KEGG   Flavobacterium sediminilitoris: LXD69_06370
Entry
LXD69_06370       CDS       T08185                                 
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
Organism
fsd  Flavobacterium sediminilitoris
SSDB
Motif
Pfam: Sortilin-Vps10 MAM PKD_4 PKD InlK_D3 CATSPERB_2nd
Other DBs
NCBI-ProteinID: UOX35134
LinkDB
Position
complement(1405055..1409860)
AA seq 1601 aa
MKKTLLIFILFLCYSSFSQENWQIMMHDRNANFNEIQKDFNIYYKKNVSNSKKLPKGKGI
KQFKRWEYYWENRVDENGNFPKEGNLLEEIKRYKNSHTKFISRGYFAGSGNWKIIGPISS
PNNGTGQINGNGRINCITFHPTDPNTIFVGAPSGGFWKSIDGGATWKEYSSGLVRLGVSS
IVIDPIDPNIIYIGTGDRDSGDAPGYGVYKSIDGGITWLSSNTGMGNRTVYEILMNPTNS
NILIASTNGNRIYKSIDAGANWTFASTSSSMKDIAFKPGDPNTIYASGTSVDVSTDGGAT
FTQVTSGTPIGVQRIALAVSNNEPDWVYLLAGGANGLIGIYRSTDSGISFSTRTNAPNIL
GYNTDGSGTASQAYYDLVIAADPTDANIIYTGGVNLWKSTDGGVTMNCVSYWVGQSGTID
GVHADQHALEFSPHTNFLYNGNDGGVYYSSNNGTDWNDISSGLAIAQVYKIGASQTIDNL
VINGYQDNGTAINRGPIFSTEIGGDGMECIIDPTNENYMYGALYYGEIRRSTNGGTSFGN
ITSSISETGAWVTPYKLDPNNSNTMFAGYENIWINTAVRTGSTWNQISNFGATSKIVDLA
IAPSNSNIMYVSRNGTNKFYYTNDALAASPTWTNLNTNLPASLVPKDIEIDPNDPNHVFI
ALGNNIYESTDAGLNWTDISGTLPNISLNTIVIDHSSPVNAMYVGMDVGVYYKDDNLSDW
ESFSTGLANLEITELEIYSNNTECKSKLYAATYGQGLWTSDLKDPGNIAPTACFESETTE
DCIGNDFILIDKSDYTPTSWSWTITPTTFTYINGTSSTSQNPEIRFTNAGTYTVELTATN
ANGSNTETKTAYINIYAGTIASNFNEDFEGETLCATTTDCGSTTCGLTGFWSNLTNGNDD
DIDWRVDEGGTPSANTGPNTDFNPGTATGNYIYLEASSCSNKTGILESQCIVIDKNYDFN
FAYHMFGVNTGSLHIDLFSDGKWQENIITTISGNQGNQWNIATVNLAPYVGKTIKLRIRG
ITGNGFESDIAIDDIQLVSNCSTPTTWNGTAWSNGTPSLTIPVVIDGNYSTSINGNFECC
SLLINSGFELNINHSNHIVVENDIVNNGILNVKNNGSLIQINDINTNIGNINYERTTNIR
QQDYVFWSSPIEGFNVGDISPLTSSGNIYKWDSVFTNGNGGQGYWVNAPNDVMLPGNGYI
VRGPSNFTSTAQDFTAEFINGSPNNGAISTTISRGNYTGVDYSGANSITITRFDDNWNLI
GNPYPSSINVIDFLNLNSSIIEGSVRIWTHGTLPSTSNPNPFYGNYTTNYSLSDFIVHNG
TGTVSGPNGFNGFIAGGQGFMVLMNDGATASDNIIFNNSLRNKTYTNDQFYKTSPSSVEK
NRIWLNLSNENADSDRTLIGYLEEATNSKDRLYDAFTKVEPNAQKIYTFIGSDKMTIQAF
GLPFSDEDTIPLGINTPTPGNYTISIHAVDGFFTGQQIFVEDTFLNTINNISNQPYSFYS
EANEINDRFILRFNTSLLSNIDFEVDPNDIIVSGIDQIEIESKKEKIKNIVIYDVLGRKV
LDKNNIDAYKFNINSIIKSDSALLMKITLSNNQIAYKKFLF
NT seq 4806 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaaaccttactcatttttatattatttttatgttattcgtcgttttcacaagaa
aattggcaaataatgatgcatgatagaaatgctaattttaatgaaattcaaaaagatttt
aatatatactacaaaaaaaatgtgtcaaattctaaaaagcttcctaaaggaaaaggaatt
aaacaatttaaaagatgggaatactattgggaaaatagagtcgatgaaaatggtaatttt
ccaaaagaaggaaatctattagaagaaattaaaagatataaaaattcacatactaaattc
ataagtagagggtattttgctggttcaggaaattggaaaattataggtcctatttcttct
ccaaataacggaacaggacaaatcaatggaaatgggaggataaactgtattacatttcac
ccaacagatccaaacactatttttgtaggagcaccatcaggtggtttttggaaatcaata
gatggtggagcaacatggaaagaatattcaagcggattagttcgtttaggtgtttcaagt
attgttatagatccaatagatccaaatattatttacattggaacaggcgatagagatagt
ggtgatgcgcctggttatggtgtatataaaagtatagatggaggaataacatggcttagt
agtaatactggaatgggaaatagaactgtttatgaaattttaatgaatccaaccaattct
aacatcttaatagcctcaacaaacggtaatagaatatacaaaagtatagatgcaggcgca
aattggacttttgcctctactagttcttctatgaaagatattgcttttaagcctggagat
ccaaatacgatatatgcttcaggaacaagtgtagatgtttctacagatggaggagcaact
tttactcaggttactagtggcactcctataggtgttcaaagaattgctttagccgtttct
aataacgaaccagactgggtttacttattagctggtggagctaatggattaataggtata
tatcgctcaacagatagtggaataagtttttcaacaagaacaaacgcacctaatatttta
gggtataatacagatggttctggcacagcaagtcaagcatattatgacttagtcattgct
gcagatccaactgatgctaatatcatatacacaggtggagtaaatctttggaaatcgaca
gatggaggagtaacaatgaattgtgtttcatattgggttggacaaagtggaactatagac
ggagttcatgcagaccagcacgctttagaattttctccacatactaattttttatataat
ggaaatgatggaggtgtatattattcttcaaataatggaaccgattggaatgatattagt
agtggtttagctattgcacaagtttataaaattggcgcatcacaaacaattgataatcta
gttataaatggttatcaagataatggaacagcaataaacagaggtcctatattctccacg
gaaataggtggtgacggtatggaatgtattattgatccaactaatgaaaactatatgtat
ggagccttatactatggagaaattcgcagatcaacaaacggaggaacttcttttggaaat
attacaagtagtatctctgaaacaggagcttgggtaacgccatataaactagatcctaat
aattcaaatacaatgttcgcaggttatgaaaatatatggataaatactgctgtgcgtaca
ggatctacttggaatcaaatctctaattttggagcaacttccaaaattgttgatttagca
attgccccatcaaatagtaatataatgtatgtttctagaaacggaacaaataaattctac
tatacaaatgacgctttagcagcttcacctacttggactaatttaaacacaaatttacct
gcttcattagtacctaaagatattgaaatagatccaaatgatcctaatcatgtttttata
gcattaggaaataacatttatgaatccaccgatgcaggattaaattggacagatatttca
ggaacactccctaatatttcattaaatactattgtaatagatcactcaagccctgttaat
gcgatgtatgtaggaatggatgtaggagtatattataaagatgataatttgtccgattgg
gaatccttttcaaccggattagcaaatttagaaattactgagttagaaatatattcaaat
aacacagagtgtaaaagtaaactttatgctgctacttatggacaaggtctttggacaagt
gatttaaaggatcctggaaacattgctccaactgcttgttttgaatcagaaacaacagaa
gattgtataggaaatgacttcatattaatagataaatctgattatacacctacttcatgg
tcttggacaataactcctactacttttacatatataaacggaacatcatctacatctcaa
aatcctgaaattagatttactaacgcaggtacttatactgttgaattaacagcaacaaat
gcaaatggctctaatacagagactaaaacagcgtatattaacatttatgccggaactata
gcttcaaattttaatgaagattttgaaggtgaaacactatgtgcaactactacagattgt
ggttcaacaacatgtggtttaactggcttttggtcaaatttaacaaacggaaatgatgat
gatatcgactggagagttgatgaaggaggaactcctagtgccaatacaggtccaaacact
gattttaatcctggtacagctacaggaaattatatttatttagaagcatcgtcctgttct
aataaaacaggaatactagaaagccaatgcatcgtaatagacaagaattatgatttcaat
tttgcttatcatatgtttggagtaaatacaggcagcttacatatcgatttattttctgat
ggaaaatggcaagaaaatatcataaccactatctctggtaatcaaggaaatcaatggaat
atagctacagtaaatttagcaccatacgtaggaaaaacaatcaaattacgaattagagga
ataacaggtaatggtttcgaatcagatattgctatagatgatatacagttagtttcaaat
tgctctacccctacaacatggaatgggacagcatggagtaatggaactccttcactaacc
ataccagtagtaatagacggaaattacagcacatctataaacggaaattttgaatgttgt
agtttattaataaattcaggattcgaattaaacattaatcattcgaatcatattgttgtt
gaaaatgatatcgttaataatgggattttaaatgtgaaaaacaacggatcattaatccaa
ataaatgatataaatactaatattggaaatattaattacgaaagaacaactaatattcgt
caacaagactatgtattttggtcttctcctattgaaggatttaatgtaggagatatttct
cctttaacatcttcaggaaacatatacaaatgggattctgtttttacaaatggaaatgga
ggtcaaggatattgggttaatgctcctaatgacgttatgcttcctggaaatggttatatt
gtacgaggaccaagtaatttcacaagtactgcacaagattttacagccgaattcattaat
ggttctccaaacaatggagctatttcaacaactatttctagaggaaattatacgggtgtt
gattattcaggagcaaactctataacaataacaagatttgatgataactggaatttaatt
ggaaacccatatccttcatctattaatgtaattgattttctaaatttaaatagctcaatt
attgaagggtctgttagaatctggacacatggaactcttccaagtacatctaatcctaat
cctttttatgggaactatacaacaaattattctttgtcagattttattgtacataatgga
acaggaacagtaagtggtccaaatggatttaatgggtttattgctggaggacaaggcttt
atggttttaatgaatgatggtgctacagcatcagataatattatttttaataattcattg
agaaataagacatacacaaacgatcaattttataaaacaagtccttcttcagttgaaaag
aacagaatttggttaaatttatcaaatgaaaatgcggattcagatagaacactaattggc
tatttagaagaagctacaaattcaaaagatagattatatgatgctttcacaaaagtagag
ccaaacgcacaaaagatatatacttttataggaagtgataaaatgactatccaagcattt
ggactacctttctctgatgaagacactattccgttaggtataaacacaccaactcctgga
aattatactatttcaattcatgcagttgatggattttttacaggacaacaaatatttgtc
gaagatactttcttaaacactattaataatatttctaatcaaccttactctttttattct
gaagcaaatgaaatcaatgatcgttttatcttaaggtttaatacatctttactttctaat
attgattttgaagtagacccaaatgatattattgtaagtggaatagatcaaattgaaata
gaatctaaaaaagagaaaattaaaaatattgttatttatgatgttttaggaagaaaagta
ttagataagaataatatcgatgcatataaattcaacataaattcaattataaaatcagat
tcggcattattaatgaaaattacattaagcaataaccaaatagcatataagaaattttta
ttttaa

DBGET integrated database retrieval system