Gossypium hirsutum (upland cotton): 107911841
Help
Entry
107911841 CDS
T04793
Name
(RefSeq) LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK2
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
LRR_1
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_4
LRR_8
LRRNT_2
LRR_6
APH
ABC1
Pkinase_fungal
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107911841
NCBI-ProteinID:
XP_016695283
UniProt:
A0A1U8K2S7
LinkDB
All DBs
Position
D11:6567664..6571573
Genome browser
AA seq
1140 aa
AA seq
DB search
MGFFSASVIKWQPFFLLFSCVLNSVVLGDNSSDKAVLLEFKKSVLDPSGLLSTWTENSGH
CSWSGVSCDKNSKVLSLNITGFGNGKKGNFNNTNAFLSFSCSDYSVFPFYGFGIRRNCGE
SNGGLYGKLLPSIGKLSELRILSLPFHRFGGEIHAEIWELENLEVLDLENSLLSGTLPVS
VSGIKNLRVLNLGFNNISGEIPSWLSSLKQMEILNLAGNLVNGTVPGSFGRFRGVYLSFT
SLGGLLPPDIGEGCKLEHLDLSGNNLVGQIPASLGNCSQLRSLLLYTNLLEEQIPHKIGQ
LRNLEVLDVSGNSLSGPIPVELGNCSGLTVLVLSNMFNPYDDLAIAKGDRSTVKDDFNFY
QGGIPSEITKLSKLRILWVPRATLEGNLPSDWGACDDLEMVNLAQNFFAGEIPIGLSYCK
KLRYLDLSSNKRLAGELIEELAVPCMSVFDVSENSLSGSIPRFYNQGCPEVLTSDSYAIE
PFNPTSAYLSFLARKLQVGTHFEFFGGDGGPTVFHNFGDNNFTGSVLSVPIPPKRLGKQI
SYAFYAGENLLSGPFPQNLFENCNELGSLYVNVSYNRMSGQIPAEMSKICKSLKFLDVSG
NQITGSIPPSIGDLVSLVSLNLSWNLLRGWIPSSFGLMKDLRYLSLSGNNLTRSIPSTFG
RLQSLEILEMSSNSLSGEIPEGLVNLRNLTVLLLNNNKLFGKIPSGLANVTKLSAFNVSF
NNLSGPLPSSYNLMKCSNLLGNPLLQPCHEYSSMSSSDQARAGNSQNYAASPRGSATRRN
GNNGFNSIEIASITSASAIVSVLLALIILFIYTRKWNSKSKIISTTKKEVTIFTNIGVPL
TFDSVVQATGNFNASNCIGNGGFGSTYKAEISPGVLLAIKRLAIGRLQGFQQFDAEIKIL
GRLRHPNLVTLIGYHASEMETFLVYNYFPGGNLEKFIQERSARAMDWRILYKIALDIARA
LAYLHDQCVPRILHRDVKPSNILLDDEYNAYLSDFGLARLLGTSETHATTGVAGTFGYVA
PEYAMTCRVSDKADVYSYGVVLLELLSDKKALDPSFSPYGNGFNIVQWSCLLLRQGQAKE
FFTAGLWDAGPQNDLVEILHLAVVCTVDSLSTRPTMKQVVRRLKQLQPPSCYLHDEVSLH
NT seq
3423 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtttcttttcagcttcagtgatcaagtggcagccatttttcttactcttctcctgt
gtattgaacagtgtcgttttgggtgataattcttcagacaaagctgttcttcttgagttt
aagaagtctgtcttagatccttcagggcttttatcaacttggacagaaaattccggtcac
tgttcatggtctggtgtttcatgtgataaaaactctaaggttttgtctcttaacataact
ggttttggtaatgggaaaaaaggtaatttcaacaatacgaatgcttttctctcgttttct
tgttctgattatagtgtatttccattttatggatttggtattagaaggaattgtggggaa
agtaatgggggtttgtatgggaagttgttgccttctattggaaaattgagtgaacttaga
attttatcacttccttttcatagatttggtggtgaaattcatgctgaaatttgggagttg
gagaatttggaagtacttgatctagagaacagtttgttatctgggactttgcctgttagt
gtttctgggataaagaacttgagagttcttaatttggggtttaataacattagtggagag
ataccaagttggctttcaagtttgaaacaaatggagatattgaatttggctggtaatctc
gtgaatggaaccgttcccggatcttttggaaggtttcgaggtgtttacttgtcatttaca
tcgctcggtggcttgttgccccctgatattggtgaaggttgtaagcttgagcatttggat
ttgtctgggaataacttggttgggcagattcctgctagtttggggaactgtagtcagttg
aggtcgttgttgttgtatacaaatttattggaggaacaaattcctcacaaaatcggtcag
cttcgaaatcttgaagtgttggatgtttcagggaatagtttgagtggtccaatacctgtt
gagcttggaaattgttctggattgactgtgcttgtgctctcaaatatgtttaatccatat
gatgaccttgccattgctaaaggcgatcgaagcactgtaaaggatgattttaatttttat
caaggtgggattccttctgaaatcacgaagctttcaaagctgaggatattatgggttccg
agggcaacgcttgagggaaacctgccaagtgattggggtgcttgtgatgatttggagatg
gtaaatttggctcagaatttttttgccggggaaattcctattggtcttagttactgcaag
aagctccggtaccttgacttaagctcaaataagcggcttgctggagagcttattgaggaa
cttgcggttccttgtatgagtgtgtttgatgtcagtgaaaattccttgtcaggttccatc
cctagattctacaaccagggatgccctgaagttctgacctcagattcatatgccattgaa
cccttcaacccgacttctgcttatttatcatttttggcaagaaaacttcaagttggaaca
cattttgagttctttggaggagatggtggtcctactgtgtttcacaactttggagataac
aattttactggcagtgtcttgtcggtgccaatcccaccaaaaaggttagggaaacagatt
tcttatgcattttatgctggagagaacttgctcagcggaccatttccacagaatttgttc
gagaactgcaatgagttgggttcgctttatgttaatgttagctacaatagaatgtctggt
cagattccagctgaaatgagtaaaatttgcaagtctctcaaatttttggatgtgtctggg
aatcaaattaccgggtccattccgcctagcattggagacttggtttcacttgtttcgctt
aatttgagctggaacctgttacgaggctggattccaagcagttttgggctgatgaaggat
ctccggtatctttctttgtctggtaacaatctgaccagatctattccttccacctttggc
cggttgcaatctttagaaattctggagatgtcctcaaattctctttctggtgaaattcct
gaaggtctggttaatttgagaaacctgactgttcttctgctcaataacaacaaactcttt
gggaaaattccctctggtttggcaaatgtgaccaagctctctgcattcaatgtatccttc
aataacttgtctgggccactaccctcaagttataatttgatgaaatgcagcaatcttctt
gggaacccacttctacagccttgtcatgaatactcctcaatgtcatcttcagatcaagcg
agagcagggaattcacaaaattatgctgcatcaccaaggggatccgcaacccgaaggaat
ggaaataatggtttcaattcaattgagatagcttcaataacatctgcttcagccattgtt
tcagttcttctggctcttattattttattcatatataccaggaagtggaattcaaaatcc
aaaattatcagcactacgaaaaaagaagtcacgattttcacaaacattggggtccctttg
acatttgacagtgttgtgcaggccacggggaatttcaatgctagcaactgtattgggaat
ggaggttttgggtcaacttataaagcagagatctcccctggagtcttgttggctataaag
cggcttgcaatcggacggttgcaaggctttcaacagtttgatgctgaaattaaaatcctt
gggagattgcgccacccaaatcttgtcactcttattggttatcatgccagtgaaatggaa
acattccttgtatacaattattttccaggtggtaacttagaaaagtttattcaggagagg
tccgcaagagctatggattggaggatactttacaagattgctctggacatagcccgtgct
cttgcctacctacatgatcagtgcgtcccacggattctccatcgtgatgttaagcccagc
aatatcctcttggatgatgagtacaatgcttatttatcagactttggtttggccagactt
ttgggcacatctgaaacgcatgctaccacgggtgttgctggaactttcggatatgttgct
ccggaatatgcaatgacttgccgtgtttctgataaagctgatgtttacagctatggggtg
gtgctccttgagttgctctcagataagaaagctttggatccatcgttttctccttacgga
aatggtttcaacattgttcaatggtcatgcttgctcttacggcaaggccaggccaaggag
ttcttcactgcagggttatgggatgcagggccccagaatgacttggttgaaattctacac
ttggctgttgtttgtactgttgattcgctctctactagacctacaatgaagcaagttgtc
cgacgtctgaagcaacttcaaccaccatcatgttacttacatgatgaagtttcccttcat
taa
DBGET
integrated database retrieval system