Ictalurus punctatus (channel catfish): 108273922
Help
Entry
108273922 CDS
T04658
Name
(RefSeq) calymmin isoform X1
Organism
ipu
Ictalurus punctatus (channel catfish)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
108273922
NCBI-ProteinID:
XP_047015622
UniProt:
A0A979F6D8
LinkDB
All DBs
Position
13:complement(2132494..2156030)
Genome browser
AA seq
998 aa
AA seq
DB search
MPGRALLRTALLLWLAQPTLQGGTGYKPQNGGLGQMLIPSKGYGHGPQNANTYQLNTKAQ
GYGPAAPQPNGNGAKGYGAAQAAGNRGKPSGPYKGYGAVPAALGNGNGARPNGPYTGYGA
VPAALGNGAKPNGPYKGYGAAPASLGNGNGAKPNGYGNNGNLPNGYGPAPVASKGRGPKH
SGYGASPFTSNGQKAKPNPNGGYGSKPNKPGYGAQPSYGGFGAGMRIAPQMAYKGRGGYG
QGNGYDQADSSFAGYRNGPASYPQSGGSLGGGYLNGAKAAKPGYGGGPLAQSGGAAKPNG
YGPVAGGPNAQGAKPAGYGGTKGPKAGYAGYPNGAGIKGPKPGYGGLPTGYGQRSNGYGG
YPNAGAKAPKPGYGVGAGNGGASNGQGAKPNGYGPVANGNEKGPKGKSLSPEAPSLPSVT
GYTKGVAQPAKPEPTIGVPTALPPTKRMPLMSNWKGPKPQVPQGYPSQPIVQEQAPVNLQ
NKAPKPEQYVPQGQAPFPVLAPLIPQGKGPKPATQIAPEIPQGNPQKPVAPALLPFTQPE
KAPKPVAQDQQLVAPVYPQGNGPKPVALQPAAPQGKGPKPVAPGLEIPQTKDPKPVAPEP
DAPQTAGLPLALEPTPATPQMKGPKVANPDCGLGVSGQWTKLPSPGYGPGPWYPNSRGAK
ASKPGPGYGPKLKQPGYINPGAGYGYGNGGAGQLPYNGAPIIRARLDAGTSPIEPQTAEL
GPEVKSGREYGGPYGAQPMGLGSEGKPQVRYGIGGLLFSGSPRGYNSNPYGKYGNPDAAS
PYGSKAAGNYNPLEFNANPKSAGKYSMGGSPYTASTSDSGKYGPYGGQQLGLQALAGNSG
KYGQSVGPYAPEPISLGGDAKSSGKYGNPSLPFEALGPVTDGQSIDQPVLQYEAPAIDGL
KSVDQFGDGEVQPQPIAPLLDDRVGEGPASYIKGGVRAEAVSLENPAFSPVDTPTEAATP
QHIPVQQNLKGPQLPQSWSGGKEPKHDLKGFFGNGYHG
NT seq
2997 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaggacgagcgcttctcaggacggcgctgctgctttggttggctcagccgacactt
cagggtggaacagggtacaaacctcaaaatggtggtttgggccaaatgttgataccatcc
aaaggatatggtcacggtccacagaatgccaacacctaccaactcaacactaaagcacaa
ggttatggacctgcagcacctcagcccaatgggaatggagccaaaggttatggtgctgca
caggctgccggaaatagaggaaaacccagtggtccttataaaggatacggtgctgtacct
gctgctctcggaaatggaaatggagccagacccaatggtccttatacagggtacggtgct
gtacctgctgctctcggaaatggcgccaaacccaatggtccttataaagggtacggtgct
gcacctgcttctctcggaaatggaaatggagccaaacctaatggttatggaaataatggc
aacttacccaatggttacggacctgcacctgtagcttctaaaggacggggacccaaacac
agcggctatggagcttcaccttttacatccaatggccagaaagcaaagccaaacccaaat
ggaggttatgggtccaagccaaataagcctggatatggagcacaaccttcatatggtgga
tttggagcagggatgagaatagcaccacaaatggcctacaaaggacgaggaggctatggg
caaggaaacggatatgaccaggcagattcttcattcgcaggctacagaaacggaccggct
tcttatccccaatctggaggcagtctcggtggaggatacttgaatggagcaaaagctgcc
aaacctggttatggtggtggacctttggcacagagtggaggagcagccaagcccaatggc
tatggtccagtcgctggtggtccgaatgcacagggagcaaaacctgcaggatatggaggc
accaaaggacccaaagcaggatatgctggatatcccaatggagctggaattaaaggaccg
aaaccaggttacggtggtttgcccacaggttacggacagagatccaatggatatggaggt
tatcccaatgcgggtgctaaagcacctaagccagggtatggtgttggtgctggtaatgga
ggagcaagtaatggacaaggagccaagcccaatggatatggccctgtagcaaatggaaat
gagaaagggcccaaaggaaaaagccttagccctgaagccccaagtcttccatcagtaaca
gggtacaccaaaggagttgcacagccagctaaacctgagcctaccataggagtacctact
gcactgccacccaccaagagaatgccattaatgtcaaattggaagggcccaaaacctcag
gttccacaaggctacccgtctcagccaatagtgcaagagcaggctccagtgaatctacag
aataaagcacccaaacctgaacaatatgtcccacaaggacaagctccgttcccagtgctt
gcacccctcattcctcagggtaaaggtccaaagccagccacccaaatagctccagaaatt
cctcaaggaaatcctcagaaaccagttgctcctgctttacttccattcactcaaccagag
aaagccccaaagccagttgctcaagaccaacagcttgttgcaccagtgtatccacagggg
aatggtccaaagccagttgctttacaaccagctgctccacaaggtaaaggtcccaaacct
gttgctccgggccttgagattccacaaacgaaagatcccaaacctgtagcaccagaacca
gatgcaccacagacagcaggtcttccacttgcccttgaaccaacccctgctacgcctcag
atgaagggtccaaaagtagcaaatcctgattgtggacttggagtgtctggacaatggact
aagctgcccagtcctggatatggtcctggaccgtggtacccaaacagtagaggagccaag
gcctcaaaaccaggtccaggatatggccctaaactcaaacagccaggctacattaatcca
ggagcaggatacggatatggcaacggtggagcaggacagctaccgtataacggtgccccc
atcatccgcgctcgactggatgcaggaaccagtccaatcgaaccgcagacggctgaactc
gggcctgaggtgaaatctggccgtgaatacggtggaccatatggagctcagccaatggga
ttaggctccgagggaaagcctcaagtcagatatgggatcggcggcctcctttttagcggc
tcacccagaggatacaactccaatccgtacgggaaatacggtaatcccgatgctgcatcg
ccttatggttctaaagcagccggaaactacaatccgctggaatttaacgccaatcccaaa
tctgctgggaaatacagtatgggaggctctccgtacactgctagcactagtgactctgga
aaatatggaccttatggtggccagcagcttggtttgcaagctctcgctgggaattctggg
aaatatggccagtctgttggaccctacgccccggagccgatcagtctcggtggtgatgct
aaatcatctggaaaatatggcaatccatcgcttccatttgaggccctcggtccagtcact
gatggtcagtccatcgatcagcctgtgctgcaatatgaagctcctgctattgatggattg
aagtctgtagatcagttcggagatggagaggtgcagccccaacctattgctcctctgcta
gatgatcgagttggagaagggccagcctcttatatcaagggaggagtccgagctgaagca
gtgtctctagaaaaccctgccttctcgccggtggacacgcccactgaagcagcgacaccg
cagcacattcccgttcagcagaacctcaaaggcccacagctaccccagtcctggtcagga
ggcaaggagccgaaacacgacctgaaaggattcttcggcaatggatatcacggttga
DBGET
integrated database retrieval system