Gossypium hirsutum (upland cotton): 107917600
Help
Entry
107917600 CDS
T04793
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS1-like
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
LRR_4
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
LRRNT_2
ABC1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107917600
NCBI-ProteinID:
XP_016702413
UniProt:
A0A1U8KN34
LinkDB
All DBs
Position
D08:35934385..35938657
Genome browser
AA seq
1275 aa
AA seq
DB search
MEFKLLFHFLCFLYLLLPISGATREQADGNPDRGALVSFKRGLQNPHFLSSWNQKIHFCK
WDGVTCRLGRVTSLSLPSRSLTGSLSPSLSSLLNLTLLDLSSNSFFGQIPTELAELTLLE
TLKLGSNSFTGNIPPELGSLNTLRTLELSTNALTGTVPTKLGQLTQLQFLDLANNFLSGS
LPSTLFENLQSLTSLDISNNSFSGNIPPEIGELKNLTALYIGINQFTGKIPPEIGKLSLL
ENFFSPSCSITGPLPEQLSNLKSLTKLDLSYNPLKCSIPKSIGKLQNLTILNLVYTELNG
SIPAELGNCRNLMMLMLSFNSLSGSLPEELSSLPMLTFSAETNQLSGPLPPWLGKWNQVE
SLLLSNNHFSGNIPPEIENCSRLKHLSLSNNKLSGSIPRELCNAESLFEVDLDGNNLSGT
IENVFVNCRNLAQLVLLNNHINGSIPEYLSELPLMVIDLDSNNFTGTIPVSLWSSNSLME
FSAGNNMLEGTLPVDIGNAVTLETLVLSGNRLKGSIPKEIGNLTALSVLNLNSNFLEGNI
PVEIGDCKALTTVDLGNNNFSGSIPMELADLDQLQCLVLSHNNLSGSIPWKPSSYFHQAN
LPDLSFVQHHGVFDLSHNRLTGPIPEELGNCAVVVDLLLNNNMLTGRIPGSLSRLTNLTT
LDLSGNLLRGPIPVEFGDSLKLQGLYLGNNQLTGTISESLGRVGSLVKLNLTGNRLSGVV
PASFGNLKELTHLDLSNNKLAGELPSSLSQMLNLVGLYVQKNRLSGEIHNLFSNSVSWKI
EDLNLSNNIFFGSLPQSLGNLSYLMYLDLHGNKFTGAIPSEIGNLMQLEYFDVSGNRLSG
QIPEEVCSLFSLFYLNLAENRLGGPVPRNGICQNLSKIFLAGNNDLCGRITGLECQIRSS
ERSSLLNAWGLAGIVAASVFIIFASAFVVRRWIMRSGQLSDPEEIEESKLNNFLDQNLCF
LSSSSRSKEPLSINIATFEQPLLKLTLGDILEGTHHFCKTNIIGDGGFGTVYKAKLPSGK
TVAVKKLSQAKTQGNREFIAEMETLGKVKHQNLVPLLGYCSLGEEKLLVYEYMINGSLDL
WLRNRSGALDVLDWSKRFKIAVGAARGLAFLHHGFIPHIIHRDIKASNILLSEDFEAKVA
DFGLARLISACETHVSTDIAGTFGYIPPEYGQSGRSTTKGDVFSFGVILLELVTGKEPTG
PEFKEIEGGNLVGWVTKKIKKGQAADVLDPVVMSVDSKQMMLQVLSIAAVCLAENPANRP
TMLQVLKLLKGIHKE
NT seq
3828 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagtttaagcttttgtttcacttcctctgtttcctctatttgttgttaccgatatca
ggggcaacgagagagcaagcagacggaaacccagataggggagctctggtttccttcaaa
agagggcttcaaaaccctcattttctatcatcatggaaccaaaaaatccatttctgcaag
tgggatggtgtcacatgtcggctcggccgagtcacctcgctttctcttccatctcggtcc
ttgacaggttctctctctccgtccctttcgtccctcttaaacctcaccctcctagatctg
tcctctaactccttctttggccaaattccgactgagttggccgagttgactctcctcgag
accctcaaactcgggtctaactctttcaccggaaatatccctcccgagctgggcagcctg
aatacacttcgtacgctagaactttccaccaatgcactcactggcacagtgccgactaag
cttggacagttaactcagctacagttcttggacctggctaacaatttcctttcaggttct
ctcccttcaacactctttgaaaaccttcagtctttaacctctctggatatttccaacaat
tctttctctggtaatatcccgcctgaaattggtgagctaaaaaacctgaccgctctttac
attggaatcaaccaatttacagggaaaataccacctgaaattggtaaactttcactcctt
gagaactttttttcaccctcttgttccataacaggacctttgcctgaacaactatccaat
ctaaaatcactcaccaagctcgacctttcttataacccattgaaatgttccattccaaag
tctataggaaagttacagaatttgactatattgaacctcgtctacaccgagctcaatggt
tcaataccagcggagcttgggaactgccggaatttgatgatgttgatgctgtctttcaat
tcgctgtccgggtccttgcctgaggagctttcaagtttgcctatgctgactttttctgct
gaaacgaaccagctttctgggccactgcccccttggcttgggaaatggaaccaggtggag
tctttgctactttcaaacaaccacttttcaggtaacatccctcctgaaattgagaattgc
tcaaggcttaagcaccttagtttgagcaataacaagttgtcgggttcgataccaagagag
ttatgcaatgcagaatcactctttgaggttgatctcgatggtaataacctttcgggtacc
attgagaatgtgtttgtgaactgtagaaatcttgctcagttggttttgcttaataatcac
attaatggttcaatcccagagtatctttcagagcttccattgatggttattgaccttgac
tccaacaatttcactggtaccattcctgtgagtttatggagttcaaatagtttgatggag
ttttctgctggaaataatatgctagaggggactctgccagttgatattggaaatgcggtt
acattggaaactcttgttcttagcggtaatcgtttgaagggaagtataccaaaggagatc
ggcaatctcacagctctttctgtgctaaacttgaattcgaatttcttggaaggaaatata
cctgttgaaattggagactgcaaagcattgacaacggtggatcttggaaacaacaatttc
agtggatcaattcccatggaacttgcggaccttgatcagctgcagtgcctggttctttct
cacaataatctatccggttccatcccttggaaaccatcttcatatttccatcaggctaat
ctgcccgacttgagctttgtgcagcatcatggagtattcgatctgtcacacaataggttg
actggtcccatacctgaagaattgggaaactgtgctgtagtggtggatcttcttctcaac
aacaacatgcttactggcaggattccaggatcactttctcgtttgacaaatcttacaact
ttggatttgtctggaaatttgctgagaggtcctattcctgttgaattcggtgactctctc
aagcttcagggcttgtatttggggaataaccagcttacaggaaccatctctgaaagctta
ggtcgtgtgggtagtttggtaaagttaaatttgactggcaataggttatctggtgtagtt
cctgcgagttttgggaacttgaaagagcttactcacttggatttaagcaataataagctt
gccggtgagctaccttcgtcattgtcccagatgcttaacctggtggggctctatgttcag
aagaataggctttctggtgagatacataacctgttctcaaattccgtgtcttggaagatt
gaagacttgaatttgagtaataacattttctttggaagcttgcctcaatctttgggcaat
ttgtcttatttgatgtacttggatcttcatggaaataaatttactggtgccattccttca
gaaattggtaacttgatgcaactagagtattttgatgtatctggaaacagattatccgga
cagattccagaggaagtgtgcagtttgttcagtctgttctacttgaatctagcagaaaac
cggttgggaggacctgtgcccagaaatggtatttgtcaaaacctgtcaaaaatctttcta
gctgggaacaatgatttgtgtggaagaattacaggtttggagtgccagatcagaagttct
gaaagatcttctttgttaaatgcctggggccttgcagggattgtggctgcaagtgtcttt
atcatttttgcttcagcctttgttgtacgcagatggattatgcggagtggccagctgagt
gatccagaagaaattgaggaaagcaaattaaacaacttcctggatcaaaatctctgcttc
ttgagcagcagcagcaggtcaaaggagccgctgagcatcaatatagcgacatttgagcag
ccactcctgaaactcacactcggtgacatccttgagggaacccatcacttttgcaagacc
aacataatcggagatggaggctttggaactgtttacaaagctaagttgcctagtgggaag
actgttgcagttaagaagctaagccaggccaaaacacaaggcaatcgagaattcatagct
gaaatggaaaccttgggaaaggtgaagcaccaaaatcttgttccattgcttggatactgt
tctttgggtgaggagaagctccttgtttacgaatacatgatcaatggaagtttggatctt
tggttgagaaatcgcagtggagctcttgatgtccttgattggtccaaacgcttcaaaatc
gctgttggtgctgctcggggactagcatttcttcaccatggcttcattccccacatcatc
catagagatatcaaagccagcaacatcttactcagtgaagactttgaagcaaaagttgcg
gacttcgggctggcaagactgattagtgcttgtgaaactcatgttagtactgatatagca
gggacttttggttacattccaccagaatatggacagagcggtaggtccactacaaaggga
gatgttttcagttttggtgtgatactgctggaattggtgactgggaaagagccaacaggc
cctgaatttaaagagattgaaggagggaatttagttggatgggtgactaagaagataaaa
aagggtcaagctgcagatgttttagatcctgtggttatgagtgtggattcaaagcagatg
atgcttcaggtgctcagtattgctgcagtttgcctggccgagaaccctgctaacagacct
accatgcttcaagtgttgaagctcctcaaagggatccacaaggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
