Fulvivirga ligni: LVD16_17430
Help
Entry
LVD16_17430 CDS
T09288
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
flw
Fulvivirga ligni
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
STN
FecR_C
CooC_C
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII19624
LinkDB
All DBs
Position
complement(4139839..4143201)
Genome browser
AA seq
1120 aa
AA seq
DB search
MEKRLLFKKYVKYLSYVLILQLLIVFTYSSASLTKAGNIQDDKINIDVKNANLSDVLSLI
EKQTGSTFLYQSQLISKHKVTIHAVDKSLKQVLDSILEPLDIAYEIDKTHIILSRKIKQQ
AALKISGQVTDEADGTPLPGVNIIVKGTTTGTSTDANGEYSLQLKEENSVLVLSFIGYLT
QEVPVNGRSVINVPLKADIQSLEEVVVVGYGEQKKITSVGSQSSIKVADLQQQPVANLSN
AITGRIAGIVGVQRSGEPGYDNSQIFIRGISSFAQSASNPLILVDGVERSFNNIDPEDIE
SFSILKDASATAIYGVRGGNGVILINTKKGSNSKPKLNFQYNQGITQFTKLPQFVDGVEY
MRVANEARHNTNPNMPPYYSEETIQATIDQSDPDLYPNVDWFDEILDDRGQNRRINFNVD
GGSDKATYYLSVGYYDEKGLFKSEELDQYTSSIGFTRYNFTSNLTLDLTNSTKVNFGASG
YISDGNYPGVSSGAIFASAYTLPPVVHPPKYSDGKIAQQRTGDINNPYNLLTQSGYVAET
KSQIWSNIRVTQDLSHFVDGLSATAMFSFDNNNTHQISRTKSVDRWLAVGRDSEGNLIYE
GDAPVVVGTNVLGYARSNGGQRQKYFEASLNYNHAFGKHEVGGLILYNQTDRVDAFAGDF
TTSIPYRFHGIAGRGTYAYDERYLLEANFGYNGSEAFAPENRYGFFPSVGIGWVASNEKF
FGALDKYIQFLKIRLSHGVVGNAALTASGQRFAYLSTVNGTGADYVFGRNQDNRFGGLDI
EYYAANVQWETSTKSNLGVELNTLNGDLALTVDFFRDIRSDIYLLRGDVPDYAGVRNQPT
GNLGEVFNKGVDGTLTYNKHLGRSFDVSFRGNFTWNRATVVNDANAEWPYPWQQRIGRKL
GQRFGYIALGLFESEEEIANSPRQTGTVKPGDIKFKDLNADGVIDSYDQAPIGYGAFPEI
AYGFGTSIAYKGFAIGAFFKGISNVDIMLNGEGIIPFQQGVGTRGNLLANIDNRWTEEDP
NPNAFYPRLSDGVNNMNYDGSTWWVRNGGYLRLQNVEVSYTFPQSEWFDKIGLDNLRLYC
IGYNLVTFSKFKLWDVELGDGRGASYPLIKTISFGIDCRF
NT seq
3363 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaacgattactattcaaaaaatatgtaaaatacctctcgtatgtccttatttta
cagttacttatagtttttacttattcttcggcttcccttactaaagccggtaatattcag
gatgacaaaatcaatatcgatgtcaaaaacgccaacctcagcgatgttttatcattgata
gagaagcaaacaggatctacatttctttaccaaagtcagcttatttcaaaacataaagtc
accattcatgcggtagacaaaagcttgaagcaggtattagatagtattttagaacctctt
gacattgcttatgagatagataaaacccacattattctatctagaaaaattaaacaacaa
gccgctttaaagatttcaggacaggtaacggatgaggctgatggcacacctttacctggg
gtgaacatcatcgtaaaaggtaccactaccggtacttctactgatgctaatggtgaatat
tcattacaactgaaggaagaaaacagtgtgcttgttctgagctttatcggataccttaca
caagaggttcctgtgaacggtagaagcgtaatcaatgtgccattaaaggctgatattcag
tcgcttgaggaagtggtggtagttggttacggtgagcaaaagaagatcacctcagtagga
tcacaatcatccattaaagtggctgatttacaacaacaaccagtggctaacctgagcaac
gctattactgggcgtatcgccggtatagtaggtgtgcagcggtctggggagcctggttac
gataattcacagatattcatcagaggtataagtagcttcgctcagtcagccagtaatcct
ttgattttggtggatggtgtggagcggtctttcaataatattgaccctgaagatattgaa
agcttcagtatattaaaagatgcatcggccacggctatttatggtgtgcgtggtggtaat
ggtgtaatcctaattaataccaagaaaggatctaactctaagccgaaactgaactttcag
tacaatcagggtatcacccaatttactaagttgccccaatttgtagatggcgtggagtat
atgcgtgtagccaatgaggccaggcataatactaacccaaacatgccaccatactattct
gaagagaccattcaggctaccatcgatcagtcagatccggatctttacccaaatgttgac
tggtttgatgagatactggatgatcgcggccaaaacagaaggattaactttaatgtagat
ggcggatcagacaaggctacttattacttatctgtaggttattatgatgaaaaaggcctt
tttaaaagtgaagagctagaccagtacacatcgtcaataggtttcaccagatataacttc
acctccaacctcacacttgatcttactaactctaccaaggtgaactttggagcttcaggc
tatatttcagatggtaattaccctggcgtttcttcaggagctattttcgcatcagcctat
actttgcctccggtggtgcacccgcctaagtattctgatgggaagatcgcgcagcaaaga
actggtgacatcaataacccatacaacctgcttacgcaatcgggttatgtggccgagact
aaaagtcagatttggtctaatatcagggttactcaggacctgagccattttgtagatggt
ctttcagctacggccatgttttctttcgataataataacacacaccaaatcagcagaaca
aaatctgtagatagatggcttgccgtgggcagagactcagaaggaaacctgatctacgaa
ggagatgcacctgttgtggtaggtaccaacgtgttaggttatgcaagaagcaatggtggg
cagcgacaaaaatattttgaagcttcactaaattataaccatgcctttggtaaacatgag
gtaggtggactaatcctttataaccaaacggatagagtggatgcctttgcaggagatttt
actacctctattccttatcgtttccatggtatagctggtagaggtacttatgcctatgat
gagcgctatttattagaagccaacttcgggtataacggatctgaagcctttgccccggaa
aacagatatggctttttcccttctgtaggtattggttgggtagcttctaatgagaaattc
tttggtgcgctagataagtatattcagttcttaaaaataaggctttctcacggagtagta
ggtaatgcagcacttaccgcatctggtcagcgattcgcttacctttctacggtaaatggc
accggagctgattatgtttttggtagaaaccaggacaatcgctttggcgggctggacata
gaatactatgctgctaatgtgcagtgggaaacatccacgaagagtaatcttggggtagag
ctgaacaccctgaatggtgatctggccctgaccgtagacttttttagagatattagatca
gacatttacttgttgcgaggagatgtacccgactacgctggcgttagaaaccaacccaca
ggtaatttgggagaggttttcaataaaggtgtagacggtacattgacctataataagcac
ctggggcgcagttttgatgtgagcttcagaggtaacttcacctggaacagagccaccgtg
gtaaatgatgccaatgccgaatggccttacccatggcagcagagaattggccgtaagctg
ggacaaagattcggttatattgccttaggtctttttgaaagcgaagaggagatagccaac
agcccaagacaaacaggtacggtgaagccaggagatatcaagtttaaagatcttaatgct
gatggtgtgatagattcttatgatcaggcacctattggatatggagctttccctgagata
gcttatggttttggtacttctattgcctataaaggatttgccattggcgctttcttcaaa
ggcattagcaatgtagacattatgttgaatggtgaaggtattattccattccagcagggc
gtgggtaccagaggaaacttgctggccaacatagataaccgctggacagaggaagatcct
aacccgaatgccttctacccaagacttagtgatggtgtaaacaacatgaactatgacggc
agcacctggtgggtaagaaatggtggttatttaagactgcagaacgtggaagtaagctat
acttttcctcaaagcgaatggttcgacaaaatcgggctggataacctaaggctttattgt
ataggatataacttggtcacattcagtaagttcaagctttgggatgtggagctgggtgat
ggacgaggagcttcttatccccttataaagaccatcagtttcggaattgattgtagattt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
