Helianthus annuus (common sunflower): 110893809
Help
Entry
110893809 CDS
T05101
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat extensin-like protein 4
Organism
han
Helianthus annuus (common sunflower)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110893809
NCBI-ProteinID:
XP_021996635
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(3195339..3198186)
Genome browser
AA seq
752 aa
AA seq
DB search
MKTICLSLISFLLLCLLAFSPVRVLSFFDDSVAVAAGAGYGRLTDGEVKYIRQRQLLYYL
DENGDRGENVTVDPSLVFENPRLRNAYIALQAWKQAILSDPQNLTVDWVGSGVCGYTGVF
CAPAPDNRSERTVAGIDLNHGDIAGYLPEELGLLTDLALFHINSNRFCGTIPKKFKNLKI
LFELDISNNRFAGIFPRVVLKLPKLKFLDLRFNEFEGNVPKELFDKDLDAIFINHNRFKF
ELPDNFGNSPVSVIVLANNKFHGCLPASIGNMSDTLNEIIMMNNGLRSCIPDEIGLLSNV
TVFDVSFNELMGPLPESISGLVSVEQLNVASNYLSGSIPESVCRLPRLENFTYSDNFFTG
EPPVCLNLAAFDDRRNCLPGRPAQRPVNQCRMFQSKKIHCSAFRCAPFVPVLPTPPPPVL
VPSPPVVTPSPPVVTPSPPVYTPPSPSPPPPPSPPPPVYSPPPPPPSPPPPVYSPPPPPP
SPPPPSPPPPPPPSPPPPSPPPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPVMSPPPPPPPPPPPPPPPS
PPPPSPPPPVMSPPPPPPPPLSPPPPVNPPYCVRPPPPPPVTPSPPPPVHSPPPPVHSPP
PPQPYYYDSPPPPHSPPPPHSPPPPPHSPPPPHLPPPPYIYSSPPPPSPQSPPPPPHSPP
PPPHSPPPPAPLCIEPPPPPPPCIEYTPPPSPTPSPPPPPLVYYSPPPPVHHPPPPPAIT
YNSPPPPAPVYEGPLPPVFGVSYQSPPPPPFY
NT seq
2259 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaccatttgtttaagtttaatctcctttcttcttctttgtctgcttgcattctca
cctgttagggttttatctttcttcgatgactccgtcgccgtcgccgccggcgccggctac
ggccggctcaccgacggcgaggtgaagtacatccggcaacggcagctgctatactacctc
gacgagaacggtgacagaggtgaaaacgtgacggtggatccgtcgctggtgtttgaaaac
cctaggttgagaaatgcttatattgctttacaagcatggaagcaagcgatactttcagat
ccacaaaatctgaccgttgattgggttggatctggtgtgtgcggctacacaggagtgttc
tgtgcacccgcaccggataatcgttctgaaagaaccgtcgctggaatagacctcaaccac
ggcgacattgctggatatctaccggaggaactcggtttgttaaccgatctggcgttgttt
cacataaactcgaaccggttttgcggaacaattccgaaaaagtttaagaacttgaagatt
ctgtttgagcttgatatcagcaacaacaggtttgccggaatattccctcgcgttgtgctt
aaattacctaaattaaagtttttagatctccggtttaatgagtttgaaggtaatgtgcct
aaagaattgtttgataaagatttggatgctatttttattaaccacaaccggtttaaattc
gagttaccggataacttcggtaattcgccggtttcggttattgttttggcgaataataag
tttcacgggtgtctgccggcgagtattgggaatatgtcggatacattgaatgagattatt
atgatgaataacgggttgaggtcttgtatcccggatgagattgggttgttgagtaatgtg
acggtgtttgatgtgagttttaatgagttgatggggccgttgccggagagtatttctggg
ttggtgagtgtggagcagttgaatgttgccagtaattatttgagtgggagtattccggag
agtgtttgccggttgccccgcttggagaattttacctattcggataatttctttactggc
gagcctcctgtttgcttgaatttggctgcctttgatgatcggaggaattgtttgcctggg
agacccgctcagagaccggttaaccagtgtaggatgtttcagagtaagaagatacattgt
agtgctttccgctgcgctccgtttgttccggtgttgcccacgccaccaccgccggttctc
gtgccttcaccgcctgttgttaccccgtcgccgcctgttgttaccccatcgccacctgtt
tataccccaccttcaccgtcccctccaccaccgccttcgcctccaccacccgtttactca
cctcccccgcctccaccttcgcctccaccacccgtttactcgcccccgcctcctccacca
tcgcccccgcctccctcgccacctccgcctcctccaccgtcacccccaccgccttccccg
cctccaccccctccaccatcgcccccgccaccttccccacctccaccgtctcccccacca
ccagtaatgtcaccgcctcccccacctccacctccaccccctccaccaccaccaccatct
ccaccaccgccatctcctccgcccccagtcatgtcacctccaccgccaccgcctccacca
ctatctccaccaccgccagttaatccgccttattgcgtacgaccgccaccaccacctcca
gttacaccctcaccaccgccacccgtccattcccctcctccaccagtccactccccacct
cccccacaaccttactactatgattcaccacctccacctcactcgccaccaccacctcac
tcccctccaccaccaccccactcgcctccaccacctcacttaccgcctccgccttacata
tactcatcaccaccgcctccatcacctcaatccccacctccgccgccccattcaccacct
ccaccaccccattccccacctccaccagcccctctttgtatagaaccaccaccaccacca
cctccttgcattgaatacacaccaccaccatcaccaaccccatcgcccccaccgcctcca
ctagtctattactccccaccgccaccagtccaccatcctcctccccctccagcaataaca
tacaacagcccaccacctccagcaccagtatacgagggccccctaccgcccgtattcggg
gtatcatatcaatctcctccaccaccacccttctattga
DBGET
integrated database retrieval system
