Gossypium hirsutum (upland cotton): 107957321
Help
Entry
107957321 CDS
T04793
Name
(RefSeq) putative receptor-like protein kinase At3g47110
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
LRR_4
LRRNT_2
ABC1
APH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107957321
NCBI-ProteinID:
XP_016748314
UniProt:
A0A1U8PDF7
LinkDB
All DBs
Position
A05:77752596..77755981
Genome browser
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MEYAQFLVLLFSLFQIHINSCMCQHMGELDSTTDKAALLSFKLQLNDPLNSLSGWTRNST
SHCTWFGISCTRKGSRVESLQLSSLGLVGPLPSSLSNLTSLRTLNLSHNLFHGLFQLEFS
KLSHLRHIDLRNNSINGTLPVSLSHCLNLKTLRLQGNKFSGNLPPQLGNLQRLSILSISI
NNLTGSIPPTFGNLSSLTYLALARNMLIGEIPSEFGQLKKLQHIQLSENHLSGHIPPSIF
NISSLVFLSVTHNNLSGSLPIPNDNHRFQALPNVREVYLALNWFEGILPAYLSNASNIEC
LDLSRNRFHGPIPLFGNMRKLIMLDLGQNLFSSSTARNVHFIGSLSNCTQLEYLRINSNR
LSGEFPSVANLSTNIQHLCISDNFLTGGFPHGMDKFQNLISLSLEMNSLTGDIPRSIAKL
GNLQNFLVHQNMFSGEIPEIFANLTRVSRIAMRNNQFSGKIATSLGNCQQLQTLDLAWNR
LNGSIPEEVFKLSGLNYLVLEHNMLSGPLPSDVGNLKQLQVIDVSDNNLFGGLTSSISGC
SSLLYLNMSRNNLSGEIPSSLANILPLEVLDLSSNNLSGPIPQELANLKSLKVLNLSSNH
LEGDVPTGNIFSNLSSSSIRGNDDLCSADKEIARNLQLHQCKTKGRQSNHLIKILVPTAG
ATLFICLVFCFVWALISRRKKNRVKGSQSLLSLKGLPPLISYSDIQIATSNFTAENLLGK
GGFGSVYKGTFNTGDDGASINNFTFAVKVLDLQQTKAVQSFLAECEALRNARHRNLVKII
TSCSSIDHKGDEFKALVYEFMPNGNLDKWLYPEDEESGFCLTLMQRLNIAIDVASAMDYL
HNDCDPAVVHCDLKPANVLLDENMTAHVGDFGLARFLSQRPSQRENSTMGLKGSVGYIAP
EYGLGSKASTSGDAYSFGVLVLEMFIAKKPTDKMFKEGLSLNNFASAVDRNQVFETVDPR
ILKNHGGSEQSSSNPSSSNDSSNGGTSSTDSDHNCRKYEECLAAVIRVGLSCAAQSPKDR
LSMRETLTKLHDIKKKFLN
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatacgcgcagtttttggtgctgcttttctccttgtttcagattcacataaactct
tgtatgtgccagcatatgggggagttggattcaacaaccgacaaagcagccttgctatca
ttcaaactccaactcaatgatcctctaaattcactttcaggttggacccgcaactctact
tctcactgcacctggtttggtatatcttgcaccagaaaagggtcccgagttgaatctctc
caactcagttcactcggccttgttggccccttaccttcttctctctcaaacctcacttcc
cttcgcacgcttaacctttcccacaacttatttcacggtctatttcagttggagtttagt
aagctttcccatcttcgacatattgaccttagaaataactccattaatggcactcttcct
gtttctctttctcattgccttaaccttaaaacacttagattgcaagggaacaaatttagt
ggaaaccttccacctcaactaggcaacctccaaaggcttagtatccttagcatctccatc
aataatctcacaggttcaatcccccctacatttgggaacctttcctctttaacctatctt
gctctggcaagaaacatgttaatcggtgaaattccaagtgagtttggtcagcttaaaaag
cttcaacatattcagctttctgaaaatcatctctcaggccacatccctccttctattttc
aacatttcttctttggttttcttgtctgtcacacataataacctttcaggaagccttcca
attccaaatgataatcatagattccaggctctcccaaatgtcagagaagtatatttggca
ctaaactggtttgaaggaatcctacctgcgtatctatctaacgcttcaaacattgaatgt
cttgatctgtctaggaatagatttcatggtccgattcctttgtttggcaacatgagaaaa
cttataatgctggaccttggtcaaaatcttttctcttctagcactgctcggaatgttcac
ttcattggttccctttcaaactgtactcagcttgaatatctgaggataaattccaacaga
ctttccggtgaatttccctcagtggcgaatctgtcaaccaatatccaacatttatgcatt
tctgacaatttcttgactggtggcttccctcatgggatggacaagttccaaaatctgata
tctctttcacttgagatgaactctttgacaggtgatattccaaggagcatagccaaactc
ggaaacttgcagaactttttggtgcaccagaatatgttctctggagaaatcccagaaatc
tttgctaatcttacacgagtttctagaatcgcaatgaggaataaccagttttctggtaaa
attgccaccagccttggaaattgtcagcagctacaaacattggacctggcttggaatagg
ctaaatggaagcataccagaagaggttttcaagctttctggtttaaactacttggttttg
gagcataacatgctttcgggtcctctccccagtgatgttggcaacttgaagcagcttcaa
gtgattgatgtttctgataataacttgttcggaggtttaacttcatcaatcagtggctgt
tcaagtttgctatacctcaacatgtcaaggaacaatctcagtggtgaaatcccgagttca
ttagcaaatatattaccactagaggttttggatctctcttccaacaatctttctggacca
attccacaagagttggcaaatcttaagtcactcaaggtcttaaatttgtcttccaatcat
ttggaaggagatgttcctacaggaaatatcttctcaaatctcagctcgtcttcgatccgg
ggtaacgacgacctttgcagtgctgacaaagaaattgccagaaatctgcaacttcatcaa
tgcaaaacaaagggaagacagagtaatcatttgatcaaaattttagttccaactgccgga
gctacactgtttatatgtttagttttttgctttgtgtgggcattgatatccagaaggaag
aaaaacagggtgaagggcagtcaatctttactttcattgaaagggttaccgccgttgata
tcttactcggatatccagattgctacaagcaattttacagctgaaaacctgcttggcaag
ggaggtttcgggtcggtttacaaaggtacgttcaatactggtgatgatggagcttccatc
aacaactttacatttgctgtcaaagttcttgacctgcaacaaaccaaggccgttcagagt
tttcttgctgaatgtgaggccttgaggaatgccaggcatcgaaacctggtgaagatcatc
acctcatgctcgagcatcgatcataaaggagatgaattcaaagctttggtatacgagttc
atgccgaatggcaacctagataagtggctatatccagaggatgaggaatcagggttttgt
ttgaccttgatgcaaagactgaatatagccattgatgtagcttccgccatggattatttg
cacaacgactgcgacccggctgttgtgcactgcgatttgaagcctgcaaatgtacttttg
gatgaaaatatgacggctcatgtgggggatttcggcttggcgaggttcctttctcaaagg
ccgtcccaaagggagaacagcacaatgggattgaaaggctcggttggttacattgcacca
gagtatggcctaggaagcaaagcttcaaccagtggagatgcctatagttttggagttctt
gtgcttgaaatgttcattgccaagaaaccaactgataagatgtttaaagaaggattaagc
ctcaacaatttcgcatcagctgtggatagaaatcaagtttttgagacagttgatccaagg
atattgaagaaccatggaggttcagaacaaagctcatcaaaccctagctctagtaatgac
agcagcaatggcggcaccagcagcactgacagtgatcacaactgcaggaaatatgaagaa
tgtttagcagctgttataagagttggattaagttgtgcagctcaatcgcccaaagatcgc
ttatccatgagagaaaccttgacaaagttgcatgatattaaaaaaaaatttcttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
