Gossypium hirsutum (upland cotton): 107925134
Help
Entry
107925134 CDS
T04793
Name
(RefSeq) receptor-like protein kinase HSL1
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
ABC1
TMEM33_Pom33
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107925134
NCBI-ProteinID:
XP_016711198
UniProt:
A0A1U8LCU4
LinkDB
All DBs
Position
D10:2543663..2547409
Genome browser
AA seq
1001 aa
AA seq
DB search
MLFHFLSFLLLLFFIFTFPSLSLSLNQEGLYLLQLKSSLSDPDSALSSWNPRHPTPCNWR
GVSCDAATASVTSLDLSNANLAGPFPSFLCRLQNLSYISFYFNNINSTIPDISTCRNLVH
LDLSQNLLTGELPHTLADLLNLKYLDLTGNNISGDFPASFGRFQKLEVLSLVYNLLDGTI
PAFLGNISTLKMLNLSYNPFSPGRIPPELGNLTNLEILWLTECNLVGEIPDSLGKLKKLA
DLDLALNHLVGNIPSSLTELVSVVQIELYNNSLTGELPRGFSNLTNLRLLDVSMNRLTGK
IPDELTRLPLESLNLYSNNLEGTLPPSIADSPALYELRIFQNRLTGELPQNLGKNSPLRW
FDVSSNQFTGPIPTSLCEKGKLEEMLMIYNSFSGQIPSSLANCRSLNRIRLGYNKLSGEI
PTGFWGLPHVYLLELVNNSFSGPIGKSIANAANLSLLIISRNEFNGFLPEELGLVNNLAK
LSASDNKFNGALPKSIVNLDGLGILDLHGNELEGELPNGIDSLKKLNELNLANNKFSGKI
PDGIGSLSVLNYLDLSDNQLTGRIPLTLQSLKLNQLNLSNNLLSGELPPLFDKDMYKNSF
LGNPGLCGNYSGSCGGKDEDKLKGYVWLLRSIFILAGLVFVVGVVWFYLKYRNYQKAKAI
DKSKWTLMSFHKLGFSEYEILDCLDEDNVIGRGSSGKVYKVVLSSGEAVAVKKLWGGLKK
GCDSVDLEKGHAESQVQDDGFQAEVETLGKIRHKNIVKLWCSCTTRDCKLLVYEYMPNGS
LGDLLHSCKSGSLGWPTRYKIIVDAAEGLSYLHHDCVPPIVHRDVKSNNILLDGDFGARV
ADFGVAKVVDAAGKVAKSMSVIAGSCGYIAPEYAYTLRVNEKSDIYSFGVVILELVTGRL
PIDPEFGEKDLVKWVCTTLNQKGVDYVLDSKLNPCFKEEMCKVLNIGLLCTSPLPINRPS
MRRVVKLLQEAGAENQLKAAKKDGKLTPYYYEDGSDQGSVA
NT seq
3006 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcttccatttcctctcctttctcctcctcctcttcttcatcttcactttcccttca
ctttccctgtctctcaaccaagaaggtctctaccttctccaactcaaatcctcactttcc
gacccagactccgccctttcttcatggaaccctcgccaccctactccatgcaactggcgc
ggtgtttcttgcgacgccgccaccgcttccgtcacttcccttgacctctccaacgctaac
ctcgccggtcctttcccttccttcctttgtcgcctccaaaacctttcctacattagcttc
tatttcaacaatatcaattccaccatacccgacatctccacgtgtcgaaatctcgtccac
cttgatctctctcagaaccttcttaccggtgagcttcctcacactttggctgacctcctt
aatcttaaataccttgatttgaccggtaataatatctccggagattttccggcgtcgttt
ggacggtttcagaagctcgaggttttgtccctcgtttacaatctgctagacggaactatc
cctgcttttttggggaacattagtacgcttaaaatgttgaatttgtcgtacaacccgttt
agtccgggtcggatcccgccggagcttgggaacttgaccaacttggagattttgtggctc
accgagtgtaatttagtcggcgagatacctgactcactggggaaactcaagaaacttgct
gatttagaccttgcacttaaccatttggtcgggaatataccgagttcgctcacggagttg
gtcagtgtagttcagattgagctctacaacaactcgttgacgggcgagttacctcgcggg
ttctcgaatttaaccaacctgagactcctcgacgtgtcgatgaaccggttaactgggaag
attccggacgagctaactcggctaccacttgaaagtctcaacctttactccaacaacttg
gaaggaacattgccaccgagtatcgctgactcaccagctctgtacgaactcagaatcttt
cagaaccgactcactggtgagttacctcaaaatctcggcaaaaactcaccgctcagatgg
ttcgatgtgtccagcaaccaattcaccggcccaatcccaaccagcttatgcgagaaaggg
aagctagaagagatgctaatgatatacaactcgttttcaggtcaaataccgtcgagttta
gccaactgcaggagcctgaatcggatccgactcggttacaacaaattatccggcgaaata
cccaccggattttggggtctcccccatgtttatttacttgaactcgttaacaactcgttc
tctggaccaattgggaaatcaattgcaaatgctgcaaatttgtcccttttgattatatct
agaaacgagttcaatggtttcttgcctgaagaactcggtttagttaataacttagctaaa
ctctctgctagtgacaacaagttcaatggggcattgcctaaaagtatagtaaaccttgat
ggattagggatccttgatcttcatgggaatgaattagaaggtgaattgcctaatgggatc
gattcgttgaagaaattaaacgagttgaacttagctaacaacaagttttctgggaaaatc
ccagatggaatcggtagcttatcggtgttgaattatctcgacttgtccgataatcagtta
accggaagaatcccactcactttgcagagtttgaagcttaatcagcttaacctctcgaat
aatttgttatctggtgagttacctcctttgttcgataaagacatgtacaaaaacagcttc
ttggggaaccctggtttatgtgggaattatagtggttcgtgtggtggtaaggatgaagat
aagcttaaaggttatgtttggttacttagatccatctttatactagctggtttggtgttt
gttgttggtgtggtttggttttacttgaaatataggaattatcagaaagctaaggccatt
gataagtctaaatggactttaatgtcattccataaattgggttttagtgagtatgagata
ttggattgtcttgatgaagataatgtgatagggagaggatcttcgggtaaagtttacaag
gtcgtgcttagtagcggtgaggctgttgctgtgaagaagctttggggtggtttgaaaaag
ggttgcgacagtgtagatcttgagaaaggtcatgctgagtcacaggttcaggacgacggg
tttcaagctgaggttgagacattagggaagattaggcacaagaacattgttaagttatgg
tgttcttgtactacccgggattgcaagcttttggtgtatgagtacatgccgaatggtagc
ttgggtgatttgctgcatagctgcaaaagtggttcactcggttggccgacgaggtacaag
attatcgtggatgcagccgagggactttcgtatttgcatcatgattgtgtgcctccgatt
gtgcacagggatgtcaagtccaataatatcttattggatggtgactttggcgctagagtg
gcggatttcggagttgccaaggtggttgatgcggctggaaaggttgctaagtctatgtct
gtcattgccggatcttgtggttacattgctccagagtatgcgtatacgcttcgggtgaac
gagaagagtgacatatacagttttggagtagtaatactcgagttagtcacaggcagactc
ccaatcgacccggagtttggcgagaaggacctcgtaaagtgggtctgcaccactctaaat
caaaaaggagtggactatgtcctcgattccaaactcaatccatgtttcaaagaagaaatg
tgtaaggtcctcaacatcggtctcctttgtacaagtccactcccgatcaaccgaccgtcg
atgagaagggtggttaagttgctgcaagaagccggtgctgagaaccagctgaaggctgcc
aaaaaggacgggaaattaactccttattactacgaagacggctcggatcaaggaagtgta
gcttga
DBGET
integrated database retrieval system