Gossypium hirsutum (upland cotton): 107914172
Help
Entry
107914172 CDS
T04793
Name
(RefSeq) G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-2
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
B_lectin
S_locus_glycop
PAN_2
ABC1
APH
Podoplanin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107914172
NCBI-ProteinID:
XP_016698457
UniProt:
A0A1U8K7I4
LinkDB
All DBs
Position
A12:80608856..80611831
Genome browser
AA seq
862 aa
AA seq
DB search
MSSLSFIFFLLLLSFHTQNAIFVTNSSPNDPSSKPPFSHEETLKTSSQATKMESTVVILK
GNATILSVNRTFELGFFTINGESDWYLGIWYSSIPTQTRVWVANREKPIKNITGSSLEIT
GTGRLVVKESPDSVVWQSDNVEKAKRFVFLETGNLVLYSSNGLKVWQSFDFPTDTWLPDM
NLTAQQALTSWKSSFDPSPGLFSLRLNPQLFNEFELVHNSINVYWSTGNWTGKAFVDVPQ
MTIPYIYNFRFSDPFLPTASFGYTERSLDGSVEPPLTRFQVDVNGQLKQYTWSAETESWN
MFWSVPEDKCGVYGLCGDFASCLVSTTLKPCACVNGFRPFNEREWGYGDFTGGCRRESGG
LCADNDGFNEIGDVRFDGGKTVSFQGTRSICEKSCLSNCSCIGLYHNEGSNTCKNVYGSL
LNLRNSSSNDLKKDVFYIRVPRGIVKKNVHRTMVFVGSVVGSIVALGFMGMILLVFKKII
DYKRKDRYDDDGVCPGLNLKVFTYKELNGVTRGFSEKLGHGGFGVVFRGKLSDSTVVAVK
RLERPGSGEKEFRAEVCTIGNIQHVNLVRLRGFCSENSHRLLVYDYMPNGPLSAFLIPDS
PNLCWDVRFRVAVGTAKGIAYLHEECRDCIIHCDIKPENILLDSDFIAKVSDFGLAKLVG
RDFSRVLATMRGTWGYVAPEWISGMAITPKADVYSYGMTLLEIIGGRRNVQAPQSAGNGN
AFNEGRDGEKWFFPPWAARRIIEGNVAAIVDSRLGVAYNLEEANRLALVAIWCIQDDEEM
RPTMGMVVKMLEGVVEVTIPPPPKLIQAIVAGESYHGIGTNSGMSKVDGCSDYNVGFSSA
GSRSSLSNLSSPLEPKFGSLIE
NT seq
2589 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttctctttccttcatcttcttccttctactcctttcatttcacacccaaaatgca
atctttgtcactaattcttcaccaaatgacccttcttcaaaaccccccttttcacatgaa
gaaacattgaaaaccagttcccaagctacaaaaatggagtccactgttgtgattctcaaa
ggaaacgcaactattcttagcgttaaccgcactttcgaactgggttttttcaccataaat
ggtgaatccgattggtatttaggaatttggtactcttcgatcccgactcaaacccgggtt
tgggttgcgaatcgtgaaaaacccataaaaaatatcaccggatcttcactggaaatcacc
ggaactgggcggttggtggtgaaggaatcgccggattccgtcgtttggcagagcgacaac
gttgaaaaagcgaaaaggtttgtttttttagagactgggaatctcgttttgtattcttca
aatgggttaaaagtatggcaaagctttgattttccgacggatacatggttgccggacatg
aatttaaccgcccagcaagctttaacttcatggaagagctcgttcgacccatcaccgggg
cttttctctttgaggctaaatcctcaattgttcaacgagttcgagctcgttcataattcg
atcaatgtgtattggtctaccggaaactggaccggaaaagctttcgtcgatgtcccgcaa
atgacaatcccgtacatttacaacttccgtttctccgaccctttcttgccgacggcgtcg
tttgggtacacggaaagatcgttagacggcagtgttgaaccgcctttgacgaggttccag
gttgatgtcaacgggcagctgaaacaatacacatggtcggcggagacagagagttggaac
atgttttggtcggtgccggaggataagtgtggagtctatggtttgtgcggcgatttcgcg
tcttgtcttgtaagtacaacgttaaaaccttgtgcttgtgttaatggatttaggcctttt
aatgagagagagtggggatatggggattttaccggtggttgccggcgagaaagtggtggt
ctttgtgctgataatgatgggtttaatgaaataggtgatgtgaggtttgatggagggaaa
acggtgtcgtttcaaggtactaggagtatttgtgaaaagtcttgtttgagtaattgttct
tgtattggattgtatcataacgaggggtctaatacatgtaagaatgtttatgggtctttg
ttgaatttgagaaattcaagctctaatgatttaaaaaaggatgtgttttacattagggtt
ccgagaggaattgtgaagaaaaatgtgcatagaactatggttttcgttggtagcgttgtt
gggtccattgttgctttagggttcatgggaatgattttgttggtttttaaaaagataata
gattacaagaggaaagatagatatgatgacgatggtgtttgccccgggttgaatctcaag
gtattcacttataaagaactcaatggtgtgactcgggggttctcagagaaactaggtcat
ggtggattcggggtggtctttcgaggcaagttatcggattcgactgttgttgctgttaaa
cgccttgaaaggccggggagtggtgagaaagaatttcgggccgaggtgtgcactatcggc
aacattcaacatgttaatcttgtgagactcagagggttttgttccgagaattcccataga
ttgttggtttacgattacatgcctaatggtcctctgagtgcatttttaataccggatagt
cctaatttgtgttgggatgtgaggtttcgggtggcggttggcactgcaaagggcatagca
tatttgcacgaggaatgcagggattgcatcattcattgcgatatcaaaccagaaaacatt
ctcttggatagtgatttcattgcgaaagtatcggatttcggattagcaaagcttgttgga
agggattttagtagggtattagctacaatgaggggtacttggggctatgtcgctccagaa
tggatatccggtatggctattaccccaaaagctgatgtttatagctatgggatgacattg
ttggaaataatcggcggccgtagaaacgtgcaagcaccacaatccgcagggaatggcaat
gcattcaatgaaggaagggatggagagaaatggtttttccctccatgggcagcacgtcga
ataattgagggcaatgttgctgcaatcgtggatagtaggcttggtgttgcatacaattta
gaggaggccaaccgtcttgcattggtagcaatatggtgtatacaagatgatgaggaaatg
aggcctacaatgggcatggtagtaaagatgttagaaggagtggtggaagtgaccatccct
ccaccaccaaaactaatacaagcaatagttgcaggcgaatcttatcacggaattggaaca
aattccggcatgtcaaaagttgatggatgctctgactacaacgttgggttttcaagtgct
ggttcacgatcatctcttagtaacctctcttctccgttggaaccaaaattcggaagtcta
atcgaatga
DBGET
integrated database retrieval system