Gossypium hirsutum (upland cotton): 107889535
Help
Entry
107889535 CDS
T04793
Name
(RefSeq) probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g06940
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_1
Pkinase
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
LRR_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107889535
NCBI-ProteinID:
XP_016669485
UniProt:
A0A1U8HTY0
LinkDB
All DBs
Position
A09:71023572..71026774
Genome browser
AA seq
886 aa
AA seq
DB search
MATLCKYPFLLSLCFTFFMFSSASTQEADALLNFKAFIDDPNHSLSSWSNNSGVHHCNWT
GITCIPTPSLYVSSIDLQSLNLSGEIPSSICELPYLSHLNLADNLFNQPIPLHLSECSSL
ETLNLSKNLIWGTIPDQISQFDALKVLDLSKNHIEGKIPESIGSLVHLQVLNLGSNLLSG
TVPFVFGNFTELAVLDLSQNAYLASAVPTDIGKLEKLEQLFLQRSGFLGEIPESFVGLNN
LITLDLSQNNLTGKLPQTLGSSLKNLVSFDVSENKLLGSFPSGICDGKGLKILSLHTNFF
NGSISESISKCLNLEIFQVQNNGFSGDFPNGLWSLPKVMLVRAENNRFSGELLDSISKAA
QLEQVQIDNNSFTGKIPQGLGLVKSLYRFSASLNGFSGEIPPNFCDSPVMSIINLSHNTL
SGQIPELRKCRKLVSLSLADNSLTGEIPPSLADLPVLTYLDLSHNQLSGSIAPALQNLKL
ALFNVSFNQLSGRVPSSLISGLPASFLEGNSGLCGPGLPNPCSDEHPKHHSSGLTTLTCA
LISIAFAMAMVIVAAGVFVFHRFSKRKSQPGVWRSVFFYPLRLTEHDLVMGMDEKSALGN
GGPFGRVYTISLPSGELVAIKKLVNFGTQPSKALKAQVKVLAKMRHKNIVKILGFCHSDE
SIFLIYEFLQKGSLGDLICRPDFELHWSARLRIATGVAQGLAYLHKGYVPHLLHRNLKST
NILLDADYEPKLTDFAIDRIVGEAPFQSTITSEFAHSCYNAPECRYSKKATEQMDVYSFG
VVLLELITGRQAEDIESLDSLDIVKWVRRKVNITNGALQILDPKISSSSSQKEMLRALET
ALHCTAVMPEKRPSMIEVVKTLESLNSGSCVPSTLDSEEQMQSVGV
NT seq
2661 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctacactctgcaaatacccttttcttctctccctctgcttcacattcttcatgttt
tcctcagcttcaactcaagaagctgatgcccttcttaatttcaaggctttcattgatgac
cctaatcactctctttccagttggtctaataattcaggtgttcatcactgtaactggact
ggtattacctgcattcctactccttcactctatgtatcctccattgaccttcaaagcttg
aatctttctggtgaaataccatcttcaatatgtgaactgccctatttgtctcatcttaac
cttgctgataacctttttaatcagcctattccactgcacctctctgagtgcagttccttg
gagactttgaatcttagtaaaaatctcatttggggtaccatcccagatcagatttcacag
tttgatgccttgaaagttcttgacttgagcaaaaatcatattgaagggaagattcctgag
agtattgggtcattggtgcatcttcaagtgctcaacttgggaagcaacttgctttcaggt
actgttccttttgtgtttggcaattttactgagcttgctgtacttgatttgtcccaaaat
gcttacttggcgagtgcggttcctactgatatcggaaagcttgagaagcttgagcagctg
tttttgcaaagatctggttttcttggtgaaatccctgaatcttttgttggtttaaataat
ttgatcactttggatctttctcagaacaatctaactggtaagcttccacaaacactaggc
tcttctctaaagaacttggtgtcctttgacgtctcagagaacaagctcttggggtcattt
ccaagtggtatttgtgatggaaaaggccttaaaatcctcagtctccatactaatttcttt
aatggttcaatatctgagtccatttctaagtgcttgaaccttgagatttttcaagttcaa
aacaatggattctcaggtgatttccctaatggattatggtccttaccaaaagttatgctg
gtcagagcagaaaacaataggttctctggggaattgttagattcaatatcaaaggctgct
cagttggagcaagttcagatagacaataatagctttactggtaaaataccacagggtctt
ggcctggtaaagagcttatacagattttcagcttctcttaatggtttctctggtgaaata
cctccaaacttttgtgattcacctgttatgagcataataaatctttcccacaataccctg
tcaggtcagattccagaattgaggaaatgcaggaaactggtttccttgtctttagcagac
aatagtcttactggagaaatcccaccttcccttgctgacctaccagtgctaacttacctt
gatctatctcataaccaacttagtggttccattgcaccagcgttgcagaacttaaagctg
gctctcttcaacgtatccttcaaccaactctctggtagggtcccatcgtctctaatatca
ggcctaccagcttcatttttggaaggaaattctggactctgcggccctggattgccaaat
ccttgctccgatgaacacccgaaacatcattcttctggtttgacaaccttgacatgtgcc
ctcatatctatagcttttgccatggcaatggtgattgttgctgctggcgtgtttgtgttt
catagattttccaagaggaagtctcagccaggcgtttggagatcagtcttcttctaccct
cttagactcaccgagcatgatttagtaatggggatggatgagaaaagtgctctaggaaat
ggtggtccttttggtagggtttataccataagtctacccagtggtgaactagttgctata
aagaaactggtcaattttgggacccaaccttccaaagcgttaaaggcccaagtgaaggta
ttggccaagatgaggcataagaacattgttaaaattctggggttttgccattcggatgaa
tcgattttcctcatttatgaattcctgcagaagggtagtttaggggatttgatttgcaga
ccggattttgagttgcattggagtgctagattgaggattgcaaccggggtggcacaagga
ttggcataccttcacaagggttatgttccacatttgcttcatagaaatctcaagtcaacg
aacattcttctcgatgcggattatgaaccgaagcttacggattttgcaattgataggata
gttggagaagctccatttcagtctaccattacttcagaatttgcacactcctgctataat
gcaccagaatgtagatacagtaagaaagctaccgaacagatggatgtttatagctttggg
gtggtgctgttagagctcataactggtcgacaagctgaagacattgaatccttggactca
ctcgatatcgtgaagtgggttcgaagaaaagttaatattaccaatggagcattacaaatt
cttgaccctaagatatcatcaagttcttcccagaaggaaatgctaagagctctggaaacc
gccctgcactgcaccgctgttatgccagaaaaaaggccatcgatgattgaagtggtgaaa
acacttgagtctcttaactcaggttcatgtgttccgtctactttggactccgaggagcaa
atgcagtcggttggtgtttga
DBGET
integrated database retrieval system