Flavobacterium oreochromis: JJC03_12795
Help
Entry
JJC03_12795 CDS
T08111
Name
(GenBank) GAF domain-containing protein
Organism
foe
Flavobacterium oreochromis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
GAF
PAS_3
GAF_2
PAS_9
GAF_3
PAS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYS85925
LinkDB
All DBs
Position
2672599..2674533
Genome browser
AA seq
644 aa
AA seq
DB search
MSFKSDRPNYFEYLEKEQLIVATDVYEYFYINEFVDDYFLKEKIKSMLNLPVFINGELHS
LLSFETTKQKREWDSDDVNFARSIADVISLAIETYKRRETEEKLEEKTRILTAIAVSTEK
LLKNNNLDQLFKEIFSIVGQATNIDRIYYFENNEVEHYFSHKNEWVNNSKNIQPQINNAA
LQRMLHEDNMIYYQVLSQKQVFKAKSSQINDSFIYERLCSQGILSILLFPIFINDVFRGF
LGFDDCTKEREWTEEEVSILQILANNVSITIERIENLNLIEESQKQFKLLADNIPGVVFL
SEYDQKFSKIYISDKIENLTGYTPEEFLNGQVYLIDLTHKEDKGKVIFENKKAFENNIPF
QLIYRIKKKTGEYIWIEEFSDTVIKDGKVSYIGGILVDVTEKKLIEKEIKAREYAETSNK
AKSEFLANMSHEIRTPLNAIIGFSGLMQQTQLDPTQNEYLSTVNESAKILLEVVNDILDF
SKIEMGKLELEFKKSNLYDLVLQIVKIIRFDSEKKGIALNFVFDEKIPQYVSIDPLRIKQ
VLLNLLSNAVKFTNEGEVVLELKVKEIKENKVKIQFLVRDSGIGIRKGNHQRIFEPFSQE
DNSTTRKYGGTGLGLTISNNILNLMGTKLQLESNYKSGSTFFLS
NT seq
1935 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtcctttaagtcagatagacctaattattttgaatatttagaaaaagaacaactaatt
gtagcaactgacgtatacgaatatttttatataaatgaatttgtagatgattattttctg
aaagagaaaataaaatcgatgttaaatcttcctgtttttattaatggagagttacattct
ttattaagttttgaaacaacaaaacaaaaaagagaatgggatagtgatgatgttaatttt
gccagatcaattgcggatgttatttctcttgcgattgaaacctataaaagaagagaaaca
gaagaaaaattagaagaaaaaacaagaatattaacagcaattgcagtttcaacagaaaaa
ttattaaagaataataacttagatcaattgtttaaagaaatattttctattgtaggtcaa
gctaccaatatagatcgtatttactattttgaaaataatgaagtagaacactattttagt
cataaaaatgaatgggtaaataatagtaaaaatatacagcctcaaataaataatgccgct
ttacaaagaatgcttcatgaagataatatgatttattatcaagtgttatcacaaaaacaa
gtatttaaagcaaaaagttctcaaataaatgattcctttatttacgaaagattatgttca
caaggaatattgtctattttgttatttcctatatttattaatgatgtatttagaggcttt
ttaggttttgatgattgtacaaaagagcgagaatggacagaagaagaagtaagtatactt
caaattttagctaataatgtttctattacaattgaaagaattgaaaatttaaatctaatt
gaagagtctcaaaaacagtttaaattattagcagataatataccaggagtagtgttttta
tcagaatatgatcaaaaattttctaaaatatatatcagtgataaaatagaaaatcttaca
ggttatactcctgaagaatttctaaatggtcaagtttatttaattgatttaactcataaa
gaagataaaggaaaagtaatttttgaaaataaaaaagcttttgaaaataatatccctttt
cagttgatatatcgaattaagaaaaaaacaggagaatatatctggattgaagaatttagt
gataccgttattaaagacggaaaagtatcctatataggaggaatattagtagatgtaaca
gaaaaaaaattgatagaaaaagaaataaaagctcgcgaatatgctgaaacctctaataaa
gctaaatcagaattcttagccaatatgagtcatgagatcagaactcctttaaatgctatt
atcggattttcaggtttaatgcagcaaacacaattagatccaactcaaaatgaatattta
tcaacagtaaatgaatcagctaagattttattagaagtagtaaatgatattttagatttt
tctaaaattgagatgggaaaattagaattagaatttaaaaaatcaaacctatatgattta
gtattgcaaattgttaaaataatacgttttgattcagaaaaaaaaggaattgcgctcaat
tttgtcttcgatgaaaaaattcctcaatatgtttctatagatccattaagaataaaacaa
gtattattgaatttattatcgaatgctgttaaatttacaaacgaaggggaggtagtttta
gaattaaaagtaaaagaaataaaagaaaataaagttaaaattcagtttttagttcgtgac
agtggaataggtataagaaaaggaaatcatcaaagaatttttgaacctttttctcaagaa
gataactcaacgactagaaaatatggaggaacaggtttaggtttgacaatttctaataat
attttaaatctaatgggaacgaaacttcaattagaaagtaattataaatcaggaagtact
ttctttttgagttag
DBGET
integrated database retrieval system
