Gekko japonicus (Schlegel's Japanese gecko): 107118003
Help
Entry
107118003 CDS
T04299
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) collagen type I alpha 2 chain
KO
K06236
collagen type I alpha
Organism
gja
Gekko japonicus (Schlegel's Japanese gecko)
Pathway
gja04510
Focal adhesion
gja04512
ECM-receptor interaction
gja04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gja00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
107118003 (COL1A2)
09140 Cellular Processes
09144 Cellular community - eukaryotes
04510 Focal adhesion
107118003 (COL1A2)
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
107118003 (COL1A2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
gja00536
]
107118003 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
gja00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
107118003 (COL1A2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
COLFI
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107118003
NCBI-ProteinID:
XP_015275703
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
1363 aa
AA seq
DB search
MLSFVDTRILLLLAVTSCLATSQYVNEARQGRKGPRGDKGPQGERGPPGPPGRDGEDGPP
GPPGPPGPPGLGGNFAAQYDQSKSADFGPGPMGLMGPRGPPGVTGPPGPPGHSGHAGEPG
EPGQTGPQGARGPTGPPGKSGEDGHPGKPGRSGERGVPGPQGARGFPGTPGLPGFKGIRG
HNGLDGRKGEPGAPGNKGEPGAPGENGTPGQSGARGLPGERGRVGAPGPVGARGSDGSVG
PAGPAGPIGGAGPSGFPGAPGPKGEIGSAGSPGPSGPAGPRGEIGLPGASGPVGPPGNPG
ANGINGAKGAVGLPGVAGAPGLPGGRGIPGPSGPAGASGPRGLAGEPGIPGAKGETGNKG
EPGAAGPSGPSGASGEEGKRGVNGEPGATGAPGPAGLRGVPGSRGLPGSDGRAGVIGAAG
NRGATGSAGARGPGGDAGRPGEPGLMGARGLPGQSGSPGPAGKEGLSGLSGPDGRPGPVG
PAGPRGEPGIIGFPGPKGPNGEPGKPGDRGHVGLAGPRGAPGPDGNNGAQGPPGVIGNAG
SKGETGPAGAPGFQGLPGPSGGVGEAGKPGERGLHGEFGLPGPAGVRGERGPPGESGAVG
PVGSIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGIAGAPGSAGPSGPSGIPGERGIAGGPGGKGEKGPTG
FRGEPGATGRDGSRGAPGAIGAPGPAGAAGERGEAGSSGPSGPAGSRGIPGERGETGPAG
PPGFAGPPGAAGQAGAKGERGQRGPKGDVGPQGAVGAAGNAGPAGPVGPPGPGGGRGDTG
PPGVTGFPGAAGRVGPPGPAGITGPSGPPGPAGKEGIRGPRGDTGPVGRTGETGPVGPPG
FSGEKGPSGEAGTAGPPGSPGPQGLLGSVGNLGLPGSRGERGLPGIAGAVGEPGPVGASG
PPGARGPSGPIGNPGVNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGVPGYKGERGGPGSPGPSGTLG
APGPHGAVGPAGRPGNRGEAGPVGPVGSVGPVGARGPSGPQGPRGEKGGPGDKGPRGLPG
LKGHNGLQGLPGIAGHHGEQGSPGSTGPSGPRGPPGPSGPHGKDGRNGIPGPVGPAGVRG
SQGSPGPSGPPGSPGLPGPPGVNGGGYEVGFDAEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKTLNNQ
IETLLTPEGSKKNPARTCRDLRLSHPEWTTGFYWIDPNQGCTMDAIRVYCDFSTGETCIH
ANPENIPTKNWYTSRNPAEKKHIWFGEVISGGTQFEYNNEGVTAKDMATQLAFMRLLANH
ASQNITYHCKNSVAYMDAETGNLKKSVMLQGSNDVELRAEGNSRFTYSVLEDGCSTKTNQ
WSKTIIEYRTNKPSRLPILDIAPLDIGGADQEFGLDIGPVCFK
NT seq
4092 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcagctttgtggatacacggattttgttgctgctcgcagtaacttcatgcctagca
acaagtcaatatgtaaatgaggcaaggcaaggacggaagggccccagaggagacaaagga
ccacagggagaaaggggtccaccaggcccaccaggtagagatggtgaagatggtccacca
ggccccccagggccccctggtcctcccggtcttggcggaaactttgctgctcaatatgat
caatctaaatcagctgactttggcccaggaccaatgggacttatgggacccagaggccct
cctggagtaactggaccccctggtcctccaggccactctggacatgctggtgaacctggt
gaacccggtcaaacaggtccacaaggtgctcgtggtccaactggtcctcctgggaagtct
ggtgaagatggtcatcctgggaaacctggcagatctggtgagaggggtgttcctggcccg
cagggtgctcgtggctttcctggaactcctggcctccctggtttcaaaggaataagggga
cataatggtttggatggtcgcaaaggagaacctggtgctcctggtaacaagggtgaacct
ggtgcccctggagaaaatggtaccccaggacaatctggtgctcgtggtctccctggtgaa
aggggaagagttggtgctcctggaccagttggtgctcgtggcagtgatggaagcgttggt
cccgctggtcctgctggtcccattggtggtgctggaccttctggattcccaggtgctcct
ggtcccaagggtgaaattggatctgctggtagccctggcccatctggtcctgctggtcca
cgtggtgaaattggtctccctggtgcttctggtcctgttggtccaccaggtaaccctggt
gccaatggcattaatggtgctaaaggtgcagttggtcttcccggtgtggctggtgctcct
ggcctgccaggcggccgtggtatccctggcccatctggtccagctggtgcttctggtccc
agaggacttgctggtgagcctggaattcctggagccaagggagaaactggtaacaagggt
gaacccggtgctgctggcccatctggcccaagtggtgcaagtggtgaggaaggcaagagg
ggtgtcaacggtgaacctggagctactggtgcacctggcccagcaggtttaagaggtgtt
cctggatctcgtggtctccctggatctgatggcagagctggagttataggtgctgctggt
aatcgtggtgctactggctctgctggtgctagaggtcctggtggtgatgcaggtcgccct
ggtgaacctggtctcatgggtgcaagaggtctccctggtcaatctggaagcccaggccct
gctggcaaggaaggtctttctggtctgtctggtcctgatggccgacctggtccagttggt
ccagctggtccaagaggtgaacctggtatcataggcttcccaggaccaaaaggccccaat
ggtgaacctggcaagcctggtgacagaggccatgttggtcttgctggccctcggggtgct
cctggtcctgatgggaacaatggagctcaaggaccacctggtgttattggtaatgctggt
tccaaaggtgaaactggtcctgctggtgctcctggcttccaaggtctaccaggtccatca
ggcggagtcggtgaagctggcaaaccaggggaaagaggtcttcatggcgaatttggactc
cctggccctgctggtgtgagaggtgaacgtgggcctccaggtgaaagtggtgctgttggt
cctgtaggttccattggaagtcgtggcccatctggtccaccagggcctgatggtaacaag
ggcgaacctggaattgccggtgcacctggttccgcaggcccatctggtcccagtggaatc
ccaggagaaagaggcattgctggtggtccaggaggcaaaggtgaaaagggcccaacagga
ttcagaggtgaaccgggagcaacaggaagagatggttcacgtggtgctcctggagccatt
ggtgcccctggtcctgctggagctgctggtgaaaggggtgaagctggttcctctggccca
tctggccctgctggttctcgtggaatacctggtgaacgtggtgagaccggtcctgctggt
cctcctggatttgcgggccctcctggtgcagctggccaggctggtgctaaaggtgaaaga
ggtcagagaggccctaaaggtgatgtaggccctcagggtgctgttggtgctgctggtaac
gctggccccgctggtccagtcggtcctccaggtcctggtggaggtcgtggagatactggt
ccacctggtgttactggtttccctggtgctgctggtagagttggacccccaggccctgct
ggtatcactggtccatccggtcctcctggtccagctggcaaggaaggtatcagaggccca
cgtggtgacactggaccagttggccgtactggagaaactggacctgttggacctcctggt
ttctctggagagaaaggcccaagtggagaagctggcactgctggtcctcccggttcccca
ggtcctcagggtcttctcggatctgttggtaaccttggtttgcctgggtctaggggagag
cgtggtctcccaggtatcgctggagccgtgggtgagcctggacctgttggcgcttctggt
cccccaggtgcccgtggcccttctggccccattggtaaccctggtgtgaatggtgctcct
ggtgaagctgggcgtgatggaaatcctggtaacgatggtcctccaggccgtgacggtgtt
cctggttacaagggtgaacgtggtggtcctggcagccctgggccttctggtactcttggt
gcccctggcccccatggtgctgtcggtcctgctggcagacctggaaatcgtggtgaagcc
ggtcctgtcggtccagttggttctgttggcccagttggagcaagaggtccttcaggccca
caaggtccacgtggtgagaaaggtggtccaggtgacaagggacctaggggattgcctgga
cttaaaggacataatggacttcaggggctgcctggcattgctggtcatcatggagaacaa
ggttcacctggttctactggtccttctggcccaaggggccctcctggtccttctggtcct
catggcaaagatggtcgcaatggtattcctggacctgttggacctgctggtgtgcgtggt
tctcagggtagcccaggaccttccggtccaccaggttctcctggtcttcctggcccacct
ggtgtcaatggtggtggatatgaagttggctttgatgcagaatactaccgggctgaccag
ccttccctcagacccaaggattatgaagttgatgccactctgaaaacattgaacaaccaa
attgagactctcctgacccctgaaggctctaagaaaaatccagctcgcacctgccgtgac
ttaagactcagccatccagaatggactaccggcttctactggatcgatcctaaccaaggc
tgcaccatggatgccattagagtgtactgtgatttctccactggtgagacctgtatccat
gctaatccagaaaacatcccaaccaagaactggtacactagcaggaatcctgcagagaag
aagcacatatggtttggagaagttatcagtggtggtactcagtttgaatacaataatgaa
ggcgtgactgccaaggacatggccacccaacttgccttcatgcggctgctggctaatcat
gcctcccagaacatcacttaccactgcaaaaacagtgttgcctacatggatgcagaaaca
ggaaaccttaagaagtcagtgatgttgcagggatccaacgatgttgaactacgagctgaa
ggcaacagcaggttcacttacagtgttcttgaagacggctgctctacaaagaccaatcaa
tggtccaaaacaatcattgaatacagaacaaataagccatctcgcttgcccatcctggac
attgcacctttggacattggtggcgctgaccaagaattcggtttggacattggcccagtc
tgtttcaaatga
DBGET
integrated database retrieval system