Gossypium raimondii: 128039268
Help
Entry
128039268 CDS
T04129
Name
(RefSeq) putative disease resistance protein RGA3
Organism
gra
Gossypium raimondii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NB-ARC
LRR_4
AAA_16
AAA_22
nSTAND1
LRR_8
AAA_14
NACHT
ATPase_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128039268
NCBI-ProteinID:
XP_052483635
LinkDB
All DBs
Position
2:46413694..46419091
Genome browser
AA seq
1411 aa
AA seq
DB search
MAKKIKDILETLDGLNKDASSFGLQQRATEHVSPVPRRSNVETFSVMDESTIVGRENDVS
KVVDLLVNPKDEQVVSVVPIVGMAGLGKTALAKLVYDDLRVKRHFGVKSWVCVSDHFSVK
KILGAMFEQLTGDRHTSMPENMNAMIMKLKERIEKDQSKYLLVLDDVWDVEKWEELQLCL
KGVSTNGGNGIIVTTRIQDVASKVQALPNRRHQAGRLEDEECWSIIKQRALMDSPISHEL
ELIGQEIAKQCRGVPLVAKLMGGIMRKIEMSPRAWSKNQRSDAWGSMESVLKLSFDHLSS
PYVKKCFAYCAMFPKDYCFGKEELIQLWTAEGFLGSSMEMVDIGDQYLNELLSNSLFQDV
EKDKFGNILTFKMHDLVHDLSLSVSKFDTLVFRENSTLTSDECSHIRHLNVGCDGKLLPE
ILKEVAPHLHSLFSEIDVFKQLSISVTRLRVLKFVGANYILELPDSLGELKHLRYLDISG
TFIKALPKSTAKLYHLQTLRLLDLPRLTLPDGLENLISLTHLYFDSREVQPDNIGNLTCL
QTLPLFVVGSERGRSIKELGSLNELRGKLKICHLGGVRDKQEANGANLHRKEKLCKLIFD
FEGRHSGGGYNCEEVMEGLQPHSNLQSLIVRNYEGESFPSWMLKPVGDSNTGLFLLNNLM
ELNFYDCINCESLPPLGQLHNLQFLELRNMKKVKRMGNEFYGNEGIDGMNKVIKVFPALK
KFTLNGMANLKKWTAMAATKTIMFPCLVELNIWDCPMLKSVPLTGQCSSLEKLSIFDCKN
LSKIGDGLSTSTCLKELALKNCPNLSWIPNLEGFSSLQILSIDSCNELEALPITGRCSSL
EKLSILDCEKLRKIGDGLSTSTCLKELELLWCPNLTSIPKLEGFSSIQNLSIDSCIKLEV
LEISGGCSAFEKLSISKCKTLSKTGDRLFTYTCLKELNLEDCPNLSSIPNLKGFSCLQNL
SIHTCNGLEVLPIIGACSSLEKLNIFGCEKLSKIGDGLSTSTCLKELGLKNCPNLSLIPN
LEGFSCLQNISIDSCNRLEVLPIIGRCSSLEKLSIFDCKKLSKIGDGLSNSTCLRELGLK
NCPNLSWIPNLEGFSSLQILSIDSCNELEVLAITGRCSSIKKLSIFNCEKLRKIGDKLST
FICLKELGLKNCPNLSWIPNLEGFSSLQDLSIDSCNELEVLLIQEFQGIEAFPEWLGNLS
SLWRLSLIGFGKLKSFPHQLQHLTALEDLTMSGFHEIEALPEWLGNLSSLKRLYLSGFRK
LKSFPHQLQLLSTLKYLTIEEFQGIEAFPEWLGKLSSLRYLYLSGFGKLKSLPHQLHLPS
ALEDLTMSMFHEIEALPELLGNLSSLRRLHINSCNKLMYLPSVDVMRSLSKLKTIDILMC
PQLETRCERESGPEWSKISHIPQIIINGRRI
NT seq
4236 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaaaaaaattaaggacatccttgaaacactggatggccttaacaaagacgccagt
tcatttggtcttcagcagagagctacagaacatgtgtctcctgtacctagaagatcaaat
gtggagacgttctctgtcatggatgaatcgaccattgttggaagggaaaatgatgtctca
aaggtggttgacctgttagtcaatcctaaagatgagcaggttgtttctgttgtacctata
gtaggtatggcaggtcttggcaaaactgcattggcaaaactggtgtatgatgatctgcgt
gtgaaaaggcattttggtgtcaaatcctgggtctgtgtttctgatcattttagtgtcaaa
aagattttaggagcgatgtttgaacagcttactggtgatagacatacctcaatgccagaa
aatatgaatgcaatgattatgaagctcaaggagaggatagaaaaggatcagagcaagtat
cttcttgtccttgatgatgtctgggatgttgagaaatgggaggaactacagctttgtctg
aaaggagttagtacaaatggtgggaatggaattattgtcacaacacgcattcaagatgta
gcatcaaaagtgcaagcccttccaaatcgaaggcatcaagcaggaagactagaagatgaa
gaatgttggtccataattaaacaacgagcattgatggactctccaatatctcacgaatta
gagttaattggacaggaaattgctaagcaatgtcgaggagtgccgttggtagctaaactt
atgggagggataatgcgcaaaattgaaatgagtcctcgcgcatggtcgaaaaatcaaaga
agtgatgcatggggttcaatggaaagtgtgttaaagttaagtttcgatcacttgtcttct
ccatatgtgaagaagtgttttgcatactgtgccatgtttcctaaagattattgctttggg
aaagaggaattgatccaactgtggacggctgaaggatttcttggcagctccatggaaatg
gtagatattggtgaccaatacttgaatgaattgttatcaaattccttatttcaagatgtc
gagaaggacaaattcgggaatattctcacattcaagatgcacgacttggtgcatgattta
tcattgtctgtgtcaaagtttgatactttggtttttcgagaaaattccactctcacctca
gatgagtgttctcatattcgtcatctcaatgttggatgtgatgggaaattattaccagaa
atcttaaaggaggtagctccacacttacactcactgttttcagagattgatgtgttcaag
caactatcaataagcgtcacaagattacgtgtcctaaagtttgtcggtgctaattatatt
cttgagttgccagattcccttggagaattgaagcacttgaggtatttggacatctcaggg
acttttatcaaagcactgcctaagtccacagctaaactttaccatctccaaacattaagg
ctcttggatttaccgagactcacccttccagatggattggaaaatttgataagcttgacg
cacttatattttgatagtcgagaagttcagccagataatattggaaacctaacttgtctt
caaacattacccctatttgttgtgggttcagaaaggggacgttcgattaaggagctagga
tccttaaacgaactgcgtggaaaactgaagatatgccatcttgggggtgttagagacaaa
caagaggctaatggagcaaatctgcaccgcaaggaaaaattatgcaagttgatatttgat
tttgaagggaggcacagtgggggtggttataactgtgaagaagtgatggaaggtctccaa
cctcactcaaatttgcaaagcttaattgttaggaattatgaaggtgaaagctttccctcc
tggatgttaaaacctgttggtgattctaatactggtttgtttttgcttaacaatttgatg
gagctgaatttttacgattgcatcaactgtgaaagtcttccacctctgggccaattgcac
aatctccagtttcttgagttgagaaatatgaagaaagtgaaacgcatgggtaatgaattt
tatggcaacgaaggtattgatggtatgaataaggtgatcaaggtgtttcctgcattgaaa
aaattcaccttaaatgggatggcaaatctaaaaaaatggacagcaatggcggccacaaag
acgatcatgtttccttgcttggtggagctgaatatttgggattgtcccatgttgaaaagt
gttccacttacgggacaatgttcatctcttgaaaagcttagcattttcgattgcaaaaac
ttaagcaagattggagacggattatctacctccacttgtctcaaagaattagctctaaag
aattgtcctaatttaagttggattccaaatttggaaggattttcctctcttcaaattctg
tcaattgatagctgcaatgaattggaagctcttccaataactgggaggtgttcatctctt
gaaaagcttagcattctcgattgcgagaaattaagaaagattggggacggtttatctacc
tccacttgtcttaaagaattagagctattgtggtgtcctaatttaacttccattccaaaa
ttggaaggattttcgtctattcaaaatctgtcaattgatagctgcatcaaattggaagtt
cttgagatatccggaggatgttcagcttttgaaaagcttagcatttccaagtgtaaaaca
ttatccaagactggagacagattatttacctacacttgtctcaaagaattaaatctagaa
gattgtcctaatttaagttcgattccaaatttgaaaggattttcgtgtctccaaaatctg
tcaattcatacctgcaacggattggaagttcttccgataattggagcatgctcatctctt
gaaaagcttaacattttcggttgcgaaaaattaagcaagattggagacggattgtctacc
tccacttgtctcaaagaattaggtctaaagaattgtcctaatttaagtttaatcccaaat
ttggaaggattttcctgtcttcaaaatatctcgattgatagctgcaacagattggaagtt
cttccaataattggaaggtgttcatctctcgaaaagcttagcattttcgactgcaaaaaa
ttaagcaaaattggagacggattatctaactctacttgtctcagagaattaggtctaaag
aattgtcctaatttaagttggattccaaatttggaaggattttcctctcttcaaattctg
tcaattgatagctgcaacgaattggaagttcttgcgataactggaaggtgttcatctatt
aaaaagcttagcattttcaattgtgaaaaactaagaaagattggagacaaattgtctacc
ttcatttgtctcaaggaattaggtctaaagaattgtcctaatttaagttggattccaaat
ttggaaggattttcctctcttcaagatctgtcaattgatagctgcaatgaattggaagtt
cttctgatacaagagtttcaaggaatagaagcctttccggagtggttgggaaatctctct
tctctatggcgtctaagtttgattggttttggaaagctaaagagttttcctcaccaactt
caacacctcactgcccttgaagatttgactatgtcggggtttcatgaaatagaagccttg
ccagagtggttgggaaatctctcttctctaaagcgtctatatttgagtggttttcgaaag
ttaaagagttttcctcaccaacttcagctcctttctacccttaaatatttgactatagaa
gagtttcaaggaatagaagcctttccggagtggttgggaaagctctcttcgctaaggtat
ctatatttgagtggttttggaaagctaaagagccttcctcaccaacttcatctccccagt
gcccttgaagatttgactatgtcgatgtttcatgaaatagaagccttgccagagttgttg
ggaaatctctcttccctaaggcgtctgcatatcaattcatgcaataaactcatgtacctc
ccttctgtagatgttatgcgaagcctctccaaattaaaaacaattgacattttgatgtgt
cctcaattagagacaagatgtgagagggagagtggccctgaatggtccaagatttcccac
attccacaaataattattaatggtcggaggatctag
DBGET
integrated database retrieval system