Gossypium hirsutum (upland cotton): 121208557
Help
Entry
121208557 CDS
T04793
Name
(RefSeq) receptor-like protein kinase HSL1
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
LRR_6
ABC1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121208557
NCBI-ProteinID:
XP_040935458
LinkDB
All DBs
Position
A10:2608032..2611803
Genome browser
AA seq
1000 aa
AA seq
DB search
MLFHFLSFLFFFFFITLPSLSLSLNQEGLYLLQLKSSLSDPDSALSSWNPRHPTPCNWRG
VSCDAATASVTSLDLSNANLAGPFPSFLCRLQNLSYISFYFNNINSTIPDISTCRNLVHL
DLSQNLLTGELPHTLADLPNLKYLDLTGNNISGDFPSSFGRFQKLEVLSLVYNLLDGTIP
AFLGNISTLKMLNLSYNPFSPGRIPPELGNLTNLEILWLTECNLVREIPDSLGQLKKLAD
LDLALNHLVGNIPSSLTELVSVVQIELYNNSLTGELPRGFSNLTNLRLLDVSMNRLTGKI
PDELTRLPLESLNLYSNNLEGTLPPSIADSPALYELRIFQNRLTGELPQNLGKNSPLRWF
DVSSNQFTGPIPPSLCEKGKLEEMLMIYNSFSGQIPSSLANCRSLNRIRLGYNKLSGEIP
TGFWGLPHVYLLDLVNNSFSGPIGKSIANAANLSLLIISRNEFNGFLPEELGLVNNLAKL
SASDNKFNGALPKSIVNLDGLGILDLHGNELEGELPNGIDSLKKLNELNLANNKFSGKIP
DGIGSLSVLNYLDLSDNQLTGRIPLALQSLKLNQLNLSNNLLSGELPPLFDKDMYKNSFL
GNPGLCGNYSGSCGGKDEEKHKGYVWLLRSIFILAGLVFVVGVVWFYFKYRNYQKAKAID
KSKWTLMSFHKLGFSEYEILDCLDEDNVIGRGSSGKVYKVVLSNGEAVAVKKLWGCLKKG
CDSVDLEKGHAESQVQDDGFQAEVETLGKIRHKNIVKLWCSCTTRDCKLLVYEYMPNGSL
GDLLHSCKSGSLGWPTRYKIIVDAAEGLSYLHHDCVPPIVHRDVKSNNILLDGDFGARVA
DFGVAKVVDAAGKVAKSMSVIAGSCGYIAPEYAYTLRVNEKSDIYSFGVVILELVTGRLP
IDPEFGEKDLVKWVCTTLDQKGVDYVLDSKLNPCFKEEMCKVLNIGLLCTSPLPINRPSM
RRVVKFLQEAGAENQLKAAKKDGKLTPYYYEDGSDQGSVA
NT seq
3003 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcttccatttcctctcttttctcttcttcttcttcttcatcactctcccttcactt
tccctgtctctcaaccaagaaggtctctaccttctccaactcaaatcctcactttccgac
ccagactccgctctttcttcatggaaccctcgccaccccactccatgcaactggcgcggt
gtttcttgcgacgccgccaccgcttccgtcacttcccttgacctctccaacgctaacctc
gccggtcctttcccttccttcctttgtcgcctccaaaacctttcctacattagcttctat
ttcaacaatatcaattccaccatacccgacatttccacgtgtcgaaatctcgtccacctt
gatctctctcagaaccttcttaccggcgagcttcctcacactttggccgacctccctaat
cttaaatacctcgatttgacgggtaataatatctccggtgattttccgtcgtcgtttggc
cggtttcagaagctcgaggttttgtccctcgtttacaatctgctagacgggactatccct
gcttttttggggaacattagtacgcttaaaatgttgaatttgtcctacaacccgtttagt
ccgggtcggatcccgcctgagcttgggaacttgaccaacttggagattttgtggctcaca
gagtgtaatttagtccgcgagatacctgactcactggggcaactcaagaaacttgctgat
ttagaccttgcacttaaccatttggtcgggaatataccaagttcgctcacggagttggtc
agtgtagttcagattgagctctacaacaactcgttgacgggcgagttaccccgtgggttc
tcgaatttaaccaacctgagactcctcgacgtgtcgatgaaccggttaactgggaagatt
ccggatgagctaactcggctcccacttgaaagtctcaacctttactccaacaacttggaa
ggaacattgccaccgagtatcgccgactcaccagctctgtacgaactcagaatctttcag
aaccgactcaccggtgagttacctcaaaatctcggcaaaaactcaccgctcagatggttc
gatgtgtccagcaaccaattcaccggcccaatcccacccagcttatgcgagaaagggaag
ctagaagagatgttaatgatatacaactcgttttcaggtcaaataccgtcgagtttagcc
aactgcaggagcctgaatcggatccgactcggttacaacaaattatccggcgaaataccc
accggattttggggtctcccccatgtttatttacttgatctcgttaacaactcgttctct
ggaccaattgggaaatcaattgcaaatgctgcaaatttgtcccttttgattatatctaga
aacgagttcaatggtttcttgcctgaagaactcggtttagttaataacttagctaaactc
tctgctagtgacaacaagttcaatggggcattgcctaaaagtatagtaaaccttgatgga
ttagggatccttgatcttcatgggaatgaattagaaggtgaattacctaatgggatcgat
tcgttgaagaaattaaacgagctgaacttagctaacaacaagttttctgggaaaatccca
gatggaatcggtagcttatcggtgttgaattatctcgacttgtccgataatcagttaacc
ggaagaatcccactcgctttgcagagtttgaagcttaatcagcttaacctctcgaataat
ttgttatctggtgagttaccgcctttgttcgataaagacatgtacaaaaacagcttcttg
gggaaccctggtttatgtgggaattatagtggttcgtgtggtggtaaggatgaagagaag
cataaaggttatgtttggttacttagatccatttttatactagctggtttggtgtttgtt
gttggtgtggtttggttttactttaaatataggaattatcagaaagctaaggccattgat
aagtctaaatggactttaatgtcattccataaattgggttttagtgaatatgagatattg
gattgtcttgatgaagataatgtgatagggagaggatcttcgggtaaagtttacaaggtc
gtgcttagtaacggtgaggctgttgccgtgaagaagctttggggttgtttgaaaaagggt
tgcgacagtgtagatcttgagaaaggtcatgctgagtcacaggttcaggacgacgggttt
caagctgaggttgagacattagggaagattaggcacaagaatattgttaagttatggtgt
tcttgtactacccgggattgcaagcttttggtgtatgagtacatgccgaatggtagcttg
ggtgatttgttgcacagctgcaaaagtggttcactcggttggccgacgaggtacaagatt
atcgtggatgcagccgagggactttcgtatttgcatcatgattgtgtgcctccgattgtg
catagagatgtcaagtccaataatatcttattggatggtgactttggcgctagagtggcg
gatttcggagttgccaaggtggttgatgctgctggaaaggtcgctaagtctatgtctgtc
attgccggatcttgtggttacattgctccagagtatgcgtatacgcttcgggtgaacgag
aagagtgacatatacagttttggagtagtaatacttgagttagtcacaggcagactccca
attgacccggagtttggcgagaaggacctcgtaaagtgggtctgcaccactctagatcaa
aaaggagtggactatgtcctcgattccaaactcaatccatgtttcaaagaggaaatgtgt
aaggtcctcaacatcggtctcctttgtacaagtccactcccgatcaaccgaccgtcgatg
agaagggtggttaagtttctgcaagaagccggtgccgagaaccagctgaaggctgccaaa
aaggacgggaaattaactccttattactacgaagacggctcggatcaaggaagtgtagct
tga
DBGET
integrated database retrieval system
