Flavobacterium channae: LOS89_10775
Help
Entry
LOS89_10775 CDS
T08502
Name
(GenBank) T9SS type B sorting domain-containing protein
Organism
fcb
Flavobacterium channae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Ig_2
Ig_7
Glyco_hydro_92
PKD_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UGS23234
LinkDB
All DBs
Position
2317665..2321270
Genome browser
AA seq
1201 aa
AA seq
DB search
MMKKTVSILLICFLFLSYNLYSQGGASSCAQLAANPTAYQSCATNVPFSSSVGGNSESFN
SSCIPTQYVGPTWFFIEIDTPGNVVLQISQRNLSGVGTDVDFVLWGPFQNLNNICSQLIP
ANEVDCSYLPDAVETVNIPNSSAGDLYVIVIDNYSGQPGNITVSQTGGTGSTNCDFLSSV
TLNNTDGSLLTTLDYCKPDTKEIVATIDITDFPGSPSNLRFNYTWYKDGVQISTVSNSTS
ATNSITVTESGIYKVVTTAYDITVNPSGNTTGLRESEATADLKFHVKPDVSITNTNTVCL
NTNPILSSTIINNADLDSTVDVLNYQWYRNNVLVNGATTNSFTPTLPGDYFVRVSNLPCS
VTDSNVIRIIANPNVQISSNTTICENDSYTITSSNTNAGINSGLSYQWFKDGVAILGATN
AAYIVNKFNQALNTTSQYYLETTEQGTCNNISNTVSITINAQPIINTALTTLEQCDYINN
TLDGIAETNLLQLYNYFTNNTPGLTLYFYSDIALTQLINNPSNYINTSSPFTQNIYVKAV
NENVVPNCTSAGIGNFVLQINPTSVANYPDIPAVCPELNQNFGFINFDAQRVLIKNTYFP
SSDVSISFHLTTSDASTGLNGLTNASQIPVGTTLIYTRVISNTTQSCEGIGTFNVVVIQA
PLQNTINNESLCLLDSYLLNSKDGEALAGQNPTVVASYFNTFDNARDNVLVINKNVSLPL
TLGTRTIFVRLFDSLTGCFSVVSSNITVFPNPTIIQPSPIRHCGDTTAAFDLNSRINQIT
NGNTNYQVTFYANNADLVANNPIATPDSYTSATATIICKVVDPTNFSCAATTTLNLVVMS
LPGSNSNPTPIELCNDSGFEYFDLTTRELQMAGATPVNTIAFRYYKELVDALANGNANRI
SNPNNFLNTTINFQKIYVRLNSRTNIDSETGESCFKILELDLHVRPYPFNHLLNEPYTIC
IDQLNNITYPVEIKTQLNSTDYIFQWFNGHDAIPGNEISGETNSSFVTSTVGLYSVQVTN
ISNAANCSSIFNLSTANSIVPNSLTITPDELIAFDTENTVTAIVAPASPDYLYSIDGTYF
QESNVFTNIPGGDYTLTVINKFGCGVLTETFTIVDYPNYFTPNGDGHNDTWNIKGSAALD
AAVIRIFDRYGKLMKQIDPNGNGWDGTFNNKPLPSTDYWFTIEYTKDNVTKEFKGHFSLI
R
NT seq
3606 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaaaaaacagtttctattttattaatttgctttctattcctgagctataacctt
tatagtcaaggaggagcgtcttcatgtgctcaattagcagcaaatccaacagcctaccaa
tcttgtgcaacaaacgttccttttagcagttctgttggaggaaatagtgaaagttttaat
tcaagttgtattcctacacaatatgtaggaccaacttggttttttattgaaattgacact
ccaggaaatgtcgtattacaaattagtcagcgaaatttaagtggcgttggtactgatgtt
gattttgtattatggggtccttttcaaaatttaaataacatttgtagtcaacttattcct
gctaacgaagttgattgtagttatttacctgatgctgttgaaacagttaacattccaaac
agtagtgcaggtgatttatacgttattgtaatagataattattcgggacaaccaggaaat
attaccgtatcgcaaactggaggaactggaagtacgaattgtgacttcctttcttcggta
actttaaataatacagatggttctcttttaactactttagactattgcaaacctgacact
aaagaaattgtcgcaacaattgacattactgattttccaggatcaccaagtaatcttaga
tttaactatacttggtataaagatggtgttcaaataagcacagtttcaaattctacgtca
gcaacaaatagtattacagtaactgaaagtggcatttataaagttgttactacagcatat
gacattacggtaaatccgagtgggaatacgactggattaagagaaagtgaagctacagca
gatttaaaattccacgtaaaaccagatgtaagtattaccaatactaatacggtttgttta
aatacaaacccaatattatcatctacaattataaacaatgccgatttagactcaactgtt
gacgttttaaattatcaatggtatcgcaacaatgtattagtaaacggagctactacaaat
agcttcactcctactttacctggtgattattttgtaagagtaagtaatttaccttgttct
gtaaccgattcgaatgtaatccgaataatagcgaatccaaatgttcaaatttcatctaat
actactatttgtgaaaatgacagctacacaattacttcatcaaatacaaatgcaggaatt
aatagtggtttaagttatcaatggtttaaagatggtgttgccattttgggcgcaacaaat
gctgcttatatagtaaacaaattcaatcaagctctaaatacaacttcacagtattattta
gaaacgactgaacaaggaacttgtaataatatttccaacactgtttcaattactattaat
gcacaaccaataattaatactgctttaacaactttggaacaatgtgattacatcaacaat
actctagatggaattgcagaaaccaacttattacaattgtataattattttactaataac
actcctggattaactctttatttttattcagatattgcgttaacacagttaatcaacaat
ccttcaaactacattaatacaagttcaccttttacacaaaatatttatgtaaaagcagtt
aatgaaaatgtagttccaaattgtacttcagctgggattggtaattttgttttacaaatt
aatccaacaagcgttgctaattatcctgacattcctgctgtatgccctgaattgaatcaa
aatttcggcttcatcaattttgatgctcaacgtgttttaataaaaaatacatatttccca
agttctgatgtatcaatttcgtttcatttgactacttcggatgcttcaacaggattaaac
ggactaacaaatgctagtcaaattcctgttggaacaactttaatttacacaagagttatt
tcgaacacaacacaaagttgtgaaggaattggtacatttaacgtagttgtaattcaagcg
ccgttacaaaacacaataaataatgagtctttatgtcttttagattcgtatttattaaac
agtaaagatggagaagcacttgctggacaaaacccaacagttgtagcttcttatttcaat
acttttgataatgcacgtgataatgttttagtaattaacaaaaatgtttcactaccatta
actttaggaactagaacaatatttgttcgtttgtttgattctctaacaggatgtttttca
gttgtaagttctaatattacggttttcccaaatccaacaattatacagccttctccaatc
cgtcattgtggagatacaactgctgcttttgatttgaatagtagaattaatcaaataaca
aatggcaacactaactatcaagtaactttttatgcaaataatgccgatttagtagcaaac
aatccaattgcaacacctgatagctatactagtgcaactgcaacaattatttgtaaagtt
gtagatccaactaacttttcatgtgcggcaactactactttaaatttagttgtgatgtca
cttcctggaagcaattcaaacccaacaccaattgaattatgtaacgattctggctttgaa
tattttgatttaacaactagagaattacaaatggctggtgctacaccagttaacacaatt
gcttttagatattacaaagaattagtggatgcattagcaaatggaaatgcaaacagaatt
tctaatccaaacaactttttaaatacaactattaacttccaaaaaatatatgttcgtttg
aacagtagaacaaacattgatagcgaaaccggtgaatcttgttttaaaattttagagtta
gatttgcatgtaagaccttaccctttcaatcatcttttaaacgaaccgtatacaatttgt
attgaccaactgaataacattacttatccggttgagattaaaacgcaattaaacagtacg
gattatatttttcaatggtttaatggacacgatgcaattcctggaaatgaaattagtggt
gagaccaattcttcttttgtaacatcaactgtaggattatattctgttcaagttactaat
atttctaatgctgcaaactgttcgtcgatattcaatttaagtacagcaaactcaattgta
ccaaattcattaactattacaccagatgaattaatagcttttgatacagaaaatacagta
actgcaattgttgcccctgcatcacctgattatttatattcaattgatggaacttatttc
caagaaagcaatgtgtttaccaatattcctggtggggattacaccttaactgtaatcaat
aaattcggatgtggagttcttactgaaacgtttacaattgttgattatccaaattacttt
acaccaaatggcgatggacataatgacacttggaatatcaaaggaagtgctgcattagat
gctgctgtaattcgaatttttgatcgttatgggaaattaatgaaacaaatagacccgaat
ggtaatggttgggatggtacttttaacaacaaaccacttccttcaaccgattattggttt
acgattgaatacacaaaagacaatgttactaaagaatttaaagggcattttagtttaata
agataa
DBGET
integrated database retrieval system
