Gossypium hirsutum (upland cotton): 107919446
Help
Entry
107919446 CDS
T04793
Name
(RefSeq) G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
PAN_2
S_locus_glycop
ABC1
B_lectin
PAN_1
Pkinase_fungal
Kinase-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107919446
NCBI-ProteinID:
XP_040965897
LinkDB
All DBs
Position
D13:complement(3172657..3175166)
Genome browser
AA seq
633 aa
AA seq
DB search
MLLNKASDMVWQSFHHPTDSLVLGQSLMLQHPLTTNVSLPNSSIVSYEFAINASVNYTAS
LVTYGEPTFTASMVTYGESTASMDPYYVSPILSYVDLEFQKGKFGSFSVPASAKFIQLGS
DGHLKAYEWKDPKWEGTDLLPIDPCSYPFACGNYGVCLKEGCSCPVDANENGTTYFKPIN
YTKPDLGCYAVSPISCESSIHQSFLELQGYNFHPVKKYLISETKTLKECKALCLNNCSCE
AFMDTEGSCYFLSGGLSIAKSYSSGYGTYNDNSAFIKVQSSPISQSSNKNVSSPKYTSVI
VGSTLGAIFGVFLICAFIILGFRKGFQEVEEDYLDNMLGMPTRFSYEELKNVTKNFSNKI
GEGGFGYVFHGTLPPGSEVAVKHLVGFGAVNKSFVAEVQTIGSINHFNLVSLVGFCAEKF
NRLLVYKYMANGSLDRWIFYKNQESALRWQIRKKIIIDIAKGLAYLHEGCNQKIIHLDIK
PQNILLDENFNAKVSDFGLSKLIGRDQSRVVTAMRGTPGYMALEWLSSVITEKADVYSFG
IVVLEILCGRPNVDKSQLGEDMHLLRLFRRKQEEGLLLDLVDQCSDDMQSNATEVVEMMK
VAAWCLQNEYARRPSMSAVVKLFEDSNLLDKWQ
NT seq
1902 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgcttaacaaagccagtgacatggtttggcagtcatttcaccacccaacggactct
ttagttcttggtcaaagtttaatgctacagcatccattgacgaccaatgtatcgctaccg
aattcaagtattgtttcgtatgaatttgctatcaatgcttctgttaactacactgcttct
ttggttacctatggtgaacccactttcactgcttctatggtaacttatggtgaatccact
gcatctatggatccctattacgtaagtcctatcttgtcttatgttgatcttgaattccaa
aaaggaaagttcgggagtttctccgtgccagcctcagctaagtttatacagttgggaagt
gatggccacttgaaggcatatgagtggaaagatcccaagtgggagggcactgatctactc
cccattgatccatgtagttatccattcgcatgtggaaattatggcgtttgcttaaaagag
ggatgcagttgccctgttgatgcaaatgaaaatggaactacttattttaagccaataaat
tatacaaagccagatcttggatgttatgcagtttcaccaatctcttgtgagagttctatt
catcagagttttctcgagctacaaggctacaattttcatcccgtgaaaaaatatttgatc
tctgagacaaaaactttaaaagaatgtaaagcactctgtttaaacaactgttcttgcgaa
gcctttatggatacagagggttcctgctattttctgtctggaggattgtccatcgcgaaa
agttattctagcggctatggtacttacaatgacaactcagcttttataaaggtgcaaagt
tctccaatttcacagagttctaacaagaatgtttcatcacccaagtatacatcagttatt
gtgggctcaactcttggagctatctttggtgtgtttcttatatgcgctttcattattcta
ggatttagaaaagggttccaagaagttgaggaagattatctagacaacatgctgggaatg
ccaactagattctcatatgaagagttgaagaacgtcaccaaaaattttagcaacaagatt
ggtgagggtggttttgggtatgtgtttcatggaaccttacctccgggatctgaagttgca
gtgaagcatcttgttggctttggtgcagttaacaagtcatttgtagctgaagttcaaaca
attggaagcattaaccatttcaatttggtaagtttggttggattttgtgctgaaaaattc
aacaggcttttagtctataagtacatggctaatggatcgttagaccgatggatcttctat
aaaaaccaagaatctgctcttagatggcaaattagaaagaagatcattatagatatagcc
aaaggactagcctatcttcatgaaggttgcaatcaaaagataattcacttagacatcaaa
cctcaaaatatccttctagatgagaatttcaatgccaaagtttcagattttgggttgtct
aagctaattggaagagaccaaagtcgggtcgtaacagctatgaggggaacccctggttat
atggctcttgaatggttaagctcagttataactgaaaaagcagatgtctatagctttggt
attgtggtcctggaaattctatgtgggagaccaaacgtcgataaatctcagctaggagag
gatatgcatttactgagactttttaggagaaagcaagaagaagggctactgttggattta
gtcgatcaatgcagcgatgatatgcagtcgaatgcaaccgaagttgtggagatgatgaag
gttgctgcatggtgtctgcaaaatgaatatgccaggaggccttccatgtccgcagtggtg
aaactttttgaggactcaaatttgttggataaatggcagtag
DBGET
integrated database retrieval system
