Gossypium hirsutum (upland cotton): 107948674
Help
Entry
107948674 CDS
T04793
Name
(RefSeq) phytosulfokine receptor 2-like
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_4
LRRNT_2
LRR_6
ABC1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107948674
NCBI-ProteinID:
XP_016738787
UniProt:
A0A1U8NI71
LinkDB
All DBs
Position
A04:7117490..7122186
Genome browser
AA seq
1051 aa
AA seq
DB search
MLTMRFNPMTSLNWVFLACFICSTLSFEISSQHCDPNDLLALKQFVGNLTAGSIITSWSN
ESICCQWDGVVCGNNINVSVSNRVIGLILHGKGLKGKISSSLASLDHLKRLDLSCNHLRD
PLPSELSNLKQLEYLDFSHNMLSGPVSSSVSGLESIQWLNLSSNSFDGDLLELGRFPEIV
VFNLSNNSFTGQFGSRICSNSKRIQVLDLSMNQLVGSLEGLENCNMSLQQLHLDYNSLAG
DFPDSLYSMLSLQGLSIAGNNFSGQLSKELSKLSSLKSLIISGNRFSGRLPDIFENLTQL
ELLCAHSNLFSGPLPSSLAQCSKLRVLDLRNNSFSGPLDLDFTGMSNLYSLDLATNHFSG
SLPVSLSDCKGLHVLSLAKNEFRGQIPESYANLGSLVFLSLSNNSFIDLPGALSVLQHCK
NLSTLILTKNLYGEEIPRNVSGFESLTILALGNCALKGQIPEWLLGCKKLEVLDLSWNHL
NGSIPTWIGQMEKLFYLDFSNNSLTGEIPKSLTELKSLTSSNCSSSISSSSAGIPLYVKR
NQSASGLPYNRLSSFPPSLYLSNNRLSGTILPEFGQLKQLHVLDLSWNNITGVIPSSISD
MENLEILDLSHNNLHGSIPSSFSKLTFLSKFSVAYNHLHGMIPTDGQFYSFPNSSFEGNP
GLCGKIVSPCDVFNSMVKPTIPSGSSRKFSRSSILGITISIGVGISLLLAIVILRMLRRD
AGDRIDDFDEELSQSHGLFEGFGTSKLVLFQSSHCKELTVMDLLNSTNNFNQANIIGCGG
FGLVYKAYLPDGTKAAVKRLSGDCGQMEREFQAEVEALSRAQHKNLVSLQGYCKHGNDRL
LIYSYMENGSLDYWLHESVGELSVLKWDVRLKIAQGAACGLAYLHKICEPNIVHRDVKSS
NILLDEKFEAHLADFGLSRLLRPYDTHVTTDLVGTLGYIPPEYSQTLTATCRGDVYSFGV
VLLELLTGRRAVEVRKGKNCRDLVSWMFQMKSEKRESEIIDSSIWDKDNEKQLFEMLEIA
CKCLDPDPKRRPLIDEVVSCLNSIENEVVQQ
NT seq
3156 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgactatgagattcaatccaatgacttccctcaattgggtattcttagcttgcttt
atctgttctacactgagctttgagatttcaagccaacactgtgatccaaatgatttgttg
gcattgaaacaatttgttgggaacctcacagctggttccatcatcacatcatggtctaat
gaatccatttgttgtcaatgggatggtgttgtttgtgggaataatatcaatgtctcagtt
tctaatagagtcattggtttgattcttcatgggaagggtctcaaagggaaaatctcaagc
tctttagccagtttagatcaccttaaacggcttgacctttcgtgcaatcatcttcgagat
cccttgccttcagaactctcaaatttgaagcagttggagtaccttgattttagccataac
atgctttcggggccggtttcgagctctgtttccggtttggaatctattcaatggctgaat
ctttcgagcaattcattcgatggtgacctgttagagcttggaaggtttccggaaattgtt
gtgttcaacttgagcaacaattcatttactggccaattcggatctcgaatctgcagtaac
tcgaaacggattcaggttcttgatttgtcaatgaaccagttagtagggagtcttgaaggc
ctagagaattgtaatatgtctctacaacagttgcatttggactataattcacttgcaggt
gattttcccgactcgttgtactcgatgttgtcactgcagggtctttcgatcgccggaaac
aatttctcgggtcaattaagcaaggaattgagtaagctttctagccttaaatccttgatt
atatctggaaaccgtttttcgggtagactgcctgatatcttcgagaacctcacacaatta
gagttgttgtgtgcacactcgaatttgttttccggtccattgccatcgtccctggcgcaa
tgctcgaagcttcgtgtacttgatcttcggaacaattcgtttagtggtcctcttgatctt
gattttaccggaatgtcaaatctttactcactcgatctcgctactaatcatttttctggt
tccctgcctgtttcactatctgattgtaaaggactgcacgttttgagtttggcgaagaat
gaattccgtggccaaatccccgagagttacgccaatctcggatcactcgtgttcctctcg
ttgtcaaataatagttttatcgatttacctggagctctatctgtgcttcagcactgcaaa
aatctctccactcttatcctcacaaagaatttatatggagaggaaattcccagaaatgta
agcggatttgagagcttaacgattttagcacttggaaattgtgctctgaaaggccaaata
ccggagtggttgttgggatgcaagaagcttgaagtgttggatttgtcatggaatcactta
aatggaagcattccaacttggatcggccagatggagaagttgttttacttggacttctcg
aataactctctcactggagaaatcccaaagagtttaacagagctaaagagcctcacttct
tcgaattgcagctcatcgatttcttcatcttcagctggaatcccgctttacgtgaagcgg
aatcagagtgctagcggtcttccatacaaccggctttcgagttttccgccatcattatac
ttgagcaataacagattaagtgggacgatattgcctgaatttgggcaattgaagcaactc
catgtcttagatttgagctggaataacatcactggtgtcatccctagttccatttctgat
atggaaaacttggaaattctcgatttatcgcacaataacttgcatggatcaattccttca
tcattttccaagctcacatttttgtcgaaatttagtgttgcctataatcacttgcatggt
atgattccaactgatggacagttttatagctttcccaactcaagctttgaggggaatccc
ggactttgtgggaaaatagtctctccttgcgatgttttcaacagtatggtaaagccaact
attccatccggttcaagcaggaagttcagtcgaagcagcattcttggaataacaatcagt
ataggagttggaatttccttgcttcttgctattgttatacttagaatgttaaggagggat
gccggtgatcggattgatgattttgatgaggaacttagccaatcacatgggttatttgaa
ggttttggtacatcaaaattggttcttttccaaagttcgcactgcaaggagctcacggtg
atggacttgttaaactctacaaacaatttcaaccaagcaaacataattggttgcggcggc
tttggactggtatacaaagcctatcttcctgatggcacaaaagctgccgtcaagaggctt
tctggtgattgcggtcagatggaacgtgagttccaagctgaagttgaggccctttcgaga
gctcagcacaagaaccttgtttctctacaaggttattgtaagcatggtaacgaccgatta
ttaatttactcgtatatggagaatggaagcttggattattggctgcatgagagtgttggt
gagttgtcggttctcaaatgggacgtaaggctcaagatcgctcaaggagctgcttgtggg
ttggcttatttgcataagatttgtgaaccaaacatagttcaccgggacgtaaaatccagc
aacattcttttggatgaaaagtttgaagctcatttagcagattttggcctttcaaggcta
cttcgtccgtatgatacccatgtcacaacagacttagttggaacattgggttatattcct
ccggaatacagccagaccctaactgcaacctgcagaggtgatgtttacagtttcggtgtt
gttcttttggagcttcttaccggcagaagggctgtcgaagtacgcaaagggaaaaactgt
cgggatttggtctcctggatgtttcagatgaaatccgagaaaagggagtcggagattata
gactcatcaatatgggacaaggataacgaaaaacagctgttcgaaatgcttgaaattgcc
tgtaagtgcttagacccagacccgaagcggagacccttaatcgacgaggttgtatcatgt
ctgaatagcattgaaaatgaggttgttcaacaatga
DBGET
integrated database retrieval system