Glossina fuscipes (tsetse fly): 119644968
Help
Entry
119644968 CDS
T09630
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13
KO
K15164
mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13
Organism
gfs
Glossina fuscipes (tsetse fly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gfs00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
gfs03021
]
119644968
Transcription machinery [BR:
gfs03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Mediator complex
CDK-module
119644968
BRITE hierarchy
Motif
Pfam:
Med13_C
MID_MedPIWI
Ribosomal_60s
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119644968
NCBI-ProteinID:
XP_037900639
UniProt:
A0A9C5ZNU2
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2865 aa
AA seq
DB search
MTHQSHQTNGASLEDCHTNFFALTDLCGIKWRKFVNSERPNASSDPLDDPILRSYSRCMQ
ADILCVWRRIQSTKQDNSDLNALGDEVNNTKVHPPLSLAAAKELWIFWYGEEPDLTDLVD
AELLRVAANQATWNGTWERGLTYECRSLLFKALHNLMERFVLTKDIVRFGKWFVQPCTSN
ERIFGRSSQHLSFSFTFFVHGDTVCASIDLREHPAVRPLTKEHLSEAAAAFTTVAASSNN
SQEQTSPNNSPIVAEATGENSAANANGSNMPKPRKVILAPFGMAATLTGNSYKANDPMAE
KILEDWASFFPLCNKENSDVPPVVEVISGGHKMYHPSIYVLVTDLDDMEEMEAAASQKGS
LGTSSSAEAAALTTLSSVNTGDNLSSNVRKPLTETVSNKLTTTTTTTTTTTPTPTNMNQT
ASSKSLAYMVERLKIDPKKVQNHYDALTSNYTCNTTNTHAPPQAATEMPERAWQDCVTNS
LHAQYANTAISANFNENISVIGNGGSNGGSGSVGVGGGGGGGNASIGDCGGEQQADIKPN
TLALLQKQQIWDFVDPTQKAPCICTKFRKALKEIYNNSCENETNLNKHAFHLFVFWSFLK
YLWKKNVYTKLFSFQFSTKSVTKVTATAAAAATAATAAAAAAAATTTTTTTTTSLSSLSL
SSSSSSSSSSASFASSASTALSASTHMMMGSSTGAIRVSHCNTTIKPYYAFGFTSNGSNS
SSSSSSNSNSNSSSVGNSLAHHVLAQLSSNSHIHINNQQLSIASGSSIGHNNQSCIPSTE
MSKVCTKTNTLLRIHRIPPFHKRHLFESDGKDYWLIGNNSTNSKITISSSCFIDSNQKQQ
QTNYPRAALYQNSACTSEITRKQRSLAAQHHHPAAATTPGHGTPLQGANGGASSYSRNSV
MDTMPVPSVGSPGTPAPSPHPNSTLSQPTSVPPADQLLAMSPRAPASVSNLQQPPTPIEH
LLDKNTPAPTPTDQNDNKSTTASPYVHPTPSVEPPPSVEGIHNIIGGTXXXXLESTGLQL
NPTVSSASSTSHSHSHSHSTTTLNAMLPNSLKRNSSTQGSAGNSIHAMHDFLNLYKPPKI
CVKDIDSFANDDCLKLDVLYDFTVQDAWSYHTIKRFKPNDLSKPCRIMRTKNLYEGHTHI
KPLMPSPRSVYGNQLLAADSVQAAQIASVSGVDSSTFMADMSGGLVGIASNNQNISRLAN
DNSAGPLTAVGSSTTSNFFEELDIKTEMMSGTASGTSSISPCKDSKSGIGGNLFTVEGLN
PSPNDLEQLFETSSNDECSSVQIHTPPDSNNPSNGCAISNTAIDDLKRSTNPAILGNSNV
AIANSTAGAAVMVALQNCNNSSASSTSAVSSLNNSVGNISGGANIIQAEDLTKMFPTPPS
HEQHHPNSSPCQMDIHMTDLSVITNLGSNLDSGLGMLKIKQEYSIELGSPIEEPIEDWSY
VYRPPQQAKFVGSSKYAPLTNLPSQTMAPLIAPPNCIYKPSWQPTRSTHQQPQQQQQLQQ
HNQSLQQQQNHQQQQPQHQQHQQLHELLSSAPRTPLQQPRTPLGPMSSSPMHNTVPTPLS
SGGGGGGSLLLNQLNCPQAALTNTPSAMQQLMQRAGMSPVSPAPHVPFPHTSPMMHHQQR
QTPIHPPPPYEVAVASPALSSASSTAAYINKQYHSQEPPHTPQSVANLHSVGGPPSVSGV
HHPSASLGLFSGTVSNTSANAVTRELPEVSSLIVNILLYDTALNVFRDHNFDSSTVCVCN
ADSQRIGNIRGADSGVYVPLPGTSFNPSPLTSSATTVGNIRALSAFGAVSSGGGGGIGSA
LDSPASLAGAGSSSSTTPSTTTPASNGQQHITGYVDDDSVECTCGFSSVINRRLAYGAGL
FYEDELEITGIAEDPGRNKKQSLLTLISSFTSKSNGTNGNGVMDKAADQLAYSIFNLLLD
QCSIIQTSSSAVHRALQRHRRRLAKRNRQPQSVTTIANVLEYMDANDIISLALEQARLAF
DSSRVDVMDQQIIAFSHRKSGSQTILALTGRLNVHKWPYMPVGFSRSNKDIVSTMKSIQP
MLQNAFHSKSRSAAGAKDATYTVSGPLTWRQFHRLAGRASGQCEPQPIPSVIVGHDKDWI
SVAPLAIHYWDKFLLEPYSYARDVVYLVIAPDNDYVISKTKTYFKELSTTYEMCKLGKHT
LMCGWGGMLTVSQRPPTEKPYTTNMDNWLRTMEDTTLAEKLRLYAHAFQHMLVPYLNRIP
SDKSLLNPPDANIHAGSHNNTRLNATGNTSSPMAGTITGLENSDRGDHASSTPMEHGDLS
QHATTDNSGNINDNKGTDVKPDVKPPLVLGDPLGVGETLEEINPPAIVLYVVEPFTYGSD
SPELERLACIAILRMYSELLKSIPDSVRANMNIQIISLESILELGRTRNRKRFSDEIKCL
ALNIFSQCRRHMVHAQAVKSLTGFGTAANIEAFLKSKDDQNRRPYKMYTPPYILAPIHEK
NEKTDFSRAASGGMRGSPNEQKYSVMYCNYCMSEDQSWLLATVTDDRGEMLEKVCINIDV
PNRTRRRKAPARRIGLSKLMDYILGLISQTTQTWRLVLGRIGRIGHSELKSWSALLSKQN
LQKATKQLKDMCKQCQLMYPPSILSACLVTLEPDAKLRVMPDQFTPDERFSQISIQNPLS
TPQDVTCTHILVFPTSAVCLSFTRQFQNEPQVDLDNDFLNFEEDENEAFADTDLDDLLIW
ENRGISDHNSPDRMEDNRSWQSAGGNNFNSAQQQDVEEVGSINQQPLAVGYLVSTAPTGR
MPSWFWAACPHLEDVCPVFLKTALHLHVPNIQTTDDILNSTNAHSSATDHPLDSTLTADV
LRYVLEGYNALSWLALDSNTHDRLSCLPINVQTLMDLYYLTAAIA
NT seq
8598 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgcatcaatcacatcagaccaacggcgctagtttggaggattgccacacaaacttt
tttgctttgacggatttatgcggaataaaatggcgaaaatttgttaacagcgagcgaccg
aatgcatccagtgatccattggatgatcccatattacgctcctattcgcgatgtatgcaa
gctgacatactttgcgtttggagacgtatacagtctaccaaacaggataattccgattta
aatgctttaggcgatgaggtaaataataccaaagtgcatccacctctatcgttagccgct
gccaaagaactatggatattttggtatggcgaagaacccgatctcaccgatttggtcgat
gcggaacttttaagagttgccgcaaatcaagccacttggaatggcacctgggaacgtggt
cttacctacgaatgtcgatccttgctttttaaagctctacataatcttatggaacgattt
gtactgaccaaggatattgtacgttttggtaaatggtttgttcaaccttgcacttctaac
gaaagaattttcggtagaagttcgcagcatttatcattctcctttacattcttcgtgcac
ggcgatacggtgtgcgcgtccattgatttacgagagcatccggcggtgagacctttaaca
aaggagcatttgtctgaggcagcggcggcttttactacggtggcagcttcttccaataat
tcgcaagaacaaacatcacctaataattctcctatagtagctgaggccactggggagaat
agtgctgccaatgcaaatggctcgaatatgccaaaacctcgcaaagtaattttagctcca
ttcggtatggctgcaactttaacgggcaacagttacaaggcaaacgatccaatggctgaa
aagatactcgaagattgggcctcattttttccattgtgcaataaagagaatagtgatgtg
ccgcctgtagttgaagttatatcaggcggtcacaaaatgtaccatccttccatttatgta
ctagtcacagatttggatgatatggaagaaatggaggcagccgcctcgcaaaagggctct
ttgggcacatcgtcatccgctgaggccgccgctttaacaacattatcctcagtcaacacc
ggcgacaaccttagcagtaacgttagaaaaccattaacggaaacagtatctaacaaatta
acaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaccaacaccaacaaatatgaatcagacg
gcctcttcaaaatctctggcttatatggttgaacgtttaaaaatcgatccgaaaaaggtt
caaaatcattacgatgctttaactagcaattatacctgcaatacaacaaatactcatgca
ccgccacaggctgccactgaaatgcctgaacgtgcttggcaagattgtgttacaaattcg
ctgcatgcacaatatgcgaataccgcaatatcggcgaactttaatgaaaatattagtgta
attggcaatggcggtagtaacggcggcagcggtagcgttggcgttggcggtggcggtggc
ggtggcaatgcgagcataggcgattgtggcggtgaacagcaagcagacattaaaccaaat
actttagcgcttttacaaaaacaacaaatatgggattttgtcgatccaacacaaaaagca
ccttgcatatgcacaaaatttcgaaaagctcttaaagaaatttacaataattcatgtgag
aacgaaacaaacttgaacaaacatgcattccatttatttgttttttggtcgtttttgaaa
tatttgtggaaaaaaaatgtctatacaaaacttttcagttttcaatttagcacgaaatcg
gtaacaaaagtaacagcgacagcagcagcagcagcaacggcagcaacagcagcagcagca
gcagcagcagcaacaacaacaacaacaacaacaacaacgtcattatcatcattatcatta
tcatcatcgtcatcgtcatcatcatcatctgcatcttttgcatcttctgcatctactgca
ttgtcagcatctacgcatatgatgatgggatcgagtacgggtgcaatacgtgttagccat
tgtaataccactattaaaccatattatgcgtttggctttaccagcaatggcagcaacagc
agtagcagcagcagcagcaacagcaacagcaacagcagcagcgttggtaactccttggcg
catcatgttttagctcaattaagcagtaatagtcacatacatatcaataatcaacaatta
tccattgcttctggctcgtcaattggccacaataatcaaagctgcattccttcaaccgaa
atgtccaaagtttgtacaaaaacgaataccttattgcgaatacacagaattcctcctttt
cacaaacgtcacctctttgagagtgacgggaaggactattggttgattggcaacaatagc
acaaattccaagataacaatttcctcctcttgttttattgattccaaccaaaagcaacaa
caaactaattatcctagagcagccttatatcaaaattctgcttgtacttcggaaataaca
agaaaacaaagatctttggctgcacaacatcatcatccggctgccgcgacaactcctggc
catggtacacccttgcagggtgcgaatggtggtgcctctagttattcacgtaattctgtt
atggacacaatgccagtgccttctgtgggctcaccgggtacaccagcgccttcgccccat
ccaaattcaactttgtcacagccaacgtctgtaccacctgcggatcaacttttggctatg
agtccccgtgcaccagcatctgtttcgaatttacaacagcccccaacaccaattgaacat
ttgttagataagaatacgccagcacctacaccaacagatcagaatgataataagagcaca
actgcgtcaccatatgtacatccaacacctagtgtggaacctccaccctccgttgaaggc
atacataatataataggaggaacagnnnnnnnnnaattagaatcaactggtctacaatta
aatccaacagtttcctctgcttccagtaccagccacagccacagccacagccacagcact
accactcttaacgcaatgttgccaaacagtttaaagagaaattcatcgactcaaggctcc
gccggaaattctattcatgcaatgcatgacttcttaaatttatataagccaccaaaaata
tgtgtcaaagacattgatagtttcgccaacgatgattgtcttaaattggacgttctctac
gatttcacagtacaggatgcttggtcctatcataccattaaacgttttaaacccaacgat
ttatcgaaaccatgtcgtataatgcgtaccaaaaatctttacgaaggacatacgcatata
aaaccgttaatgccttcaccacgttcagtttatggaaatcaactactggccgcagattca
gtacaagctgcacaaatagcttctgtgtcaggtgtggactcttccacctttatggctgat
atgtctggtggccttgtaggcattgccagcaataatcaaaacattagtcggttagcaaat
gataactctgcaggaccactgacagcggtcggctccagtactactagcaatttctttgaa
gagcttgacatcaaaactgaaatgatgtctggtacggcgagcggcacctcttcaatttcg
ccatgcaaggactcgaaaagtggcatcggtggcaacttgtttactgtggaaggtttaaat
ccttcgcctaacgacttggaacaactttttgaaacctcttcgaatgatgagtgcagtagc
gttcaaatccatacacctccagattcaaataatccatcaaacggttgcgctatcagcaat
acagccattgatgatttaaaacgcagtacaaatccagcgattttgggcaattccaatgta
gcgattgccaatagcactgctggagccgctgttatggttgctttgcaaaattgtaataat
tcatcggcttcttccacgtcagcggtatcatccttaaataacagtgttggtaatatttct
ggcggtgcaaatataattcaagctgaagatctcacaaaaatgtttcccacaccgccttct
catgagcaacatcatccaaattcgagtccctgccaaatggatatacatatgaccgattta
agtgtaattactaacttgggatctaacttggacagcggtttgggtatgctaaaaatcaag
caagaatattctatagagttaggtagcccgatcgaagagcctatagaagattggtcgtac
gtatatcgaccgccacaacaagcaaaattcgtggggtcatcaaagtatgcaccattgacc
aatctacctagccaaacaatggcgccattaattgcgccgcctaattgtatctataaacct
tcttggcagccaacccgcagtactcatcaacaaccgcaacagcaacaacaattacaacaa
cacaatcaatccctccagcaacagcaaaaccaccagcaacagcaaccccagcaccagcag
catcaacaattgcacgaactgctttcatccgcaccacgaacacctttacaacagccccgc
acacctctaggtccaatgtcatcgtcacccatgcacaatacagtgcctacaccgcttagt
agtggcgggggtggtggaggcagtttattattaaaccaacttaactgccctcaagcagcg
ctgacaaatacaccgtctgctatgcaacaactaatgcaacgtgctggtatgtctcctgtt
tcgcccgcccctcacgttccctttccacacacaagtcccatgatgcaccaccaacaaaga
caaacaccaattcatccgcccccaccatatgaagtcgcagttgcaagtcctgccttatct
tctgcgtcatcaacagcggcatatatcaataagcaatatcactctcaagaaccgcctcat
acgcctcaaagcgtagcaaatctacattccgtgggtggtccacccagtgtttcgggtgta
catcatccctcagctagtttgggattattctcgggtaccgttagcaatacatctgccaac
gcagtaacccgcgaactacccgaagttagttctcttatcgtgaacatactgctatacgat
acagctctgaatgttttccgtgaccacaattttgacagcagcactgtgtgtgtgtgcaat
gctgactcacagcgtattggtaacattcgtggtgccgattcaggggtttatgtgcctttg
ccgggtacctccttcaatccctcgcctttaacatcgtctgcaactacagtaggaaacata
cgtgctttaagtgcctttggtgcagttagtagtggaggtggtggtggcattggaagcgct
ttagattcgccagcatcactggctggagcaggctccagctcttcaacaacaccgtcaacg
acaacacctgcgtcaaacggccaacaacacatcactggttatgtggacgatgattctgtt
gaatgcacctgcgggtttagttctgtaataaataggcgtttggcgtatggggctggtctc
ttttatgaggacgaactagaaattaccggtatagctgaagacccgggacgtaataaaaaa
caatctctcctaacgctaataagttcatttacctcgaaatctaatggaactaatggtaat
ggcgtaatggacaaagcggctgatcaattggcttattccatatttaatttactgctggat
cagtgctcaattatacaaacctccagtagcgccgttcatagagctctacaaagacatcga
cggaggctagccaaaagaaatcgtcaaccgcaatcagtcactactattgctaatgtgctc
gagtatatggatgccaatgatataatatctctggcactcgagcaagctcggcttgctttc
gatagttcgcgggtggatgtaatggatcaacagattatagcattctcccaccgtaaaagc
ggctcacaaacaattttagctctcacaggacgtttaaatgttcataaatggccgtacatg
ccagtaggcttctcccgcagcaataaggacattgttagtaccatgaaatccattcagcct
atgcttcaaaatgcattccattcgaaatcacgaagcgcagcgggtgccaaagatgctaca
tatactgtaagtggaccacttacttggcgtcaattccatcgacttgctggacgagcctct
ggtcaatgtgaaccacaaccgataccatctgtaatagtcggtcacgataaggactggatt
tcagtcgcccctctagcaattcattattgggataagttcctattggaaccttattcgtat
gcgcgagacgtagtttatctagtaatagcgcctgataatgattatgtcatcagtaaaacg
aaaacgtattttaaagaacttagcaccacctatgaaatgtgtaaattgggcaagcatacg
cttatgtgtggatggggaggaatgctaacagtgagtcagcgcccgcctacagaaaaacct
tacacgaccaatatggacaattggttacgaacaatggaagacactacattagcggagaag
ttgcgtttgtatgcccatgcctttcaacatatgttggttccctatctcaatcgtataccc
agcgataaaagtcttctaaatccccctgatgccaatattcacgcgggatctcataacaat
acccgtttgaatgcaactggcaatactagcagtcctatggctggtacaatcactggtctt
gaaaactctgatagaggcgatcatgcgtcatctacgcctatggaacatggagatctttct
caacatgcgaccacagataactctgggaatataaacgataataagggcactgatgtgaaa
ccagacgtaaaacctcctttggtgttgggtgacccgttgggcgttggtgagaccttagag
gaaattaatccgccagctattgttttatacgtagtggaacctttcacatatggatccgat
tctcccgaattggagcgactggcttgtattgctatacttagaatgtattccgaattacta
aaaagtataccagactcggtgcgagctaatatgaatattcaaattatctcgttagagtcg
atacttgaattggggcggacacgcaatcgcaaacgtttctctgatgaaataaaatgttta
gctcttaatattttctctcagtgcaggcgacacatggttcatgcgcaggctgttaaaagc
ctaactggattcggtacggccgccaatattgaagcatttcttaaaagcaaggatgaccaa
aatcgccgaccatataaaatgtacacaccaccttatatattggcacccatccacgaaaag
aatgagaaaacggatttttcgagagcagcgtctggtggcatgcgtggcagccccaatgag
cagaaatactcagttatgtactgcaattactgtatgagcgaggatcaaagctggttattg
gctacggttacggatgatcgcggagaaatgctagagaaggtctgtatcaacattgacgta
ccaaatcgtacccggcgccggaaagcacctgctcgtcgtattggtctcagcaaacttatg
gattacattttggggttaatttcgcaaactacgcaaacatggcgattagttttaggtcgt
atcggacgtatcggtcatagtgaactgaaatcatggagtgccctgctaagtaaacaaaat
ttacaaaaagctactaaacagctcaaggacatgtgcaagcaatgccaactcatgtatcca
ccaagtatattaagcgcttgcctggttacgttggaacctgatgccaaattgcgtgtaatg
cctgatcaatttacgcccgatgaacgcttctcacaaatttccatacaaaatccgctctcg
acgcctcaagatgttacttgcacccatattttggtatttcctactagtgcagtatgcttg
tcatttacacgacaatttcaaaatgaaccacaagtggatttggacaatgatttcttaaat
tttgaagaagatgaaaacgaggcttttgcagataccgatctagacgatttacttatttgg
gaaaatcgcggtatctcagatcacaacagccctgatcgtatggaggacaatcgtagttgg
cagagcgctggtggtaataattttaattcagctcaacaacaagatgttgaagaggtcggt
tctataaatcaacaacctttggctgtgggctatttggtatctacagcccctacgggacgt
atgccatcgtggttctgggctgcttgcccacatctcgaagatgtgtgtcctgtattcctg
aaaaccgctttacatttgcacgtgcccaatatacaaaccaccgacgatatacttaactcg
acaaatgcccattcatcggccacagaccatccgttggattcaactttaacggccgatgtg
ctacgttatgtacttgaaggctataatgcactgtcttggttggcattagactcgaatact
cacgatcgtttatcgtgcttacccatcaacgtacagacactgatggatctctattatttg
acagctgcaattgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
