Gossypium hirsutum (upland cotton): 107890526
Help
Entry
107890526 CDS
T04793
Name
(RefSeq) probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g28040
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_4
LRRNT_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107890526
NCBI-ProteinID:
XP_016670484
UniProt:
A0A1U8I441
LinkDB
All DBs
Position
D09:50890239..50893648
Genome browser
AA seq
985 aa
AA seq
DB search
MGMLTKGSLHFLICLLLCMDYYCMGDDESSSVQLNDDVLGLIVFKSDIKDPSSYLESWNE
DDNSPCSWRFIKCNPNNGRVSEVSLDGLGLSGKIGKGLQKLEYLKVLSLSRNNFSGIIGR
AFGVLNSLERLDLSYNNLSGSIPSTFVNMNSIRFLDLSGNSLSGSIPEELFQTCSSLRFL
SLSENSFDGQLPSTLSKCSYLNYLNVSKNHFSGNIDFVSGIWSMYRLRALDLSYNSFSGS
VPEGVLALHYLKQLHLQFNGFSGPMPADIGLCPHLNSLDFSHNLFSGPLPDSLQRLNSLV
FFSLSYNMFTSEFPPWISTLSSLEHLDFSSNSLTGSLPSSTGNLKTLKYLRLSNNKLVGS
IPAGLFDLGLEDMDLSDNRLNGSIPRGSSSLFESLRNLDLSRNNLEGTIPAEMGLFANLR
YLNLSWNKLESSIPPELGLFPNLTVLDLRNNALSGDVAGDICESGSLVILQLDGNSLTGP
IPDEIGNCSSLYSLTLSHNNLTGSIPKSISKLTELKILKLEFNELSGEIPKELGLLENLL
AVNVSYNQLIGRLPVGGIFPSLDQSALQGNLGICSPLLKGPCKLNVPKPLVLDPDAYKGR
MGDHRRRNESANPIRFHHRNSLSVSAIIAISAAVLIVCGVIIISLLNISVRRRLEFVETA
LESMCSSSTRSGSPTAGKLILFDSKLSTNGIGNPEILLNKAAEIGEGVFGTVYKVPLNPQ
GRFVAIKKLVISNMIQYPEDFDREVRVLGKARHPNLISLEGYYWTPQSQLLITEYATNGD
LQTKLHERPATAPPLSWSNRFKIILGTAKGLAHLHHSFRPPVIHYNIKPSNILLDENYNP
KISDFGLARLLTKLEKHVISNRFQSALGYVAPELACQNLRVNEKCDVFGFGMLILELVTG
RRPVEYGEDNVVILSDHVRVSVEQGNVLDCVDLGMVDYPEDEVFPVLKLALVCTSQIPSS
RPSMAEVVQILQVIKTPVPQRMEPL
NT seq
2958 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggatgttaacgaagggttctcttcattttctgatttgcttgcttctttgcatggat
tattattgcatgggagatgatgagtcttcttccgttcaactcaacgatgatgtacttggc
ttgatagtgttcaaatcagatatcaaagacccttcatcttatcttgaatcctggaatgaa
gatgataactcgccttgttcatggcggttcatcaaatgcaacccaaacaacggtcgtgtc
tcagaggtatctcttgatggtttaggattatcgggaaagatcggcaaagggctacaaaag
ttggagtatttgaaggtattatcactgtctcgtaacaatttcagtgggataattggtcgg
gcatttggtgtgcttaacagtcttgaaaggcttgatcttagttataataatctttctggg
tcaattcctagcacttttgttaacatgaattcgattagattcctcgatctttccgggaat
tctctttcgggttcaatccctgaagaactctttcaaacttgttcttcacttagattcctt
tctttatctgagaattcatttgatggccaattaccgagcacattgtctaaatgttcatat
ttgaattatcttaatgtttccaaaaaccatttctctggtaacatagattttgtttctggg
atttggtcgatgtatcggcttcgagctttggatctgtcttacaattcattttctgggtca
gttccagaaggtgttttagcattgcattacttaaaacagctccatttacaattcaatggc
ttctcaggaccaatgcctgcagatattggactatgtcctcatctaaattcattggatttc
agccataatcttttcagcggaccacttccagattctcttcagagactaaattcattggtt
ttcttcagtttatcatataacatgttcaccagtgagtttcctccatggattagtacctta
agcagcttggaacacttggatttctcaagcaatagtttaacaggtagcttgccatcatca
actggtaatctcaaaactctaaaatatttgagattgtcaaataataagctcgttggtagc
ataccagctggtttatttgatctgggattggaagatatggatctttctgataataggtta
aacggttcgatcccgagaggttcaagtagtcttttcgagtctcttcgaaacttggatctg
tctagaaacaatcttgaaggtacaattcctgcagaaatggggctttttgctaacctgagg
tacttgaacttatcttggaacaagcttgaatcaagcataccaccagaactcgggttattt
ccaaacctgaccgtgttggatcttcgaaacaatgctttatccggtgatgttgcaggggat
atatgtgaatctgggagcttggttattcttcaattagatgggaactcattgactgggccg
attccggatgagattggcaactgttcgtcattgtactcactgacattatctcacaacaat
ctaaccggttcaatcccgaaatcgatttcgaagttgaccgagcttaagattctcaaactt
gaattcaacgaactaagtggagaaattccaaaagagctcgggttgttggaaaatcttctt
gctgtgaatgtatcatacaatcaacttataggtaggcttcctgtaggaggcatatttcca
agcttggatcaaagtgctttgcagggaaatttggggatttgttcgccattgttgaaagga
ccgtgtaagttgaatgtgccgaaacctttagttctcgatccggatgcgtataagggtcga
atgggtgatcataggcgaagaaacgaatctgcaaacccaataagattccatcatcgtaac
tcccttagtgtttctgccattatcgcaatttcagcagctgttctgattgtatgcggggtg
ataattatcagcctcttaaacatttcagttcgaaggcgactcgaatttgtggagacagca
ctggaaagcatgtgttcaagttcaacaagatccggaagtccaaccgcaggcaagctcatt
ttgttcgattcaaagctatcgactaatgggatcggcaaccctgaaatcctcctcaacaaa
gctgcagagattggtgaaggagtattcggaacagtttacaaggtcccattgaatcctcaa
ggaagattcgtagcaatcaaaaagctggtgatatcgaacatgattcagtatccagaagac
ttcgaccgagaagttcgagttctcggaaaagcaaggcacccgaatttgatatcactggaa
ggatactattggacacctcaatctcaacttctgataacagagtatgcaactaatggagac
ttgcaaacaaaactccatgaaagaccagctacagccccaccactttcgtggtccaaccgc
ttcaagataatccttggaacagctaaaggattggctcacttgcaccactcattcaggcca
ccagtaatccattacaacataaaaccaagtaacatcctcctcgacgagaactacaatccg
aagatttcggattttggattagcaaggcttttaacgaagctcgaaaagcatgtgatcagc
aacaggtttcagagtgcactaggatacgtagcaccagagctagcatgtcaaaacttaagg
gtcaatgaaaaatgtgatgtattcggtttcgggatgttaatcttggagcttgtgaccgga
cgaaggccggttgagtatggggaagataatgtcgtgatactgagtgatcatgttcgagtt
tccgtcgagcaagggaatgtgttggattgtgttgatctaggtatggttgattatccagaa
gatgaggtgtttccagtgctgaaattagcactggtttgtacttctcagataccttcaagc
aggccttcaatggcggaagtggtgcaaatacttcaagttatcaaaaccccggttccacaa
agaatggaaccattgtga
DBGET
integrated database retrieval system