Empedobacter falsenii: FH779_02335
Help
Entry
FH779_02335 CDS
T06702
Name
(GenBank) T9SS type B sorting domain-containing protein
Organism
efal
Empedobacter falsenii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
IgGFc_binding
CHU_C
Big_9
SprB
DUF2850
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLL56996
UniProt:
A0A7H9DPZ5
LinkDB
All DBs
Position
483135..486479
Genome browser
AA seq
1114 aa
AA seq
DB search
MKRYLLIIFLFFNIIQSFAQLDTKHWFAPMVDRTGNPYPSQRIYLSTNRTTPFEVKIYNN
NLVVGNVTISKGNPGYFVIPRNLIITSDVADLYKPVKMGLYLEADYAYFANLRFSVANHA
EIITSKGRAGIGDLFYTVMAPITTYNDILNFMTSVLATEDNTVVKISNFNPNIIFSDGVK
RSEFNITLNKGESYIIEGGGNYQVNYEGFIGAKIESDKPISVTNGNFNGQYAGYYPNASD
ILMDQNVPVQQLGKDFVLVKGNGAVGQNMEGAIVVATKDNTEIYVNNESVPLVTINEGEY
FVVKDYKYINQGKDHYNLFIQTTEKAYVYQLLAGSENASTEATGGMNFIPALNCFLPKSI
DEIGLIDENPILYTNNNQGGITKIPTKLNLITEKGAVVTVNGSVPNSNYGPFNLTGTTDW
VTYGIPDVKGNITIKSDKAITGGITAGSDAAGYGGFFAGLPTKPKIVAEGCFPDVTLTVT
PDIYETYQWFEDGVAIPGATEVTFKPTRLGNYSVEVTIGTCPPLKDEYKLRTCPDESELE
FETCGVAPIHITPKFTKSAQTINFNETKIVENPSKGVVTINTVKGIITYTPNKGQKGYDE
FKYIIYGSDKFEDSEIVTVKILINELIVNNATVYACNVNGKGIFDLSDANVTSDPDVTKN
YYPTKEDAENEVNEIIDFEHYESTNKKVYVVVKNKTGCKEIAEIQLEFFPFPQIDLTKYQ
TTYCGSKMNIKLDEIIRQIFSNRELFTVKYYLNEQDALDGNTNTISSQNIFTADTKVYVR
IETLKGCQPEIITLEFKFGEKVKLNQEVLDVDVCDNDFDGVYTFNLNDYVLVNFVNDYNY
DYKFFETFDDAENNINSINSNQVVNRNKTFYVRFEKAGLCFSIAVINTFVSVPEYSSTLK
DVKICPNTKTILDAGDNYLDYKWSTGETTQTIEVGVGDYWVELLSKEGCPYVHNVNVSHF
QLPNIVMIKTVNGRAEIIVEGGTPPYKYSLNGVDWQSSNVFEPLKEGNYTVYVISADNCT
PVTKDFFVNLIPNFISPNNDGYNDSWRAQFLGYKNAIVQIFDRYGAIIKDEVVNDEYIWD
GKKNGFTVPSDSYWYRIKLNDKEIITGYITVKNK
NT seq
3345 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagagatatttacttattatatttttattttttaacataatccaatcttttgcacaa
cttgatacaaaacattggtttgctccaatggttgatagaactggaaatccatatccaagt
caaagaatatatttatctacgaatagaacaacgccttttgaggttaaaatctataacaat
aatttggttgtaggtaatgtaacaataagtaaaggaaatcctggttattttgtaatccca
cgaaacttgataattacttcagatgtggctgatttatataaacccgttaagatgggattg
tatttagaagcagattacgcttattttgcgaatcttagattttctgttgccaatcatgca
gaaattattacttctaaaggtagagctggaataggagatttgttttatacagttatggct
cctataacaacgtacaatgatattttgaactttatgacaagtgttttagctacagaggat
aacactgttgtgaaaatttcaaatttcaatcctaatattatttttagtgatggagtaaaa
aggagcgagttcaatattactttgaataaaggtgaatcctatattattgaaggtggcgga
aattatcaagtgaattatgaaggttttattggtgctaaaattgaatcagacaaacctata
tctgtaacaaatggtaattttaatggacaatatgctggttattatccaaatgcatcagat
atattaatggatcaaaatgttccagttcaacaattgggaaaagatttcgtattagtaaaa
ggaaatggagctgttggacaaaatatggaaggagcaatagtggtcgcgactaaagataat
acagagatttatgtcaataatgaatcagttccattagttactataaatgaaggtgagtat
tttgtagttaaagattacaaatatattaatcaagggaaagatcattataatttatttatt
caaacaactgagaaagcctatgtttatcaattattagctggatcagaaaatgcatcaaca
gaagcaacaggcggaatgaattttattccagcacttaattgttttctaccaaaatcaatt
gatgaaataggtttgatcgatgaaaatccaattctttacacgaataataatcaaggagga
ataactaaaatacccacaaaacttaatttgattactgaaaaaggagctgtagttactgta
aatggttcagttcccaattcaaattatggtccttttaatttgacaggtactacagattgg
gtgacatatggaatacctgatgttaaaggaaatattacgatcaaatcagataaagcaatt
acaggaggaattacagctggaagtgatgctgctggatatgggggtttttttgcaggatta
ccaacaaaaccaaaaatcgtagcagaaggatgttttcctgatgtaacattaacagtaaca
ccagatatatacgaaacatatcaatggtttgaggatggggttgctattccaggagcaacc
gaagtaacttttaaaccaacaagattaggaaattattcggtagaagttacaataggtact
tgtccgccattaaaagacgaatataaattaagaacttgtcctgatgaatcagaattagaa
tttgaaacatgtggagttgctccaattcatattactccaaaatttacaaaatctgcccaa
acgattaatttcaatgaaaccaagatagtagaaaatccttcaaaaggagtcgttacaatt
aacactgtaaaaggtattattacttatacgccaaataaagggcaaaaaggttatgatgaa
ttcaaatatataatttatggatctgataaatttgaggatagtgagattgtaacagttaaa
attttgattaatgaactcattgttaataatgcaacggtctatgcgtgtaatgtaaatggt
aaaggtatttttgatctatctgatgcaaatgtaacttctgatccagatgtgacaaaaaat
tattatcctacgaaagaagatgcagaaaatgaagtgaatgaaataatagattttgagcat
tatgaatctacaaataagaaagtttatgtagttgtcaaaaataaaacaggatgtaaagaa
attgccgaaatacaattagagttttttccttttccacagattgatttaactaaatatcaa
actacatattgtggaagcaaaatgaatattaaacttgatgaaattatccgacaaattttt
tctaaccgagaattgtttacagtaaaatattatttaaatgagcaagatgctttagacgga
aatacgaatacaatttcatctcaaaatatatttactgctgatacaaaagtgtacgtaaga
attgagacattgaaaggttgtcaaccagaaattattactttagaatttaaattcggtgaa
aaagtaaaacttaatcaagaagttttagatgtagatgtttgtgataacgattttgatgga
gtttatacattcaatttgaatgattatgttttagtaaattttgttaatgattataattac
gattataagttttttgaaaccttcgatgacgctgagaataacataaattcaattaattct
aatcaagttgtaaatagaaataaaactttttatgtgagatttgaaaaagcaggtttatgt
ttttctattgctgttattaatacttttgtatctgttccggaatactcatcaacgctaaaa
gatgtgaaaatatgtcctaataccaaaactattttagatgcaggagataattatttagat
tataaatggagtacaggtgaaacaacacagacgattgaggttggggttggagattattgg
gtagaacttctttcaaaagagggatgtccatatgttcacaatgttaatgtttctcatttt
caattaccaaatattgtaatgataaaaactgtcaatggacgtgcagaaatcattgtagaa
ggaggaacaccaccatataaatactcattaaatggtgtagattggcaaagttcgaatgtc
tttgaacctttaaaagaaggaaattatactgtttatgtaatttcggctgataattgtact
ccagtaacaaaagatttttttgtaaacttaattcctaattttatttcacctaataatgat
ggttataatgatagttggagagcacaatttttaggttacaaaaatgcaattgttcaaatc
tttgatcgatatggagcaattataaaagatgaagttgtgaatgatgaatatatttgggat
ggtaaaaagaatggttttacagttccttctgatagttattggtacagaataaaattgaat
gataaagaaattattacaggctatataacagttaaaaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
