Gossypium raimondii: 105796763
Help
Entry
105796763 CDS
T04129
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
gra
Gossypium raimondii
Pathway
gra03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gra00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
105796763
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
gra03019
]
105796763
Messenger RNA biogenesis [BR:
gra03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
105796763
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105796763
NCBI-ProteinID:
XP_012482018
UniProt:
A0A0D2PN02
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(5259885..5263458)
Genome browser
AA seq
458 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDRLKEYFGQYGDILQTVVMRDKVTGRPRGFGFVVFSDPSVL
DTVLQEKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSARSGNFNQGRNSGGGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTEDGFRQYFEAYGHVTDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKSFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGASRTMSGGASGFGGYQGYGSSGGNSSSYDGRMDSSSYMRAQGTGAG
FPTYGSSGYAPGYGYGPANNGVGYGSYGNYGGAGAGYGAPAGAAYGNPNAGYASGPPGAP
RSSWGTQAPSGYGAMGYGNAAPWGAGAGSGGPGSAATGQSPTGATGYGGQGYGYGGYGGN
DGSYGNAGYGAAGGRSGGTPNSNAVAGGEDLQGSGGGYMVSGYGDVNGSSGYGNATWRSD
SSQGSGNYGGAQANGPHGGQGGYGGGYGGAQGRQAQQQ
NT seq
1377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaagctgtttattggagggatatcatgggaaacaagtgaggat
aggctaaaggaatactttggtcagtacggcgacatcttgcagactgttgttatgagagat
aaggttacggggagacctcgtggctttggattcgttgtcttctcagatccgtccgttctc
gataccgttcttcaagaaaagcacaccattgatggtagaacggttgaggcaaagagggcg
ttatctagagaggagcagcaaacgtctgctagatctggtaattttaatcagggtagaaat
tccggaggtggtggaaatatcaggaccaagaagatttttgttggaggattgcctccgacc
ttaactgaagacgggtttcgccaatactttgaggcatatggtcatgtaactgatgtagta
atcatgtatgaccagaatactcagcggcctcgggggtttggttttatctccttcgacact
gaagatgcagttgacagggttttgcacaagagttttcatgatttgaatggcaagcaagtt
gaagtgaagcgggcccttcctaaagatgccaaccccggtggggctagccgtactatgagt
ggtggtgccagtggttttggaggttaccagggttatggttcttctggtgggaattcaagt
tcttatgatggtcgaatggactccagtagttacatgcgcgcccagggtactggagctggc
tttccaacttatggctcatcaggatatgcacctggttacggttatggtcctgctaataat
ggtgttggctatggtagttatggaaattatggtggtgcaggtgctggttatggtgctcct
gcaggtgcagcttatgggaaccctaatgctggttatgcaagtgggcctcctggtgcccct
agaagttcatggggcactcaagctccatctggttatggtgctatgggttatgggaatgct
gctccttggggtgctggtgctggtagtggtggcccaggttctgcagctactggccagtct
cccactggagctactgggtatgggggtcaaggttatggatatggtggatatggcggtaat
gatggatcttatgggaatgctggctatggggctgctggaggtcgttctggtggtactcca
aatagtaatgctgttgcaggtggggaagatctacaagggagtggtggtggttacatggta
agtgggtatggtgatgtaaatggaagttcagggtatggaaatgcaacatggaggtctgat
tcatcccaaggttctggaaattatgggggtgctcaggcaaatggtcctcatggtggacaa
ggtggttatggtggtgggtatggcggtgcacagggccgacaagctcagcaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
