Flavobacterium psychrophilum JIP02/86: FP0945
Help
Entry
FP0945 CDS
T00548
Name
(GenBank) Probable ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family
Organism
fps
Flavobacterium psychrophilum JIP02/86
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
CMS1
Helicase_RecD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL43039
UniProt:
A6GY66
LinkDB
All DBs
Position
1259506..1260840
Genome browser
AA seq
444 aa
AA seq
DB search
MSKQFANLGIAEPILKALLDLKITVPTEIQQKSVPVLLSSQDDFIGLAKTGTGKTAAFGL
PLLQLINVNNAKIQAVILVPTRELGNQIFTNLESFAKYLPEVSIASVCGGIPIKPQIERL
QQTTHIVVATPGRLIDLIKRGAINIKEINYLILDEADEMATALKEGLDEIAIDLPKNRKT
WLFSATMPGTVKQLVQNYMSKKVTQVSASMEIVGNSSINHEYIVVDPIEKLEVLMHFLTS
KEGQRGIIFCKTKAAVNKLAKNLAINRFSSGAIHGSLTQPIRDRIMDQFRAGHINILVAT
DLAARGIDVKEISYVVNYHLPDVHETYVHRSGRTARAGANGFSLTILQQEEIAEIADFEK
ALGIKFEKFEKPNPESIEENNAYLWAKQIFKTKPNHELSIDIKEKIKTVFHHLTKDELIE
KLMANYFLQNKPDTTPVVKRQKIK
NT seq
1335 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaacaattcgcaaatttaggaatagcagaacccattttaaaagcattactagat
cttaaaattactgttcccacagaaattcaacaaaaatcagtgccagtattgctttccagc
caagacgattttattggattagcaaaaacaggaacaggaaaaacagcagctttcggattg
cctttattgcaattaattaacgtaaataatgctaaaatacaagccgtaatattagtgcca
accagagaattaggcaaccaaatatttacaaatttagaaagctttgctaaatatttacca
gaagtttctatagcttctgtttgtggcggaatacctataaaacctcaaatagaacgtttg
caacaaaccactcatatagtcgttgcaacaccaggaaggttgatcgatttgataaaaaga
ggcgcaataaacattaaagaaattaactatttaattcttgatgaagcagatgaaatggca
acagccctaaaagaaggattagacgaaattgctatcgatttacctaaaaacagaaaaact
tggttattttctgcaacaatgccaggaacagtaaaacaattggtacaaaactatatgtca
aaaaaagtgacacaagtaagtgctagtatggaaattgtgggtaattcgagcattaatcac
gaatatattgttgtagatccaatagaaaaattagaagttctcatgcattttttaacttca
aaagaaggacaaagaggtattattttttgcaaaaccaaagccgcagttaataaattagct
aaaaatttagccattaatcgcttttcatctggagcaatacacggaagcttaacgcaacca
atccgtgatagaatcatggatcagtttcgtgcaggacacattaatatattagtagccaca
gatttagccgctcgtggaatcgatgtaaaagaaatttcctatgtagtaaattatcattta
ccagatgtacatgaaacttatgtacaccgtagcggacgtacagcaagagctggtgctaat
ggcttttcgctaacgattttgcaacaagaagaaattgctgaaattgccgattttgaaaaa
gctttaggaattaaatttgaaaaatttgaaaaacccaatccagaaagcatcgaagaaaat
aatgcttatttgtgggcaaaacaaatcttcaaaaccaagccaaatcatgaattatcaatt
gatattaaagaaaaaataaaaacagtttttcatcatcttaccaaagatgaactgattgaa
aaattaatggctaattattttttgcaaaacaaacctgataccacaccagttgtaaaaaga
caaaaaattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
