Erigeron canadensis (horseweed): 122591640
Help
Entry
122591640 CDS
T07610
Name
(RefSeq) receptor-like protein kinase 5
Organism
ecad
Erigeron canadensis (horseweed)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
LRR_1
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
Stevor
Orf78
ETRAMP
RIFIN
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122591640
NCBI-ProteinID:
XP_043619834
LinkDB
All DBs
Position
3:19834060..19837322
Genome browser
AA seq
1001 aa
AA seq
DB search
MSIIPPPLLILLSLLCYHVTSQPIANNNQNDQNTLLKIKSFWSNPTILNHWNQSSNPCSW
PEITCTDNTITRITIIKTDITGPVPPFICDIKNLTHIDLNYNYITGEFPTSLYNCTNLEY
LDLSQNLLVGRIPDDISRLSPAIRDLRLFANNFTGDIPVAISRLSKLSSLQLHQCLFNGS
YPEEIGNLNDLEVLNLGFNDFTPSRLPESFTRLKKLRTFHMTEANLIGEIPGNLSGLVAI
ELLDLSANHLVGSIPSDLFLLKNLTEVYLYYNNLTGGIPDSIEATKMQVIDLSANKLTGK
IPEGFGNLESLSNLSLMINQLSGEVPLGIGRLSSLIDIRIFENNLSGPLPPDFGRYSDLK
RFEVFQNKFTGNLPKNLCYNGKLEGLNAYQNSLSGEIPNSLGSCNSLMKIQVYGNQFSGE
IPNGLWKVSSLETMLINDNSFSGELPQEFAPKLSTLDISNNRFSGQIPTSISSWTSLRVF
KASYNRLDGAIPRNLTALPDLNTLLLDGNQLSGEIPATIVSWSSLNTLNLSRNKLTGQIP
AGLGFLERLTVLDLSRNNLSGQIPSQLGRWLVVLDLSANDLTGSIPSQLENGAFDRSFLD
NPRLCSNNPSLGLNSCISRTKSGSSSKISAKNVMIIAVIAAILFLLAVLLTAYVIVLYRR
RKYNLDSKWRFTSFQKLTFTESTILPRLTESNVIGHGGSGKVYRIPVNRLGDFVAVKKIS
TKIDLEQRLEKEFLAEVEILSTIRHSNIVKLMGCISCDNSKLLVYEYLENRSLDRWLHRK
QTQSNRGLTGSIRHVVLDWPKRLQIALGAARGLSYMHHDCIPAVVHRDVKSSNVLLDGDF
NAKIADFGLARILAKDSELNTMSTVAGSFGYMAPEYAHTTRVDNKIDVYSFGVILLELTT
GKEASNGSEHSSLAEWAWQEALSGASISAALDDEVNEPKYSNTMSSVFKLGLWCTSRLPT
NRPSMKEVCQTLLRCSLAMEEKMKNGSDVLDHLPLLKLENV
NT seq
3006 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaataataccaccaccccttctcatcctcctatccctcctatgctatcatgtaact
tcacaaccaattgccaataataaccaaaatgatcaaaatacccttctaaagatcaaaagc
ttttggtccaacccaaccatcctcaaccattggaaccaatcctccaacccttgcagctgg
ccggagatcacgtgtaccgacaacacgattactaggatcacaataataaaaacggatatc
actggacccgttccgcctttcatttgtgatattaaaaacttgacccatattgatttaaat
tacaattacatcacaggagagtttccaacatctctctataactgcacaaatcttgaatac
cttgatttgtctcaaaacttgttagtgggacgaatccctgatgatatatcgcggttatca
cctgcaatacgagacctcaggctctttgccaacaacttcactggtgacattccggtggcg
atttcaagattatcaaagctttcatcacttcaactgcatcaatgtctatttaatggaagt
tatccagaggaaatcggaaatttaaacgaccttgaagtgctaaatttgggttttaatgac
tttacaccatcaagacttcccgagagttttactcggttgaaaaagcttcgaactttccac
atgacggaagccaacttaataggagaaatacccggaaacttatccggcttggtggctatt
gagctgctagatttgtctgccaatcatcttgttggatcaataccgagtgatttgttcttg
ttaaagaatttaacagaagtttatctttactataacaatctaacaggtggaattcctgac
tccattgaagcaacaaaaatgcaggtcattgatctctctgcaaacaagttaactggaaaa
atcccagaaggttttgggaatcttgagagtttgtctaacttgtcgctcatgataaatcag
ttatcaggtgaagttcctcttggtatcggccgcctgtctagcttgattgacattcgaatt
tttgagaataacctatcgggtccactgccacctgattttggaaggtactctgacctgaaa
agatttgaagtattccaaaataagttcacaggaaacttaccaaagaatctttgttacaat
gggaagctcgaaggcttgaatgcttaccagaatagtctttcaggtgagataccaaattca
cttggaagttgtaacagcttgatgaaaattcaagtttatgggaaccagttttcaggagaa
atccctaatggattgtggaaggtttcaagtttagaaacaatgctaattaatgataactca
ttttccggggaactgccacaggaattcgcgccaaagttatcaacacttgatattagtaat
aacagattttcgggtcaaattcctaccagcatatcctcttggacaagtctaagggttttc
aaagcaagttataatcgactagatggcgcaattcctcgaaatttaacagcacttccagat
ttaaacaccttgttgctggatgggaaccaactctccggcgaaattccggcaactattgtc
tcctggagttcactcaataccttaaatctcagtaggaacaagctaactggtcagattcca
gctggtctcgggttcttagaacgtcttacagtgttggatttgtcaagaaacaatctttcg
ggtcaaataccaagtcagctcggtagatggctcgttgtgcttgatctttcagccaatgat
ctcactggaagcatcccgagtcagctcgaaaatggtgcttttgatagaagttttctggat
aatcctcgtctttgttcaaataacccatcattaggcctcaattcttgcatttccaggacc
aaatccggatcatctagcaagatttcagctaaaaatgtgatgattattgcggttatagca
gcaatattgttccttttggcagtactactgacagcatatgtcattgttctttaccgccga
aggaagtataatttggattcaaaatggagattcacttcattccagaaactgactttcaca
gaatccacgattttgcctcgtttgacggagagcaacgtcattgggcatggtggttcagga
aaggtgtatcggattccagtgaaccgattgggcgattttgttgcggtaaagaagatttca
acgaaaatagacttagaacaaagactcgaaaaagagttcttagcagaagtagagattcta
agtacgatccgtcactcaaacatagtcaaattaatgggatgcatttcatgtgacaactca
aagcttcttgtgtacgagtacttagagaaccgaagtttggatcgttggttgcaccgaaag
cagactcaatcgaaccgtggattgaccggttctattcgccatgtggtgcttgattggcct
aaaaggttacagatagcacttggagcagccagaggtttgtcttatatgcaccatgattgt
attccggcagtggtccaccgggatgtgaagtcaagcaacgtgcttttagatggtgatttc
aatgccaagattgctgatttcgggttagccaggatcttggccaaggacagtgagctaaac
acaatgtcaaccgtggctggttcattcggatacatggctccagaatatgcgcatacgact
agagtggacaacaagattgatgtgtatagctttggagtgatcttgttagaattgacaaca
ggaaaagaggccagcaatggcagtgagcattcatcactggccgaatgggcttggcaagaa
gccctaagtggtgcatcaatatcagctgctttagatgatgaagtgaatgagcccaagtac
tcgaacaccatgagcagtgtatttaaacttgggctatggtgtacaagtagattgccaacc
aacagaccctccatgaaggaagtatgccagacgctgctacgttgcagcctggcaatggaa
gaaaaaatgaagaatggaagtgatgtacttgatcatcttcccctcctcaagcttgaaaac
gtctaa
DBGET
integrated database retrieval system
