Fragilariopsis cylindrus: FRACYDRAFT_189284
Help
Entry
FRACYDRAFT_189284 CDS
T04784
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fcy
Fragilariopsis cylindrus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PqiA
AHH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
OEU13821
JGI:
189284
UniProt:
A0A1E7F6L2
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1506 aa
AA seq
DB search
MRLSLLILLFHVFIVGTSSSTTLASKANAEEKEIQFEGGLSNQIIAGRRIQDTTVNNLDD
SSTSTTSSDDFDRLNELLENVVIGIDDDMTISEKVGFINLDMVVESLRCRDIRIGDIVLN
HSTDESETTTTVIDVDLALNGVDAACDIEYKYEYGFLKGSGTAEIVTKGNAADTSMRFIT
SNDSPVTFSVTNCIVNVEISDVNFKDADFASSLIGIFEKPLRDLFEKEIEGYACTELSTS
GVTFLNDDLFLMIGNTLEGYTTSVDDTGLFDESTLFPDNYDINQALNFRQISETQIGTLF
NRALSELDQLLGNGSGSGNDNDNDNELGINNVLRSYVLDENKALVVNVEQLLGMDGINLA
LHDNFTETNISLEEVRIYGLDSMTKFDPLVIFGNYTLQNEFSWEFLQIEIDLSVDIQPSS
LETSILKDSTDDGSVQKGITEDITIKFGAENIDVTASIFALIDVEALGGLTIGSLLSLTN
TEDYSWLLPCLTSSIRALQFTELKLSAEQIQVPTLEGFVDDGLDRVISNIAELAFDMYRD
ILVEDVLPNVFQNTVKNFVNDQIATILVGEDDSSNACPDYDEISAGDSDLYVDFREFFDS
SFSTTSNEYGEVPSILRSLMDKQLLETDPSTGMPKINEVLIDSLTRGQSGTEGTLIFDGD
GTDLFSIKQRINVGGLDADVRISSRYVKIENLDTIMSPLMLLEPVSTEPYFLNNSVTIGT
EERPVKLSTNFAFAIIDEVGGTEISNEIDISLDMYTANVLMTLMLKVAKSKLLGFPLVDM
FDPYCWIATIPPPTLNEQGVSVDDEIMAAVVDFAASVANLNLNLNCVQCSSPGIIELTAT
LTSSGEAQNDVTDLVNLLLLPFVTDLIKGDVLQVQIDRLLNDADKKCRHSPNYDPNFRQL
NYASFELPEAEASTTYLMLLGVVSAALLLLVAVLALSIRYFTQRRHTRWLLMLPVEQLEA
LKQIQRSEDSLQLALNSTTRSMFQSDKDIPFLIRYGMPVIILGNIGLFLSGHLSLGATVN
IEAQIAGETISVDKFFEFSMAKSTIDIWMAGGEELAILILVFSGIWPYTKQLMTLALWFT
PTSWVPISRRGSILIWLDRLAKWSMIDIFVLIISLAAFRVSVNSPSNVAFLPDNFYSLDL
LVVPLWGLYANLIAQLVSQISSHFINHYHRRIENNALDAYDDQHSTYRPPKTSENSDRNV
TFRTHRFGRPHRGETEKLVVRNWVNHVLIFAVMVLIACIIAGCILPSFSVEVFGLLGVAV
ESGQEFRDANTNHSVFTVIKMLFEEAQFIDTIRSYIGLVSFSVVFALTVLVVPILQSIAL
LVLWFIPMTTKQQTKISVLVEILQAWQYVEVYIIAVFVASWQLGPISSFMVNSYCGSLDG
FFSELVFYGILKDEDAQCFSVLSSIEGGFYVLAAGAILLVLVNSFVTKATKQYSRDQVEL
YRQSPSEDHTEELEDGKEIDVDNADTTIHPVPVLFTDTFRWLLKRDEDKGTNCHDSSRQD
PSSTAN
NT seq
4521 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagattatctttgttaatactattatttcatgtatttattgtagggacctcgtcctca
accaccttagcttcgaaagcaaacgcagaagaaaaagaaattcaattcgagggcggttta
tctaaccaaataatcgcgggacgacggattcaggacactacagtcaataatttagatgat
tcctctactagtaccacctcctccgatgatttcgatcgacttaatgaattattggaaaat
gttgtaattggaatcgacgacgatatgacgatctctgaaaaggttggtttcatcaaccta
gatatggtagtagaaagtcttcgttgtcgtgacataagaataggtgatattgtattaaac
cacagcactgatgaaagtgagacaactactaccgtcatcgatgtcgaccttgctcttaat
ggggttgatgctgcatgtgatattgaatacaaatacgaatacggattcttgaagggttct
ggaacagcagaaattgtaaccaaggggaatgccgctgatacttcgatgagatttattact
agtaatgattctcctgttactttttccgttacaaattgcatcgttaacgttgagattagt
gatgtgaattttaaagatgctgattttgcttccagtttgataggaatattcgaaaaacct
ttgagagatttgtttgaaaaggaaattgaaggatatgcctgcacggagttgtcgacgtct
ggagttacctttttgaatgatgatctttttttgatgattggtaataccctagagggttat
actacttccgtagacgataccggcttattcgacgagtctactctttttccagacaattac
gatataaatcaagcgctcaactttcgacaaatttcagaaacacagatcgggacattgttc
aacagagctttgagtgagttggaccaactacttggaaatggaagtggaagtggaaatgac
aacgacaatgataacgagctcggaatcaacaacgtattgcgatcgtatgtgttggacgaa
aataaagcattggtagtaaacgtagaacagttacttggaatggacggtatcaatttagca
ttgcatgataatttcactgaaaccaatatctccttggaagaagtaagaatttacggatta
gatagcatgacaaaatttgatcctttggtcatttttggaaattatactctacagaatgaa
ttttcctgggagtttttgcagattgaaattgaccttagtgttgatattcagccatcgtca
ttggagacttcaatattgaaagactcaacagatgatgggtctgttcagaaaggtattacc
gaagatatcacaatcaaatttggtgctgaaaacattgacgtgactgcaagtatatttgca
ttgattgacgtggaagccttgggtggattgactattggatcgttactgtccttaacaaac
actgaagattattcatggctgttaccctgtttaacatcaagtatccgtgctttgcaattt
actgaattgaaactatcagccgagcaaatccaggtaccaactctggagggatttgttgat
gacggacttgatcgtgtcatttccaacatagctgaacttgctttcgatatgtatcgtgac
attttggtggaggatgttctccctaatgtgttccaaaatactgtcaagaactttgtcaac
gaccaaattgcaaccatcttggtcggtgaagacgacagcagcaacgcttgtcccgactac
gacgaaatctctgctggtgatagcgatttgtatgtagattttcgagagttctttgactct
tctttctcaacgacaagtaacgaatacggagaagtgccatcgattttgcggagtctcatg
gacaaacaattgctcgaaacagatccttctacgggaatgccaaaaataaacgaagtttta
atcgattcgcttacccgaggccaatctggaacggaaggtaccttgatattcgatggagac
ggcacagatttgttcagcataaaacaaagaatcaacgtcggtggactagacgctgacgtt
cgcataagctcgaggtatgttaaaattgaaaacctcgacacaataatgtcaccgctcatg
ctactcgagcctgtttctacagaaccttactttttgaacaacagtgttaccattggaacc
gaagaacgtcccgtaaaactatcgacgaactttgccttcgctattatagacgaagtgggg
ggaacggaaatctcgaacgaaatcgacatcagtctagacatgtacacggctaatgtcctc
atgactttgatgctgaaagttgccaaatcaaaattgctcgggtttcctttagtcgatatg
tttgatccttattgctggatcgcgacaattcctcctcccaccttaaatgagcaaggagtc
agtgttgatgacgaaattatggcggctgtagtcgatttcgccgcctctgttgccaattta
aatctcaatttaaattgcgtccaatgctctagtcctgggattatcgaactgacagcaact
ctgacgtcatctggcgaagctcaaaatgatgttacggatttggttaacttactattatta
ccgttcgtcactgatcttattaaaggggatgtattgcaagtccaaatagaccgattgctg
aatgatgcagataaaaaatgccgtcacagtcccaattacgacccgaattttcgtcaacta
aactacgcttctttcgaattacctgaagccgaggcttctaccacttacttgatgcttctt
ggtgtggtatctgccgcgttattattgttggtcgcagtgcttgcattgtctatacgctat
ttcacccaacgtcgtcacacacgatggcttttgatgcttcctgtggagcaacttgaagca
ttgaaacagatccaacgaagcgaggattctttacagttggcattgaactccacaacgaga
tcaatgtttcagagtgacaaagacattccatttttgatacggtatggtatgcctgttatt
attctgggtaacattggactattcctctctggtcatttgagtctcggtgctactgttaac
atcgaagcgcaaatcgctggtgagactatcagcgttgataaattctttgagttttcaatg
gcaaaatcaaccattgacatctggatggcgggcggtgaagaactcgcgattctcattctg
gtgttttctgggatctggccatatacgaaacaattgatgaccctcgctttgtggttcacc
cctacttcgtgggttcctatttctcggcgcggatcaattctgatatggctggataggctg
gctaagtggtcgatgattgatatttttgtcttaataatctctcttgccgcctttcgcgtg
tcagtcaacagtccaagtaatgttgcctttttaccggataatttttattctcttgatcta
ttggttgttccgctttgggggttatacgcaaatttgattgctcagcttgtgagccaaatt
tcatcacacttcatcaaccattatcatcgcaggatcgagaacaacgcgcttgatgcatac
gatgaccagcatagtacttatcgtccaccgaagacgtcagagaactctgataggaatgta
acgtttcgcacccatcgatttggtcgtccacatcgcggagaaaccgaaaaattagtagtt
cggaattgggtgaaccatgtattgatatttgcggtaatggttttaatagcttgtataatc
gccgggtgtatacttccttcattctctgttgaagtatttggattacttggtgtagcagtc
gaatcaggacaagaatttagggacgctaacacgaatcacagtgtgttcaccgttattaag
atgctctttgaagaggctcaatttattgatacaatcagatcatatatcggtcttgtctct
ttttctgtggtttttgcccttactgttcttgttgtacctattcttcaatcaattgcctta
ctggtactgtggttcattccgatgacgacgaaacagcaaacaaaaatatctgtattggtt
gaaatattgcaagcatggcagtacgtcgaagtttatatcatcgctgttttcgtcgctagt
tggcaacttgggccaatttcatcgttcatggtcaattcatattgcggatcattggatgga
tttttttcagagttagtattctacggaattctcaaagacgaggacgcacaatgttttagt
gtactgtcctcgatagaaggagggttctatgttctagctgctggtgccatcctacttgta
ctagtcaattcgttcgttacaaaagctacaaaacaatattctcgtgatcaggttgaactt
tataggcagagcccatcagaagatcacactgaggaattagaggatggtaaagaaatagac
gtcgacaatgcggatacgacaatacatcccgtaccggtattatttacagacacctttcga
tggcttttgaaacgagacgaagacaaggggactaattgccatgattcaagtcgtcaagat
ccgagcagtactgcaaattag
DBGET
integrated database retrieval system
