Flammeovirga pectinis: EI427_21200
Help
Entry
EI427_21200 CDS
T05771
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fll
Flammeovirga pectinis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
Por_Secre_tail
DUF642
Porphyrn_cat_1
GspH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZQ64744
UniProt:
A0A3S9P9A3
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(159445..162477)
Genome browser
AA seq
1010 aa
AA seq
DB search
MNLKLTYLVFLFATLTASAQVQLTVNGTQRSHTIHPMIQGQGLSYSVETDSIYEDGAMAQ
LFKDVGAGFLRWPGGTPTSMYHWNDLGAGWVDNWNPEYPEEWTPHTSEFMDLDEYMTLTR
AAGTQPMVGINMSSGMEWGRVDDGVAEAVALVKYCIDNNFDAKCFFLDNETYHHGNGYNK
DMRGDGGHWTAANYAQQINLYADSIKKYVPDAKFFINWRDQFSNNVSDYETLLTVAGHNI
DYVDVHWYWKWGVSNWADWKAKTPMEYETASYDGGSYVEEVAYFNNLAASLGKSHIKVAV
LEWNIAPGDHNSNPDHTEYMTALMQSEMQMQFMQAGIEYASMWTSHWKESSKSEFLTLIN
SDNDHAPSASAAMFELYHHAIGGQVTTSSVSDNNIMTTTVVKGNKTYVYLLNKNDENKSV
EFNFNNLNVTSVDQALRFSDPGELSTISLWNSTTSGNYVASIKANSLTMVSFNYEANTEL
LFNGDFENGLSSWDSWNSPTVTSDAQNGNSAIKIETSGSFNQWVTVEPSTTYKLTAFVKT
DNSAKKVVLGVGNSGGNIATKDIYSTSYKEHEVVFTTNANTTSVQAWVWLPESNGTSAYA
DNMSLTKVEEVSNEPVTSLSLSHENETVFSNTALQLSATVLPTNASDKSVVWESDNTSTA
TVNANGLVTALTPGTATITATTNDGGFTANTTITVIAAQVNGIISPIQGNTYDIASGLEF
SFSTAPETKYIYVYDMDWNLISSLTTPNLTFSYTPTATGDVTYRYIFQDANWQDLENGTV
DVSITATVLNADFELGLNSWDYYGGTTTETLNPHNGSTSLKINARGGASQIISLKKNTDY
QVSFYAKVEDPSVMAKFHIKNALGAKYFEQNIVESNYTQFTINFTTDNEGEEAKIGFWRG
NDAVGASFLDDVVISEITSSARFRSIGQIQDLNIDIEIYPNPATDFVTIKAEHMERVKSL
SILNVVGQSVLDTSFEGVLRLPVSTLQKGTYIVVVSDISGNKATSKLLIK
NT seq
3033 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttaaaactaacctatttagtctttctgtttgcaactttaactgcatctgcacaa
gtacagttaacagttaatggaacacaaagaagccacacaatacaccccatgatacaaggg
caggggttatcttactctgtagaaacagattctatttatgaagatggagcaatggcacaa
ctatttaaagatgttggagctggttttttacgttggccgggcggaacacctacttctatg
taccattggaatgatttaggtgctggttgggtggataattggaaccctgaatatcccgaa
gaatggacgccacatacttctgaatttatggatttggatgaatacatgacattaactcgt
gccgctggtactcaaccaatggtaggtattaatatgagttctggtatggaatggggtcgc
gtagatgatggtgttgctgaggctgtagctttagtgaaatattgtattgataacaacttc
gatgctaaatgctttttcttagataacgaaacttatcaccacggtaacggttataataaa
gacatgagaggtgatggcggacattggactgccgctaactatgcacaacaaattaatttg
tatgcagattctataaaaaaatacgttcctgatgctaaatttttcatcaattggagagat
caattcagtaataatgtatctgattatgaaactttacttaccgtagcaggtcacaatatt
gattatgtagacgtgcattggtattggaaatggggagtatcgaactgggcagactggaaa
gccaaaacacctatggaatacgagacagcatcatatgatggtggttcttatgtagaagaa
gtagcttactttaataacttggcagcttctttaggaaaatctcatattaaggtggctgtt
ttagaatggaatattgctcctggagatcataattctaatccagatcatacggaatatatg
accgcattaatgcaatctgaaatgcaaatgcaatttatgcaagcgggtattgaatatgct
tctatgtggacttcgcattggaaagagagctcaaagtcagaatttctaactttaatcaat
tctgataatgaccatgcaccaagtgcttctgctgctatgtttgaactgtaccatcatgct
attggaggtcaggttacaacatcttctgtatcggataataatatcatgacaacaactgtt
gtaaaaggaaacaaaacgtatgtatatctccttaataaaaatgatgagaataaatctgta
gagttcaattttaataatttaaacgtcacttctgtagatcaagcactacgttttagtgat
ccgggtgaattgtctactatttcactatggaattctacaacctcaggtaattatgtggca
agtataaaagcaaattcattaacaatggtttcttttaattatgaagcaaacacagaatta
ctctttaatggcgattttgaaaatggattaagcagttgggattcttggaattcaccaacg
gtaacttctgatgctcagaatggaaattctgccattaaaattgaaacttcaggatcattt
aatcaatgggtaacggtagaaccatctacaacatataaactaactgcttttgtgaaaacg
gataattcagcaaaaaaagtagtgttgggtgttggtaatagtgggggtaatattgctact
aaggatatttattctacttcttataaagaacatgaggtagtatttactacaaatgcaaat
acaacgtctgttcaggcttgggtttggttgccagaaagtaatggtacgagtgcttatgca
gataatatgtctttaacaaaagtagaagaagtaagtaacgaacctgttacaagtctttca
ctttctcatgagaatgaaacggtattttcaaatacagccttacagttatctgccactgtt
cttcctacaaacgcatcagataaaagtgtagtttgggagagtgataatacttctactgca
acagtaaatgcaaacggattggtaactgctctaacgcccggaacagctactattacagca
acaacaaatgatggtgggtttacagcaaatacaactattacggtaattgcagctcaggta
aatggaatcatttctcctattcaaggcaatacatatgatatagcttcggggcttgaattc
tcttttagtactgctccagaaactaagtatatttatgtttatgatatggattggaatttg
atttcttcacttaccacaccaaatttaacattctcgtatacaccaactgctaccggtgat
gttacttaccgttatattttccaagatgccaattggcaagatttagaaaatggtactgtt
gatgtatccataacggcaacggttctgaatgcagattttgaactagggttaaactcatgg
gattattatggaggaacaactacagaaacattaaatcctcataatggtagtacttcttta
aaaattaatgctaggggtggtgctagtcagatcataagtttaaagaaaaatacagactac
caagtctctttttatgctaaagtagaagatccttctgtcatggctaagtttcatataaaa
aatgctctaggagcaaaatattttgaacaaaatatagtcgaaagcaattatacacagttc
actatcaactttacaactgataatgaaggagaagaggccaagattggattttggagagga
aatgatgccgttggagcttcttttttagatgatgttgtgattagtgaaattacaagtagt
gcaagatttagatctataggtcaaattcaagacctaaatattgatattgaaatctatcca
aatcctgctactgattttgtaactattaaagcggaacacatggaacgtgtaaaatcactt
tcaattctaaatgttgtaggtcagtctgtactagacacttcttttgagggtgtgcttaga
ttaccagtctcaacattacaaaaaggaacatacattgttgtggtatcagatatttctggt
aataaagcaacaagtaagttattgataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
