Elaeis guineensis (African oil palm): 105053037
Help
Entry
105053037 CDS
T03921
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600-like
Organism
egu
Elaeis guineensis (African oil palm)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
TPR_19
ATP13
AEP1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105053037
NCBI-ProteinID:
XP_010932343
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(33480633..33483754)
Genome browser
AA seq
620 aa
AA seq
DB search
MAHLYPYRSQSLLKSCPNLRIGQSVHADVTKRGYDPNPFVRAQVISMYSGYGSPRDVRKL
LDEMTETNAVMWNVAISRFFRAGDCSGAREIFDGMPSPNGVTWSAMIAGYAQNGRPRDSF
LTFWRMRRREDLCSLVNPNIIAAVLSACARLKDLALGEQVHGYAAKIGTYTETDAFVGAA
LVNMYGRCGSMGPARLAFDSMVSKSVVAWSSVIANYVRCNNFSSAVEVFKEMIRSGAVPN
NVTLTTMISACSDISCLFYGKELHGAVVRRTAEKADIFVSTALIDMYGKCGSMSYACRVF
QFDGSFLGCCPIPMWNAMISGYVANDQFDDAFCLVRSMGRSLRSGALLNSVTMATILPVC
GKSASLLYGKELHCYALKYGLDKEVVVGNGLLDMYCKCGKVNSAKNQFDMMIEKNAISWT
TLIDGYGIQGDGYAAIEVFESMVREEKVEPDHVTFVALISACSHSGLVEEGLRYFELMTR
EYGIIPTEENYGCLVDLLARAGHIDEAMNVIRKLPIEPSSNVWGALLGACRIHGNVDGAE
LAMHHLLELEPDRSGFQKLLSKIYAQMGRLDGAQNVCKEMIALGAARRLGCSWLDKPFRF
ITKKTWQTNPSLNSVDTEIS
NT seq
1863 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctcatctctacccataccgcagccagtcactcctcaaatcatgcccaaatctccga
atcggccaatccgtccacgctgatgtcacaaaacgtggctacgaccccaatcccttcgtg
agggcccaagtcatctcgatgtactcggggtacggttctccgcgcgacgtccggaaattg
ctcgacgaaatgaccgaaacgaatgctgtcatgtggaacgtggctatctcgcgcttcttc
cgtgcaggcgactgcagtggagcacgagagatcttcgacgggatgccatcgcccaatggc
gtcacatggtctgccatgattgcagggtatgcgcagaacggccgtcctcgtgattctttt
cttacgttttggagaatgagaagaagagaggacttatgttctctggtgaatcctaacatt
attgctgctgtcctttcggcctgtgcgcggttgaaagatcttgctcttggcgagcaggtg
catggatacgcagcgaagatcggcacatatacagaaaccgatgcatttgtgggagccgct
ctcgtcaacatgtatggtagatgcggcagcatgggacctgctaggctggcttttgactcc
atggtctcgaagagtgtggtggcttggtcttcagtcattgcaaattacgtgcggtgtaat
aatttttcgagcgccgtagaggtcttcaaggagatgattcgtagcggtgccgtaccgaat
aatgtgaccctgaccaccatgatctccgcatgctcagatatctcttgtttgttctatgga
aaggaattgcatggagctgtggttcgaagaacagcagagaaggccgacatatttgtatca
actgcattgatagacatgtatggtaaatgtggttccatgtcctatgcttgtcgggttttt
caattcgatggaagttttttgggttgttgtccgatcccaatgtggaatgccatgatctca
ggatatgtagcaaacgatcaatttgatgatgctttctgtttggtccgatccatgggtagg
tcattgagaagtggagcattgttgaactctgtaaccatggcaactatccttcctgtttgt
ggtaaatctgcgtcactgctttatggcaaggaacttcattgttatgctctaaagtatggg
ttggataaagaggttgttgttggcaatgggcttttagatatgtattgcaagtgtgggaag
gtcaattctgcaaaaaatcaatttgatatgatgattgaaaagaatgcgatctcatggacc
acactgatcgatggctatgggatacaaggtgatgggtatgctgcgatcgaagtttttgaa
agcatggttagagaggaaaaagtggagccagaccatgtcacttttgtggctctcatctct
gcatgtagtcattctggtctcgttgaggaaggtcttagatactttgaactgatgactcga
gagtatgggatcatacccactgaagaaaattatggatgtttagttgatctcctggctcga
gctggacacatcgacgaggctatgaatgtcatcaggaaactgcccatcgagccaagttct
aatgtttggggagccttgcttggagcttgcaggattcacgggaatgttgatggagcagag
ttggcaatgcatcatctgcttgagcttgaaccagatcgaagtggcttccagaagttgttg
tcaaaaatatatgctcagatgggaagattggatggtgctcagaatgtgtgcaaggagatg
attgcattgggtgcggctaggaggcttggttgtagttggttggataaacccttccgtttc
atcacaaagaagacatggcaaacaaatccatcgctcaacagcgtggatacagaaatttca
tag
DBGET
integrated database retrieval system