Gossypium hirsutum (upland cotton): 107897667
Help
Entry
107897667 CDS
T04793
Name
(RefSeq) protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 6-like
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
LRR_1
LRR_4
LRR_8
LRRNT_2
LRR_6
DUF6479
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107897667
NCBI-ProteinID:
XP_016678678
UniProt:
A0A1U8IQH5
LinkDB
All DBs
Position
D06:54149936..54156396
Genome browser
AA seq
724 aa
AA seq
DB search
MTEIWRKGLVLVLLTVCILGCANAATDQGDASALGVMFSGLNSPQQLTGWTANNGDPCGQ
SWKGVTCSDQRVTEIKLSNLALSGSVGYSLQSLTSLKELDLSNNNLAGDIPYDIPQNLQR
LNLAFNQFTGSVPYSINQMHSLQYLNLAHNQLQNQLSDMFGPLSSLSTLDLSFNSLTGDL
PESFKNLTSMNSMYLQNNQLTGTIDVLANLPLDTLYVSNNHFTGWIPDQLKSINLQKDGN
SWSLGPAPPPPPGTPPATRNNRNHKSGSNSSPSDGDSSGGPGGGSKSGIGGGVIAGIVIS
ILIVGALVAFFLVKRRSRRTSSDIEKLDNQPFAPLPSNEVQEMKSIQSASSVDTKTFDTP
ASINLRPPPVDRHKSFDEEDFSKKPFVVKKAVAAPKNVASYSIADLQMATGSFSVENLLG
EGSFGRFYRAQFDDGKVLAVKKINSSVLPSELSDDFIEVVSNISELHHTNITKLVGYCSE
HGQHLLVYEFHKNGSLHEFLHLSDEYSKPLIWNSRVKIALGTARALEYLHEGCLPSIVHK
NIKSENILLDAELNPHLSDSGLATFIPNADQVLNHDDVTMSGYGAPEVTMSGQYSLKSDV
YSFGVVMLELLTGRKPFDSTRPRLEQSLVRWATPQLHDIDALSKMVDPALEGLYPVKSLS
RFADVIALCVQPEPEFRPPMSEVVQALVRLVQRANMSKRTIGTDQGASQRTDNVVADDAH
DYVS
NT seq
2175 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacggaaatttggagaaaaggtttggttttggtgctgcttacagtctgcattttggga
tgtgcaaatgctgctacagatcaaggagatgcttctgccctaggggttatgttcagcggt
ttaaattcaccacagcagctaactgggtggaccgctaacaatggtgatccatgtgggcag
tcctggaaaggtgttacttgctcagaccaacgtgtcactgaaattaagctgtcaaatcta
gcactttccgggtcagtgggttacagccttcaaagtttgacatcattgaaggaactggac
ttgagcaataacaatcttgcaggcgatataccatatgatattcctcaaaacttgcagcga
ttaaatcttgcatttaatcaatttactggaagtgtcccttattccataaatcagatgcat
tctcttcaatacctaaatcttgcacataaccagttgcagaaccaattgagtgacatgttt
ggaccactttcttccctctctacattggatctctctttcaattctctgactggtgatctc
cctgagagttttaagaatcttactagtatgaactctatgtacttgcagaacaaccagtta
actggcactattgatgtgcttgccaatcttccccttgacactctttatgtctccaataat
cattttactggctggatacctgatcaattgaaaagcatcaatttgcagaaggatggtaat
tcctggagcttggggcctgcacctccacctcctcctggtacccctcctgccactagaaat
aatagaaatcacaaatctggtagcaatagttcaccatcggatggtgattctagtggtggg
cctggtgggggtagcaaatcagggattggaggtggagtcatagcaggaatcgtaatatcc
atccttattgttggggctcttgtagcattctttctggtgaagagaagatccaggaggaca
tcctcagatattgaaaagcttgataatcaaccctttgctcctcttccttctaatgaagtg
caagaaatgaaatctatacagtctgcctcttcagttgacaccaagacctttgatacacct
gcttcgataaaccttcgacccccacctgttgaccgtcacaaatcatttgatgaagaagac
ttttctaaaaagccttttgttgttaagaaggctgttgcagctcctaaaaatgttgcatca
tattcaatagcagacctccagatggctactggcagtttcagtgttgaaaatcttcttggt
gaaggatcttttggacgtttttatcgagctcaatttgatgacggcaaggttcttgctgtg
aagaaaataaattcatcagttcttcccagtgaactatctgatgattttatagaggtagtt
tcgaatatctccgagttgcatcacacaaacatcacaaagctggttggctattgttcagag
catggacagcacctacttgtgtacgagttccacaaaaatggctcactccatgagtttctg
catctatcagatgagtacagcaagccattgatttggaactcccgtgtcaaaattgctctg
gggactgcacgtgcattagagtacctgcatgaaggttgcttgccatctattgttcataaa
aatatcaagtcagaaaacatcttacttgacgctgaactcaatcctcacctttcagactca
ggcttggcaacctttattccaaatgcagatcaggtactaaatcatgatgatgttaccatg
tctggatacggtgcacccgaagttaccatgtctggtcagtattctcttaagagtgatgtt
tacagttttggagtggttatgttggaacttctcacaggacgtaagccatttgatagcaca
aggccaagactagagcagtctttggttcgatgggcaacacctcagctgcatgatattgat
gctttatctaagatggttgaccctgcacttgaagggctttacccggttaagtctctctct
cggtttgccgacgttattgcactttgcgtccagccggagcccgaattccggcctcctatg
tcggaagtggttcaagcattggttcgactagtgcaacgagctaacatgagtaagagaaca
atagggacagaccaaggtgcatctcagagaaccgataacgttgtcgctgatgatgcacat
gactacgtgtcttga
DBGET
integrated database retrieval system