Francisella opportunistica: CGC45_02570
Help
Entry
CGC45_02570 CDS
T06355
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
foo
Francisella opportunistica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
Condensation
PP-binding
AMP-binding_C
Thioesterase
HydF_dimer
DEAD
Lipase_3
Hydrolase_4
Abhydrolase_6
Abhydrolase_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXH32840
UniProt:
A0A345JQE6
LinkDB
All DBs
Position
529379..535156
Genome browser
AA seq
1925 aa
AA seq
DB search
MYSNITDLIQAVNQTQRAFPQDKTIDQLFEEQVAKTPDNIAVVFEDKQLTYKELNQRSNQ
LARYIKDKYRSITNQQLQPDTLIALYLDRSLEMIISILAVLKSGAAYVPISPDFPSDRTK
YILEDTNATLLLSQTHLINKLKEVAQDIEIIATDSQEFQNYAKDNLNTNVQPNNLAYVIY
TSGTTGKPKGVMIEHISVINTVSNIFDIYDSNESKINIGFYASYIFDVSVSEIFSTILYG
NILHIYNESTRLDSNILSNYLIDNSIHYTFLPPVVLSILPMDKVYPSLKGIIVAGEPCNH
KTALFWKDKVNLYNYYGPTETAIYAAGKQINDKKVNNIGKPLFNTKLYILDNNLLPSPIG
VPGELYIGGAGLARGYLNLPQLTKERFIDNPFATPDDIAKGYTRLYKTGDICKWLANREI
EYIGRNDFQVKLRGFRIELGEIENVISAIDNIKQSCVLVKDEVLVAYYVSDIEIDETAIK
DHLAKKLPEYMIPSFYMRLESFPLTINGKLDRRALPDFDISNIKQPYLAPTTDLQQQMCQ
IWQEVLKIDKVGITDNFFNIGGNSILAITTIMRINKITNKSYQVIDLFKSQTIQQLSNLE
VNSNDISNESLNLTSKKLHHFEKVIFNHQLSSGDNLIYNESFLIDYKKYIDLNNLKSGVK
YLLDKYTLLHSNYIYNNDGCLKRILNYDNSCICEQKIVKTQTELHQVLNEIERISFDLYN
DKLIRFYLIDVLDIKKQYLFISCHHLILDATSLINIILPDLYSYLFLNEKDNRKSGINDF
NEASYYINKHYKNNFEEKLSFWKNKLESLSPLDLPKNNQEFTNKGKQISFNCDKKTRTQL
LQVSKNLNISEFSILYTLFTLVLHKISNQNKFAIITNIDERLYTPKHKDTIGCLINNMFL
VSDFANNNDLSYFIYQAGREIISNINNAIAYESLLDNLDRDHIRLLSDIQFNFETEETHS
LPYNQTQIYSHSGYVKQGLYFEVDLKNDEILCRVEFNNQYEKDFICTLINGYKTLLSKLD
IILNKKISEISIIDDDQYKQILAISKGEYRGYPQTTIHQLFEEQVAKTPDNIALVFEDKQ
LTYKELNQRSNQLARYIKDKYRSITNQQLQQDTLIALYLDRSLEMIISILAVLKAAAAYV
PISPDFPSDRTKYILEDTNATILLSQTHLINKLKEVAQDVEIIATDSQQFQNYAKDNLNT
NVQPNNLAYVIYTSGTTGKPKGVMIEHYSFVSFIKLFSEKIKTNNGLNLLSLTNIVFDIF
GLEYALPLLNGYKLILSSADKITDEQIVQSNIIQQTPKVISNLCQIHKGKFHDKTLLFGG
EKAANNEVKVFLEEFKYVYNVYGPAETTIWSSIKEVDSSTKSSVIGTPLFNEKLYVLDNN
LFPSPIGVPGELYIGGAGLARGYLNLPQLTKERFINNPFATPDDIAKGYTRLYKTGDICK
WLANGEIEYIGRNDFQVKLRGFRIELGEIENVISAIDNIKQSCVLVKDETLVAYYVADKS
INESVIKDHLAKKLPEYMIPSFYMKLESFPLTINGKLDRKALPKIELTKKQYLAPTTELQ
QQMCQIWQQVLKIDKVGITDNFFNIGGNSILSIQAAYKMTQLFNTEISIADIFRYKTIAN
ILKNVTNEFQLISYFNQKDDNKEDLFFVHPAFAGCEVYRALIEKLSPYYNCIGVENYNLY
AKNKINSLSFLAKLYLERLDLNDKNKQIILLGWSLGGLIAFEMAYWLERQGFNNIQLILL
DPHIPKGKKEKHHAHFNPDKGGRNIEEYIYEFTSKLDKNYAQRVLDSKDFDIVLGKTQPT
GKLKNTKIALFKATNQPGYFIKNNNLNFYANNFNVLYFKVDHLSLISNIIENWPKYNYSF
ISKRFDLLEMQQDKLIFRLFKFKKLLLLHKKTTLFVCTTVIASSAYVLELFDFVIEPVTL
VLLAY
NT seq
5778 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtattccaatattactgaccttatccaagcagtaaatcaaacacaacgagcttttcct
caagataaaaccatcgatcaactttttgaagagcaagtagctaaaaccccagataatata
gctgtagtttttgaggataaacaactaacttataaagaattaaaccaaagaagtaaccaa
cttgctagatatatcaaagataaatatagatctataactaatcagcaactacaaccagat
accttaatagctttgtacttagatagaagcttagagatgattatatcaatattagcagta
cttaaatcaggagctgcatatgtgcctatatcacctgactttcctagtgatagaacaaaa
tatattttagaagatactaatgcaactcttttactatctcaaacacatttaattaataag
cttaaagaagtagctcaagatatagagattattgctacagattcacaagaatttcaaaac
tatgctaaagataatttaaatactaatgtacaacctaataatctagcttatgtaatttat
acttctggaactactggtaaacctaaaggggttatgattgagcatatttctgttataaat
acagtttcaaatatatttgatatatatgatagtaatgaaagtaaaattaatattggtttt
tatgcatcttatatttttgatgtttcagtttctgaaatattttcaaccattttatatgga
aacattttgcatatttataatgaatcaactaggttagatagtaatatactcagtaattat
ttaattgataacagtatacattatacttttttaccaccagttgttttatcaatattacca
atggataaagtttatccatcactaaaaggtataattgtagctggagaaccttgtaatcat
aaaacagctttattttggaaagataaagttaacttatataattattatggtccaacagaa
acagctatatatgccgctggcaaacaaattaatgataaaaaagttaataatatcggcaaa
cccctattcaatacaaagctttatatcttagataataatttactcccatcaccgataggt
gtaccaggagagttgtatataggaggtgctggtttagcaagaggctatttaaatttacca
caattaactaaagaaagatttatagataatccttttgccacaccagatgatattgctaaa
ggttatactcgtttatacaaaacaggtgatatctgtaaatggttagctaatagagaaatt
gaatatataggtagaaatgattttcaagttaaattaagaggctttaggattgagcttgga
gagattgaaaatgtaatatcagcaattgataatattaaacaaagctgtgttttagttaag
gatgaggtattagtagcttactatgtatcagatatagaaatagatgaaacagctattaaa
gatcatctagctaaaaaattacctgaatatatgatccctagtttttatatgagattagaa
tcatttcctctaactattaacggtaaattagatagaagagctttgcctgattttgatatt
tctaatattaagcaaccatatctagcccctactactgatttacaacagcaaatgtgtcaa
atatggcaagaggttctaaagatagataaagtaggtatcactgataatttctttaatatt
ggcggtaattctattttagcaattactactatcatgagaattaataaaataactaataaa
tcctaccaagtaatagatttatttaaatcacaaactattcaacaattatctaatttagaa
gttaattcaaatgatatttctaacgaaagtttaaatttaacatcgaaaaaattacatcat
tttgaaaaagttatatttaatcatcaattatcatcaggtgataacttaatatataatgag
agtttccttattgattacaaaaaatatatcgatttaaataatttaaaatcaggagttaaa
tatctactagataaatatacgttattacatagtaactatatttataataatgatggttgc
cttaaacgaatactaaattatgataattcctgcatttgtgaacaaaaaatagtaaaaaca
caaactgaattacatcaagttctcaatgagatcgagagaattagttttgatttatataat
gataaactaattagattttatctaattgatgttttagatattaaaaaacaatatttattt
atttcttgtcaccatctgatacttgatgctacatcattaatcaatattattttacctgat
ttatattcatatttatttttaaatgaaaaagataatagaaaatcaggtataaatgatttt
aatgaggcatcttactatattaataagcattacaaaaataattttgaagaaaagcttagc
ttctggaaaaataaattagaaagcttgtctcctttagatttgccaaaaaataatcaagag
tttactaataaaggaaaacagatttcatttaattgtgataaaaagacaagaacacaatta
ctacaagtgtctaaaaatcttaatattagtgaattctctatattgtatactctatttaca
ttagttttacataaaatatcaaatcaaaataagtttgcaattattacaaatatagatgaa
cgtttatatactcctaaacataaagatactataggctgtttaataaacaatatgttttta
gtatcagattttgctaataataatgatttgagttattttatatatcaggctggcagagaa
ataatatctaatattaataatgctattgcttatgaaagcttattagataatttagataga
gaccatattagactattatcagatattcaatttaattttgaaacagaggaaactcatagt
cttccatataaccaaacccaaatatattctcattcaggttatgttaagcagggattatat
tttgaggtagacttaaaaaatgatgagatattatgtagagttgaatttaataatcagtat
gaaaaagattttatatgcacgcttattaatggatataaaactttattatctaaattagat
attatcttaaataaaaagatttcagaaataagcataatagatgatgatcaatataaacaa
atattagctatttcaaagggtgaatatcgaggatatcctcagacaacaatccatcaactt
tttgaagagcaagtagctaaaactccagataatatagctttagtctttgaagataaacaa
ctaacttataaagaattaaaccaaagaagtaaccaacttgctagatatatcaaagataaa
tatagatctataactaatcagcaactacaacaagataccttaatagctttatacttagat
agaagcttagagatgattatatcaatattagcagtactcaaagcagcagctgcatatgtg
cctatatcacctgactttcctagtgatagaacaaaatatattttagaagatactaatgca
actattttactatctcaaacacatttaattaataagcttaaagaagtagctcaagatgta
gagattattgctacagattcacaacagtttcaaaactatgctaaagataatttaaatact
aatgtacaacctaataatctagcttatgtaatttacacttctggaactactggtaaacct
aaaggtgtaatgattgaacattatagctttgtttctttcattaaactatttagtgaaaaa
ataaaaactaataatggattaaacctattaagtttgacaaacattgtttttgatatattt
ggtcttgagtatgccctaccactgttaaatggttataagctaattttatcctcagctgat
aaaattaccgatgagcaaattgtacaaagtaatataatacaacaaacaccaaaagttatt
agtaatttatgtcaaatacacaaaggcaaatttcatgataaaactttattatttgggggt
gaaaaagcagcaaataatgaggtcaaagtttttttagaagagtttaagtatgtttacaat
gtatatggaccagcagagacaactatatggagttcaataaaagaagttgattccagtaca
aaatcttctgtaataggaactcctttgtttaatgaaaaactatatgtcctagataataat
ttattcccttcaccaataggtgtaccaggggagttatatataggtggtgctggtttagct
agaggctatttaaatttaccacaattaactaaagaaagatttatcaataatccttttgcc
acaccagatgatattgccaaaggttatacacgtttatacaaaacaggtgatatctgtaaa
tggttagctaatggagaaattgaatatataggtagaaatgatttccaagttaaattaaga
ggctttaggattgagcttggagaaattgaaaatgtaatatcagcaattgataatattaaa
caaagctgtgttttagttaaggatgaaacactagtggcttattatgtagctgataaatca
ataaatgaatctgtaattaaagatcatttagctaaaaagctacctgaatatatgatccct
agtttttatatgaaattagaatcattccctctaactattaatggtaaattagatagaaaa
gctttgcctaaaattgaattaaccaaaaaacaatatctcgcccctactactgaattacaa
cagcaaatgtgtcaaatatggcaacaggttcttaaaatagataaagtaggtattactgat
aatttctttaatattggtggtaattctattttatctattcaagcagcatataaaatgaca
cagttatttaatactgaaatatctatagctgatatatttaggtataaaacaatagctaat
atattgaaaaatgttacaaatgaatttcaattaattagttattttaatcaaaaggacgat
aataaagaagatttattttttgttcaccctgcttttgctggatgtgaagtataccgcgct
ctgatagaaaaactatcgccttattataattgcataggggttgaaaattataatttatat
gcaaaaaataaaattaattcactctcatttttagccaagctttacttagaaagattagat
ctcaatgataaaaataagcaaattatattattaggatggtcattaggtggactaattgct
tttgaaatggcttattggttagaaagacaaggatttaataatatccagttaatattatta
gacccacatataccaaaaggtaagaaagaaaaacaccatgctcactttaacccagataag
ggaggaagaaatattgaagaatatatatatgagtttacaagtaagttagataaaaattat
gcacaaagagttttagatagcaaagatttcgatattgttttaggtaaaactcaaccaaca
ggcaagttaaagaatacaaaaatagctttattcaaagcaacgaatcaacccggatatttt
attaaaaataataatctaaacttttatgctaacaactttaatgttttatattttaaagtc
gatcacttatctttaatatcaaatattatagaaaattggcctaaatataattattcattc
atatccaaaagatttgatttattagaaatgcagcaagataagttgatatttagactcttt
aaattcaaaaagctattacttttacacaagaaaaccacattatttgtatgtacaactgtt
attgctagtagtgcttatgtattagaactatttgattttgttattgaaccagtaacatta
gtattattagcatattaa
DBGET
integrated database retrieval system