Gossypium hirsutum (upland cotton): 107890534
Help
Entry
107890534 CDS
T04793
Name
(RefSeq) extensin-2-like
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pollen_Ole_e_1
Extensin_2
DUF6234
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107890534
NCBI-ProteinID:
XP_040957214
LinkDB
All DBs
Position
D09:complement(50941912..50945983)
Genome browser
AA seq
936 aa
AA seq
DB search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NT seq
2811 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgctccttggggcgaccctgccaggggtcagttttggtcccaaatgttggtggct
ttggctgttgttgtcgttgctgttgcgagtaatgtaggtgttgcgtcggctgatagttat
gtatactcttcacctcctccaccaccttatgagtataagtcacctccaccaccttctcca
tctcccccaccaccatacgtgtataaatctccaccacctccttcaccttctccaccacca
ccttatgagtacaagtcaccaccacctccaccgaaacatgaagtgaaccctccataccac
tataaatctccaccaccaccgtctccatcacctcctcctccatactattataagtctcct
ccaccaccatccccgtcaccacctcctccatactactacaagtctccaccaccatcatcc
ccatcaccacctcccccgtactactacaagtctccaccacctccatccccatccccacct
cctccatattactataagtctccaccacctccgtccccgtcaccacctcctccttattac
tacaaatccccaccacctccatctccttccccacctcctccatactactacaagtcccca
cctcctccatctccatctccatctccacctcctccatattactacaaatctccaccacca
ccgtccccatcaccacctcctccttactactacaaatccccgccgcctccatctccttcc
ccaccaccaccttactactacaagtctccccccccaccttctccttcaccacccccacct
tactattataagtctccaccaccaccatcaccatctccaccacctccttactactacaaa
tctccaccaccaccctcaccatctccaccaccaccttactactacaagtccccaccacct
ccagtgaagtctcccccaccaccatactattataagtctcccccaccaccatcaccatct
ccaccacctccttactactacaagtctccaccaccaccttcaccatctcctccaccacct
tactactatacgtctccgccacctcctccgcattacgtctctccaccatactactacaaa
tcaccacctcctccaactccatatcatcccgcccctcacccccacccccacccattcata
gtcaaggtcgttggtaaagtttactgctacaggtgctatgactggagctatccagcaaaa
tcgcacaacaagaaacatctcaaagatgctgttgtggaagtgacttgcaaggttggagaa
aaggagatcacagcttacggaaaaaccaaaatcaatggaaaatttagcatcacagttgaa
ggatttaactatgccaaatatggagctgaggcatgcaaggccaagctccatgccccaccc
aagggttcatcttgcaacattgctaccggtctgcatgggggcaacaagggtgccatgctc
accgtgaagtccaaggacaagtatgaggttgtgcttaaggctgagccatttgcctatgct
ccaaagaccccttacaaggagtgtgagaagccaaagccaaagcctactccagctccttac
tattacacctctccaccaccaccatcgcctacttatgcttacaagtcaccacctcctcca
ccatactattacaagtccccgccaccaccaagccctacctatgtttataagtcaccacca
ccaccaccatactactacaaatctccacccccaccagtccactctccacccccaccatat
tactacaagtctccacccccaccatactactacaaatcaccaccacctccagtgaaggcc
ccagcaccaacctaccactacaactccccgcctccaccatcaccatctcctcctcctcct
tactactacaaatccccaccacctccatctccatcaccaccacctccatactactacaaa
tcccctcctcccccgtcttcatctccgcctcctccttacaactacaagtccccaccacca
ccagtccactctccaccaccaccatactactacaaatctccaccaccaccagtccactct
ccaccaccgccataccattacaaatccccaccaccaccaattcattcccctccaccacca
tactattacaaatcaccaccacctccagtgaaggctccagcaccaacttaccactacaac
tcccctcctccaccatcaccatcaccaccaccatactactacaaatctccacctcctcca
tctccatcaccaccaccaccatattactacaaatctcctcctcccccatcgccatctcct
cctcctccctactactacaaatctccaccacctccatctccatcaccaccaccaccatac
tactacaaatctccacctcccccatcaccatctccacctcctccctactactacaaatct
ccaccaccaccagtccactctccaccaccaccctactattacaagtccccacctccccca
tctccatcaccaccaccaccatactactacaaatctcctcctcccccatcgccatctcct
cctcctccttactactacaaatctccaccacctccatctccatcaccaccaccaccatac
tactacaaatctccacctcccccatcaccatctccacctcctccctactactacaaatct
ccaccaccaccagtccactctccaccaccaccctactattacaagtccccacctcctcca
tccccttcaccccctcccccatactactatcactcacctcccccaccagtgaaatcacct
ccacctccagcctatatttacgcttctcctccaccacctactcactattga
DBGET
integrated database retrieval system
