLIDEQQL
QGFLYINPMNGQIKTLKRLTGKGRSDPYEMKIRAEDNGEPGMFSDVKLSLYISDIIENDG
VPTFVHPTADEIAYVSENASIGSLVFRALATDPDDPNTLEGTIHYSFLEETKDSLIFSID
SETGLITTASVLDREVQEKYTLVLVARDLGDVPQQSTKIFNVIITDVDDNKPTFNRSIEE
KPLMMEVEEESPRGTLVGSIAAYDPDIGDNALIDYIITDGNEDNVFYLNSSNNVAEIRIN
GEIDRESVSEYVLAIKCFKHKTKTYSLHKSYNKQDPSERLVVIKILDIDDNLPKFIDENL
TLGVRVSVPLDTLVATIQATDVDNSAEQITYHITNLTYANRLESPKEIKSWPFFLDQLSG
QIRTTSSMASYAEGYFNIVVAAINSDVPGRHSNTTIKVFIVKDRGLLKFVFTRPPNIVGH
YIKKFKEDVEKSLGIPQASLNLYDTQFYSKNDGSLDFSSTGSCFQLVGPNNYNPKDTISL
LEDPSNHELKNVYKQYDVKNIERCSPKQVKSAVTWVQMSVLGIAIFIGFVSILSICLLCC
SFKKWKKLR
NT seq
5250 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgtccgccgatggcgtatagctggcttgttatcttactcgtatttttggatgttttc
ggccagtcagaatgtgtatcaaacaaccggccaccgcaatttctgccaggcggcgacatg
gcaaggttttctatatccgaagataccccagttggaaagtcagtttacaaactgtcagcg
attgaccccgagggatctagggtatcgtacactgtaagcggccaacatctgaacatcgat
cgttcgactggtgtcgtcacactagcaaagcgtttggaccgagaaacgttggattcactg
gaagtcgtcattagcgtgaccgacgagtcgattaaagactctgacgcaaatacggtgtct
ctaagaagagatatagccatcatcgatgtcaacgataatccaccagagttcctagggaga
ccatattcgtttagcgtttcagaagacacgcaagttggaaccataatatatagcaacgtg
acagttgttgataaagatataggatcgaatagtgagatttctatgacatgcattcaaaat
aatgaaccttgtgtgacatttaatctactcactgaaaaagtgtctacgggtacgtacgta
ggttctatcagattagcacgtccactggatttcgacacggtgtcatcgtataaacttact
gtgaaagcgtcagatggagggctgaaaactactctatcatccaccgcaaatattacggta
gttgtcaaggacatacaggacgaacgtccagttttcacgaactcaccatattcgattgtg
atcgacgagaatacgccagcaggcgtacaggtactaaaagtcaacgccgaagacggggac
gcgggtttgaagaggccagttgtattgagcttagaagatgattccctaggatatttcacc
atcgagaatgagtccaacggaactgcttacatattcaccagtgacaatcctatcgatcgg
gaaaacaaagtagtttctgacgctggtggtatttatacgttcagattaaaggctactgag
ctgattaacaacgaattgcctggtgacgtcagctacgagatcgttaccgtagtagttcaa
gacgtggatgacgaaaaaccagaattcaatgaaaaaagttttacgacgtcggtgtctgaa
gacattagtataggaactccattaccgggattaaatattatagtaaatgacaaggactta
ggagataatggaagatacgtattggtaatgaggactcaagactccagagtatctaattgg
tttaaaattattcccgaaacggccttgggaaggtccaccgttctgattcgtctagttgat
aacgatggatttgattacgatgcaggagtaactgatgtagaattcgatattgttgctatg
taccaagataatataagtggtggatttaaagaagcatctgcagctcacgtgcaagtcaac
gtactcgatgctaatgataatttgccaaaatttgctcaatcaacatatgcatactccata
cctgaaaattttgtacctggaacgagtatagcaaatctcactgctaccgatattgatagt
ggaataaatggcgaaatwacttacagtctacaaggttttggaatggacaagtttggtagt
gatcctgaattcggcggtatatatttgactggcaaggtcgactacgagcagcaaagttca
tattctctaacttttgaagcaaaagatggaggtaatcgttccacccacgtagttattttg
gttgaaattatagacgttaacgataatactccagtattcaattccttagaatacaaaaga
actatacgagaaggaggtactgaatttcaaccaaaattctttgttcaggcgtccgacgcc
gacagtggacttaattctatgattcgttattcggtcgccagctcaaactataacggcgtt
gtgatggtgaatccgatcagcggggagctgacattgaattctccggtaaactctagtcac
acgtctcggggtcaatatgaggtagtgataagagcgacggatctgggaataccaccttta
catgcagaagctaacatttacatcagagttggtgtgccaggaaaccagaggcccatgttc
aaaaatctcacatattccattacaataccggaaaacacaccgaggacaatggacatactg
aaagttcgagcgacygatccagatggtcctgatcatctgattgaatacagtatggtcaat
agtaacgataattttcaaatcaataaaaaaaccggagccatatctgtgtcggaacgagct
atactcgacttggactcaactggattgtcatattatcatttggttgtcatggctatggac
agtgggttgcctatcagagaggttgcacatgccgatgtgtacgtcaatgtcacggacgtg
aataataaacctccaaagtttgacgataatataagttacatagtatacgtacctgaaatc
acaaaaattggcgaagtcgtgtacaaagtaaatgccgtcgacccggataaaaatgcgtcg
atcaagtacgcgatcgttgaaccagtcagagcgaatgacaaaactggattgcctttaaaa
aacagtagctcatacaatttcaaagatgtattcagcatcaataaacttactggtgagata
aaagtaaattcgtcactcaactatcagttggcgtcggtgatcgtattaaccataagagcg
gtagacatgaacgccgttgaaaacgtccatgaacagtacgacgaggtggaaatcacattt
ttcgtgaaaccgtacctgaataaaaaccccgtgttcactaattccggatggtcggctgac
ggtgacatgtccattttaatcatacgggtggatgaagaaacgccgattggtactgaactg
gtgcagttgaaagccagggacgtgcttacgaacgagtccctttacgattttaaggctatc
acggctgtaccgagacaaattgccatggactatgctggcaaagttatacttacggaacga
ctggactatgaaacgctagaaaacaagacgttgacgtttcaagtgaaagtcaccaccgaa
gatggtgaacggtccactakcaaaactatagtgatcgaagtacaagatatcaatgacaat
agtccagaatttgaatatcccatgtatcgaacatctctcgtagaatccagtccaaaaggt
actgttgttttatcagtcagagcaaacgacaaggatttagcaacatcccaaaatggtata
atcaggtaccatctgggaggggaaaattcaaacttgtttaccgttgatcccataagcgga
gagataacagtttctggaaatggtgtaattgatcgtgaaaaaactccaattttaaaattg
atgttatttgcttccgatacgccacaaggaggtcctcatcaaaagctgtcttcagtacca
gttcatattgatgtgaaggatataaacgataatgcgcctgaatttgatacttcaatctat
attgcagtagtattagagaatgtagttcctgaaacaagtgtgttaaacgtatccgcacac
gatccggatgagggatctgcaggtttggttcattacaagctcatcgatgaacaacaactt
caaggtttcttgtacataaatccaatgaacggacaaataaagactttaaaaagattaacg
ggtaaaggtcgttctgatccgtatgaaatgaaaataagagccgaagacaatggagaacca
ggaatgttttctgatgttaagcttagtttatacatcagtgacataattgaaaatgatgga
gttccgacttttgtacatccaactgctgatgaaatcgcatatgtatctgagaatgcatct
attgggtcattagtatttagagctttggctacagatccagacgatccaaatacattggaa
ggaacaattcattatagctttttagaagaaacaaaagattcattaattttttctattgat
tcagaaacaggattaataacgactgcatccgttttagacagagaggtacaagaaaaatat
actcttgtattagtagcaagagatttaggcgatgttcctcaacagtcgacaaaaattttc
aacgttattataaccgacgtcgatgacaataaaccaacattcaatagatctatagaagaa
aaacctttaatgatggaagtagaagaagagtcaccccgcggtaccttagttggttccata
gcagcgtatgacccggatattggagataatgcattgattgattacattataacggatgga
aacgaggataatgtattttatttaaactcttcgaataatgtagctgaaataagaattaat
ggagaaattgatagagaatctgtatctgaatatgttttggcaataaaatgttttaaacat
aaaacaaaaacatacagcttgcataaatcgtacaacaaacaagatcctagtgagagactg
gtggttatcaaaatacttgatatcgatgacaatttaccgaaatttatcgatgaaaactta
actttaggcgttagggtaagcgttcctcttgatactcttgtggctacaatacaagccacc
gatgttgacaattcggcagaacaaatcacgtatcacatcacaaatctcacttatgctaat
aggcttgaaagcccaaaagagatcaaaagctggccattctttttagatcaattaagtggt
cagatcagaacaacatcttcgatggcatcctatgcagaaggttactttaacatagttgtg
gcagcgatcaatagcgacgtgcctggtcgacattccaacactacaatcaaggtgtttatt
gtaaaagatcgtggtttgttgaagtttgttttcacaagaccaccaaatattgtaggtcat
tacataaaaaaattcaaagaagacgtcgaaaaatcattagggatacctcaagctagttta
aacttatatgacactcagttttattcaaaaaatgacggaagtctagattttagtagcaca
ggttcgtgttttcagctagtgggaccaaacaattataatccaaaagatacgatatcgtta
ctcgaagaccctagcaatcatgagttaaaaaacgtgtacaagcaatacgatgttaaaaac
atcgaacgatgttccccgaaacaagtcaaatcagctgttacatgggtacagatgtcggtg
ctaggtattgcaattttcattggattcgtatcgattttgtcaatatgccttctatgttgt
tcttttaaaaaatggaaaaagttacggtaa
DBGET
integrated database retrieval system