Fusobacterium periodonticum: C4N17_05670
Help
Entry
C4N17_05670 CDS
T06291
Name
(GenBank) autotransporter domain-containing protein
Organism
fpei
Fusobacterium periodonticum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
TraV
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVQ25230
LinkDB
All DBs
Position
complement(1144496..1150846)
Genome browser
AA seq
2116 aa
AA seq
DB search
MRNNNLHDVEKNLRSIAKRYENVKYSVGLAVLFLMKGTNAFSDNNMIQEAEKQKEVITND
QVTKSMAKKQEEKSQKAKQGLKASWTNMQFGANDLYSNFFVTPKAEVEKTSIVKTEKAVL
VASADNSVTLPMFAKLSSDIDTTDTNTPTMEEIKTSKENLRGSVGNLKDKIDVARRENNK
EINGLRLELIQLMEQGNQVVKSPWASWQFGVNYFYDNWGSSYKGRGDKSEKYAYEGVLER
DTNLFNRYVPVSSKNYSSLAKSSNPRSAASNQREGLKSYGLASTRLAEEPKIVTQVNAGI
NPKTINKQALNISAKAANAVTLPETVSFSPISPKTPVIAPPNVVIKDVTLSPLWNADDRL
PDTQYIYVSGTNVVKPGSTYNLTTNYKNPNIPGYNRTKTFSADEVLKTSDGTDYTTVPGY
TARGGMRDYTYGAIFEFIGGDHTIEGLTLEVDTVRERNGNIIKGVRAISTDGNNNLKVRN
KSNIKLSADNVVGFATDEDPNGAGNLRQLINDTDGLIYSTGKQNVSFILVKEQDNPAATH
EHINNGKIIMDGDESYAFAFSKTNGVHPNVYITHNINNGEIVMAGKENYGFALGAGRDYK
VADSYIDNTAGGTISMLGNKSMAIITQSNMDHANNAGTINIAGSESYGMYTESATSMTNT
GDINITDYTKNFTSNNAGGKWLDNKEYSASNAQKSIGIASGKAGSTITNSGNINISTGEN
NIGAYTNIGNVVNSGNINVTNGQNIGMYVAGTGTGTNTNTGKVTVTSDGSIGLMTTGTAT
LTNNGELKVTGGNNATNTTGTIGMSAGVGSTIDSTNGKATIDVTGDKSIGLYSEGTLKIG
ESTIKTNNGAINYYAKDNGKIEVVTGKTSTATTGQSSLLFYTKGTGKIILNGNINATIKG
GSTPSTRGTAFYYEATPGAYGTFNTAAIQNYFNTSFGNGSSTLNNLTLNMEDNSRLFIAS
NVEMNLSDTAATSLMTGITNAPTITGSNYKTFMLYLSKLNINQSVDLNDPNNAYNKLEIS
NSTIENANSMTGSLNRQVAIAQENGNDTNGNGYNANKVTLTNTASGVINLTGDETTGIYA
KRGIITNDGQISVGKKSTGIYIVEDDRSPATATLGAKATNSSTGVITLGEDSTGMYYKIE
PDNADGKGTNTAIPGGLTNAGRIESTADNIIAMSFDSPYGTKTFENLSTGVIDLQGQNST
GMFATGAGAYTAKNDGTIKLASSTNVNTPNIGMYAEEVQITPAPAPKTTLVTLENNGTIE
GGDKTVGIYGHNVNLGASSLTKVGAGGTGVYSKGGSVIINGGTLSVGENGTTGSNDAVGV
YYVGGTGGAITSNATDVKIGNSAYGFVVQNENGAAVTLSTNTPNVTLGEDAVYAYSNNKA
GSITNGTTLTSTGDGNYGIYGAGTVTNNGQMNFGTGVGNVGIYSILGGTATNNSTITVGA
SDAANEKYAIAMAAGYKSSDSGNIINSPTGVINVTGKDSIGMYATGPLSTATNKGTINLS
GENSVGMYLDNGATGVNDGSITTIGAPKGVKGVVLSNNSKLINNAGATININSADGFAVY
RSNTPKTNVTIVNYGDITVSGGAQADGEYDATGGKELEKTVGGVTLKSPKGTNDINITAN
GQAVTNIEKVTEPVGTRGDALISNLGMYVDTLRGTNPINGLGYLNIEEADLLYGVEAAEN
STSKYFEVSGNILKPYQDAMRTAPQTLKWSHNSAALTWMALPTLDANGIPSKVAMAKIPY
TAFAGNESSPVAVTDTYNFLDGLEQRYGVEALGTRENKVFQKLNSIGNNEETLFYQAVDE
MMGHQYANTQQRIQATGDILDKEFNYLRSEWQTVSKDSNKVKVFGAKGEYNSDTAGIINY
KNNAYGVAYVHEDETVKLGDTIGWYAGIVHNTFKFKDIGNSKEEQLQGKIGIFKSIPFDH
NNSLNWIISGDIFAGYNKMNRKFLVVDEMFGAKGRYHTYGLGLKNEISKDFRLSESFSLR
PYAALGLEYGRVSKIREKSGEIKLDVKSNDYFSVKPEIGADLIFKQYFGRKTLKVGVTVA
YENELGKVANGKNKARVAGTDADWFNIRGEKEDRRGNVKTDLNIGIDNQRIGLTGNVGYD
TKGHNVRGGVGLRVIF
NT seq
6351 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaataataatctacatgatgtagaaaaaaatttacgttcaattgcaaagaggtat
gagaacgtaaagtattcagttggtctagcagtacttttcttaatgaaaggaacaaatgca
ttttctgataataatatgatacaagaagcagaaaagcaaaaggaagttataactaatgac
caagtgacaaaatctatggctaagaagcaggaagaaaaatcccaaaaagcaaaacaaggt
ttaaaagcttcttggacaaatatgcaatttggagctaatgatctatatagcaattttttt
gttacaccaaaagctgaggtagaaaaaacttcaattgtaaaaactgaaaaggccgtttta
gtagctagtgcagacaatagtgttactttacctatgtttgctaaactatcatcagatata
gatactacagatacaaatactcctacaatggaagaaataaaaacaagtaaagaaaatcta
agaggttccgtaggaaatctaaaagataaaatagatgtggcaagaagagaaaacaacaaa
gaaatcaacggattaagattagagttaattcaattgatggaacaaggaaatcaagtagta
aaatcaccttgggcttcatggcaatttggagtaaactatttttatgataattggggatct
tcatataagggaagaggggataaatctgaaaaatatgcctatgaaggagtattggaaaga
gatacaaatctatttaatagatatgtacctgtaagtagtaagaattatagttcattagct
aaatcaagtaatcctagatcagctgcatcaaaccaaagagaaggattaaaaagttatggt
cttgcaagtactagattggctgaagaaccaaaaattgttacacaagtaaacgcaggaata
aatcctaaaactataaataaacaagctttaaatatttcagctaaagctgcaaatgcagtt
acattacctgaaactgtaagttttagtccaatttcaccaaaaactccagttatagcacct
ccaaatgttgttataaaagatgtaacattatcaccattgtggaatgcagatgatcgtcta
ccagatacacagtatatatatgtaagtggaactaatgttgtaaagccaggctctacttat
aatcttacaactaattataaaaatcccaatattccaggttataacagaacaaaaactttc
tctgctgatgaagtattaaaaacttcagatggtacagactatacaacagtgccaggatat
actgcaagaggtggaatgagagattacacttatggtgcaatttttgaatttataggcgga
gatcacacaatagaaggattaacactagaagtagatacagtcagagaaagaaatggaaat
ataattaagggagttagagccatttcaacagatggtaataataatttgaaagttcgtaat
aagtcaaatataaaattatcagcagataatgttgttggatttgcaacagatgaagatcca
aatggagcagggaatttacgtcaactaataaatgatacagatggattaatatattctact
ggaaaacaaaatgttagttttatacttgtaaaagagcaagacaatccagcagcaacacat
gagcatataaataatggtaaaatcattatggacggagacgaatcttatgcttttgctttt
agtaaaacaaatggggttcacccaaatgtatatatcactcataatataaacaatggtgaa
atagttatggcaggaaaagaaaactatggatttgcacttggagcaggaagagactataag
gtggcagattcatatattgataatactgctggaggaactatttcaatgctaggtaataag
tctatggctattattacccaaagtaatatggatcatgctaataacgcgggtacaataaat
attgctggaagtgagtcatatggtatgtacacagaaagtgcaacttctatgacaaatact
ggagatattaatattacagattatacaaagaacttcactagtaacaatgcaggtggaaaa
tggttggataataaggagtattctgctagtaatgcacaaaaatctataggtatagcttct
ggaaaagcaggatcaacaataactaatagtggaaatatcaatataagcacaggagaaaat
aatataggtgcttatacaaatatcggaaatgttgttaacagtggaaatattaatgtgaca
aatggtcaaaatataggaatgtatgtagctggaacagggacaggaactaatactaatact
ggaaaagtaacagtaacttcagatggttctattggacttatgacaacaggaacagcaaca
ttaactaataacggtgaacttaaagttactggtggaaataatgcaacaaatacaacggga
actataggtatgagtgctggagtaggttctactattgacagtacaaatggtaaggcaaca
atagatgtaacaggagataaatctataggactttactcagaaggaacactaaaaatagga
gaatcaactattaaaacaaataatggagcaataaactattatgcaaaggataatggaaag
attgaagttgttactggtaaaacttctacagcaactacagggcaatcatctttattgttc
tatacaaaaggtacaggaaaaattattcttaatggaaatataaatgctacaataaaggga
ggttctactccttcaacaagaggaacagctttctattatgaagcgacacctggagcatat
ggtacgtttaatacagctgctattcaaaactattttaatacttcttttggaaatggaagt
agtacattaaataatttaacattaaatatggaagataattcaagattatttattgcttct
aatgttgaaatgaatttatcagatacagcagcaacaagtctaatgactggtataacaaat
gctccaactataacaggatctaactataagacatttatgctgtatttgagtaaattaaat
ataaatcaatcagttgatttaaatgatccaaataatgcctataataaacttgaaatttca
aactcaactattgagaatgcaaattctatgacaggaagtttaaatagacaagttgcaata
gctcaagaaaatggaaatgatacaaatggaaatggatacaatgctaataaagtaacttta
actaatacagcaagtggagtaataaacttaactggtgatgaaacaacaggtatatatgct
aaaagaggtataattaccaatgatggtcaaatatctgtaggaaaaaaatcaacaggaata
tatatagttgaagatgatcgtagtcctgcaactgcaactcttggtgcaaaagctacaaat
agttcaactggagtaataacattaggtgaagattcaacaggaatgtactataaaattgag
ccagataatgctgatggaaaaggaactaatacagctatacctggaggattaactaatgct
ggtagaatagaatctactgctgataatataatagcaatgtcgtttgatagtccatatgga
actaaaactttcgaaaatttatcaacaggagtaatagatttacaagggcaaaattcaaca
ggaatgtttgcaacaggagctggagcatacactgctaaaaatgatggaactataaagtta
gcttcatcaactaacgtaaatacacctaatataggaatgtatgcggaagaagttcaaata
acaccagcaccagcaccgaaaacaacattagtaacattagaaaataatggaactatagaa
ggtggagataaaactgttggaatctatggacacaatgttaatctaggagcaagctcttta
acaaaagttggagctggaggaacaggagtatactctaaaggtggaagtgttatcataaat
ggaggtacattatctgttggagaaaatggaactacaggttcaaatgatgcagttggagta
tactatgttggtggaacaggtggagcaataacaagtaatgcaactgatgtaaaaatagga
aatagtgcatatggttttgttgttcaaaatgaaaatggagcagcagtaacattatcaaca
aatacacctaatgtaacactgggagaagatgcggtatatgcatattcaaataataaggca
ggttctataacaaatggaacaacattaacttctactggtgatggaaactacggaatttat
ggagcaggaactgtaacaaataatggacaaatgaactttggaacaggagtaggaaatgta
ggtatctacagtattcttggtggaactgcaacaaataactctacaataacagtaggagct
tcagatgcagctaatgaaaaatatgcaatagctatggcagcaggatacaaatcaagtgat
tctggaaacataatcaatagccctacaggagttattaatgtaacaggaaaagatagtatt
ggtatgtatgcaacaggacctttatcaactgcaacaaacaaaggtacaataaatcttagt
ggagaaaattctgtaggaatgtacctagataatggagcaacaggagtaaatgatggttct
ataacaacaataggagcacctaaaggtgtaaaaggagttgttttaagtaacaattctaaa
ttaataaataatgcaggggcaacaataaatataaactctgcagatggttttgcagtatat
agatcaaatacaccaaaaactaatgtaacaatagtgaactatggagatataacagtaagt
ggtggagcacaagcagatggtgaatatgatgcaactggaggaaaagaattagaaaaaaca
gttggaggagtaactttaaaatcgcctaaaggaactaatgatatcaatataacagcaaat
gggcaagcagttacaaatattgaaaaagtgactgaaccagttggaactagaggagatgca
ttaatatctaatctaggaatgtatgtagatacattgagaggaactaacccaattaatgga
ttaggatatctaaatatagaagaagctgacttactatatggggttgaagcagcagagaac
tcaacttcaaaatactttgaagtttctggaaatattttaaaaccatatcaagatgcaatg
agaactgcacctcaaacactaaaatggagtcataattccgcagcattaacttggatggct
ttaccaacacttgatgcaaatggtattccttcaaaagtagctatggcaaaaataccatac
acagcttttgctggaaacgaatcttcaccagttgcagtaacagatacatataacttctta
gacggattagaacaaagatatggagttgaagctttaggaactagagaaaacaaagtgttc
caaaaattaaactctataggaaataatgaagaaactctattctatcaagcagtagatgaa
atgatgggacaccaatatgctaatactcaacaaagaatacaagcaactggagacatctta
gataaagaatttaactacttaagaagtgaatggcaaactgtatctaaagattcaaataaa
gtaaaagtatttggagctaaaggtgaatataactcagatacagcaggaataattaattac
aaaaataatgcttatggagtagcttacgttcatgaagatgaaacagttaaattaggagat
acaataggttggtatgcaggtatagttcataatacatttaagtttaaagatattggaaat
tcaaaagaagaacaattacaaggaaaaattggaatatttaaatcaattccatttgaccat
aataatagcttgaattggataatatcaggagatatatttgcaggatacaataagatgaat
agaaaattcttagtagtggatgaaatgtttggtgcaaaaggaagataccatacttatggt
ctaggtctaaaaaatgaaatcagtaaagattttagactaagtgaatcatttagcttaaga
ccatatgcagctctaggtttagaatatggaagagtatcaaaaataagagaaaaatcagga
gaaattaaattagatgttaagtcaaatgattatttctcagtaaaacctgaaataggagct
gatttaatattcaaacaatactttggaagaaaaacactaaaagttggagttacagtagct
tatgaaaatgaattaggaaaagtagcaaatggtaaaaacaaagctagagtagctggaaca
gatgctgactggttcaatatcagaggtgaaaaagaagatagaagaggaaatgttaagaca
gaccttaatattggaatagataaccaaagaattggattaactgggaatgtaggttacgat
acaaaaggacataatgtaagaggtggagtaggacttagagttatattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
