Erysipelothrix rhusiopathiae Fujisawa: ERH_1099
Help
Entry
ERH_1099 CDS
T01525
Symbol
uvrC
Name
(GenBank) excinuclease ABC, C subunit
KO
K03703
excinuclease ABC subunit C
Organism
erh
Erysipelothrix rhusiopathiae Fujisawa
Pathway
erh03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
erh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
ERH_1099 (uvrC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
erh03400
]
ERH_1099 (uvrC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
erh03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
ERH_1099 (uvrC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrC_RNaseH_dom
GIY-YIG
UVR
HHH_5
HHH_2
GIY_YIG_2
FtsQ_DivIB_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK32154
LinkDB
All DBs
Position
complement(1182708..1184480)
Genome browser
AA seq
590 aa
AA seq
DB search
MTHSTIEEKLKRLPMEPGCYLMKNKNGEIIYVGKAKKLKNRVSSYFTGAHDHKTTRMVRQ
IDDFDFIITSTEKESLILEINLIKEHRPQFNIIFMDDKSYPYLKIPREGKPEVLVARDRK
QSKQFHYFGPYPDATAARDMARLLNDSVPTGDTLLPNTLAIYSAFNRTGKRYTPEELNVW
RQNVMSILNGNIKPFKDELERKMLEASQSLNFELAQVYKEKLHALDYIGDKQQVQFSLNE
RFDLFHFAYYQGYIAIVGLFVRGGRLLERSMAVEACMEEPLDAFVSFIAQFYENQPVPKT
IYVPDLVNAEELGDVLDAEVKVPLRGKKKTLLEITQKNAQQQLDDQFSILRERQQFKDEA
LRDLSAALGMSSIIHRIEVFDNSHISGAFAVSACVVYDDGEPNKNQYRRYKLHQGNDDVA
SMKEVLYRRYFRLMRESKPMPDLILVDGGKPQLNAALEVLSDLELDLRVCSLVKDDRHRT
HALMREDGTLITINKTSSLFNFLMQMQDEVHRFVITYHRNLRKKAMTRSILDEVSGLGKV
RQKELYKKFGSLKNIRAASLETLQTVLPEDVAGDLYDILHIDWNDYHEKN
NT seq
1773 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacacactcaacaatcgaggaaaaacttaaacgtttgcccatggagccgggttgttat
ctcatgaaaaataagaatggtgagattatctatgtcgggaaagcgaagaaattaaaaaat
cgcgtaagttcctattttacgggtgcccatgatcataagacaacacgtatggtacgtcaa
attgatgattttgactttatcattacaagtacggagaaagagtctttaattctagaaatt
aatttaattaaagaacaccgacctcaattcaatatcatttttatggatgataagtcgtat
ccatatttaaaaattccccgagaaggaaaaccggaagttttggttgcgcgagatcgtaaa
caatccaagcaatttcattattttggtccatatcctgatgcgacagctgcacgtgatatg
gcccgtcttctaaatgactcagtgcctaccggagatacattattacccaatactttagcc
atttacagcgcatttaatcgtactggtaaacgttatacaccggaagaactgaatgtttgg
cgtcaaaatgtgatgagtattttaaacggtaatataaaaccgtttaaagatgagttagag
cgaaagatgcttgaagcaagccaatctttaaattttgagttggcacaagtctataaggaa
aagctacatgctttagactatattggtgataaacaacaagttcaattttctttaaacgaa
cgatttgatttgtttcactttgcctactatcaagggtatattgcgattgtaggtctcttt
gttagagggggtcgcttgttggagcgaagcatggcggttgaggcatgtatggaagaaccg
cttgatgcttttgtttcttttattgcacaattttatgaaaaccaaccggtacccaaaacg
atttatgttccagacttagtgaatgcagaagaattgggcgatgttttggatgctgaggtt
aaagtaccattgcgtggtaaaaagaaaacacttttggaaattacacaaaagaatgcgcaa
caacaacttgatgatcagttttcaatccttcgtgagcgtcaacaatttaaagatgaggcg
ttaagagatttaagtgctgctttaggtatgagttcgattattcatcgtattgaggttttt
gataactcgcatatttccggtgctttcgctgtttctgcctgtgttgtttatgatgatggt
gaaccgaataaaaaccaataccgtcgctataaattacatcaaggtaatgatgatgttgct
tctatgaaagaagtcttgtatcgtcgatattttcgtcttatgcgggaatcgaaaccgatg
ccggatttaattttagttgatggtggtaaacctcagcttaatgcagcgttagaggttctc
agtgatcttgaacttgatttgagggtttgttccttggttaaagatgatcgacatcgtacg
cacgctttaatgcgtgaagatggaactttaattacaattaataaaacaagttcgctcttt
aattttttgatgcagatgcaagatgaagtgcatcgatttgtaataacgtatcaccgtaat
ttacggaaaaaagctatgacacgctcaattcttgatgaagtaagtggattgggaaaagta
agacagaaagaactctataagaaatttggctctttgaagaatattcgcgcggcgtcttta
gaaacgcttcagacggttttacctgaagatgttgcgggtgatttgtatgatatactacat
atagattggaatgattatcatgaaaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system