KEGG   Gekko japonicus (Schlegel's Japanese gecko): 107118003
Entry
107118003         CDS       T04299                                 
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) collagen type I alpha 2 chain
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
gja  Gekko japonicus (Schlegel's Japanese gecko)
Pathway
gja04510  Focal adhesion
gja04512  ECM-receptor interaction
gja04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:gja00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    107118003 (COL1A2)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    107118003 (COL1A2)
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    107118003 (COL1A2)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:gja00536]
    107118003 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:gja00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   107118003 (COL1A2)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI
Other DBs
NCBI-GeneID: 107118003
NCBI-ProteinID: XP_015275703
LinkDB
Position
Un
AA seq 1363 aa
MLSFVDTRILLLLAVTSCLATSQYVNEARQGRKGPRGDKGPQGERGPPGPPGRDGEDGPP
GPPGPPGPPGLGGNFAAQYDQSKSADFGPGPMGLMGPRGPPGVTGPPGPPGHSGHAGEPG
EPGQTGPQGARGPTGPPGKSGEDGHPGKPGRSGERGVPGPQGARGFPGTPGLPGFKGIRG
HNGLDGRKGEPGAPGNKGEPGAPGENGTPGQSGARGLPGERGRVGAPGPVGARGSDGSVG
PAGPAGPIGGAGPSGFPGAPGPKGEIGSAGSPGPSGPAGPRGEIGLPGASGPVGPPGNPG
ANGINGAKGAVGLPGVAGAPGLPGGRGIPGPSGPAGASGPRGLAGEPGIPGAKGETGNKG
EPGAAGPSGPSGASGEEGKRGVNGEPGATGAPGPAGLRGVPGSRGLPGSDGRAGVIGAAG
NRGATGSAGARGPGGDAGRPGEPGLMGARGLPGQSGSPGPAGKEGLSGLSGPDGRPGPVG
PAGPRGEPGIIGFPGPKGPNGEPGKPGDRGHVGLAGPRGAPGPDGNNGAQGPPGVIGNAG
SKGETGPAGAPGFQGLPGPSGGVGEAGKPGERGLHGEFGLPGPAGVRGERGPPGESGAVG
PVGSIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGIAGAPGSAGPSGPSGIPGERGIAGGPGGKGEKGPTG
FRGEPGATGRDGSRGAPGAIGAPGPAGAAGERGEAGSSGPSGPAGSRGIPGERGETGPAG
PPGFAGPPGAAGQAGAKGERGQRGPKGDVGPQGAVGAAGNAGPAGPVGPPGPGGGRGDTG
PPGVTGFPGAAGRVGPPGPAGITGPSGPPGPAGKEGIRGPRGDTGPVGRTGETGPVGPPG
FSGEKGPSGEAGTAGPPGSPGPQGLLGSVGNLGLPGSRGERGLPGIAGAVGEPGPVGASG
PPGARGPSGPIGNPGVNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGVPGYKGERGGPGSPGPSGTLG
APGPHGAVGPAGRPGNRGEAGPVGPVGSVGPVGARGPSGPQGPRGEKGGPGDKGPRGLPG
LKGHNGLQGLPGIAGHHGEQGSPGSTGPSGPRGPPGPSGPHGKDGRNGIPGPVGPAGVRG
SQGSPGPSGPPGSPGLPGPPGVNGGGYEVGFDAEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKTLNNQ
IETLLTPEGSKKNPARTCRDLRLSHPEWTTGFYWIDPNQGCTMDAIRVYCDFSTGETCIH
ANPENIPTKNWYTSRNPAEKKHIWFGEVISGGTQFEYNNEGVTAKDMATQLAFMRLLANH
ASQNITYHCKNSVAYMDAETGNLKKSVMLQGSNDVELRAEGNSRFTYSVLEDGCSTKTNQ
WSKTIIEYRTNKPSRLPILDIAPLDIGGADQEFGLDIGPVCFK
NT seq 4092 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctcagctttgtggatacacggattttgttgctgctcgcagtaacttcatgcctagca
acaagtcaatatgtaaatgaggcaaggcaaggacggaagggccccagaggagacaaagga
ccacagggagaaaggggtccaccaggcccaccaggtagagatggtgaagatggtccacca
ggccccccagggccccctggtcctcccggtcttggcggaaactttgctgctcaatatgat
caatctaaatcagctgactttggcccaggaccaatgggacttatgggacccagaggccct
cctggagtaactggaccccctggtcctccaggccactctggacatgctggtgaacctggt
gaacccggtcaaacaggtccacaaggtgctcgtggtccaactggtcctcctgggaagtct
ggtgaagatggtcatcctgggaaacctggcagatctggtgagaggggtgttcctggcccg
cagggtgctcgtggctttcctggaactcctggcctccctggtttcaaaggaataagggga
cataatggtttggatggtcgcaaaggagaacctggtgctcctggtaacaagggtgaacct
ggtgcccctggagaaaatggtaccccaggacaatctggtgctcgtggtctccctggtgaa
aggggaagagttggtgctcctggaccagttggtgctcgtggcagtgatggaagcgttggt
cccgctggtcctgctggtcccattggtggtgctggaccttctggattcccaggtgctcct
ggtcccaagggtgaaattggatctgctggtagccctggcccatctggtcctgctggtcca
cgtggtgaaattggtctccctggtgcttctggtcctgttggtccaccaggtaaccctggt
gccaatggcattaatggtgctaaaggtgcagttggtcttcccggtgtggctggtgctcct
ggcctgccaggcggccgtggtatccctggcccatctggtccagctggtgcttctggtccc
agaggacttgctggtgagcctggaattcctggagccaagggagaaactggtaacaagggt
gaacccggtgctgctggcccatctggcccaagtggtgcaagtggtgaggaaggcaagagg
ggtgtcaacggtgaacctggagctactggtgcacctggcccagcaggtttaagaggtgtt
cctggatctcgtggtctccctggatctgatggcagagctggagttataggtgctgctggt
aatcgtggtgctactggctctgctggtgctagaggtcctggtggtgatgcaggtcgccct
ggtgaacctggtctcatgggtgcaagaggtctccctggtcaatctggaagcccaggccct
gctggcaaggaaggtctttctggtctgtctggtcctgatggccgacctggtccagttggt
ccagctggtccaagaggtgaacctggtatcataggcttcccaggaccaaaaggccccaat
ggtgaacctggcaagcctggtgacagaggccatgttggtcttgctggccctcggggtgct
cctggtcctgatgggaacaatggagctcaaggaccacctggtgttattggtaatgctggt
tccaaaggtgaaactggtcctgctggtgctcctggcttccaaggtctaccaggtccatca
ggcggagtcggtgaagctggcaaaccaggggaaagaggtcttcatggcgaatttggactc
cctggccctgctggtgtgagaggtgaacgtgggcctccaggtgaaagtggtgctgttggt
cctgtaggttccattggaagtcgtggcccatctggtccaccagggcctgatggtaacaag
ggcgaacctggaattgccggtgcacctggttccgcaggcccatctggtcccagtggaatc
ccaggagaaagaggcattgctggtggtccaggaggcaaaggtgaaaagggcccaacagga
ttcagaggtgaaccgggagcaacaggaagagatggttcacgtggtgctcctggagccatt
ggtgcccctggtcctgctggagctgctggtgaaaggggtgaagctggttcctctggccca
tctggccctgctggttctcgtggaatacctggtgaacgtggtgagaccggtcctgctggt
cctcctggatttgcgggccctcctggtgcagctggccaggctggtgctaaaggtgaaaga
ggtcagagaggccctaaaggtgatgtaggccctcagggtgctgttggtgctgctggtaac
gctggccccgctggtccagtcggtcctccaggtcctggtggaggtcgtggagatactggt
ccacctggtgttactggtttccctggtgctgctggtagagttggacccccaggccctgct
ggtatcactggtccatccggtcctcctggtccagctggcaaggaaggtatcagaggccca
cgtggtgacactggaccagttggccgtactggagaaactggacctgttggacctcctggt
ttctctggagagaaaggcccaagtggagaagctggcactgctggtcctcccggttcccca
ggtcctcagggtcttctcggatctgttggtaaccttggtttgcctgggtctaggggagag
cgtggtctcccaggtatcgctggagccgtgggtgagcctggacctgttggcgcttctggt
cccccaggtgcccgtggcccttctggccccattggtaaccctggtgtgaatggtgctcct
ggtgaagctgggcgtgatggaaatcctggtaacgatggtcctccaggccgtgacggtgtt
cctggttacaagggtgaacgtggtggtcctggcagccctgggccttctggtactcttggt
gcccctggcccccatggtgctgtcggtcctgctggcagacctggaaatcgtggtgaagcc
ggtcctgtcggtccagttggttctgttggcccagttggagcaagaggtccttcaggccca
caaggtccacgtggtgagaaaggtggtccaggtgacaagggacctaggggattgcctgga
cttaaaggacataatggacttcaggggctgcctggcattgctggtcatcatggagaacaa
ggttcacctggttctactggtccttctggcccaaggggccctcctggtccttctggtcct
catggcaaagatggtcgcaatggtattcctggacctgttggacctgctggtgtgcgtggt
tctcagggtagcccaggaccttccggtccaccaggttctcctggtcttcctggcccacct
ggtgtcaatggtggtggatatgaagttggctttgatgcagaatactaccgggctgaccag
ccttccctcagacccaaggattatgaagttgatgccactctgaaaacattgaacaaccaa
attgagactctcctgacccctgaaggctctaagaaaaatccagctcgcacctgccgtgac
ttaagactcagccatccagaatggactaccggcttctactggatcgatcctaaccaaggc
tgcaccatggatgccattagagtgtactgtgatttctccactggtgagacctgtatccat
gctaatccagaaaacatcccaaccaagaactggtacactagcaggaatcctgcagagaag
aagcacatatggtttggagaagttatcagtggtggtactcagtttgaatacaataatgaa
ggcgtgactgccaaggacatggccacccaacttgccttcatgcggctgctggctaatcat
gcctcccagaacatcacttaccactgcaaaaacagtgttgcctacatggatgcagaaaca
ggaaaccttaagaagtcagtgatgttgcagggatccaacgatgttgaactacgagctgaa
ggcaacagcaggttcacttacagtgttcttgaagacggctgctctacaaagaccaatcaa
tggtccaaaacaatcattgaatacagaacaaataagccatctcgcttgcccatcctggac
attgcacctttggacattggtggcgctgaccaagaattcggtttggacattggcccagtc
tgtttcaaatga

DBGET integrated database retrieval system