Helianthus annuus (common sunflower): 110901029
Help
Entry
110901029 CDS
T05101
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC110901029
Organism
han
Helianthus annuus (common sunflower)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PIF1
Helitron_like_N
Pif1_2B_dom
Rep_fac-A_C
RepSA
DUF223
REPA_OB_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110901029
NCBI-ProteinID:
XP_022003575
LinkDB
All DBs
Position
15:64534144..64540457
Genome browser
AA seq
1309 aa
AA seq
DB search
MEKQRVSLLDAGLFYQRHLPGGARYMLQQYQDAMAICRWAETPDLFITMTCNPRWPEVDR
HISATTPGRTASDRPDILARVFKIRLDELIKDLRKKNHFGKTKAVIYTIEFQKRGLPHCH
ALLFLEPADKIGTTEDIDRYISAELPSELQDPAAFAVISKQMMHGPCGELNPTSPCMHNQ
KCTKGYPKNYCDETFIRNDGWPCYKRPNNSRTVRVGSQDIRLDNRYVVPYNRDLLVKYGC
HINVEWCNQAIEACWKLFSFDMNYRSVAVERLPFHEEGCNRVYFRDDADVADVAQRSTSA
FSKFTAWMEANRNHPEGRNLTYVEYPTHYTWHEKDRQWMPRYGGNTIGRIYHVNPSMGEK
YYHRLLLNVVRGPRSFKEIRTVDGVEYPNYMLACKALSLLGDDVEWVEAIREAYQWKLGN
QLLELFVTILLFCTVSDQSKLFYDCLEYLSEDVAFKQRALLGNQLVVFTDEEILNYTLLE
INSILNNHNKSLADFPTLPQLDPHLTDDGSNGLIIAEKTYNVQEEAVKFNELHSGLNAIQ
RQVFDAILDSVNNNNGGVFFCIWQRRDRKIVLSVASSGIASMLLPGGRTAHSRFRIPIDI
ENDSCCSIDYGSNLAQLINAADLIIWDEAPLQHRYAFEAVDRTFRDVCRDNMVDARHRVF
GGKVVVLGGDFRQILPVVPHAPRSQIVASVVNKSDTIWNACKVFHLTTNMRLHNPNVSRD
SLEKMKTFSNWILAMGAGRLPTISLVGEDEPTWIKMPNDLLIPVSENPIGAVVSNTFPDI
LERVNDIHYLKKRCILCPMNDEVDKINLHVLEKMPGELQELLSADEICQSTNNYDEMCAL
YPPEFLNTLNFSGISNHRLQLKIGAPVILMRNLNLQKGLCNGTRLVVTQISRRVIEAVII
TGTHVGEKAFIGRIDMTPTNTCWPFSFKHVSVYLGFTIHARIPANLIYIFKNRLEEGCVY
MIDNFFVHPYDMLYRPLRRCKYLEFSRWTRVSASSIEPWLFKRYVFDLAPFEDLTKRIND
DHYLTDVFGALRAWGPVNTESSNVHGNKLNVTLWGKAALKFTDEAIRSYGNNQILVILTG
CKVRMFDGGPCLVSTVATELYLNLDFPIVIEAFKNIVVPPVTFTLDDQSNEDMSVVSVFD
IYNYIKDGLAKGKMYNVEGTIIGVDLEEDWKYKLAVQLWNQEKEITCVLFDDAANLLLGL
TAEQLIIKTLSEGADDPYWIYEFLMDALCARHVIFRIRVDDYNLAPTYSPRFTVSKYLGD
DINNLASTLLPSTCPSADVLHDEASEFLSRINDDEWDMIHESLWGPRDC
NT seq
3930 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagaaacaacgtgtgagtttgttggatgcagggttattctaccagcgtcatttaccg
gggggggcaaggtatatgctacaacaatatcaagatgcaatggcgatttgccgttgggct
gagacaccagatctttttattaccatgacttgcaacccgagatggcctgaagttgaccgt
cacattagtgctaccacacctgggcggacagcatcagatagaccagacattcttgcacgc
gtttttaaaattcggcttgatgagcttattaaagatttaaggaaaaaaaatcattttggc
aagacgaaggctgttatttacacaattgaattccaaaaacgtggacttccgcattgtcat
gctttgctttttctagaacctgcggataagattggtacaacggaagatattgatagatat
atatccgctgaacttccttctgaattgcaagatcctgctgcttttgcagttattagcaag
caaatgatgcatggaccatgtggtgaactaaatccaacgagtccttgtatgcataatcag
aaatgtacgaaagggtatccaaagaactattgtgatgaaacatttataagaaatgatggg
tggccctgttataaaaggccgaacaattcaagaacagtccgggttggtagtcaagatatt
aggcttgataatcgatatgtggttccttataaccgtgacttacttgtcaaatatggttgc
catataaatgtggagtggtgtaaccaggcgatagaagcgtgttggaagctgttttcattt
gacatgaattaccgttcagttgcggttgaaagactaccattccatgaagaaggttgtaat
agagtctacttccgagatgatgctgatgttgctgatgtagcacaacgatcaacatctgcc
ttttctaagttcactgcatggatggaggcaaatcggaatcacccagagggtcggaattta
acctacgttgagtacccaactcattacacgtggcatgaaaaggataggcaatggatgcca
aggtatggtggtaatactattggtcgcatttatcatgtgaatccttctatgggtgagaag
tattatcaccgtttgttattaaatgttgttcgcggtccacgtagcttcaaagaaattcgt
acggttgacggtgtcgagtatccaaattatatgttagcttgtaaagcactaagtttgctt
ggagacgatgttgaatgggttgaggctatacgtgaagcctaccagtggaagttagggaat
caattgcttgagttgtttgtcacgattcttttattctgcacagttagtgatcagtcgaag
ttattttatgactgtcttgaatacttatccgaagatgttgctttcaaacagagagcactt
ctaggtaaccaacttgtggtgttcacggatgaggagatacttaactacacgttgcttgag
ataaattcaattttaaacaatcacaacaaatcattggccgactttccaactctacctcag
cttgatcctcatttaacggatgatggttccaatgggttgattattgctgaaaaaacatat
aatgtgcaagaagaagctgtgaaattcaatgagctacatagcgggttaaatgctattcaa
aggcaagtgtttgatgctatacttgattcagtgaataacaacaatggtggcgtttttttt
tgtatatggcaacggagggacaggaaaattgtattatccgttgcatcgtctggaattgca
tctatgttgttacctgggggtcgtaccgcacattcacggtttcgcattcctatagatatt
gaaaatgattcatgttgttcgatcgactacggcagcaaccttgctcagttaatcaacgct
gctgatctaataatttgggacgaagcacctttacaacacaggtatgcatttgaggctgtt
gaccgaacctttagagatgtttgtcgtgataacatggttgacgctcggcatcgggtattt
gggggaaaagttgtggttcttggaggtgattttcgtcaaattttaccggttgttccgcat
gccccacgtagtcagattgtcgcgtctgttgttaacaagtcagacacaatatggaatgca
tgtaaggtatttcatttgacgactaatatgcgcttacacaatccaaatgtcagtagagat
tcgcttgaaaaaatgaaaacgttcagcaattggatcttggccatgggggccggtcgcttg
cctacaatttcattggtgggggaagatgaacctacgtggatcaaaatgcctaacgatctt
ttaatcccggtttctgaaaatccgattggtgcagtggtttccaatacctttcctgatatt
ttagagagagtcaatgacattcactatttaaaaaaacgctgcattttgtgcccaatgaat
gatgaggtcgataagatcaaccttcacgtccttgaaaaaatgccaggtgaacttcaagaa
ttgttaagtgctgatgaaatatgtcaaagcacaaacaactatgacgagatgtgcgctttg
tatccacctgagtttcttaacacgttgaatttttctgggatttcaaaccataggttacag
ttaaagatcggtgcaccggttattttgatgcgcaacttaaatttgcaaaagggcttgtgt
aatggtacacggttggtggttacacaaattagtcggcgtgttattgaggcagtaattatt
accggtacacatgttggcgaaaaggcatttattggtaggatcgatatgactccaacgaat
acatgttggcctttttcttttaaacatgttagcgtgtatctgggttttacaattcatgca
aggatacctgctaatttgatttacattttcaagaaccgtttggaagagggctgtgtgtat
atgattgataacttttttgttcatccctatgatatgttgtaccgtcctttgcgacgttgt
aagtatcttgaattttcgcggtggacgagagtctctgcttcgtctattgaaccgtggttg
tttaaacgctatgtttttgatttggctccatttgaggatctaaccaaacgcataaatgat
gatcactatctgacagatgtttttggtgcactacgcgcatggggtcctgttaacactgaa
tcttcaaacgttcatggcaacaaacttaatgttacgttatggggcaaagctgctctcaag
tttactgacgaggccatccgcagttatggaaataatcaaattttggttattttgaccggt
tgcaaggtccgaatgttcgatgggggtccgtgtttagtgtcaacggttgcgactgaactt
tatctcaatctggatttccctattgtcattgaggccttcaaaaacattgtagtgccgcct
gttacgttcacattggatgatcaaagcaacgaggacatgtctgttgttagtgtatttgac
atctataattatattaaagatggtcttgctaagggaaaaatgtacaatgttgagggcaca
ataattggtgttgatttggaggaggattggaagtataaactggctgttcaattatggaac
caagaaaaagagattacatgtgttctctttgacgatgctgcaaatcttcttctcggactt
acggctgaacaattgattataaagaccttatcagagggtgctgatgatccgtattggata
tatgaatttctgatggacgctttatgtgctcggcatgtgatttttaggataagagttgat
gattacaatttggcaccaacttacagtccacgcttcaccgtatcaaaatacttgggtgac
gatattaataatcttgctagcactttacttccttcaacatgtccttctgctgatgttctc
catgacgaagctagcgagtttttatctcggatcaatgatgatgaatgggacatgatacac
gagtcattatggggaccacgcgattgttga
DBGET
integrated database retrieval system