Ictalurus furcatus (blue catfish): 128620499
Help
Entry
128620499 CDS
T09387
Symbol
si:dkey-88l16.3
Name
(RefSeq) low-density lipoprotein receptor-related protein 2
Organism
ifu
Ictalurus furcatus (blue catfish)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ldl_recept_a
Ldl_recept_b
FXa_inhibition
cEGF
EGF
PRKCSH-like
SGL
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128620499
NCBI-ProteinID:
XP_053501527
LinkDB
All DBs
Position
16:21004837..21025858
Genome browser
AA seq
2983 aa
AA seq
DB search
MDAVSLDQFQCAHGRMCIDKKLVCDGTPQCQDRSDEMDCFTRTKSCSHRCDNKTRCIPDN
FLCDGEKDCVDGTDEADCRESSSIAVTPKVETTPEPICKSPSVMCQGTALCISQSQLCDG
MLDCPDGFDELHCLHACSDPGHFLCKNKRKCIEQALVCDGRSDCSDDSDELRCPTCPLHC
DEGTVCLINQQFCDGRVDCKDGFDERNCYKTAKKSAKSSSLKCAVGFKACRDGSECVLYS
HVCDGEKDCKDGSDEKDCERQCKKGQFQCAHGRMCIDKKLVCDGTPQCQDRSDEMDCFTR
TKSCSHRCDNKTRCIPDNFLCDGERDCVDGTDEADCHERSSVAVTPKVETTPEPPCKSPS
VMCEGTSLCISQSQLCDGLLDCPDGFDELHCLHTCSDPGHFLCKNKRKCIEQALVCDGRS
DCSDGSDELRCPTCPLHCDEGTVCLTSQQFCDGGMDCKDGFDERNCYNSDKDKGALKCAV
GFKPCRDGSECILYSHVCDGEKDCKDGSDEEDCGVKSVTVAPKVETTPEPICKSPSVMCP
STSLCISQSQLCDGMLDCPDGFDELHCLHACSDPGHFLCKNKRKCIEQALVCDGHSDCTD
GSDELRCPTCPLHCDEGTVCLTSQQFCDGRMDCNDGFDERNCCMFCCNEKLFENLTEHVI
RADFFEMHFVDQTGKKATEASSLKCAVGFKPCRDGSECILYSHVCDGEKDCKDGSDEKDC
GGKSVTVTPKVETTPEPICKSPSVMCQGTALCISQSQLCDGMLDCPDGFDELHCLHACSD
PGHFLCKNKGKCIEQALVCDGRSDCSDGSDELRCPTCPLHCDEGMVCLINQQFCDGRVDC
KDGFDERNCYKSGKKAAEASSLKCAVGFKACRDGSECVLYSHVCDGEKDCKDWSDEKDCE
RQCKKGQFQCAHGRMCIDKKLVCDGTPQCQDRSDEMDCFTRTKSCSHHCDNKTRCIPDNF
LCDGERDCVDGTDEADCSTDNGDTVNSKASEEASIVFSAQSPDCRSPSVFCESTALCMSL
VQLCDGKLDCPDGSDELSCIDSCQKMGDFRCKDRRKCIERILVCDGLSDCTDGSDETDCP
AAAVPKTAAALNCRLGSKLCKDGSDCVMHTHVCDGEVDCKDGSDEEGCDLQCNPGQFQCS
YGRKCIDNKQVCDGVPQCPDNSDESTCWTPTRSCALRCDQNSLCIPEVFICNGIRDCWDG
SDETDCGNPGPHSHCKSPSIPCLATSKCISQRQLCDGRKDCADGSDERPCLQKCPYDDDF
LCKDRRRCIDRNLVCDGRLHCTDASDEVDCPTAAVYTVEAAPVKCRLGLTPCKDGSDCIL
YSHVCDGEVDCKDGSDEEGCDVTCKAGQFQCAHGRRCIDANLVCDGKPHCQDRSDEMDCF
TRTKSCSHRCDNKTRCIPDNFLCDGERDCVDGTDEADCGYPSQLRSCSAPSVLCRGGKLC
ISNTKLCDGKRDCPDGFDEESCIKRCPKTGDFMCKDRRKCVARGLVCDGRSDCTDGSDEE
RCPMVSIKPNIAGPLKCRLGWKPCKDRSECVLYSHLCDGEVDCKDGSDEDDCQYQCRPDQ
FQCAHGRMCIEKKLVCDGTPQCQDRSDEMDCFTRTKSCSHRCDNKTRCVPDNFLCDGERD
CVDGTDEADCSKSDKSSGTSSLKCAVGFKPCSDGSECILYSHVCDGEKDCKDGSDEEDCR
RKSVPVAPTVGTTPEPACKSPSVMCPGTTLCISQSQLCDGMLDCPDGFDELHCLHACSDP
AHFLCMNKARCIEQALVCDGRSDCSDGSDELRCPTCPLHCDEGTVCLTSQQFCDGRMDCK
DGFDEKKCHKGDKNAAGASSLKCPLGFKPCRDGSECVLYSHVCDGEKDCKDGSDEKDCER
QCKKSQFQCAHGKMCIDMKHVCDGTPQCQDRSDEMNCFKLSESCSHHCDNRSHCIPQTFL
CDGERDCLDGTDETDCSEGGAKEPCLRGQFQCASGQCVSTSVRCDGHADCHDQSDEKNCR
KPPHCPLEQRCPNSHVCLLKEWFCDGDKDCIDGSDEQNCNASPMQCGTFQWSCASKDQCI
PTFWRCDGVKDCKDQSDEAGCGPVKCPMYMFKCGSEECLDSQLVCNGIANCLDESDEGPG
CLSNNCSSPHPPQCEHYCVNTPHGARCGCRTGFKVQADGLYCADVDECMEIQPPVCSHGC
VNTHGSYVCQCPPGFILEPDGSSCKTEKEPGLLASVQYEVLFMGLRSSNMQMLLPPGQKP
IFSLDYDWKEQWLFWVCLQEESIKYVLHGEKGNIKTLVKGVKSDSIAVDWVAGNLYWVDG
VAGQILAVRISDRVVKRQNFTVIVDEDLEQPHSLVLLPQKGIMLWSEIGKEPQIECAGMD
GSERKVLLSHGLNWPVALAVDIVSDRIFWVDEKLKCIGSATMNGEDIKLLQLTEMSSPFS
VAVFNDMVYWSDTQRKAIHGANKITGKNQKVILKRPGQPFGLKAVHPLIQYKVPNPCEKL
QCSHVCVLAPGLHALCRCPAGLLLAEDGFTCIPPENSSTSFLLLLSPTRLTKVFTRSLRG
QVGLNQWPAHHAQSLPGINEASDLDLVLGDNTLYVADVGQNSVARIKVGDSTLMPEGQVL
NLPGDTLTALAVDWITHNLYWSSSKKPQIYVTSADGKFTSLVLQAGLQDTTSIALHPPTG
RMCFTAIGLSGNVALPQVDCAAMDGRNQMLLWKKTQLPNFLTFSSQGTTVYWADIATEVI
CSVNIDGSNYREYKTGTGSPLIASLTRSDNIFFWITRYNGTTTVWYSDGIQPKQLWFEVQ
TNIIAVKAYSANSQKGTNLCAEDNGGCSHLCLAYPGGHTCRCTQGYIAVNDIQCVPGLKC
PAGSMPCRDGYKCLSSTRFCDQIPDCQDGSDEEGCHAKENEVLVHTMSGQSCSSELCNGR
GRCMVQKGKPVCECVQGYSGYFCQDQASSSVPVVLTVLFIVCLVIAAAAFLKWRRWKAGR
EQPIDKENLMKDMEEQEAFPENFSNELYNPVEEVANEHTTPVA
NT seq
8952 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgctgtttctttagaccaatttcagtgtgctcatggaagaatgtgcatagacaag
aagctggtgtgtgatggcacacctcagtgtcaggatcgctctgatgaaatggactgcttc
acacgtaccaagagctgcagccatcgctgtgacaataagacccgctgcatcccagataac
ttcctgtgtgatggagagaaagactgtgtagatggcactgatgaagcagactgtcgcgag
agttcttccattgctgtgactcctaaagttgaaaccactccagaaccaatctgtaaaagt
ccctctgtaatgtgtcaaggcacagcactgtgcatcagtcagtctcagctgtgtgatggg
atgttggattgtcctgatgggtttgatgagctccactgtttacatgcatgctcagatcca
ggccacttcctgtgtaagaacaagaggaagtgtattgaacaggccctggtgtgtgatggt
cgctctgactgctctgatgattcagatgagttacgttgtcctacgtgtcctctgcactgt
gatgaggggacagtgtgcctgatcaaccagcagttctgtgatggacgcgtggattgtaaa
gatggctttgatgagaggaactgctataagactgccaaaaagtcagcaaaatcttcatcc
ctgaaatgtgctgtaggcttcaaagcatgcagagatggaagcgagtgtgtcctctacagt
cacgtgtgcgatggagaaaaggactgcaaggacgggtcagatgagaaggactgtgaacgg
caatgtaaaaaaggccagtttcagtgtgctcatggaaggatgtgcatagacaagaagctg
gtgtgtgatgggactcctcagtgtcaggatcgctctgatgaaatggactgctttacacgt
accaagagctgcagccatcgctgtgacaataagacccgctgcatccctgataacttcctg
tgtgatggagagagagactgtgttgatggcactgatgaagcagactgtcatgagcgttct
tctgttgcggtgactcctaaagttgaaaccactccagaaccaccctgtaaaagtccctct
gtaatgtgtgaaggcacgtcattatgcatcagtcagtctcagctctgtgatgggttatta
gattgtcctgatgggtttgatgaactccactgtttacatacctgctcagatcctggccac
ttcctgtgtaagaacaagaggaagtgtattgaacaggccctggtgtgtgatggtcgctct
gactgttctgatggttcagatgagttacgttgtcctacgtgtcctctgcactgtgatgag
gggacggtgtgcctgaccagccagcagttctgtgatggaggaatggattgtaaagatggc
tttgatgagaggaactgctacaatagtgacaaagataaaggagccctaaaatgtgctgtg
ggcttcaagccatgcagggatggaagtgagtgtatcctctacagtcacgtgtgtgatgga
gaaaaggactgtaaggacgggtcagacgaggaggactgtggagtcaaatcagtcactgtc
gctcctaaagttgaaaccactccagaaccaatctgtaaaagtccctcagtaatgtgtcca
agcacgtcactgtgcatcagtcagtctcagctgtgtgatgggatgttggattgtcctgat
gggtttgatgagctccactgtttgcatgcatgctcagatccaggccacttcctgtgtaag
aacaagaggaagtgtattgaacaagccctggtgtgtgatggtcactctgactgtactgat
ggttcagatgagttacgttgtcctacgtgtcctctgcactgtgatgaggggacggtgtgc
ctgaccagccagcagttctgtgatggacgcatggactgtaacgatggctttgatgagcgg
aactgctgtatgttctgctgtaatgaaaagttgtttgaaaatttaacggagcatgtgatc
agggctgattttttcgaaatgcattttgtagatcagactggcaaaaaggctacagaagct
tcatccctgaaatgtgctgtaggcttcaaaccatgcagggatggaagtgagtgtatcctc
tacagtcacgtgtgtgatggagaaaaggactgcaaggatgggtcagatgagaaggactgt
ggtggcaaatctgtcactgttactcctaaagttgaaaccactccagaaccaatctgtaaa
agtccctctgtaatgtgtcaaggcacagcactgtgcatcagtcagtctcagctgtgtgat
ggaatgttggattgtcctgatgggtttgatgagctccactgtttacatgcatgctcagat
ccaggccacttcctgtgtaagaacaaggggaagtgtattgaacaggccctggtgtgtgat
ggtcgctctgactgctctgatggttcagatgagttacgttgtcctacatgtcctctgcac
tgtgatgaggggatggtgtgcctgatcaaccagcagttctgtgatggacgcgtggattgt
aaagatggctttgatgagaggaactgctataagtctggcaaaaaggctgctgaagcttca
tccctgaaatgtgctgtaggcttcaaagcatgcagagatggaagcgagtgtgttctctac
agtcacgtgtgcgatggagaaaaggactgcaaggactggtcagatgagaaggactgtgaa
cggcaatgtaaaaaagggcagtttcagtgtgctcatggaaggatgtgcatagacaagaag
ctggtgtgtgatgggactcctcagtgtcaggatcgctctgatgaaatggactgctttaca
cgtaccaagagctgcagccatcactgtgacaataagacccgctgcatccctgataacttc
ctgtgtgatggagagagagactgtgttgatggcactgatgaagcagactgctctactgat
aatggagatacagtcaacagtaaggcttctgaagaggcttcgatagttttttcagctcag
agtccagactgtagaagcccctcagtgttttgtgaaagcacagcattatgtatgtccctg
gttcaactctgtgatgggaagttggactgtcctgatggttctgatgagctctcctgtata
gattcatgtcagaagatgggtgacttccgctgtaaggacaggaggaagtgtattgagcga
attctggtgtgtgatggactctcagactgcactgatggatctgacgagacagactgtcct
gctgctgcagtgccaaaaaccgcagctgccttaaactgccgtttgggttcaaaactctgt
aaggatggcagtgactgtgtgatgcacacccatgtgtgtgatggagaggtagactgtaag
gatgggtctgatgaagagggatgtgaccttcagtgtaatccaggtcagtttcagtgtagt
tatggcagaaagtgcatagacaacaagcaggtgtgtgacggggttcctcagtgtccagat
aactctgatgaatcaacatgctggacgccaacaagaagctgtgcactgcgctgcgatcaa
aacagtctctgtattccggaagtttttatctgcaatgggatcagggactgctgggatgga
tcagatgaaactgactgcggcaaccctgggccgcattcccattgcaaaagtccgtctata
ccatgcctggcaacttcaaagtgcatctcccagaggcagctctgtgatggcaggaaggac
tgtgccgatggttctgatgaaagaccatgccttcagaaatgtccttatgatgatgacttc
ctgtgtaaagataggagaaggtgtatcgacaggaatctggtctgtgatggacgtctgcac
tgcactgatgcttccgatgaggtggactgtccaactgcggctgtttataccgttgaagct
gctcctgtgaagtgccgtttgggtttgacgccctgtaaggatggcagtgactgtatcctg
tacagtcatgtgtgtgatggagaggttgattgcaaagatggctctgatgaagagggatgt
gatgttacttgcaaagcagggcagtttcagtgtgctcatggaaggaggtgcattgatgca
aaccttgtgtgtgacggtaagccacattgtcaggatcgctctgatgaaatggactgcttt
acacgcaccaagagttgcagccatcgctgtgacaataagacccgctgcatccctgataac
ttcctgtgtgatggggagagagactgtgttgatggcactgatgaagcagactgtggctac
ccttcccagctgagaagctgtagtgccccttcagtgttgtgtcgagggggaaaactgtgc
atttctaacactaaactgtgtgatggaaagcgtgactgtccagatggttttgatgaagaa
tcttgcatcaaaagatgtccaaaaacaggtgactttatgtgtaaggacaggagaaagtgt
gttgcacgaggtttggtttgtgatggccgttctgactgcactgatggctctgatgaggag
agatgtcccatggtttctataaagccaaatatagcaggtccattaaagtgccgtttgggc
tggaaaccttgtaaggaccgaagcgagtgtgtgctctacagtcacctatgtgatggagag
gtcgactgtaaagatggctctgatgaagatgactgtcaatatcagtgtagaccagaccaa
tttcagtgtgctcatggaagaatgtgcatagagaagaagctggtgtgtgatgggactcct
cagtgtcaggatcgctctgatgaaatggactgctttacacgtaccaaaagctgcagccat
cgctgtgacaataagacccgctgtgtcccagataacttcctgtgtgatggggagagagac
tgtgtagatggcactgatgaagcagactgtagtaagagtgataaatcttcaggaacttca
tccctgaaatgtgcagtgggcttcaaaccatgcagtgatggaagtgagtgtatcctctac
agtcacgtgtgtgatggagaaaaggactgtaaggacgggtctgatgaggaggactgtagg
cgcaaatctgtccctgtagctcctacagttggaaccactccagaaccagcctgtaaaagt
ccctctgtaatgtgtccaggcacaacattgtgcatcagtcagtctcagctgtgtgatggg
atgttggattgtcctgatgggtttgatgagctccactgtttacatgcctgctcagatcct
gcccacttcctgtgtatgaacaaggcgaggtgtattgaacaagccctggtgtgtgatggt
cgctctgactgttctgatggttcagatgagttgcgttgtcctacgtgtcctctgcactgt
gatgaggggacggtgtgcctgaccagccagcagttctgtgatggacgaatggattgtaaa
gatggctttgatgagaagaaatgccataagggtgacaaaaatgctgcaggagcttcatcc
ctgaaatgccctctgggcttcaagccatgcagggatggtagtgagtgtgtcctctacagt
catgtgtgcgatggagagaaagattgcaaggatgggtcagatgagaaggactgtgaacga
cagtgtaaaaaaagccagttccagtgtgcccatgggaagatgtgtatagacatgaagcat
gtgtgtgatgggacccctcaatgtcaagatcgctccgatgaaatgaactgttttaaactg
tctgagtcctgcagccatcactgtgataacagaagccactgcattcctcaaactttcctt
tgtgatggagagcgagactgtttagatggcacagatgagaccgactgtagtgagggtggt
gcgaaggagccatgtttacgagggcaatttcagtgtgccagtggacaatgtgtctccaca
agtgtccgttgtgatggtcatgcagattgccacgatcagtctgatgagaagaactgtcgt
aaacctccacactgccccctggagcagcgctgccctaacagccatgtgtgcctgttgaaa
gagtggttttgcgatggagacaaagactgcattgatgggtctgacgaacagaactgcaat
gcctctcctatgcaatgtggaactttccagtggtcttgtgcatctaaagatcagtgcatt
cccacgttttggaggtgtgacggagttaaggactgtaaagaccagagtgatgaagctgga
tgtggcccggtgaaatgccccatgtacatgttcaagtgtggcagtgaggagtgcttggat
tcccagctggtgtgtaatggcattgctaactgtctggatgaatctgatgagggtccaggg
tgtctcagcaataactgctccagcccacacccaccacaatgcgagcactactgtgtcaac
actccccatggagcgaggtgtgggtgtcgaacaggcttcaaggtccaggcagacggttta
tactgtgcagatgtagatgagtgtatggagattcagcctcctgtgtgtagccacggatgc
gtgaacactcatggctcgtacgtgtgccagtgtcctccgggttttatactggagccagat
ggcagcagctgtaagacagaaaaggaacctggtcttttggcatcagtgcagtatgaggtg
ctgtttatgggcctccggagcagcaacatgcagatgcttcttcccccaggccagaagccc
atcttctctctggactatgactggaaggaacagtggctgttctgggtctgtctacaggag
gaaagcatcaaatatgtgctgcatggagaaaagggcaatatcaagacacttgttaaaggt
gtgaaatcggactcgattgctgtagactgggttgcaggaaacctgtactgggtggatgga
gtagctggccagattttagctgtaaggattagtgaccgtgtagtgaagcgacaaaacttc
actgtgattgtggatgaagacctggagcagcctcattctctcgtgcttttgcctcagaaa
gggataatgctgtggtcagagattggcaaggagccccagatcgagtgtgctggcatggac
ggttcagagaggaaggtgctactcagccatggcttaaactggcctgtagccttagctgtg
gatattgtgtctgacagaatcttctgggtagatgagaagctcaagtgcattggttcagcc
acaatgaacggtgaagatatcaagctgctacagttgactgagatgtcaagccctttctct
gtggcggtgtttaatgacatggtgtactggtctgacacccagagaaaggccatccatggg
gctaacaaaataactggcaagaaccagaaagttattctcaaaagacctggtcaacctttt
gggctcaaggctgtacacccccttatccagtataaggtgcctaacccctgtgagaaactc
caatgttctcacgtgtgtgtactagccccagggctccatgcattatgtcgttgccctgca
ggactgctgttggctgaggatggatttacctgtatcccacctgagaactcctctacttcc
ttcctactgctgctctctcctactagactcacgaaggttttcactagaagcttgcgtggt
caggttggattaaatcagtggcctgcccaccatgcccagtctcttcctggcataaatgag
gcctcagatctagacttggttcttggtgacaacacactctatgtggcagatgtcggacag
aactctgtggctcggattaaagtgggtgactccacattgatgcctgagggccaggtgttg
aatttaccaggggatacgttgactgcgctggctgtggactggatcacacacaacttgtat
tggagcagcagcaagaagcctcagatctacgtcacgtcagcagatggaaagttcaccagc
cttgttctgcaggctgggcttcaggacactacctctattgcactacacccacccacaggc
aggatgtgcttcacagccatagggttatcagggaatgttgctttgccccaggtagactgt
gctgccatggatggccggaatcaaatgttgctttggaagaaaacacagcttcccaatttt
ttgactttttcaagccaaggcacaacagtttactgggcagatattgccactgaagttatt
tgctctgtgaacatcgatggatcaaattaccgggaatataaaactggaactggatctcct
ttaattgcgtctttaacccgaagtgacaatatcttcttctggatcacccggtacaatggt
acaacgactgtatggtacagtgatggcatccagcctaaacagttgtggtttgaagttcaa
acaaacattatagcagtgaaggcatacagtgcaaacagccagaaaggaaccaacctgtgt
gcggaggataatggtggctgtagtcacttgtgcctggcatacccaggagggcatacatgc
cgctgtacacaaggctacattgctgtaaatgacatccagtgtgtacctggcctaaagtgt
ccagcaggctctatgccttgcagagacgggtacaagtgtctctcttctacccggttttgt
gaccaaatcccagattgccaagatggctctgatgaagagggctgccatgctaaggaaaat
gaggtgttggtccacacaatgagtggccagtcctgcagttctgagctctgtaatggcaga
gggcgctgtatggtgcaaaaagggaaaccagtctgcgagtgtgtgcagggttacagtggg
tatttctgtcaggatcaggcatccagcagtgttcctgtcgtccttacagtcctctttatt
gtctgcttagttattgcggcagctgcatttctaaaatggagaagatggaaagcaggacga
gagcagcccatagataaagaaaatctcatgaaggacatggaggaacaggaggcattccct
gaaaacttttccaatgaactctacaacccagtggaggaagtagcaaatgagcatacaaca
cctgttgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
