Flammeovirga sp. MY04: MY04_5142
Help
Entry
MY04_5142 CDS
T04442
Name
(GenBank) response regulator
Organism
flm
Flammeovirga sp. MY04
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
Reg_prop
HATPase_c
HTH_18
HisKA
HTH_AraC
SGL
Y_Y_Y
HATPase_c_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANQ52477
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1555731..1559756)
Genome browser
AA seq
1341 aa
AA seq
DB search
MKNIILLSLFFLLPFNSYTSVRNYEFTKVDIASRADDVKAILEDDKGYIWLALSNELFRY
DGFQFEKMRSARVSCFAKDLNGNIYIAAENQVYQYSYENNTFEVVSRFDSYRKIHNLYVS
SKNELLICSSKGLEMINLDDNSKVTYQHHEGIDEGLTSNVVRVIYEDKKGDFWIGTHDQL
NKLDRKTNTFTRYRLQTPDEIYKKNNLIIDILPLKDKDDTKLYVGTETGLAVFDTESGSF
IKYRYQKNNKKSISNNVVRSLVRINEEMIWVGTGHGLNIFDESTKSFQQFYSDYYNQFSI
AGNSINQIYKDNRGITWFCSDNGLSRITLGDDTFNLNRLPFSNQLLDKELTIKAMKSDAS
GNMWIATDNSGLIKYDRKSDSFHSFKVPQILHNNVNDVIIDKEGDVWLVTPGGLNIIDPK
TNKISAYTAERGKKGTLKTDYLFSIAESPKGQVWIGSMYGVYKVEKNDQGKLSFLSFRPN
NKQSNTISGDYIYSIFFNENENPYIATGNGLDYFDLTTGTISKVKSNEKLNYKYLKLLKK
DQSGTIWAISENRFFKLNTASNRFEEAIEAPSKILSYEILEDKIWYTTTSKLNLFDQKSN
LSFSFSYESTGINHFVQKVSMKYQDYLVFGGKRGFTCFDPKSVSLVSDVPKVRFSSLNVL
NREITPQTKLNEHNVITNTIDHVEKIELEHDENTFGLSFSGLDFRLDNAHEYRVQLEGLE
DDWKILPANEHSVSYIKVKPGKYIFKVMASDQFGKFSDEYKSLEIIIHPPIWATWWAKAI
YFIVICVVFFLAKRMTEKNINTQNNLEIEKLKREQSEEVNQMKISFFTNVSHELRTPLTL
ITSPLSELSAMESDTNKKKLLQIIERNTDRLTRLVNQILDLRKLDKDAEKLRLEKFDMVK
LCKSITNDFTEIVSKRNINLNFYTKQPELKFWFDSEKIEKVIYNLISNALKYTPNNERIE
ILLNVVHIETNGNQQQYVEIKVKDTGLGIPKEVQSQIFERFINVKTENYTGQQGTGIGLS
LVNDYVKMHEGWVELESELGEGAEFIIYLPYESHQMEVEQEEEIHEEDFVITTSESDEEL
TQEQNSQYKLLIVEDDEDMQSFIAHCFESDYKIFKANNGKEGWEIAKKEMPDLIISDWMM
PVMDGIKFCNKLKVNVLTNHIPVIMLSAKDGIDNKMQGIDKGADDYIAKPFNVDYLKLRV
QKILLQRDKLKAKYKAEFSSQVQPISDAPTFEEKFLQKVVDEIEKDIDNSEFNVKMLGEA
LGMGQTNLYRKIKAMTDMTINEFIRNVRMKKAGQLLRQGEYNVSDVMYMVGFTHRSYFSK
SFKEMYGMTPKEFLKNNEVDA
NT seq
4026 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaatataatattactatcactattttttttattaccattcaactcctacacttct
gtaagaaattatgaatttactaaagttgatatagcgtctagagcagatgatgtaaaagca
attttggaagatgataaaggatacatttggttggctttatcgaatgagctttttagatat
gatggctttcaatttgaaaaaatgcggtcagcgagagtatcttgttttgctaaagacttg
aatggaaacatatatatagcggcagaaaatcaagtttaccaatattcttatgaaaataat
actttcgaagtagtctctaggttcgatagctatcgtaagattcataatctctatgtttca
tcaaaaaatgaattattgatttgttcttcaaaaggacttgaaatgattaatcttgatgat
aattcaaaagtaacctatcaacatcacgaaggaattgatgaggggttgacaagtaatgtt
gttcgtgttatttacgaagataaaaaaggtgatttttggatcgggacacacgatcaacta
aataaattggatagaaagaccaatacatttacccgctatagattacaaacgcccgatgaa
atttacaaaaagaataaccttattatagatattttaccacttaaagataaagatgatact
aaattatatgtaggaacggagacagggttagcagtttttgatacagaatcaggatcattt
attaagtaccgttatcagaaaaataacaagaaaagtataagcaataatgtcgtcaggtca
ttagttagaattaatgaagaaatgatttgggtgggtacaggacatggtttaaatatcttt
gatgaaagcacaaaatcgttccaacagttttattctgattattacaaccaattttcaatt
gcaggaaactctatcaatcagatttataaggacaatagaggaattacctggttctgttct
gataacggattaagtagaattactctaggtgatgatacctttaacttgaatagattacct
ttttcaaatcaactacttgataaggaactgacaattaaggctatgaaatcagatgcttct
ggaaatatgtggatagcaactgataatagtggattaataaaatatgatagaaaatcagat
agttttcactcatttaaagtgccacagattcttcataataatgtgaacgatgtaataatt
gacaaagaaggagatgtgtggttggtaacgccgggtgggttgaatattattgatcctaag
acaaataaaatttcagcttatacagcagaaagaggaaaaaaaggaacattaaaaacagat
tatctattttctattgccgaaagtccaaaagggcaagtatggattggaagtatgtatgga
gtgtataaagtggagaaaaatgatcaaggaaaattaagttttctttcatttagacctaac
aataaacaatcgaatactatctcgggtgattatatctacagtatcttctttaatgaaaat
gaaaatccgtatatcgctacaggtaatggtttagattattttgatttgactacaggtact
atttctaaagtaaaaagcaatgaaaaactaaactataaataccttaaactattaaagaag
gatcaaagtggtactatttgggcgatttcagaaaacagattctttaagttgaataccgca
tctaatcgttttgaagaagcgattgaagcaccttccaaaatattatcctacgaaatctta
gaagataaaatttggtatacaacgacttctaaactaaatctatttgatcagaaatcgaat
ctatcttttagtttctcttatgaatcaacgggaatcaatcactttgttcaaaaggtttcg
atgaagtatcaagattatcttgtctttggagggaaaagagggtttacttgttttgatccg
aaatcagttagtttagtaagtgatgtgccaaaagttaggttctcatccttaaatgtgctg
aacagagaaattactcctcagacgaagttgaatgaacataatgtgataacaaataccatc
gatcatgtggaaaaaattgaattagaacatgatgagaatacctttggattgtcattttct
ggattagatttccgattagataatgcacatgaatacagagtacagttagaaggtctagaa
gatgattggaagattttaccagcaaacgaacattcagtatcctatattaaagtaaagcct
ggtaaatacatttttaaagtaatggcttccgaccaatttggtaaattttctgatgaatat
aaatcacttgaaataatcattcatcctccaatttgggctacttggtgggccaaagctatc
tattttatagttatttgtgtggttttctttttggcgaagagaatgactgagaaaaatatc
aatacacaaaataaccttgaaattgagaagttaaaaagagagcaaagtgaagaagtcaat
caaatgaaaattagtttcttcactaacgtttctcatgaactaagaacgcctctaacatta
attactagtccattgtcagagttatctgctatggaatctgatactaacaaaaagaagtta
ttacagattatcgaacgtaacacagatagattgacacgtttggtgaatcaaattttagat
cttagaaaattggataaggatgccgagaaattaagattagaaaagtttgatatggtaaag
ctttgtaagtcaattaccaatgattttactgaaattgtatctaaaaggaatatcaatctt
aatttttatactaaacaacctgaactgaaattttggtttgattcagaaaaaatagagaag
gtgatttataaccttatttcgaatgcattaaaatatacacctaataatgaaaggattgaa
attttattaaatgtggtgcatatagaaacaaatggcaatcagcaacaatatgtcgaaatt
aaggtgaaagatacggggttaggaattccgaaagaggttcaatctcaaatctttgaacga
tttattaatgtcaagaccgagaattatactggtcaacaaggaacaggtattggtctttca
ttagtaaatgattatgtcaaaatgcatgagggttgggtagaactagagtctgaacttggt
gaaggagctgaatttatcatttatttaccatatgaatcacatcagatggaagtagaacag
gaagaagaaattcatgaggaagattttgtgattacaacatctgaatcagatgaggaactt
actcaagaacaaaatagtcagtataaattacttattgtagaagacgatgaagatatgcaa
agctttatcgctcactgttttgaatcagattataagattttcaaggccaataatggtaaa
gagggttgggaaatagccaaaaaagagatgcctgatttaatcatctcagattggatgatg
cctgtaatggatgggatcaaattctgtaataaattaaaagtgaatgtcctaacgaatcat
attcctgtaattatgttatcagctaaagatggtattgataataaaatgcaaggtattgat
aagggggctgacgattacattgcaaaaccatttaatgttgattatctcaaattaagagtt
caaaaaatacttttacagagagataagttaaaagctaaatacaaagcagagttttcatct
caggtccaaccaatttctgatgctcctacatttgaggagaaattccttcagaaagtggtc
gatgaaatagagaaagacattgataattcagagtttaatgttaaaatgttgggtgaagct
ttaggaatgggacaaacgaatttgtacagaaaaattaaagcgatgaccgatatgaccatc
aatgaatttattcgcaacgttaggatgaagaaggcaggtcagttattacgacaaggggaa
tataatgtctctgatgtgatgtatatggtgggctttactcatcgatcgtatttctctaag
agttttaaagagatgtacggaatgactccaaaagagttcttgaagaataatgaagtagat
gcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
