Gossypium hirsutum (upland cotton): 107888536
Help
Entry
107888536 CDS
T04793
Name
(RefSeq) LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK2
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_1
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
APH
ABC1
Pkinase_fungal
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107888536
NCBI-ProteinID:
XP_016668168
UniProt:
A0A1U8HW45
LinkDB
All DBs
Position
A09:complement(2500212..2504135)
Genome browser
AA seq
1131 aa
AA seq
DB search
MASSSAPVFKWQPFFLLFCALNCVVWSDDSSNKAVLLEFKESVSDPSGLLSTWSKNSHHC
SWSGVTCDKDLKVLSLNITGFGKGPKGNNSLNKTAVSASFSCSNYSLYPFYGFGIRRNCG
VSNGSLSGKLLPSIGKLSELKILSLPFHRFHGEIPSEIWGLEKLEVLDLENCLLSGKLPV
TVSGLKNLRVLNLGFNNIRGEIPSWLSSLDRMEMLNLAGNLVNGTVPAFVGRFRDVYLSF
TWLGGSLPADIGEDCRLEHLDLSGNYFVGEIPASLWKCSHLRSLLLYTNMFEEGIPRELG
QLQNLEVLDVSRNSLSGPVPVELGNCSALTVLVLSNMFNPYDNLAMVKGDANYVSDDFNF
YQGAIPSEITKLSKLRVLWAPRATLEGNLPKDWGSCDNLEMVNLAQNFFAGEIPFGLTLC
KKLRYLDLSLNKRLTGELKKELAVPCMSVFDVSENSLSGNIPRFDNSRCPDVLTSDSYSF
EPFNPTSAYLSFLASKVQVGTSINFLDRDGGPAVFHKFAGNNFSGSVLSMPVSPQRLEKH
ISYAFYAGENFLSGPFPGNLFENCNGLDALFVNVSYNRMSGPIPEDISKVCKSLKFLDVS
MNQITGPIPPSMADLVSLVSLNLSWNLLQGQIPSSFGQMKDLRFLSLAGNNLTGFIPSTF
GLLRSLEKLELSSNSLSGEIPESLVNLKNLTVLLLNNNKLSGQIPSGLANVTMLSSFNVS
FNNLSGPLPSSNNLMKCSSLLGNPLLQPCRSYTLMPSSDQARAGDSQNDAASPPGPATQK
NRNSGFRSIEIASITSASAIVSVLLALVILFLFTRKWNSRSKISTTKKEVTIFTEILVPL
TFDIVVQATGNFNASNCIGNGGFGSTYKAEISPGVLVAIKRLAIGRLQGFQQFDAEIKIL
GRLRHPNLVTLIGYHASETETFLIYNYLPGGNLEKFIQERSTRAVEWRVLHKIALDIARA
LAYLHDQCVPRILHRDVKPSNILLDDDHNAYLSDFGLARLLGTSETHATTGVAGTFGYVA
PEYAMTCRVSDKADVYSYGVVLLELLSDKKALDPSFSPYGNGFNIVQWSCMLLRQGQAKE
FFTAGLWDAGPQNDLVEVLHLAVVCTVDSLSTRPTMKQVVRRLKQLEPPSF
NT seq
3396 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcttcgtcttcagctccagttttcaagtggcagccatttttcttactcttctgtgcg
ttgaactgtgtcgtttggagtgatgattcttcaaacaaagctgttcttcttgaatttaag
gagtctgtctcagatccttcggggcttttatccacttggtccaagaattcccatcactgt
tcatggtctggtgttacatgtgacaaagacttaaaggttctgtctcttaacataactggt
tttgggaaaggtccaaaaggtaacaatagtctcaacaaaacagctgtttctgcttcgttt
tcttgttctaactacagtttatacccattttatggatttggtattagaaggaattgtggg
gtaagtaatgggagtttgtctggtaaattgttgccttccattgggaaattgagtgaactt
aagattttatcacttccttttcatagatttcatggtgaaatcccttctgaaatttggggg
ttggaaaagttggaagtacttgatttagagaactgtttgttatctgggaaattgcctgtt
acggtttccgggttaaagaatttgagagttcttaatttggggtttaataatatcagagga
gagataccaagttggctttcgagtttggaccgaatggagatgttaaacttggctggtaat
cttgtgaatggaaccgttccagcatttgtgggaaggtttagagatgtttatttgtcgttt
acgtggctaggggggtcattaccggctgatattggtgaagattgtaggcttgagcatttg
gatttatcggggaactactttgttggggagattcctgctagtttgtggaagtgtagtcat
ttgaggtcgttgttgttatatacaaatatgtttgaagaaggcattccacgtgaactcggt
cagcttcagaatcttgaagtgttggatgtttcaaggaatagtttgagtggtccggtacct
gttgagctcgggaactgttctgctttgacagtgcttgttctttcaaatatgtttaatccg
tatgataaccttgctatggttaaaggggatgcaaactatgtaagtgatgattttaatttt
tatcaaggtgcgatcccgagtgagattacaaagctttcaaagctgagggtattatgggct
ccaagagcaacgttagagggcaacttgccaaaagattggggttcttgtgataacttggag
atggtgaatttggcgcagaatttctttgccggtgaaattccgttcggtctcacgctctgc
aagaagctgcggtatcttgacttaagcttgaataaacgccttactggagagcttaaaaag
gaacttgcagttccttgtatgagtgtcttcgatgtcagtgaaaattccttgtcaggtaat
atcccaagattcgacaacagtagatgtcccgatgttcttacatcggattcctattctttt
gaacccttcaacccaacatctgcatatttatcatttttggcaagtaaagttcaggttgga
acatctatcaattttttggacagagatgggggtcctgctgtgtttcacaaatttgctggt
aacaacttcagtggcagtgtcttatcaatgccggtctcaccccaaagattggagaaacat
atttcttatgcattttatgccggagagaactttctcagtggaccatttcctgggaatttg
ttcgagaactgcaatggattggatgcactgtttgttaatgtcagctacaacagaatgtct
ggtccaattccggaggacatcagtaaagtttgcaagtctctcaaatttctggatgtctct
atgaatcaaataactgggccgattcccccgagcatggcagacttagtttcacttgtttct
cttaatttgagttggaacctgttacaaggtcagattccgagcagttttgggcagatgaag
gatctccggtttctttctttggctggtaacaatctgactggttttattccttccacgttc
gggctgttgcgatctttagagaagttggagctgtcgtcaaattcactttctggtgaaatt
cctgaaagcctggttaacttgaaaaatctgactgttcttctgctcaataacaacaaattg
tccgggcaaattccctctggtttggcgaatgtgactatgctctcttctttcaacgtgtcc
ttcaataacttgtcggggccactgccgtcgagtaataatttgatgaaatgcagcagcctt
ctcggaaaccctcttctacaaccgtgccgttcatacaccttaatgccatcttcagatcaa
gctagagcaggtgattcacaaaatgatgctgcatcacctccgggacctgcaactcaaaag
aatagaaatagtggtttccgttcaatcgagatagcatcgataacatctgcttcagccatt
gtttccgttcttctggctcttgttattttattcctatttacgaggaagtggaattcaaga
tccaaaatcagcaccaccaaaaaagaagtgactattttcacagaaatcctggtgccattg
acatttgacattgttgtgcaagccacagggaatttcaatgccagcaactgtattgggaat
ggaggtttcgggtcaacttataaagccgagatctctcctggagttttagttgcaataaag
cggcttgctattggacggttacaaggctttcaacagtttgatgctgaaattaaaattctc
gggaggttacgccacccgaatcttgtcactttaatcgggtaccacgccagtgaaactgag
acattccttatatacaattatttgcctggtggtaacttggaaaagtttattcaagagagg
tcgacgagagctgtggaatggagggtacttcacaagattgctttagacatagcccgagct
ctcgcctacctacatgatcaatgtgtaccacgtattctccatcgtgatgtcaaaccaagc
aatatcttgttagacgatgatcacaatgcttatttatcggatttcggtttggccagactt
ttgggaacttcagaaactcacgctaccacaggtgttgctggaacgttcgggtatgttgct
ccggaatatgcaatgacttgccgtgtttctgataaagctgatgtttacagttatggggtg
gtactcctcgagctgctctctgataagaaagctttagatccttcgttttctccttacgga
aatggtttcaacatagttcaatggtcttgcatgctcttacgacaaggccaagccaaagag
ttcttcactgcaggtttatgggatgcaggtccccaaaacgacctggtcgaagttctacac
ttggcagttgtgtgtactgtcgattcactctcgactagacctacaatgaaacaagtagta
cgacggctaaagcaacttgagccaccgtcattttag
DBGET
integrated database retrieval system
