Gossypium hirsutum (upland cotton): 107950656
Help
Entry
107950656 CDS
T04793
Name
(RefSeq) lysM domain receptor-like kinase 3
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
LysM
TraK
Pkinase_fungal
DUF4911
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107950656
NCBI-ProteinID:
XP_016741027
UniProt:
A0A1U8NPW4
LinkDB
All DBs
Position
D03:11399410..11409691
Genome browser
AA seq
668 aa
AA seq
DB search
MDPKVSQFVILLPLISLLIVQTLNALDSSSATIPMNCTDTSRLCTSFLAFKPQGNQSLAV
IQSMFDVIPQDITVEGEDSHGYIFIKKNCSCLTTSKNYATNTTFTVRSNQGYVYDMILEA
YDGLAMVPNVSRPARIGAVVSLRLFCGCSSSLWNYLMSYVMKDGDSVQSLASRFGVSMDS
IEQVNGISNPDNVTLGALYYIPLNSVPGEPYHVENEIPPAPVPAPSADTISEIQVSPKAH
VPYGWIIGGLGVGLALIILSIVVCVSLGSSSCFVEARGSHAKDHDDKSSHKFHILRKPSF
CCGSGRYICGKSENWTQTNGEPSNHQITIPNALGTDVLDVEKPVVFTYEDILFSTDGFSD
SNLLGRGIYGSVYFGFLRDQEVAIKRMTATKTKEFMAEMKVLCKVHHANLVELIGYAASD
NELFLIYEYAQKGSLRSHLHDPLNKGHTPLSWIMRVQIALDAARGLEYIHEHTKTHYVHR
DIKSSNILLDGSFRAKISDFGLSKLVGKTNDEEATATKVVGTFGYLAPEYLSDGLASSKS
DVYAFGVVLFEIISGKEAIIRTEGSAMKNTERRSLASIMLAALRNTPDLLSMSNMKDYID
PSMLDLYPHDCVFKMAMLAKQCVDEDPIVRPDMKQVVINLSQILLSSVEWEATLAGNSQV
FSGLVQGR
NT seq
2007 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcctaaggtttcacaatttgtgattcttctaccattaatctctcttcttattgtt
caaaccctcaatgccttggattcttcttctgctacaatacccatgaattgtacggacaca
tcaagattatgcacatcttttttggcttttaagccgcaggggaaccaaagtctagcagtg
atccagagcatgtttgatgtcataccacaagacattacagttgaaggagaggatagccat
ggctacatattcataaaaaagaactgttcttgcttgacaacctccaagaattatgcaaca
aacacaacctttacagtgagatcaaatcaagggtatgtctatgacatgattttagaggct
tatgatgggcttgcaatggttccaaatgttagcaggccggcaaggattggagctgtggtg
tctttgaggctgttttgtgggtgttcaagtagtttgtggaactacttgatgagttatgtg
atgaaagatggggacagtgtgcaatctttagctagtagatttggggttagcatggatagt
attgagcaagttaatgggatttcaaatcctgataatgtcactcttggtgctttgtactat
attcccttgaattcagttcctggtgaaccgtatcatgtggagaatgagatccccccagca
cctgttcctgcaccgtcagctgatacaatttcagaaattcaagtaagtcctaaggctcat
gtgccatatggatggatcatcgggggattgggtgttggccttgctctcattatattaagc
atagttgtttgtgtttccttgggatcatcgagctgctttgttgaagctcgaggaagtcat
gccaaagatcatgatgacaagagttctcacaagtttcatattcttcggaaaccaagtttc
tgctgtggttcaggaagatacatttgtggcaagtccgagaattggacccaaaccaacggc
gaacctagtaaccaccagattactatcccaaatgctctaggaactgatgtacttgatgtt
gagaagcctgtggttttcacttacgaagatattcttttttcaaccgatgggttctcagat
tctaatctacttggtcgtggaatctatggttctgtttattttggtttccttcgggaccag
gaagttgctatcaaaagaatgaccgctacaaagacgaaggaatttatggcagagatgaaa
gtcttgtgcaaggtccatcatgcaaatctggtagagttgattggctatgctgcaagtgat
aatgagctcttccttatttatgaatatgctcaaaagggttcccttagaagccatttacat
gatcccttgaacaaaggtcataccccactttcgtggataatgagagttcagattgcactt
gatgctgctagaggcctggagtacatccatgagcataccaaaactcattatgttcatcga
gatatcaagtcaagcaacatcttgcttgatggttctttcagggcaaagatttcagatttt
ggtttgtcaaagcttgttgggaagacaaatgatgaggaagcaacagcaacaaaagttgtc
ggtacatttggttatttggcaccagaatatttgagtgatggacttgcatcatcgaaaagc
gatgtgtatgcatttggtgttgttctgtttgagattatatctggaaaggaggccatcata
cggactgaaggcagtgcgatgaaaaacaccgaaagacgttcattggcatctattatgtta
gcagctctccggaacacaccagacttgttgagcatgtcaaacatgaaggactatattgat
ccaagtatgctggatctttaccctcatgattgtgtcttcaagatggcaatgttggccaag
caatgcgtggatgaggatcctattgtacgaccggacatgaaacaagttgtgataaacttg
tcacagatcctattatcctcagttgagtgggaagcaacacttgctggtaatagccaagta
tttagtgggttggtccaaggaagatag
DBGET
integrated database retrieval system
