Gossypium hirsutum (upland cotton): 107924582
Help
Entry
107924582 CDS
T04793
Name
(RefSeq) LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK2
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
LRR_1
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
LRR_6
APH
ABC1
Pkinase_fungal
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107924582
NCBI-ProteinID:
XP_016710585
UniProt:
A0A1U8L7K5
LinkDB
All DBs
Position
A11:7207559..7211466
Genome browser
AA seq
1140 aa
AA seq
DB search
MGFFSSSVIKWQPFFLLFSCVLNSVVLGDNSSDKAVLLEFKKSVSDPSGLLSTWTENSCH
CSWSGVSCDKNSKVLSLNITGFGNGKKGKFNNTNAFLSFSCSDYSVFPFYGFGIRRNCGE
SNGGLYGKLLPSIGKLSELRILSLPFHIFGGEIPAEIWDLENLEVLDLENSLLSGSLPVS
VSGLKNLRVLNLGFNNISGEIPSWLSSLKQMEVLNLAGNLVNGTVPGSFGRFRGVYLSFT
SLSGLLPPDIGEGCKLEHLDLSGNNLVGQIPASLGNCSQLRSLLLYTNLLEEQIPHEIGQ
LRNLEVLDVSRNSLSGPIPVELGNCSGLTVLVLSNMFNPYDDLAISKGDRSTVKDDFNFY
QGGLPSEITKLSKLRILWVPRATLEGNLPSDWGACDDLEMVNLAQNFFAGEIPIGLSYCK
KLRYLDLSSNKRLAGELIEELAVPCMSVFDVSDNSLSGSIPRFYNQGCPEVLTSDSYAIE
PFNPTSAYLSFLARKLQVGAHFEFFGGDGGPTVFHNFGDNNFTGSVLSVPIPPKRLGKQI
SYAFYAGENLLSGPFPQNLFENCNELSSLYVNVSYNRISGQIPAEMSKICKSLKFLDVSG
NQITGSIPPSIGDLVSLVSLNLSWNLLRGWIPSNFGRIKNLRYLSLSDNNLTGSIPSTFG
RLQSLEILEMSSNSLSGEIPEGLVNLRNLTVLLLNNNKLFGQIPSGLANVTKLSAFNVSF
NNLSGPLPSSYNLMKCSNLLGNPLLQPCHEYSSMSSSDQARAGNSQNYAASPRGSATRRN
GNNGFSSIEIASITSASAIVSVLLALIILFIFTRKWNSKSKIISTTKKEVTIFTNIGVPL
TFDSVVVATGNFNASNCIGNGGFGSTYKAEISPGVLLAIKRLAIGRLQGFQQFDAEIKIL
GRLRHPNLVTLIGYHASEMETFLVYNYFPGGNLEKFIQERSARAMDWRILYKIALDIARA
LAYLHDQCVPRILHRDVKPSNILLDDEYNAYLSDFGLARLLGTSETHATTGVAGTFGYVA
PEYAMTCRVSDKADVYSYGVVLLELLSDKKALDPSFSPYGNGFNIVQWSCLLLRQGQAKE
FFTAGLWDAGPQNDLVEILHLAVVCTVDSLSTRPTMKQVVRRLKQLQPPSCYLHDKVSLH
NT seq
3423 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtttcttttcatcttcagtgatcaagtggcagccatttttcttactcttctcctgt
gtattaaacagtgtcgttttgggtgataattcttcagacaaagctgttcttcttgagttt
aagaagtctgtctcagatccttcagggcttttatcaacttggacagaaaattcctgtcac
tgttcatggtctggtgtttcatgtgataaaaactctaaggttttgtctcttaacataact
ggttttgggaatgggaaaaaaggtaaattcaacaatacgaatgcttttctctcgttttct
tgttctgattatagtgtatttccattttatggatttggtattagaaggaattgtggggaa
agtaatgggggtttgtatgggaagttgttgccttctattggaaaattgagtgaacttaga
attttatcacttccttttcatatatttggtggtgaaattcctgctgaaatttgggacttg
gagaatttggaagtacttgatctagagaacagtttgttatctgggtcattgcctgttagt
gtttctgggttaaagaacttgagagttcttaatttggggtttaataacattagtggagag
ataccaagttggctttcaagtttgaaacaaatggaggtattgaatttggctggtaatctc
gtgaatggaaccgttcccggatcttttggaaggtttcgaggtgtttacttgtcatttaca
tcgctcagtggcttgttgccccctgatattggtgaaggttgtaagcttgagcatttggat
ttgtctgggaataacttggttgggcagattcctgctagtttggggaactgtagtcagttg
aggtcgttgttgttgtatacaaatttactggaggaacaaattcctcacgaaatcggtcag
cttcgaaatcttgaagtgttggatgtttcaaggaatagcttgagtggtccaatacctgtt
gagcttggaaattgttctggattgactgtgcttgtgctctcaaatatgtttaatccatat
gatgaccttgccatctctaaaggcgatcgaagcactgtaaaggatgattttaatttttat
caaggtgggcttccttctgaaatcacaaagctttcaaagctgaggatattatgggttccg
agggcaacgcttgagggcaacctgccaagtgattggggtgcttgtgatgatttggagatg
gtaaatttggctcagaatttttttgccggggaaattcctatcggtcttagttactgcaag
aagctccggtaccttgacttaagctccaataagcggcttgctggagagcttattgaggaa
cttgcagttccttgtatgagtgtgtttgatgttagtgacaattccttgtcaggttccatc
cctagattctacaaccagggatgccctgaagttctgacctcagattcatatgccattgaa
cccttcaacccgacttctgcttatttatcatttttggcaagaaaacttcaagttggagca
cattttgagttctttggaggagatggtggtcctactgtgtttcacaactttggagataac
aattttactggcagtgtcttgtcggtgccaatcccaccaaaaaggttagggaaacagatt
tcttatgcattttatgctggagagaacttgctcagcggaccatttccacagaatttgttt
gagaactgcaatgagttgagttcgctttatgttaatgttagctacaatagaatatctggt
cagattccagctgaaatgagtaaaatttgcaaatctctcaaatttttggatgtgtctggg
aatcaaattactgggtccattccgcctagcattggagacttggtttcacttgtttcgctt
aatttgagctggaacctgttacgaggctggattccgagcaattttgggcggatcaagaat
ctccggtatctttctttgtctgataacaatctgaccggatctattccttccacctttggc
cggttgcaatctttagaaattttggagatgtcgtcaaattctctttctggtgaaattcct
gaaggtctggttaatttgagaaacctgactgttcttctgctcaataacaacaaactcttt
gggcaaattccctctggtttggcaaatgtgaccaagctctccgcattcaacgtatccttc
aataacttgtccgggccactaccgtcaagttataatttgatgaaatgcagcaatcttctc
gggaacccacttctacagccttgccatgaatactcctcaatgtcatcttcagatcaagcg
agagcagggaattcacaaaattatgctgcatcaccaaggggatccgcaacccgaaggaat
ggaaataatggcttcagttcaattgagatagcttcaataacatctgcttcagccattgtt
tcagttcttctggctcttattattttattcatatttaccaggaagtggaattcaaaatcc
aaaattatcagcaccacgaaaaaagaagtcacgattttcacaaacattggggtccctttg
acatttgacagtgttgttgtggccacggggaatttcaatgctagcaactgtattgggaat
ggaggttttgggtcaacttataaagcagagatctcccctggagtcttgttggctataaag
cggcttgcaatcggacggttgcaaggctttcaacagtttgatgctgaaattaaaatcctt
gggaggttgcgccacccaaatcttgtcactcttattggttatcatgccagtgaaatggaa
acattccttgtatacaattattttccaggtggtaacttagaaaagtttattcaggagagg
tccgcaagagctatggattggaggatactgtacaagattgctctggacatagcccgtgct
cttgcctacctacatgatcagtgtgtcccacggattctccatcgtgacgttaagcccagc
aatatcctcttggatgatgagtacaatgcttatttatcagactttggtttggccagactt
ttgggcacatctgaaacgcatgctaccacgggtgttgctggaacttttggatatgttgct
ccggaatatgcaatgacttgccgtgtttctgataaagctgatgtttacagctatggggtg
gtgctccttgagttgctttcagataagaaagctttggatccatcgttttctccttacgga
aatggtttcaacattgttcaatggtcatgcttgctcttacggcagggccaggccaaggag
ttcttcactgcagggttatgggatgcagggccccagaatgacttggttgaaattctacac
ttggctgttgtgtgtactgttgattcgctctctactaggccaacaatgaagcaagttgtc
cgacggctgaagcaacttcaaccaccatcatgttacttacatgataaagtttcccttcat
taa
DBGET
integrated database retrieval system