Gossypium hirsutum (upland cotton): 107924014
Help
Entry
107924014 CDS
T04793
Name
(RefSeq) MDIS1-interacting receptor like kinase 2
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
Pkinase
LRR_8
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_4
LRRNT_2
Pkinase_fungal
ABC1
PIP49_C
TMEM154
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107924014
NCBI-ProteinID:
XP_016709752
UniProt:
A0A1U8L564
LinkDB
All DBs
Position
A11:15790781..15795250
Genome browser
AA seq
1225 aa
AA seq
DB search
MSGFRTPCLVLFHVVLLSLLPLKITCSARTQAEALVRWKNTLSFSPPSLNSWSLSNLNNL
CNWTSITCDDATGTVSQINLSNSNVSGSISQFNFTQFANLTRFDLKNNTMDGPIPSAIGT
LSRLVFLDLSENAFDGEIPVEIGRLRELQYLSLFNNSLNGTIPPEVSNLQNVRHLDLGFN
YFVSSDWSGFLPMPLLTHLGLAYNVLELEFPQFILSCHNLTFLDLSLNKLIGPIPDSLYT
NLSKLEFLNLTDNAFEGPLSSNISKLSKLIDLQLATNQLNGSIPESIGTMSDLETIELFE
NSFGGEIPSSLGQLRKLKKLDLHSNDLNSTVPSELGSCNNLTFLALAGNKLSGELPMSLS
QLTKLTDLGLSENQISGEVQSSLVSNWTKLISLQLQNNDFIGNIPPEIGLLTELQILFLY
NNNLSGSIPSEIGNLKSLIILDLSGNQLSGPIPPTIWTLSNLENLQLFYNNLNGTISPEI
GNMTSLLSFDVNTNSLHGELPDTISSLTNLEAFSVFTNNLSGTIPRDFGKNSPQLYYVSF
SNNSFHGELPPELCSGYALQNFTVNGNNFTGSLPACLRNCTDLRRVRFDGNRFTGNITNA
FGVHPELDFISLSDNQFSGEISPEWGECQNLTNLQMDRNRLSGRIPAELGKLSQLRVLNL
GANDLSGDIPLELGNLSLLFNLDLRQNHLTGNIPGIVGNLARLDSLDLSGNQLIGELPVE
LENCEKLLSLNLSHNNLTGEIPSELGSLSSLQYLLDLSSNSLSGSIPQDLGRLRSLENLN
VSHNDLSGRIPTSLSSMISLNSFDFSYNELTGQIPSDGVFQNASGNAFAGNSGLCGDVDG
FTPCSSSSIDKKSNNRRVLIAIIVPICGILILAAIAAGVFVCRRRNRMLDEEIKVSKRTE
FSESTIWEREGKFTFGDIERATEGFHDNYCIGKGGFGTVYKAELPSGQVVAVKKLNFADS
ADIQVVNFKSFENEIRMLTEVRHRNIIKLHGYCFRGSGIYLVYEYVKRGSLGSVLYGTQK
GVELEWDTRVKVVQGLAHAVAYLHHDCSAPIIHRDISLNNILLEKDYEPRLSDFGTARLL
SPNSSNWTAVAGSYGYMAPELALTMRFTSKCDVYSFGVVALEIMMGKHPGELLNSLSSVK
LLSDNKELMLKDLLDQRLPLPSNQIEEEVVSVFEIGLACTSSVPESRPTMRSVAQELSTR
TQDYLDEPLGRITISKLLALGNRTR
NT seq
3678 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgggttttcgaactccctgtcttgttctgttccatgttgttttgctttctttactt
ccattgaagatcacatgttcagcaagaacccaagcggaggcactcgtccgatggaagaac
accttgtcattttcgccaccttctctcaattcttggtcgctgtccaatctcaacaacctc
tgcaactggacttccattacctgcgatgatgccactggaaccgtctcccaaatcaacctc
tccaactcaaacgtgtctggttccatttctcagttcaacttcacccaattcgcgaatctc
acgcgtttcgacctcaaaaacaacaccatggatggcccgataccgtctgcgataggtact
ctgtcccggctagttttcttggatttgagcgaaaatgcatttgacggcgaaataccagtg
gagataggtcgtctaagggagcttcaatatctgagccttttcaacaacagtctcaatggt
accattcctcctgaagttagtaatctccaaaatgtaaggcacctcgaccttggattcaac
tactttgtttcttcagactggtctggtttcttacccatgccattgttgacacacctcggc
ttagcttacaatgtgcttgaattggaattccctcagtttatactcagctgccataatctt
acgttcctagacttgtcattgaataagttgattggtccaatacctgattcactttacacc
aatctcagcaagcttgaatttctcaatctcactgataatgcctttgaggggccattgtct
tccaatatttctaagctttccaaactcattgatcttcagttagcaaccaatcagttaaat
ggttccattcctgagagtataggaaccatgtctgatcttgaaacgattgaactatttgaa
aattcgtttggaggggagattccatcttcgttaggccaattgagaaagctcaagaaattg
gatctccactccaatgacttaaattccacagtcccatccgagcttggttcctgtaataac
ctcacatttttggccttagctgggaataaactcagtggggagttgcccatgtccttgtca
caactcacaaaattaaccgacttgggtttatctgaaaatcaaatttctggtgaagttcaa
tcatctctggtttctaattggaccaagttgatcagtttgcaacttcaaaacaatgatttc
attgggaatattccaccagaaataggtctattgactgagctccagatcctctttctctat
aacaataacctctcaggttcaattccttcagagatcgggaacttgaaatccttgataatt
ctagacctttctgggaatcagctttcaggtccgattcctccgacgatatggactctttca
aaccttgaaaatttacagcttttctataataatctgaacggcacaatttcaccagagatt
ggaaacatgacatccctgctatcttttgatgttaacacaaactccttgcatggggaatta
cccgacaccatttcaagcctcaccaacttagaagcattctcggtgttcacaaataacttg
tcggggaccattcctcgggattttgggaagaacagtcctcagctttattatgtcagcttc
tccaacaacagcttccacggggaattaccccctgaactgtgcagtggctatgctcttcaa
aatttcacagtaaatggaaacaacttcactgggtcattaccggcttgcttgaggaactgt
acggatctaagaagagtccggtttgatgggaaccgatttacgggtaacatcaccaatgca
tttggagtccatcctgagcttgattttatttctcttagtgacaaccaatttagtggtgaa
atctcgccagagtggggggaatgccaaaatctcaccaatctgcagatggatagaaacagg
ctttctggtagaatccctgctgagcttgggaagttgagccagttgcgtgttttaaacctt
ggggccaatgacttgagtggggatattcctttggaactgggaaatctgagcttgttgttc
aaccttgatttgaggcagaaccatctcactggtaacatccctgggattgtgggcaattta
gcgaggttggattctcttgatctatcggggaaccagttgataggagaattaccggtggaa
cttgagaactgcgagaaactattgagcttgaacttgagtcacaacaatctaactggtgaa
attccaagtgagcttggtagcttatcttctttgcagtatttacttgatctcagcagcaat
tcactctcaggctcaatccctcaagacttagggaggcttcgatcattggagaacctaaac
gtttcacacaatgatctgtcaggcagaattcccacttcattgtcctccatgattagtctc
aattcatttgatttctcctataatgagttaacaggtcagattccaagtgatggggtattc
caaaacgcttctggaaatgcttttgctggaaattcaggcttgtgtggtgatgttgatgga
tttacaccttgcagttccagttccatagacaagaagtccaacaacaggagggttcttatc
gctatcattgttcctatctgtggcatattaattctagcagcaattgcggctggagtgttt
gtgtgtcgcaggcgaaacagaatgcttgatgaagagattaaagtgagtaaaaggactgag
ttttctgagtctaccatttgggaaagagaaggtaaatttacattcggtgacattgaaaga
gccactgagggctttcatgataactactgcatcggaaaagggggatttggaactgtttac
aaagcagaattgccctcaggtcaagtagtagcagttaagaaactcaattttgcagactct
gccgacattcaagtggtgaatttcaagagttttgagaatgagatccgaatgttaaccgaa
gttaggcatcggaatatcataaagttgcacggatactgttttagaggaagtggcatatac
ttggtgtacgagtacgtgaaaagaggtagtttgggaagtgttttgtatggaacacaaaag
ggagtggagctagaatgggatacaagggtgaaagttgtgcaaggattggctcatgcagtt
gcttacttgcaccacgattgctctgcaccaattatacaccgagacatatcattgaacaac
atcctgctcgagaaggactacgagccaagactctctgatttcggcaccgcaaggttgttg
agtcctaactcatcgaactggactgcagttgctggctcttatgggtacatggcaccagag
cttgcactcacaatgaggttcacaagtaaatgcgatgtttacagctttggagtggtggca
ttagagattatgatgggaaagcaccctggagagttattgaactccctgtcatcagtaaaa
ctgttatcagacaataaagaattgatgctcaaggatttgctagaccaacgacttccactt
cctagcaaccaaatagaagaggaagtcgtatcggtttttgaaataggcttagcatgcaca
tcttcagtgccagagtcacgacccaccatgcgttcggtggcacaagaattatctacaaga
acgcaggattacttggatgagccattgggaagaataaccattagcaagctattagctttg
ggtaatagaacaagataa
DBGET
integrated database retrieval system