Gossypium hirsutum (upland cotton): 107946712
Help
Entry
107946712 CDS
T04793
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC107946712 isoform X1
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ephrin_rec_like
NHase_beta_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107946712
NCBI-ProteinID:
XP_040963276
LinkDB
All DBs
Position
D12:56964799..56978176
Genome browser
AA seq
1458 aa
AA seq
DB search
MHATLSNGQLQWMAKLTLLMRQYLCWSILFGHLYTSVLCLGLKQSENLFQKPRLVLSDES
VSDTSIHFENSASLPLNDSLSCEDLGGVGSFSSTCLLNSNLYLSSNLYIHGSGNLEILPH
VSIECPKEGCMITFNMSGNVNLGQYVAVVAGSVVIYAANLTVGQNSAINTTSLAGSPPPQ
TSGTPVGFDGAGGGHGGRGASCLKNNKTNFWGGDVYAWSTLSEPWSYGSKGGSKVDSASG
GHRLGGEGGGRVKLIAEDMLYLNGSITAEGGDGGLKGGGGSGGSIYIRAVKLKGYGIISA
AGGMGWGGGGGGRISLHCYSIQEDVKVSVHGGFSFGCPGNSGAAGTYFNADLLSLRVGND
NVTTETETPLLDFPTRPIWSNVFVENNAKVLVPLLWSRVQVRGQISLYHGGTIVFGLSAY
PIPEFELVAEELLMSDSTIKVFGAFRVSVKMLLMWNSKIQIDGGGNTVVTASILEVRNLV
VLRENSVINSNANLGVYGQGLLMLTGQGDAIQGQRLSLSLFYNITVGPGSLLQAPMGDEA
SRSVVTNSLCESQTCPIDLITPPDDCHVNYTLSFSLQICRVEDLLVNGIIKGSIIHIHRA
RTVTVDADGLITASELGCSKGIGKGNYLDGAGSGAGHGGRGGAGYFNGRVSNGGHEYGDA
DLPCELGSGAEGPTHSFGHVFGGGMIVMGSAQWPLLRLSIYGSLTADGQSFGEATINDNG
SLIGGLGGGSGGTVLLFLQELILAVNSSLSTVGGNGGPLGGGGGGGGRVHFDWSMIGIGD
EYVPVATTSGFINSSGGAGDNGGLFGDKGTVTGKKCPKGLYGTFCRECPIGTYKDIDGSD
EDLCTPCSLELLPDRANFIYVRGGVREPFCPYKCISEKYRMPNCYTPFEELIYIFGGPWP
FALLLSGVLLLLAVLLSTLRIKLLESSSYCANIEHPSSHHFPYLLSLSEVRGTRAEETQC
HAYRMYFMGPNTFREPWHLPYSPPDTIIEIVYEDAFNRFIGEINSVATYDWWEGSVHSIL
SLLAYPCAWSWKQWRRRKKVHRIQEYVRSEYDHSCLRSCRSRALYKGMKVGSTPDLMVAY
IDFSLGGDEKQVDMVSIIEKRFPMCIIFGGDGSYMSPYNLHSDTLLTNLVGQYVPSTVWN
RLVDGLNAQLRTVRHGSIRSALVPVMNWIASHGNPQLRFHGVKIELGWFQATASGYFQLG
ILVVRHDYIFQNLHQPDLSDRSNDEYPRKDAASAGKSLEHLQQSWPYPTHALSRRKIIGG
INGGLINDATVKSLEFKRDIFFPFSLLVHNTTPIGHQDSLQFLFTTMLLVDLAVTLLTLI
QFYWISLGAFLAVLLILPLSLLSPSPAGLNALFSKEPRRASHTRIYSLWNATSLTNIAVA
FICGMIHYGISAFQPPDQENSWNTRREDDKWWLFPTILVLLKSTQARFVDWHIANLEIQD
FSLFCPDPDGFWAYEPMS
NT seq
4377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatgcaactttatctaatggtcagctgcagtggatggcaaaacttacattgctaatg
cggcagtacctctgctggagcattctgtttgggcatctttacacatctgtcctttgtctt
ggtttgaaacagtcagagaatcttttccagaaacctagattggttttgagtgatgaatct
gttagcgacacctctatccactttgaaaattcagcttcgctaccactaaatgattctcta
tcttgtgaggacctgggaggagttggatcattcagctctacttgcttgttaaactcaaac
ttgtatttgagttccaatctttacatacatggttcgggaaacttggagatacttccccat
gtttcaatcgaatgccctaaagaagggtgtatgattacctttaacatgtctggcaatgta
aatctgggtcaatatgttgctgttgttgctggttcagtagtaatttatgctgccaatttg
actgttggtcagaattctgctatcaacacaacatctttggcgggttcaccacctccacaa
actagtggtacgcctgttggctttgatggagctggtggaggacatgggggtcggggagcg
tcatgtttgaaaaataataagacaaacttttggggaggtgatgtttatgcttggtcaact
ttgtctgaaccatggagttatgggagcaaaggtggtagtaaggttgatagtgcttctggt
ggacataggcttggaggggaaggtggaggacgagttaagcttattgcagaggacatgctg
tatttgaatggatctataactgctgaaggtggagatggaggtctaaaggggggaggaggt
tctggtggaagtatctatataagagctgtgaagctgaagggatatggtattataagtgca
gctggtgggatgggatggggtggtggtggtggtggaagaatatctctgcattgttacagc
atacaagaagatgttaaggtttctgtacatggtggttttagttttggctgtcctggaaat
tctggagcagctgggacatatttcaatgctgatttactcagtctaagagttggcaatgat
aatgttaccactgaaaccgaaactcctttgcttgattttcctactagaccaatttggtca
aatgtttttgtggagaataatgcgaaagttttggttcctcttctttggtccagagttcag
gtgagaggtcaaatcagtctatatcatggaggaacaattgtctttgggttgtctgcatac
ccaataccagaatttgagcttgttgcagaagaacttttaatgagtgattccacaataaag
gtatttggtgcatttagggtttctgtcaaaatgttgcttatgtggaactccaaaattcaa
atagatggtggtggaaatacagttgtcactgcatctatccttgaagtaaggaatctggtt
gttctaagggagaactctgtcattaattcaaatgcaaacttgggtgtatatggtcaagga
ctgctgatgttaactggtcagggtgatgcaattcaaggccagcggctttccttgtctctg
ttttataacataacagttgggccaggttctttacttcaagctccaatgggtgatgaagct
agtagaagcgtggttacaaattccctttgtgagagccaaacatgcccaattgatttgata
actcctccagatgattgccatgttaattatacactgtccttttctcttcagatttgtcga
gttgaggacctacttgttaatgggatcattaagggaagtataattcacattcacagggca
agaacagttactgttgatgctgatggtttgattaccgcatctgaattaggttgcagcaaa
ggtataggaaaaggaaactatctagatggagctggtagtggtgctgggcatgggggacgt
gggggtgctggatatttcaatggaagagttagcaatggtggtcatgaatatggtgatgct
gatcttccttgtgaattgggaagtggagcagagggtccaactcattcatttggacatgta
tttggaggaggaatgattgtaatgggatcagcgcaatggcctctgctaagacttagcatt
tatggctctttgacggccgatggccagagttttggtgaagcaacaataaatgataatggc
tcattaatcggtgggcttggtggaggttctggtggaacggttcttctattccttcaagag
cttatacttgcagtaaattcatctttatcaactgttgggggaaatggtggtcctcttggt
ggtggtggtggtggtggtgggagagtgcattttgactggtctatgataggcattggggat
gagtatgttccagttgctactaccagtggtttcattaatagtagtggaggtgcgggagat
aatggtggactctttggggacaagggcacagtaacagggaaaaagtgtccaaaaggcctc
tatggtacattctgcagggaatgccccattggcacttataaagatattgatggctctgat
gaagatctttgcactccttgctctctggagcttcttccagatcgtgctaatttcatatat
gttcgaggaggagtccgtgagccgttttgcccctataaatgcatatctgaaaagtataga
atgccaaattgctataccccttttgaggagttgatatatatatttggaggtccttggcct
tttgcacttcttctgtctggagttttgttgcttcttgctgtattgttaagcactttaagg
ataaaattgcttgaatcaagctcatattgtgctaatattgaacatccgagcagccatcat
ttcccataccttctttccctatcagaggtacggggaaccagagctgaagagactcagtgt
catgcttacagaatgtacttcatgggtcccaatacttttagagaaccatggcatcttcct
tactctcctcctgataccatcattgagatagtgtatgaagatgcttttaatagattcatt
ggtgagatcaactcagttgccacatatgattggtgggaaggttcagtgcacagtatactg
tcattgcttgcatatccttgtgcctggtcatggaaacagtggcggcgcaggaaaaaagta
catcgaattcaagaatatgtcagatcggaatatgaccattcatgtcttcgctcttgcaga
tcacgtgctctctacaaggggatgaaggttggatcaacgcctgatttgatggttgcatac
atagacttttcccttggtggcgatgagaagcaagtggacatggtatcaatcatagaaaag
agattccccatgtgtataatatttggtggggatggaagctatatgtcaccctacaatctt
catagtgatacattgttgactaatcttgttggccagtatgtgccatcaactgtttggaat
cgcttggtggatggtttgaatgcccagttgaggactgtgagacatggatccatccgttct
gcattagttcctgttatgaattggatagctagtcatggaaatcctcagcttagattccat
ggggttaaaattgagctaggctggtttcaagcaacagcttctgggtactttcaactcggt
atcttggtagtgcgtcatgactatatctttcagaatttgcaccaacctgatttgtctgac
agaagcaatgatgaatacccaaggaaagatgctgcatctgcgggcaaaagcctcgaacat
cttcagcagagttggccatatccgactcatgcattatctcgtagaaagatcataggggga
attaatggaggtcttataaatgatgctaccgtgaaatctttagaatttaaaagagacatt
ttcttcccattttctctcttagtgcacaataccacgcctattggtcatcaggactccctt
cagttcctatttactaccatgcttttggtagatcttgccgtaacccttcttactttgatt
cagttctattggatatctcttggggcattccttgctgtcttacttattcttcctttatca
ctactttctccatccccagctggtttgaatgccttgttcagtaaagagcctcggagagct
tcgcatacccgtatatattccttgtggaatgctacatctctgacaaacatcgctgtggct
ttcatctgtggcatgatacattatggaatctctgctttccagccacctgaccaggaaaat
tcttggaacacgagaagggaagatgacaaatggtggctttttcctaccatacttgtactg
ttgaagtcaacacaagctcgttttgttgattggcacatagctaatctagaaatccaagat
ttctccctcttctgtccggatccagatggtttttgggcctatgaacctatgtcttga
DBGET
integrated database retrieval system
