Ictalurus punctatus (channel catfish): 108276642 Help Entry 108276642         CDS       T04658                                  Name (RefSeq) fibrillin-2 isoform X1   KO K23342   fibrillin 2/3 Organism ipu  Ictalurus punctatus (channel catfish) Pathway ipu04820   Cytoskeleton in muscle cells Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ipu00001]  09140 Cellular Processes   09142 Cell motility    04820 Cytoskeleton in muscle cells     108276642  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ipu00536]     108276642 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ipu00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    108276642 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  EGF_CA cEGF FXa_inhibition EGF TB hEGF EGF_3 Plasmod_Pvs28 Fibrillin_U_N FBN_EGF_st1 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  108276642 NCBI-ProteinID:  XP_053542881 UniProt:  A0A9F7TRM8 LinkDB All DBs Position 16:17074360..17144551 Genome browser AA seq 2896 aa AA seqDB search MLCKRNLRCLAGCLALLGALVGHLSGEMPGRSQFQVERSSQAAESRVRRRGKQESLRGRN VCGSRLHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGEGYCSRPNMCTCSTGQIAPSCAAKTSQ QCSIRCMNGGVCEGDHCQCQKGYTGNYCGQPVCEKKCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQC ERDYRTGPCFSKVVNKMCQSQVSGIVCTKTLCCSTVGRAWGHPCEECPAQLQPCLRGFIP SIRTGACQDVDECQAMPGLCQGGNCINTVGSFECKCPAGHRLNDGTNKCEDVDECTTIPH VCEGGKCTNSVGSFSCACPSGYVLSADKTRCFGQHTGSCFSAVLSGRCAHELSGRHTKVQ CCCDRGRCWARGTVPEICPSRRSDEFHRMCLEGGYPDVDPGIRGDRVPQQPYGHDGQPLY PTNGNGPVYPELPQIPQIPQIPQIPQIPQIPYIPNNGHGHGNGQRPHGPVVSLNQTTNKC LLMPNLCLNGHCIPVGFGHRCECNIGYQVDSQTECSDIDECASDPCANGDCVNTAGSYYC KCHTGFHRPPGKQTCFDTDECLHNGMLCQNGRCLNMAGSFQCICNSGFQLTPDGRNCMDH DECSITNMCLNGMCINEDGSFKCVCKPGFTLASSGRYCTDIDECLTPGICINGRCVNTEG SYRCECLAGLAVGPDGRSCVDTHMRSTCYGAIKKGVCVHPFHGAVTKSVCCCASTDYSFG EPCQPCPGLNSAEFNALCQSGIGFSVDGTDINECALDPDICSNGVCENLRGGYRCICNTG YETDQSGRACLDVDECLVNRLLCDNGLCRNVPGSYTCTCPLGYVFREDTDTCEDLNECNS SPCINGVCKNNAGSFSCVCSPSSVLDRTGLICIDSLKATCWMNIQEGRCEVNINGATLRS ECCATLGAAWGSPCEPCERDLICQRGFTRPRGTLCEDVNECEVFPGVCLNGRCVNTQGSF KCQCPEGLTLDGTGRLCIDIRSELCYLTYDEDMCGQPVPGRFRMDVCCCTVGAAWGKECE ACPEPGTREYETLCPRGPGFANRGDILPGRPMYKDINECKVFPSICVHGICRNTIGSFRC RCNSGFTLDTDGRNCTDIEECQISPDLCGHGTCVNTPGGFECDCLPGYESGFMMMKNCMD IDECERNPALCRGGSCENTEGSYQCVCPPGHQLSEGAEACEDVNECELSATLCPNGECVN VAGTYHCSCFSGFQSIPDRKGCTDIDECTIENGGCDFHCTNSEGSYSCSCGQGYALMPDQ RTCTDVDECEEEPDICDGGQCTNVPGEYHCDCYDGYTSSMITKTCLDVNECEVSANICMF GECENTKGSFICHCEVGYSVKKGSSGCTDVDECKINAHNCAIHATCVNTPGSFQCSCKEG WVGNGVKCVDVDECTNQTHRCSPNAKCTNKPGSYRCACSKGFKGDGFTCLDIDECTDNAE LCENGQCLNIPGGYRCDCEMGFTPTPDSRACQDIDECSFQQLCVFGTCKNLPGMFHCICD EGYELDRSGGNCTDVDECLDPINCVNGHCVNTPGSYECNCPTDYELNPTGVGCVDPRVGT CFLEVLKRGHAGLACSVEVGVGVSRSSCCCSLGRAWGNPCEFCPPVNSSDYNTLCPGGEG FRPNLITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCDCPKGYYLNADSRICEDIDECLV NPGICGPGTCYNTLGNYTCVCPQDYMQVNGGNKCMDMRKGLCFRNYNGTTCENELSFNIT HRICCCGYNMGKAWNKPCQACPIPGTEGFHTLCGNIAPGFEINIETGKPVDIDECREIPG ICANGVCINHIGSFHCECPRGFSYNDVLLICEDNDECSGSEILCQRNADCINSPGSYRCE CSDGFKLSPVGACIDRNECLETPNLCSHGKCVDIHGGYMCTCHAGFMATPSGKMCMDIDE CVHQPCRNGSCKNTVGSYNCLCHPGFELTLNNQCTDIDECSAAYGQLCRNGHCINSIGSF QCLCEDGYDLTQDGKKCVDVNECIMLPGICAPGTCHNLDGSFRCICPPGYIVQSNHCVDE NECDEDPNICLFGSCYNNPGSFICVCKPGFVLSESGRRCYDTRESFCFTRFENGKCSNPQ AFNTTKDKCCCSTMSKEGWGYPCELCPKEHDAGFQDLCPFGYGIIPGIGDTIIDLNECVE NPGICHNGHCINTDGSFRCECSTGYTLDYTGMHCVDIDECAVGNPCGNGTCANVMGSFEC NCEEGFEPGPMMTCEDINECAQNPLLCAFRCINTFGGYECSCPSGYTLRHDGRMCQDLDE CAEGLHDCDTRGMNCKNLIGTFMCVCPPGLVRKMDDEVCHDENECRTQPGICENGRCVNT IGSYVCECGEGFQPDSTHTQCLDHRRGFCFTEVLQTMCQMSSSSRIPSTKSQCCCESGRG WGNQCELCPLPGTAKYKKLCPHGPGYATDGTDIDECKVIPDVCKNGQCINTMGSFQCHCN PGYTVIITGTACVDLDECVMSPKPCNFICKNTEGSYVCSCPRGYILQEDGRTCKDLDECQ LKRHNCQFMCINTIGGFACKCPPGFKQHHTACMDNNECAVEPSLCGAKGICQNSPGSFSC ECQQGFSLDSTGLQCEDIDECTSNHRCQYGCDNMSGGYRCSCPQGYTQHYQWNQCVDENE CSTPGTCGSASCYNTLGSFKCACPPGFNFEQLSSSCQDVDECGSFKNPCSYGCSNTQGGY TCGCPPGYYRVGQGHCVSGLGFGKGQLGSVSAASTAEDNRLAPEDCYDCSVNSPHKKGIW KRHTIQQTEPEEEAPVILDSVDMEQPLLVVLNISQCNNKEHILELVPAIRPLIHHVTYNI TEGNQGEIFQLRQREELTYLHCIPEKAIPGFYILMISSSSLYDHAELLQLEDNRDRDYLS GELGQNLHMKLHITLQ NT seq 8691 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgttgtgtaagaggaatttgaggtgtttggctgggtgtctggctctgctgggtgctctg gtgggacatttatccggagagatgcccgggagaagccagtttcaggtggagcgcagctca caagccgccgaaagccgagtgaggagacgcggcaagcaggagtccctcagagggcgaaat gtgtgtggatctcgtttgcactcctactgctgtccagggtggaagactttgcctgggggc aaccagtgtattgtgcccatatgccgtaacagctgtggtgaaggctactgttccaggccc aacatgtgcacttgctccactggtcaaattgctccttcttgtgctgccaaaacatctcag cagtgtagcatcagatgtatgaatggaggtgtctgtgaaggggatcactgccagtgtcag aagggttacacaggaaactactgtgggcagcccgtatgtgaaaagaagtgccagaatgga ggacgttgcattgggcccaaccggtgtgcatgtgtgtatgggttcacaggtccacagtgt gaaagagattaccgaacaggtccatgcttttcaaaggttgtgaacaagatgtgccagagc caggtgagtggcattgtgtgcactaagacgctgtgttgttctactgttggccgagcctgg ggtcacccgtgtgaagagtgccctgctcaactacaaccctgcctcagaggcttcatcccc agcatccgcaccggagcctgccaagatgttgatgaatgccaggctatgccaggtctgtgc caaggaggaaactgcatcaacacagtgggctcattcgagtgcaagtgtcctgctgggcat cgcctgaatgatggcacaaataagtgtgaggatgtagacgaatgcaccaccattccacat gtgtgtgaaggaggaaaatgcaccaactcagttggtagtttctcctgtgcgtgtccatct ggatacgtgctgtccgccgacaagacccgatgctttggccagcacacaggttcttgcttt tcagctgtgttgagtggacgctgtgcccatgagttgtctgggcgccacactaaagtgcag tgctgttgtgaccgtggccgctgctgggcccgagggacagtgccagagatatgtcctagc cgtagatctgatgaattccacaggatgtgtttagaaggaggatatccagatgtggatcct ggcattagaggggacagagttcctcagcagccctatggacatgatggccaaccactttat ccaacaaatgggaatggtcctgtatatccagagcttccgcagatccctcaaatcccacaa atccctcaaatcccacaaatccctcaaatcccttatattcccaataatgggcatggtcat ggaaatggacaaagaccacatggacctgttgttagtttaaatcagacgacaaacaaatgc ctgctgatgccaaacttgtgtcttaatggtcactgtatcccagtggggtttggccaccgc tgtgagtgtaacatcggctaccaagtggacagtcaaacggagtgctcagatatagatgaa tgtgcttctgacccatgtgcaaacggagactgtgtgaacactgccggctcttactactgc aagtgtcatacaggctttcacaggcctccaggcaagcagacctgctttgacactgatgaa tgtctgcataacggcatgctttgtcagaacggccgctgtctgaacatggcaggcagcttc cagtgcatctgcaattcaggcttccagctaacaccggatggcaggaactgtatggaccat gatgaatgttccataacaaacatgtgtttgaacggcatgtgcatcaacgaagacggcagc tttaaatgtgtgtgcaaacctggtttcacgctcgcctctagcggtcgctactgcacagat attgatgagtgcttgacccctgggatctgcattaatgggcggtgtgtaaacacagaaggg tcttacaggtgtgagtgcttggcaggactggccgttgggcctgacggacgttcatgtgtg gacacacacatgcgcagcacctgctatggagctattaaaaagggtgtgtgtgttcaccct ttccatggagcagtcaccaaatcagtgtgctgctgtgctagcacagactacagctttggg gagccctgccaaccgtgccctggcctaaattcagcggaattcaatgccttgtgtcaaagc gggattggattttcagttgacggaacagacattaatgagtgtgcactggatcctgatatc tgctctaatggagtatgtgagaatctgagaggaggctaccgctgtatctgcaacacaggc tacgagactgaccagagtggccgggcctgtcttgatgttgatgaatgcctggtgaacaga ctgctctgtgataacggattgtgtaggaacgttccaggtagctacacctgtacatgtccc ctgggttatgtcttcagagaggacacagatacatgtgaagacctgaatgaatgcaatagc agtccatgtattaatggagtgtgtaagaacaatgcaggctctttctcatgtgtatgctct cctagcagcgtacttgatcggactggcctaatttgcatcgactctctaaaggcgacatgc tggatgaacatccaagaaggccggtgcgaggtgaatataaacggtgccactttgagatct gagtgctgtgccacgctgggagctgcatggggaagtccctgtgagccatgtgagagggat cttatctgtcaaagaggcttcacgcgaccaagagggactctttgtgaagacgttaatgaa tgcgaggtgtttcctggtgtgtgtctgaatggacggtgtgtgaacacacaaggctccttt aagtgccagtgtcctgaaggactgacactggacggcactggacgcctctgtatcgacatt cgctcagagctttgctacctgacctatgatgaggacatgtgtggtcagccagtgcctgga agattcaggatggatgtatgctgctgcacagtcggagctgcctggggaaaggagtgtgag gcgtgccctgagcctggcacacgcgagtatgaaacgctgtgtcctagaggacctggcttt gccaaccgtggggacatacttccaggcagacctatgtataaagacattaacgaatgtaaa gtgttccccagtatttgtgtacacggaatatgccggaacacgatcgggagcttcagatgt cgctgtaatagcgggtttactctggatacagatggacgtaactgcacagacatcgaagag tgtcagatctcccctgacctgtgtggacacgggacgtgtgtgaacacgccaggcggtttc gagtgtgactgcttgccaggttatgagagtggcttcatgatgatgaagaactgcatggat attgacgagtgtgagcggaatcctgcactgtgtcgcggaggctcctgtgagaacacagaa ggtagttatcaatgtgtgtgtccacctggccatcagttatctgagggcgcggaggcttgt gaagatgttaacgagtgtgaactaagtgctactctctgccccaacggggagtgtgtgaat gtggctggcacttaccactgctcttgtttttctggattccagtcaatcccagacagaaaa gggtgcacagacatagatgagtgcaccattgagaatggaggctgtgacttccactgcact aactcagagggcagctacagctgcagctgtggtcagggatatgccctaatgccagatcag agaacctgtacagatgtggacgaatgtgaagaagagcctgatatatgtgatggtggtcag tgtactaatgttcctggagagtaccactgtgattgttacgatggatacacgtcttccatg atcacaaaaacttgtctagatgtgaacgagtgtgaggtcagtgccaacatctgcatgttt ggagagtgcgagaacaccaagggctcattcatctgccattgtgaggttggctactctgtg aaaaagggttcatcaggctgcacagatgttgatgagtgtaagatcaatgcccacaactgt gccatacatgccacctgtgttaacacccctggaagctttcagtgctcctgcaaagaggga tgggtaggcaatggagtgaaatgtgttgatgtggatgaatgcaccaatcagacccacagg tgcagtcctaatgctaagtgtacgaacaaacccggctcttaccgctgtgcctgctcaaag gggtttaaaggcgacggctttacctgcctagacatagacgagtgcactgacaatgctgag ctatgtgagaacggccagtgtctaaacatcccaggaggatatcgctgtgactgtgagatg ggcttcactccaacccctgacagcagagcttgccaagatatcgatgagtgctcctttcag caactctgtgtatttggtacatgtaaaaacctccctggcatgttccactgcatctgtgac gagggctatgagttagaccgatcagggggcaactgcacagatgttgatgaatgtttggac cccataaactgtgtgaacggacactgtgtgaacacaccaggctcttatgaatgtaactgc cctacagactacgaacttaacccaactggagtcggttgtgttgatccacgtgtagggacc tgttttctggaagtgttgaagcgtgggcatgctggcctggcctgtagtgtggaggtgggc gttggggtcagtcgctcatcctgctgctgctccttgggccgagcctggggaaacccctgt gaattctgccctcctgtcaactcctcggactacaacacactgtgtccaggaggagaggga ttcaggcccaacctaattactattatactggaggacattgatgagtgtcaggagcttcct ggtctgtgccagggtggaaactgtatcaacacttttggcagcttccagtgtgactgtcca aaaggctactacctcaatgcagacagccgtatttgtgaggatattgatgagtgtttggtg aatcctgggatctgtggtccaggcacatgctataacacactgggcaattacacttgtgtg tgtcctcaggattacatgcaggtcaatggaggcaataagtgcatggacatgaggaaggga ctttgctttcgcaactacaatggcaccacatgtgagaatgagctgtccttcaacattacg caccgcatctgctgctgtggctacaacatgggcaaagcctggaacaaaccctgtcaggca tgtcccataccaggcactgagggctttcacactctttgtggaaatattgcaccagggttt gaaattaacattgaaactggaaaaccagtggatattgatgagtgtcgggagatcccaggg atctgtgccaacggtgtatgcatcaaccatattggaagttttcactgtgaatgtccaaga ggattcagctacaatgatgtgctacttatatgtgaagacaatgatgagtgtagtggttca gagatcttgtgccagaggaatgcagactgtattaacagccctggcagctatcgctgtgag tgctcggacggcttcaagctctcacccgttggagcctgtatagaccgaaacgagtgtttg gaaacccccaacctttgcagtcatggcaagtgtgtggacatccacggtggctatatgtgt acatgccatgctggcttcatggccacccccagtggcaagatgtgcatggacattgatgag tgtgtgcatcagccttgtagaaatggctcatgtaagaacactgtgggatcctacaactgc ctctgccacccgggctttgagctcactctaaataaccagtgcacagatatcgatgaatgt tcagcagcatatggtcagctgtgcagaaatggccattgcattaacagtattggctccttc cagtgcctgtgtgaggatggctatgatctcacccaggatgggaagaaatgtgttgatgtg aatgagtgtataatgttacctggaatatgtgctcctggaacatgccataacttggacggc tcttttcgctgtatctgtccacctggttacattgtacagagcaaccactgtgtagatgag aatgagtgtgatgaggaccccaacatctgtctgtttggctcctgctacaataacccaggc agcttcatatgtgtgtgcaaaccaggctttgttctctcagaaagtggacggcggtgttat gacacaagagagagcttttgcttcacccggtttgagaatggaaaatgctccaaccctcag gcattcaacaccaccaaagacaagtgctgctgtagcaccatgtccaaagagggctggggc tacccctgtgagctctgccccaaagagcatgatgctggatttcaggacctgtgtcctttt ggttatggaatcattccggggattggggatacaatcattgatctgaacgaatgcgtggag aacccaggcatttgtcacaacggccactgcatcaacaccgatggctcgttccgctgcgag tgttctacaggctacacgctcgattacactggaatgcattgtgttgatattgatgagtgc gcagtggggaatccatgtggaaacggtacttgcgctaatgtgatgggaagctttgagtgc aactgtgaggaaggttttgagccagggcccatgatgacatgcgaagatataaatgaatgt gcacagaaccctttactctgtgcgttccgctgcatcaatacgtttggaggatatgagtgc tcctgtccgtctggatacacactccgacatgatgggagaatgtgtcaggatctggatgag tgtgcagagggtttacatgactgtgacaccaggggtatgaactgtaagaacctcatcgga accttcatgtgcgtgtgtcctcctggattagtgcgcaagatggatgacgaagtgtgtcat gatgagaacgagtgccgcactcagccaggtatttgtgagaatggccgctgtgtgaacact ataggcagttacgtgtgtgagtgtggagaaggcttccagcctgactctacacacacccag tgccttgaccacagacgaggcttctgtttcacggaggtgctgcagaccatgtgtcagatg tcctctagcagcagaatacccagcaccaaatcccagtgctgctgcgaaagtgggcgtggc tgggggaaccagtgcgagctctgtcccctgccaggcactgccaagtacaagaaactgtgt ccacatgggcccggctatgccacagatggcacagatatagatgagtgtaaggtcatacca gatgtgtgtaagaatggccagtgtatcaacactatgggttcctttcaatgtcactgtaat ccaggctacacagtcatcattacaggcactgcttgtgttgacttggatgaatgtgtaatg tccccaaagccatgcaactttatctgcaagaacacagagggtagctatgtgtgctcctgt ccacgtggttatatcttgcaagaggatggcagaacatgtaaagatttggacgaatgccag ttaaagaggcacaactgccagtttatgtgtattaacaccatcggtggcttcgcttgcaaa tgccctccgggctttaagcaacaccacactgcctgcatggataataacgagtgtgcagta gagcccagtctgtgtggagctaagggcatctgccagaactcaccaggcagctttagctgt gaatgccagcaaggattcagcctggactctactggcctgcaatgtgaagatattgatgag tgcacaagtaatcatagatgtcagtatggttgtgacaacatgtcaggggggtaccgctgc agctgtccccaaggctacacccagcactaccagtggaaccagtgtgttgatgagaatgag tgctccactcccggcacctgtggctcagcgtcatgttacaacacattaggcagcttcaag tgtgcctgtccgcctggattcaacttcgagcagctctccagcagctgccaggacgtggat gagtgcggctccttcaaaaacccctgcagctacggctgctccaacacccaaggaggctat acgtgcggctgtcctcctggatactacagggtcggccaagggcactgtgtttcaggtctg ggctttgggaagggtcagctgggatctgtcagtgcagctagtacagcagaggataataga ctcgctcctgaagactgctatgattgcagtgtcaacagtccacataagaaaggaatctgg aagagacacaccatccagcaaacagagccagaggaggaagctccagttatcctggacagc gtggacatggagcagcctctgctagtggtgctcaatatatcccaatgcaacaacaaagag cacatcctggagctggtgcctgccatcagacctctcattcatcacgtcacttataacatc acagaaggcaatcagggtgaaatattccaactccggcagcgtgaggagctcacctacctg cactgcatacctgagaaagctattccaggattttatattttgatgatcagcagttcttca ctttatgatcatgcagaactgctgcagttagaggacaacagggacagagactacctctca ggtgagctaggacagaacctgcacatgaagctgcacattacattacagtaa

DBGET integrated database retrieval system