Gossypium hirsutum (upland cotton): 107888195
Help
Entry
107888195 CDS
T04793
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: transmembrane protein 245
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AI-2E_transport
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107888195
NCBI-ProteinID:
XP_016667800
UniProt:
A0A1U8HP33
LinkDB
All DBs
Position
A01:14433205..14435757
Genome browser
AA seq
653 aa
AA seq
DB search
MELVPYSSEPKPKPSSSTLPWQDMFRSASVRKPSPAPGNSDAPPNQPHAPPQVPNSTDPD
HKNSLSGDPQVRLALYIAMAHAGLAFTIFILYAICKXLQEYFRPIQWAILCSIPLRGIQE
TLVGFWSEPLRLGLTETVLAVPVAVFKAFIGTLVDIKDVCLRVFLKRPKSNLSRRKRSGF
PMLVRWLVAFAVFVIAYERIGGVGSLGIIVLGFVISTKNIDDSLSAVSSFRSNSFRRSRM
SAYFTTRILKRLDTIVAIGLIIGMFVGFFAGATFFSYKIGVEGKDAVVSVKSHVEESNYA
ERMGVKRWMEENDVPGMVDKYTTQFYETVSEQIDNLAMQYNMTEFVTGIKHFVITSTTSS
SVRSTALMTPSPYTEKFLSLRKRVSNREWGQIYTEVDAIFRELIITREDLVQKAKGFAVK
GADVSQRVLASSASVLGGGAKIMFTIGNSILYGAAEVFNFVSQLMVFFWVLYYLITSESG
GVTEQVMSMIPISKPARIRCVEVLDEAISGVLLATAEIAFFQGCLTWLMFRLFEIHFVYM
STVLAFISPLLPIFPPWFATIPAAIELVLESRYIVAVVFSISHIVLMDYGATEIQESIPG
YSAYLTGLSIIGGMTLFPSAVEGAIMGPLITTVVIALKDLYVEFVLEEPKKKD
NT seq
1962 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagttggttccatattcaagtgaaccaaaacccaaaccaagctcctcaactcttcca
tggcaagacatgttccgatctgcatcggtaaggaagccttctccagcaccaggcaacagc
gacgcgcctcccaaccaacctcacgcgccaccccaggttccgaactcaaccgacccagat
cacaaaaacagcctctcgggtgatccccaggtacggttggctctatacatagccatggct
catgctggccttgccttcaccatattcattttatatgcgatttgcaagnctttgcaagag
tattttaggccaattcagtgggctatcttgtgttcgattcctttaagaggtatacaagaa
acccttgtgggattttggagcgaacctttgagactaggcctcactgaaactgttcttgct
gttcctgttgctgtcttcaaggcttttataggtacccttgttgatattaaggatgtctgt
ttgagggtgttccttaaaagaccaaaatctaatctttcaaggcgcaagagaagtgggttt
ccaatgctagttaggtggttagtagctttcgctgtgttcgtgattgcctatgagagaatt
ggtggtgttgggtcattgggcataattgtgttggggtttgtgattagtactaaaaacata
gatgattcattgtctgctgtttcatcatttaggagtaacagtttcaggagaagtagaatg
agtgcgtatttcactactaggatacttaaaaggttggatactattgtggctattgggctg
ataattggtatgtttgtggggttctttgctggagctacatttttctcgtataagatcggt
gttgagggaaaagatgccgtggtttcggtgaaatctcatgtggaagagagtaactatgct
gagaggatgggtgttaaaagatggatggaagagaatgatgtccctggaatggtggataag
tacactactcagttctatgaaacagtttccgagcagattgataacttggcaatgcagtat
aatatgacggagtttgtgaccggaattaagcatttcgtcataacttcaaccaccagttca
tcagtgcgatcgacagctttgatgaccccctctccttatacggaaaagtttttgagtttg
aggaagagggttagcaatcgcgagtgggggcaaatttacaccgaagtcgatgcgattttc
agagaattgataatcactcgggaggatttggtgcaaaaggctaaagggtttgctgttaaa
ggggcagatgtttcgcaacgggtgctagcaagcagtgcttctgttttaggtggaggcgcg
aagatcatgttcaccatcggcaattccatcctctacggagctgctgaggtgttcaatttt
gtatctcagttgatggtgttcttttgggttctatattaccttatcacatcagaatctggt
ggagtaacagaacaagtaatgtctatgattccaatatcaaaaccggctaggattagatgc
gtggaagttcttgatgaagctatttctggcgtgcttttggcaacagctgagattgcattc
tttcaaggatgtcttacatggcttatgtttagactgtttgaaatacactttgtgtatatg
tcaacagtgcttgctttcatcagccccttattgcccatatttccaccttggtttgcgaca
attcctgcagctatagaactagtgcttgaaagtagatacatagtagctgtggtcttctcc
attagtcacattgtgcttatggattatggtgctactgaaatccaggagagcatacctggt
tacagtgcctaccttacagggcttagcatcattggtggaatgacattgttcccttctgca
gttgagggagcaattatgggaccattgattacgacggttgtgatcgctttgaaagatctc
tatgtggaatttgttctggaagaacctaagaaaaaagactag
DBGET
integrated database retrieval system