Flammeovirga sp. MY04: MY04_3997
Help
Entry
MY04_3997 CDS
T04442
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
Organism
flm
Flammeovirga sp. MY04
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HTH_18
HTH_AraC
Y_Y_Y
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANQ51341
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(5008882..5011629)
Genome browser
AA seq
915 aa
AA seq
DB search
MNTININYPTQSLKTLLFFNILLFLSNNVFGIKYPVNKLNFNNGLSHGEVYSFLEDDFGN
LWIGTIDGLNKYDGDQITVYNTEDGLPNNTIRSMVEDRYHRIWLGTDKGIHIYHPLEKKF
TSLQFELFDIHERINSLIIIDDYLWVGSIKGVYAINISKNLASISNIKNTYFFPINNVHE
LINHPDHQSVWVASNDGLISLSIKETGIKTYQRVIPSFLADSKIQSISSDAEGLFCSVYG
EKYGVYYFKYGSDNINKLGAYQGVQSICSYNKGKVYLGSSINGVIEITNPLSDQSCSKVE
NLSSNIIQKIYKDKNNGLWLATSGAGVNYIDQFHQNFIHYAFQEITDNHDIKQNFIRALS
IDEKSNKMFIGIHNGGLWSYDLKNKNIQNYGLGHQLVYDIKLDKDEMYVCGSDTLSIFKR
SQSSWKKSNSIHLNSYLTSLAKSSQNVFWITSRKGLVRLERKENQWLQSVYNQNTSPSIN
HNNCRVVVFDSVYRELWLGMQGGGVNVLKLDAEDKITNVTSFTSKDTIALSNDFVRSIYK
QNDSTYFIGTYNGLHLIHRKNEGLTISEKDKRLSKHVIQSITEDDDKNLWIGINKGLIKY
SSVDLKQLVRYNNKRGLASNEFSEHTVHKTSDNKLFFGTVNGVISFSPSTIQSDSSLQEA
VLCLLQDDKSEEIVGDKVTISKNELHLKLRAKSVTATKKCNFQYQLVDIDSCIKFANSTQ
KSIQYQSLNDGTYTFKYRISNLDGIFDDSQWQEVKVNIKTSSTYSAMNILISFISMLLIG
FVIIKNRNSALAIKSKSNKDITIKKEVSLTDEDEVFLEKLYLLITEGLSDPDFSVELLEK
KMGMSHANFYRKLKLLTGKTAKNVIQDFRMDEACKLLKSKNYRVSEVAYLVGFNDPKYFT
KCFKKQFGKIPSQYT
NT seq
2748 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatacaattaacattaactatccaactcagtcgctaaaaacgttactatttttcaac
atacttctattcctatccaataatgtttttggtattaaataccctgtaaataaactcaat
ttcaacaatggtttatcgcatggcgaggtctattcattcttagaagatgattttggaaat
ctatggattggtactatcgatgggcttaataagtatgatggtgatcaaataacggtttat
aatactgaagatggattaccaaacaacaccatccgctctatggtggaagatcgttatcat
agaatttggttaggaactgataaaggcatccatatttatcatccattagaaaaaaaattc
acttctctccaattcgaactatttgatattcacgagagaatcaactccttaattattatt
gatgattatctatgggtaggctcaattaaaggtgtatatgccataaatatttcaaaaaac
ttggcttcaatttcaaatattaagaacacctatttctttccaatcaataatgttcatgaa
ctaattaatcaccctgaccatcaatctgtatgggtggcttctaatgatggattaatttct
ctctcaataaaagaaaccggaataaaaacatatcaaagagttattccttcttttcttgcc
gatagtaaaattcaatccatttcttccgatgctgaaggcttattttgcagtgtttatggg
gaaaaatatggtgtttattattttaaatatggatccgataatatcaacaaattaggtgct
taccaaggtgtacaaagtatctgtagttataacaaaggaaaagtttacttagggtcaagc
atcaatggagtaatagaaattacaaatcccttatctgaccaatcttgttctaaagtagag
aatctgtcttccaatatcattcaaaaaatatataaagataaaaacaatggattatggttg
gctacttctggtgctggtgtcaattatattgatcaattccatcaaaatttcattcattat
gcatttcaagaaatcacagataatcatgatatcaaacagaattttattcgtgcattatct
atcgatgaaaagtccaataagatgtttattggcatccataatggaggtttatggtcgtat
gatttgaagaataagaacattcaaaattatggactaggacatcaattagtatatgatatc
aaattagataaagatgaaatgtatgtatgtggttctgatacactgagtatttttaaacgt
agtcagtcttcttggaaaaaatcaaatagcatacacctgaattcgtatcttacctcattg
gcaaaaagtagtcaaaacgttttttggattacttctagaaaaggattggtgcgactagaa
agaaaggaaaatcaatggttacaatccgtttataatcaaaatacatctccaagcattaac
cataacaattgtagagtagtggttttcgattcggtctatcgagaattatggttaggcatg
caaggaggaggagtaaatgtactaaaactagatgcagaagataaaattacgaatgtgaca
tcgtttacatcaaaagatactattgcactttctaatgactttgttcgatctatttacaaa
caaaacgacagtacttattttataggaacatataatggattgcatctcattcacagaaaa
aatgaggggttaactatctcagaaaaagataaacgcttatcgaaacatgttattcagagt
atcacagaagatgatgataagaacttatggattggcatcaataaaggtttaataaaatat
tcctctgtagatttaaaacagttagtaaggtataataacaaaaggggattagcatcaaac
gaattttctgaacataccgtccataaaacctctgataataaactattttttggtactgta
aatggagtgataagtttttctccatccactatccaatcagactcttccttgcaagaagct
gtactatgtttacttcaagatgataaaagtgaagagatcgttggggataaagttaccata
tccaaaaatgaacttcatcttaaactaagagctaaatcagttactgctacaaaaaaatgt
aatttccaatatcaattagttgatatagatagttgtattaagtttgccaactctacccaa
aaaagtattcaatatcaatctttaaatgatggcacatacacttttaaatatagaatttcc
aacctagacggtatttttgacgatagtcagtggcaagaagtaaaagtgaatattaaaaca
tcaagcacatatagtgctatgaacatcttgatcagctttatatctatgttattgataggt
tttgtgataataaaaaatagaaattcagctttagcaataaaaagtaaatccaacaaggac
ataactattaaaaaagaagtttctctgacggatgaagatgaggtctttcttgaaaaactc
tatttgttaattacagaaggtttaagcgaccccgatttttctgtggaacttctagagaaa
aaaatgggaatgagtcatgctaacttttacagaaagcttaaactattaactgggaaaacc
gcaaaaaatgtgattcaagattttaggatggatgaggcttgtaaacttctaaaaagtaag
aattatagagtctctgaagtagcctatctcgttggatttaatgatccaaagtattttaca
aaatgctttaaaaaacaatttggaaaaatacctagtcagtatacataa
DBGET
integrated database retrieval system