Oryza sativa japonica (Japanese rice) (RAPDB): Os01t0601625-00
Help
Entry
Os01t0601625-00 CDS
T02163
Symbol
Os01g0601625
Name
(RAP-DB) Leucine rich repeat, N-terminal domain containing protein.
Organism
dosa
Oryza sativa japonica (Japanese rice) (RAPDB)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
Motif
Other DBs
RAP-DB:
Os01t0601625-00
LinkDB
All DBs
Position
chr01:complement(23631989..23635375)
AA seq
1128 aa
AA seq
DB search
MSKLALLLRGAAMILWLLISQTPSTCCVHARCVTGERDALLSFKASLLDPSGRLSSWQGD
DCCQWKGVRCSNRTGNIVALNLRNTNNFWYDFYDADGLNLLRGGDLSLLGGELSSSLIAL
HHLRHLDLSCNFFNGTSIPVFMGSFKNLRYLNLSWAGFGGKIPSQIGNISSLQYLDVSSN
YFFHEQNTFFMSSTDLSWLPRLTFLRHVDMTDVDLSSVRDWVHMVNMLPALQVLRLSECG
LNHTVSKLSHSNLTNLEVLDLSFNQFSYTPLRHNWFWDLTSLEELYLSEYAWFAPAEPIP
DRLGNMSALRVLDLSYSSIVGLFPKTLENMCNLQVLLMDGNNIDADLREFMERLPMCSLN
SLEELNLEYTNMSGTFPTFIHKMSNLSVLLLFGNKLVGELPAGVGALGNLKILALSNNNF
RGLVPLETVSSLDTLYLNNNKFNGFVPLEVGAVSNLKKLFLAYNTFSGPAPSWIGTLGNL
TILDLSYNNLSGPVPLEIGAVNLKILYLNNNKFSGFVPLGIGAVSHLKVLYLSYNNFSGP
APSWVGALGNLQILDLSHNSFSGPVPPGIGSLSNLTTLDLSYNRFQGVISKDHVEHLSRL
KYLDLSDNFLKIDIHTNSSPPFKLRNAAFRSCQLGPRFPLWLRWQTDIDVLVLENTKLDD
VIPDWFWVTFSRASFLQASGNKLHGSLPPSLEHISVGRIYLGSNLLTGQVPQLPISMTRL
NLSSNFLSGPLPSLKAPLLEELLLANNNITGSIPPSMCQLTGLKRLDLSGNKITGDLEQM
QCWKQSDMTNTNSADKFGSSMLSLALNHNELSGIFPQFLQNASQLLFLDLSHNRFFGSLP
KWLPERMPNLQILRLRSNIFHGHIPKNIIYLGKLHFLDIAHNNISGSIPDSLANFKAMTV
IAQNSEDYIFEESIPVITKDQQRDYTFEIYNQVVNLDFSCNKLTGHIPEEIHLLIGLTNL
NLSSNQFSGTIHDQIGDLKQLESLDLSYNELSGEIPPSLSALTSLSHLNLSYNNLSGTIP
SGSQLQALDDQIYIYVGNPGLCGPPLLKNCSTNGTQQSFYEDRSHMRSLYLGMSIGFVIG
LWTVFCTMMMKRTWMMAYFRIIDNLYDKAYVQVAISWSRLMRKNQDAA
NT seq
3387 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaaactggcgctcctcctccgaggagctgcaatgatcttgtggctactcatctcg
cagacaccatctacctgttgtgttcatgcgagatgcgtcaccggcgagcgtgatgcgctg
ctctccttcaaggcaagccttctggacccttctggcaggctgtcgtcatggcagggtgac
gactgctgccagtggaagggagtccggtgcagcaacagaactggcaatatcgttgcgctt
aacctccgcaacactaataatttctggtacgatttctatgatgctgatgggttgaaccta
ttgagaggcggtgacttgagcctattgggaggtgaattgagctcctctttgattgcttta
catcatctgaggcatctcgatctgagttgcaatttcttcaacggaacgagcatacctgtt
ttcatgggctctttcaagaacttgagatatctcaacctctcctgggcaggtttcggtggg
aaaataccttcgcaaattggtaatatttccagcttacaataccttgatgttagctcgaat
tatttcttccatgaacagaacacgtttttcatgtcttcaactgatctttcttggttgcca
cgtctcacctttttgaggcatgttgacatgactgacgttgacctcagttccgtgagggat
tgggttcacatggtgaacatgcttcctgctcttcaagttcttcgtttgtccgagtgtggc
cttaaccatactgtatctaaactatcccattcaaacctcacaaatcttgaggtccttgat
ctatcattcaatcaatttagctacacgccactccgacacaactggttttgggatctcact
agcctcgaggagctttatctctcagaatatgcatggtttgcacctgcagaacctatccct
gatagattgggtaacatgtctgccctacgtgtcttagatctaagttacagttctattgtt
ggtttgtttccgaagaccttagagaatatgtgtaatttgcaagtattgctaatggatggc
aacaatattgatgcggacttaagggaattcatggaacggttgccaatgtgctcgttgaat
tctttggaagagttgaatttagaatacacaaatatgagtggaacattcccaacgttcatt
cacaaaatgagcaatctcagcgttcttctattgtttggaaacaagttggttggcgagcta
cctgctggtgtcggagcgctgggtaatttgaaaatattggctcttagcaacaataacttc
agaggtctagtgccgcttgaaacagtaagtagtttggatactttgtatcttaacaacaac
aagttcaacggttttgtgcctcttgaagttggagcagtaagtaacttgaaaaagttgttt
cttgcgtacaatactttcagcggccctgcaccatcatggattggaacactaggtaatttg
acaatattggatcttagctacaataacctcagtggtccagtaccgcttgagattggagct
gtaaatttgaaaattttgtatcttaacaacaataagttcagcggttttgtgcctcttgga
attggagcagtaagtcatttgaaagtgttgtatcttagctacaataatttcagcggccct
gcaccatcgtgggttggagcattaggtaatttacaaattttggatctttcccacaatagc
ttcagtggacctgtaccaccagggattggatcactcagtaatttgacaacattggatctt
agctataacaggttccaaggcgtaatctctaaggatcatgttgaacatttatctcgtctg
aagtatctggatttgtcagacaacttcttgaaaatagatatacatacaaattcttctccg
ccattcaaactaagaaacgcagctttccgatcatgtcagctggggccgcgctttccattg
tggcttagatggcagactgacattgatgttcttgttcttgaaaatacaaaattggatgat
gttattccggattggttctgggtgacattttcccgagcttcattcttgcaagcatcagga
aataagttgcatggctcattaccgccaagtctagaacacatctcagttggtcgcatatat
ctcggttccaacttgttgacaggtcaagttcctcaactccctataagtatgactcgcttg
aatttgtcttcaaactttttgtcagggccattgccatctctcaaagctccactgctggag
gagctgttgcttgccaataataatattacaggcagcatcccaccatccatgtgccaattg
actggtttgaaacgtttggacctgtcaggaaacaaaataacaggagatcttgaacaaatg
caatgctggaaacagtcagatatgaccaatacaaactctgcagataaatttggttctagt
atgctcagtcttgccttgaaccacaatgaactttcaggtatatttcctcaatttcttcaa
aatgcctcacaattattgttcctggatctttcacacaacaggttttttggaagtttgcca
aagtggttaccagaaagaatgccaaacttgcaaatcttgaggttgcggtcaaatattttc
catggccatattcccaagaacattatttaccttggtaaacttcattttctggacatagca
cacaacaacatatcaggatccataccagactccttagcaaacttcaaagcaatgactgtt
atagctcagaatagtgaggactatatttttgaagagagcataccagtaatcacgaaagat
caacagcgtgactacacctttgaaatctacaatcaggtggttaatcttgatttttcatgt
aacaagttaacagggcatattccagaagaaatacatttacttattggacttaccaattta
aatttatcaagtaatcagttcagtggaacaatccatgatcaaattggtgatttgaagcag
ttggaatcccttgacttgtcctacaatgaattatctggtgaaatccccccaagtttgtca
gctctaacttctctaagccacttgaacctatcatacaacaatttatcaggcacaatacca
tcaggatcacagctacaagcactcgatgaccagatttatatatatgttggaaatcctggt
ctttgtgggcctcctctcttgaagaactgttcaactaatggtacacaacaaagtttctat
gaagatagaagccatatgagatctctctacctcgggatgagcataggatttgtgattggt
ctatggactgtgttttgcaccatgatgatgaagagaacctggatgatggcttactttcgg
atcattgacaatttatatgataaggcctatgtacaagtggctataagctggagtcgcttg
atgcggaaaaaccaagatgcagcgtga
DBGET
integrated database retrieval system